(1)
OTHER.ip
(8)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(40)
TESTES

Sense strand
GAAATGCCACAGATTGATAGATTGATATTATTATAGCTCGAAATATAGTATGATTGCAATGTAACTTCTGTAGTGTGTACAAAGGGAGCCACTTCCCACTTACTCTTACTTCTCAAGGTTTTAATAGACATAAAATTCTCCTGTACATGCGTTCCATGGTCTTCATCACTAGGAACCTTTTCTTCATCTTATTTTCACAGGAGATTGAAAGTCAGATCGATAGAATCTGTGAAATGGGAGCAGTGATGCG


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
.....................................................................................................................................AATTCTCCTGTACATGCGTTCCATGGTCTTCATCACTAGGAACCTTTTCTTC................................................................. 52 1 99.00 99.00 99.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CGATAGAATCTGTGAAATGGGAGCAG....... 26 1 13.00 13.00 - 4.00 - - - - - - - - 2.00 - - 3.00 - - 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................GATAGAATCTGTGAAATGGGAGC......... 23 1 8.00 8.00 - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TAGAATCTGTGAAATGGGAGCAGTGA.... 26 1 7.00 7.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00
............................................................................................................................................................................................................................TAGAATCTGTGAAATGGGAGCAGTGATGC. 29 1 6.00 6.00 - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TGAAAGTCAGATCGATAGAATCTGTGA.................. 27 1 5.00 5.00 - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TGAAAGTCAGATCGATAGAATCTGTG................... 26 1 4.00 4.00 - - - 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CGATAGAATCTGTGAAATGGGAG.......... 23 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TGAAAGTCAGATCGATAGAATCTGTGAAAT............... 30 1 4.00 4.00 - - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TAGAATCTGTGAAATGGGAGCAGTG..... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............ATTGATAGATTGATAgctc........................................................................................................................................................................................................................... 19 gctc 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CGATAGAATCTGTGAAATGGGAGCA........ 25 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CGATAGAATCTGTGAAATGGGAGC......... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TAGAATCTGTGAAATGGGAGCAG....... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CGATAGAATCTGTGAAATGGGAGCAGTG..... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........ACAGATTGATAGATTtgac............................................................................................................................................................................................................................... 19 tgac 2.00 0.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CGATAGAATCTGTGAAATGGGAGCAGT...... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ACAGGAGATTGAAAGggca................................... 19 ggca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TCGATAGAATCTGTGAAATGGaagc......... 25 aagc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TGAAAGTCAGATCGATAGAATCTGTGAAAggg............. 32 ggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TGAAAGTCAGATCGATAGAATCTGT.................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TGAAAGTCAGATCGATAGAATCTGTGAA................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CGATAGAATCTGTGAAATGGGA........... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................AGATCGATAGAATCTGTGAAATGGGAGC......... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TCAGATCGATAGAATCTGTGAAATGGGA........... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CGATAGAATCTGTGAAATGGGAGCcg....... 26 cg 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CGATAGAATCTGTGAAAT............... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TCGATAGAATCTGTGAAATGGGAGCAGTG..... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GATTGAAAGTCAGATCGATAGAATCTGTGt.................. 30 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TCGATAGAATCTGTGAAATGGGAG.......... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTGAAAGTCAGATCGATAGAATCTGTGAAAT............... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................GATCGATAGAATCTGTGAAATGGGAGC......... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TAGAATCTGTGAAATGGGAGCAGTGAT... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................ATCGATAGAATCTGTGAAATGGGAGCA........ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TAGAATCTGTGAAATGGGAGCAGTGATGt. 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GATTGATAGATTGATAgc............................................................................................................................................................................................................................. 18 gc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................TGTGAAATGGGAGCAGTGATG.. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
........................................................................................................................................................................................................................TCGATAGAATCTGTGAAATGGGAGCA........ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
............................................................................................................................................................................................................................TAGAATCTGTGAAATGGGAGCAGTGATGCGt 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CGATAGAATCTGTGAAATGGGAGCAGTtatt.. 31 tatt 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................GAATCTGTGAAATGGGAGCAGTGATGt. 27 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TTGAAAGTCAGATCGATAGAATCTGT.................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AGATTGAAAGTCAGATC................................ 17 3 0.33 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GAAATGCCACAGATTGATAGATTGATATTATTATAGCTCGAAATATAGTATGATTGCAATGTAACTTCTGTAGTGTGTACAAAGGGAGCCACTTCCCACTTACTCTTACTTCTCAAGGTTTTAATAGACATAAAATTCTCCTGTACATGCGTTCCATGGTCTTCATCACTAGGAACCTTTTCTTCATCTTATTTTCACAGGAGATTGAAAGTCAGATCGATAGAATCTGTGAAATGGGAGCAGTGATGCG


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
..............................................................................................................................................................................................................................TCTGTGAAATGGGAGCcgg......... 19 cgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CGTTCCATGGTCTtagg........................................................................................ 17 tagg 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -