Gene: I830077J02Rik

ID: uc008qvk.1_intron_2_0_chr3_105730160_r.3p

SPECIES: mm9

chr3:105730110 105730359 -

(1) OTHER.ip

(11) OTHER.mut

(1) OVARY

(9) PIWI.ip

(2) PIWI.mut

(1) TDRD1.ip

(44) TESTES

Sense strand

GATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGGGAAACCCTGTCTCAAAAAAACCAAAAAAAAAGAAACAAAACAAAAAAAAGAAAGTTAAGCCTGGCTTTCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGTCTGCTAGCAGGTCATCTACTCCCTTTTGTTTCTGCTAAAACAGAAAGGAACACATCATCTTGGCCTTTTTTGCTGGGGTTCTGCTGACACTGC ..................................................................................................................((((((((....))))))))((((.((((((....)))))).)))).......................................................................................... ..................................................................................................99..............................................................163.....................................................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)	SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)	SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)	GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)	GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)	SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)	SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	mjTestesWT1() Testes Data. (testes)	GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatt............................................................................................................................................................................................................................	26	att	75.00	0.00	6.00	3.00	31.00	8.00	4.00	-	5.00	2.00	5.00	1.00	1.00	-	-	-	2.00	-	-	-	-	1.00	-	-	5.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaaaa...........................................................................................................................................................................................................................	27	aaaa	36.00	0.00	2.00	5.00	10.00	3.00	2.00	2.00	5.00	-	4.00	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-
....................................................................................................................................TCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGTCT...........................................................................................	27	1	31.00	31.00	-	1.00	-	9.00	5.00	9.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	2.00	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaat............................................................................................................................................................................................................................	26	aat	28.00	0.00	2.00	-	13.00	1.00	-	-	-	2.00	2.00	1.00	2.00	-	-	1.00	2.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttt.................................................................................................................................................................................................	29	ttt	21.00	0.00	2.00	1.00	-	6.00	5.00	2.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................TTCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGT.............................................................................................	26	1	19.00	19.00	1.00	-	-	-	1.00	8.00	-	-	-	-	-	-	3.00	1.00	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................TGGCTTTCCGGAAAGGCTTCAAGGGG..................................................................................................	26	1	17.00	17.00	3.00	1.00	1.00	5.00	-	-	2.00	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTagt............................................................................................................................................................................................................................	26	agt	16.00	0.00	2.00	1.00	-	-	-	-	4.00	-	6.00	-	-	1.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................TCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGTC............................................................................................	26	1	14.00	14.00	-	-	1.00	2.00	2.00	6.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................TCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGT.............................................................................................	25	1	12.00	12.00	-	-	-	-	-	7.00	-	-	-	-	-	1.00	3.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGttt.......................................................................................................................................................................................	24	ttt	12.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	8.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TGAGTTCGAGGCCAGCCgctc...............................................................................................................................................................................................................................	21	gctc	11.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.00	-	-	5.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-
..............................................................................................................................TGGCTTTCCGGAAAGGCTTCAAGGG...................................................................................................	25	1	11.00	11.00	-	-	1.00	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	4.00	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtta.................................................................................................................................................................................................	29	tta	10.00	0.00	3.00	-	-	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................TTCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGTC............................................................................................	27	1	10.00	10.00	-	-	-	6.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatta...........................................................................................................................................................................................................................	27	atta	10.00	0.00	1.00	1.00	1.00	2.00	1.00	-	1.00	1.00	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTattt...........................................................................................................................................................................................................................	27	attt	9.00	0.00	1.00	2.00	1.00	-	-	-	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaaaa...........................................................................................................................................................................................................................	29	aaaa	8.00	0.00	-	1.00	-	1.00	4.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatt............................................................................................................................................................................................................................	28	att	7.00	0.00	-	-	3.00	-	1.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt.......................................................................................................................................................................................	26	ttt	6.00	0.00	1.00	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................ACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttt.................................................................................................................................................................................................	28	ttt	6.00	0.00	2.00	-	-	1.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGtttt......................................................................................................................................................................................	25	tttt	6.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaaga...........................................................................................................................................................................................................................	27	aaga	5.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................TTCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGTCT...........................................................................................	28	1	5.00	5.00	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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..TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTagt............................................................................................................................................................................................................................	28	agt	4.00	0.00	-	-	-	-	1.00	2.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtttt................................................................................................................................................................................................	30	tttt	3.00	0.00	-	-	-	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................TTTCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGT.............................................................................................	27	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...TTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatt............................................................................................................................................................................................................................	27	att	3.00	0.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttc.......................................................................................................................................................................................	26	ttc	3.00	0.00	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...TTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaat............................................................................................................................................................................................................................	27	aat	3.00	0.00	-	-	2.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................CAGGACAGCCAGGGCTATACAGtttt......................................................................................................................................................................................	26	tttt	3.00	0.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................CAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttt.................................................................................................................................................................................................	27	ttt	3.00	0.00	1.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaata...........................................................................................................................................................................................................................	27	aata	3.00	0.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGtgta.........................................................................................................................................................................................................	21	tgta	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGGACccag......................................................................................................................................................................................................	24	ccag	2.00	0.00	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................TTCAAGGGGCCTGTCTGCTAGCAG...................................................................................	24	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatga...........................................................................................................................................................................................................................	27	atga	2.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAtttt.......................................................................................................................................................................................	26	tttt	2.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaat............................................................................................................................................................................................................................	28	aat	2.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttta......................................................................................................................................................................................	27	ttta	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................TCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGTCc...........................................................................................	27	c	2.00	14.00	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................TTCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGTCTGC.........................................................................................	30	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................AAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtaga................................................................................................................................................................................................	26	taga	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAttt........................................................................................................................................................................................	25	ttt	2.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt.......................................................................................................................................................................................	28	ttt	2.00	0.00	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................AACAAAAAAAAGAAAGTTAAGCCTGGCT.......................................................................................................................	28	1	2.00	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................TCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGTCTG..........................................................................................	28	1	2.00	2.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................ACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtta.................................................................................................................................................................................................	28	tta	2.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtaat................................................................................................................................................................................................	30	taat	2.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................TGGCTTTCCGGAAAGGCTTCAAGG....................................................................................................	24	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatta...........................................................................................................................................................................................................................	29	atta	2.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtttt......................................................................................................................................................................................	27	tttt	2.00	0.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcatt............................................................................................................................................................................................................................	26	catt	2.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................AACAAAAAAAAGAAAGTTAAGCCTGGC........................................................................................................................	27	1	2.00	2.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaatt...........................................................................................................................................................................................................................	29	aatt	2.00	0.00	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAtaa......................................................................................................................................................................................................................	30	taa	2.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................AAACAAAAAAAAGAAAGTTAAGCCTGGC........................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................CAAAGTGAGTTCCAGGACAGCgagc...................................................................................................................................................................................................	25	gagc	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAtaaa.....................................................................................................................................................................................................................	33	taaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................TGGCTTTCCGGAAAGGCTTCAAG.....................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................TGGCTTTCCGGAAAGGCTTCAAGGGGg.................................................................................................	27	g	1.00	17.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt.......................................................................................................................................................................................	32	ttt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTgttt...........................................................................................................................................................................................................................	27	gttt	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttg.................................................................................................................................................................................................	29	ttg	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...TTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaatt...........................................................................................................................................................................................................................	28	aatt	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAttta.....................................................................................................................................................................................................................	31	ttta	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtaaa................................................................................................................................................................................................	30	taaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................TCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGTCTGC.........................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTgata...........................................................................................................................................................................................................................	27	gata	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................TTCCGGAAAGGCTTCAAG.....................................................................................................	18	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................AACAAAACAAAAAAAAGAAAGTTAAGC.............................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.ATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTatt............................................................................................................................................................................................................................	29	att	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................CAAAAAAACCAAAAAAAAAGAAACAAAAC................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCggta..........................................................................................................................................................................................................................	28	ggta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....CTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgtta..........................................................................................................................................................................................................................	27	gtta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................GTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt.......................................................................................................................................................................................	29	ttt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................AACAAAACAAAAAAAAGAAAGTTAAGCC............................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................CCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtatt......................................................................................................................................................................................	27	tatt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................CTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCcgt...................................................................................................................................................................................................	28	cgt	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCgata...................................................................................................................................................................................................	27	gata	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................ACAAAACAAAAAAAAGAAAGTTAAGCCTG..........................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAtaaa.....................................................................................................................................................................................................................	31	taaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGtttc.........................................................................................................................................................................................................	21	tttc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAtaga.....................................................................................................................................................................................................................	33	taga	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................GTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGcgt.......................................................................................................................................................................................	29	cgt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................TTTCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGTC............................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgaag..........................................................................................................................................................................................................................	26	gaag	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................CAGGACAGCCAGGGCTATACAGttt.......................................................................................................................................................................................	25	ttt	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtatt................................................................................................................................................................................................	30	tatt	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................ACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtaaa................................................................................................................................................................................................	29	taaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................AAAAAAGAAAGTTAAGCCTGGC........................................................................................................................	