(1)
OTHER.ip
(7)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(33)
TESTES

Sense strand
GAGGGAATGGGATGTGCAGCCCCTCAGAGAAGGGTTGTGCCATCTGTGTCACACAGATGGGGTGTTGTTGTGCACTTGTTTCCAGGACCTATGTGGATTTGACTACTTCTGAATTGAGCGTGCTTTGGGCACTGGTAAAGCACAAGGAAGGCTCTTCGAACAACGAGTTTGAACTGAAGCTAGCATTTTCCTTTTAATAGGCTGAAACTCCCCGATCGTGGCCAGGAGACATAGAAGGAATTCTGCAGGC
...................................................................................................((.(((((((......((((...(((((.((.........)).)))))...)))).((((((.....))))))...)))).))))).................................................................
..............................................................................................95........................................................................................185...............................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
..................................................................................................................................................................................................TAATAGGCTGAAACTCCCCGATCGTGGC............................ 28 2 36.00 36.00 6.00 12.00 3.50 0.50 - 3.00 4.50 1.00 - - - - - 0.50 0.50 - 1.00 - - - 3.00 - - 0.50 - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGTGGATTTGACTACTTCTGAATTGAGC................................................................................................................................... 28 2 10.00 10.00 3.00 - 0.50 0.50 - 1.50 2.50 0.50 0.50 - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGGCACTGGTAAAGCACAAGGAAGGC.................................................................................................. 27 2 8.00 8.00 0.50 3.50 - - - 1.00 - - - - - 0.50 - 1.50 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...................................................................................................TGACTACTTCTGAATTGAGCGTGCTT............................................................................................................................. 26 2 8.00 8.00 - - 0.50 0.50 - - - 0.50 - 1.50 - - - - 1.00 1.00 - - 0.50 0.50 - 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - 0.50 - -
.......................................................................................................TACTTCTGAATTGAGCGTGCTTTGGGC........................................................................................................................ 27 2 6.50 6.50 2.00 - - 0.50 0.50 - 1.00 0.50 - 1.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGGCACTGGTAAAGCACAAGGAAGG................................................................................................... 26 2 5.50 5.50 - 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTAATAGGCTGAAACTCCCCGATCGTGGC............................ 29 2 4.50 4.50 - 4.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TTCGAACAACGAGTTTGAACTGAAGCT..................................................................... 27 2 4.50 4.50 - - - 0.50 - - - - - 1.50 0.50 - - - - 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - -
..........................................................................................................................................................TTCGAACAACGAGTTTGAACTGAAGCTA.................................................................... 28 2 4.00 4.00 - - 0.50 0.50 - - - - 0.50 1.00 - - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TTCGAACAACGAGTTTGAACTGAAGCTAGC.................................................................. 30 2 3.50 3.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - 2.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TAATAGGCTGAAACTCCCCGATCGTG.............................. 26 2 3.50 3.50 - - - - - - - - - - 2.00 - 0.50 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGGCACTGGTAAAGCACAAGGAAGGCTC................................................................................................ 29 2 3.50 3.50 1.00 - - 0.50 1.00 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGAATTGAGCGTGCTTTGGGCACTtgt.................................................................................................................. 27 tgt 3.00 0.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TAATAGGCTGAAACTCCCCGATCGTGGCC........................... 29 2 3.00 3.00 - - 1.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGAATTGAGCGTGCTTTGGGCACTGGT.................................................................................................................. 27 2 3.00 3.00 - - - - 2.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TCGAACAACGAGTTTGAACTGAAGCTAGCA................................................................. 30 2 2.50 2.50 - - 0.50 - - - - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - -
...........................................................................................................................................................TCGAACAACGAGTTTGAACTGAAGCTA.................................................................... 27 2 2.50 2.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGAATTGAGCGTGCTTTGGGCACTGGTA................................................................................................................. 28 2 2.00 2.00 - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TTCGAACAACGAGTTTGAACTGAAGC...................................................................... 26 2 2.00 2.00 0.50 - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGCTGAAACTCCCCGATCGTGGCCA.......................... 27 2 2.00 2.00 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGATTTGACTACTTCTGAATTGAGC................................................................................................................................... 26 2 2.00 2.00 1.00 - - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TGACTACTTCTGAATTGAGCGTGCTTT............................................................................................................................ 27 2 2.00 2.00 0.50 - 0.50 - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TGGTAAAGCACAAGGAAGGCTCTTC............................................................................................. 25 2 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 0.50 1.00 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TACTTCTGAATTGAGCGTG................................................................................................................................ 