22	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................AAACAAAAAAAAGAAAGTTAAGCCTGGCT.......................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................TGGCTTTCCGGAAAGGCTTCAAGGGt..................................................................................................	26	t	1.00	11.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................TCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCcggc............................................................................................	26	cggc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................CTGCTAGCAGGTCATCTACTCCCT.....................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................AAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtta.................................................................................................................................................................................................	26	tta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................TCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCT...............................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCgtc................................................................................................................................................................................................................................	24	gtc	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................TGGCTTTCCGGAAAGGCTTCAAGGc...................................................................................................	25	c	1.00	2.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcatt............................................................................................................................................................................................................................	24	catt	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....CTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgact..........................................................................................................................................................................................................................	27	gact	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGctt.......................................................................................................................................................................................	24	ctt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....CTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGccgc............................................................................................................................................................................................................................	25	ccgc	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.ATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTaat............................................................................................................................................................................................................................	29	aat	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCggcg..........................................................................................................................................................................................................................	26	ggcg	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................CTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtttt................................................................................................................................................................................................	31	tttt	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGctaa............................................................................................................................................................................................................................	24	ctaa	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAtttt.......................................................................................................................................................................................	28	tttt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCgaaa...................................................................................................................................................................................................	27	gaaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAttt........................................................................................................................................................................................	27	ttt	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGGACcggg......................................................................................................................................................................................................	24	cggg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgttt..........................................................................................................................................................................................................................	28	gttt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGGACcaga......................................................................................................................................................................................................	24	caga	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGggt....................................................................................................................................................................................................................	32	ggt	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...TTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTact............................................................................................................................................................................................................................	27	act	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................CCTGTCTCAAAAAAACCAAAAAAAAAGAAAC.....................................................................................................................................................	31	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................ACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGtcc.................................................................................................................................................................................................	28	tcc	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCgcg................................................................................................................................................................................................................................	24	gcg	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcaat............................................................................................................................................................................................................................	26	caat	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................GTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtta.......................................................................................................................................................................................	29	tta	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................TTCAAGGGGCCTGTCTGCTAGC.....................................................................................	22	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................TACAGGGAAACCCTGTCTCAAAAAgacc...................................................................................................................................................................	28	gacc	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................TTCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGc.............................................................................................	26	c	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................AGGACAGCCAGGGCTATACAGtag.......................................................................................................................................................................................	24	tag	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................TCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCgtc.............................................................................................	25	gtc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAtagt.......................................................................................................................................................................................	28	tagt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................TGGCTTTCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGT.............................................................................................	31	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtaat......................................................................................................................................................................................	28	taat	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCgat....................................................................................................................................................................................................	26	gat	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................................................................TTTTTTGCTGGGGTTCTGCTGACA....	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcaca............................................................................................................................................................................................................................	26	caca	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................TGGCTTTCCGGAAAGGCTTCAAGGaa..................................................................................................	26	aa	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................GCTTTCCGGAAAGGCTTCAAGGGGC.................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................TCCGGAAAGGCTTCAAGGGGC.................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGttta................................................................................................................................................................................................	30	ttta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................CTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCctt...................................................................................................................................................................................................	28	ctt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TACAAAGTGAGTTCCAGtgct.........................................................................................................................................................................................................	21	tgct	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TCTGAGTTCGAGGCCAGCCggta...............................................................................................................................................................................................................................	23	ggta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..TTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGcgc.............................................................................................................................................................................................................................	27	cgc	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....CTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCgcg...........................................................................................................................................................................................................................	26	gcg	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................TAGCAGGTCATCTAC..........................................................................	15	3	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Antisense strand

GATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGGGAAACCCTGTCTCAAAAAAACCAAAAAAAAAGAAACAAAACAAAAAAAAGAAAGTTAAGCCTGGCTTTCCGGAAAGGCTTCAAGGGGCCTGTCTGCTAGCAGGTCATCTACTCCCTTTTGTTTCTGCTAAAACAGAAAGGAACACATCATCTTGGCCTTTTTTGCTGGGGTTCTGCTGACACTGC ..................................................................................................................((((((((....))))))))((((.((((((....)))))).)))).......................................................................................... ..................................................................................................99..............................................................163.....................................................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)	SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)	SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)	GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)	GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)	SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)	SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	mjTestesWT1() Testes Data. (testes)	GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcgt....................................................................................................................................................................................................................	27	gcgt	148.00	0.00	59.00	43.00	-	-	1.00	1.00	-	21.00	1.00	19.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtt....................................................................................................................................................................................................................	26	gtt	12.00	0.00	5.00	2.00	-	-	-	-	1.00	1.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgta....................................................................................................................................................................................................................	26	gta	11.00	0.00	3.00	5.00	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgcgt...................................................................................................................................................................................................................	28	gcgt	11.00	0.00	4.00	6.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcat....................................................................................................................................................................................................................	27	gcat	9.00	0.00	4.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgcgt.....................................................................................................................................................................................................................	26	gcgt	7.00	0.00	1.00	2.00	-	-	-	-	-	2.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcta....................................................................................................................................................................................................................	27	gcta	7.00	0.00	3.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtaa....................................................................................................................................................................................................................	27	gtaa	5.00	0.00	4.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGgaa..........................................................................................................................................................................................	28	gaa	4.00	0.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcgg....................................................................................................................................................................................................................	27	gcgg	4.00	0.00	2.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGActa....................................................................................................................................................................................................................	29	cta	4.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGActaa....................................................................................................................................................................................................................	30	ctaa	3.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTgcta......................................................................................................................................................................................................................	25	gcta	2.00	0.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcga....................................................................................................................................................................................................................	29	cga	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgtta.....................................................................................................................................................................................................................	26	gtta	2.00	0.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAgatt...........................................................................................................................................................................................	28	gatt	2.00	0.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTgtgt..................................................................................................................................................................................................................	29	gtgt	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgga....................................................................................................................................................................................................................	26	gga	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgctt.....................................................................................................................................................................................................................	26	gctt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtta....................................................................................................................................................................................................................	27	gtta	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgcag....................................................................................................................................................................................................................	27	gcag	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTgcgg......................................................................................................................................................................................................................	25	gcgg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtta....................................................................................................................................................................................................................	26	gtta	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTgcgt..................................................................................................................................................................................................................	29	gcgt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......TCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgggg....................................................................................................................................................................................................................	31	gggg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGcga.......................................................................................................................................................................................................................	26	cga	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgcgg.....................................................................................................................................................................................................................	26	gcgg	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........TCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgg...................................................................................................................................................................................................................	30	gg	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgagt....................................................................................................................................................................................................................	27	gagt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcat....................................................................................................................................................................................................................	29	cat	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAggc....................................................................................................................................................................................................................	26	ggc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................TCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGtcta..........................................................................................................................................................................................	28	tcta	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcagt....................................................................................................................................................................................................................	30	cagt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgcta.....................................................................................................................................................................................................................	26	gcta	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGGGAAAa.....................................................................................................................................................................................	31	a	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................TTCCAGGACAGCCAGGGCTATACAGgaaa..........................................................................................................................................................................................	29	gaaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgtaa....................................................................................................................................................................................................................	26	gtaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................CTGCTAGCAGGTCATCTAC..........................................................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................GGACAGCCAGGGCTATACAGgggt..........................................................................................................................................................................................	24	gggt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAgg..............................................................................................................................................................................................................	30	gg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAgtt..............................................................................................................................................................................................................	32	gtt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-
............GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgtta...................................................................................................................................................................................................................	27	gtta	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgat....................................................................................................................................................................................................................	25	gat	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAcga.........................................................................................................................................................................................................................	24	cga	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......AGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGac.....................................................................................................................................................................................................................	31	ac	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........TCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgga....................................................................................................................................................................................................................	30	gga	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAgtaa..............................................................................................................................................................................................................	32	gtaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................GGACAGCCAGGGCTATACAGgaac..........................................................................................................................................................................................	24	gaac	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........TCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgat....................................................................................................................................................................................................................	30	gat	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgat....................................................................................................................................................................................................................	26	gat	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........CGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAcatt....................................................................................................................................................................................................................	30	catt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............GCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgaaa....................................................................................................................................................................................................................	26	gaaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTgtt......................................................................................................................................................................................................................	24	gtt	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgccg...................................................................................................................................................................................................................	28	gccg	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgaat....................................................................................................................................................................................................................	27	gaat	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGgga.....................................................................................................................................................................................................................	25	gga	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAgctt....................................................................................................................................................................................................................	27	gctt	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............GGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGgta...................................................................................................................................................................................................................	27	gta	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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