19 2 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TAATAGGCTGAAACTCCCCGATCGTGG............................. 27 2 1.50 1.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGTGGATTTGACTACTTCTGAATTGAGCGT................................................................................................................................. 30 2 1.50 1.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TACTTCTGAATTGAGCGTGCTTTGG.......................................................................................................................... 25 2 1.50 1.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TAAAGCACAAGGAAGGCTCTTCGAAC......................................................................................... 26 2 1.50 1.50 - - - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TCGAACAACGAGTTTGAACTGAAGCT..................................................................... 26 2 1.50 1.50 - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TACTTCTGAATTGAGCGTGCTTTGGGCA....................................................................................................................... 28 2 1.50 1.50 0.50 - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGCTGAAACTCCCCGATCGTGGCCAG......................... 28 2 1.50 1.50 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................AGCACAAGGAAGGCTCTTCGAACAACGA.................................................................................... 28 2 1.50 1.50 0.50 - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGAAACTCCCCGATCGTGGCCAt......................... 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TGTCACACAGATGGGGTGTTGTTGTG.................................................................................................................................................................................. 26 2 1.00 1.00 - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GAGAAGGGTTGTGCCATCTGTcac........................................................................................................................................................................................................ 24 cac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TGACTACTTCTGAATTGAGCGTGC............................................................................................................................... 24 2 1.00 1.00 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................CCAGGACCTATGTGGATTTGACTACTTCa............................................................................................................................................ 29 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................GACCTATGTGGATTTGACTACTTCTG........................................................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TCTTCGAACAACGAGTTTGAACTGAAGCT..................................................................... 29 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTAATAGGCTGAAACTCCCCGATCGT............................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................AAGCACAAGGAAGGCTCTTCGAAaa........................................................................................ 25 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCCCCGATCGTGGCCAGGAGACATAGAA.............. 28 2 1.00 1.00 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TTCCAGGACCTATGTGGATTTGACTACa............................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGAATTGAGCGTGCTTTGGGCACTGG................................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TGAAACTCCCCGATCGTGGCCAGGgg...................... 26 gg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TAATAGGCTGAAACTCCCCGATCtggc............................. 27 tggc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TAATAGGCTGAAACTCCCCGA................................... 21 2 1.00 1.00 - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TTTAATAGGCTGAAACTCCCCGATC................................. 25 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGTGGATTTGACTACTTCTGAATTGAGa................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCCCCGATCGTGGCCAGGAGACATAGA............... 27 2 1.00 1.00 - - - - - - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TGACTACTTCTGAATTGAGCGTGCTTTGt.......................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..........................................................................................................................................................TTCGAACAACGAGTTTGAACTGAggct..................................................................... 27 ggct 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCCCCGATCGTGGCCAGGAGACATAGAAGt............ 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................AATAGGCTGAAACTCCCCGATCGgggc............................ 27 gggc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCCCCGATCGTGGCCAGGAGACATA................. 25 2 1.00 1.00 - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGTGTCACACAGATGGGGTGTTGTTGTt.................................................................................................................................................................................. 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TTTGACTACTTCTGAATTGAGCGTGt............................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGGCACTGGTAAAGCACAAGGAAGGCTCTTC............................................................................................. 32 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - -
...............................................................................TTCCAGGACCTATGTGGATTTGACTACTT.............................................................................................................................................. 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TGGTAAAGCACAAGGAAGGCTCTTCG............................................................................................ 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TAATAGGCTGAAACTCCCCGATCGTGGCCA.......................... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TGGTAAAGCACAAGGAAGGCTCTTCGA........................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TTCTGAATTGAGCGTGCTTTGGGC........................................................................................................................ 24 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGCACTTGTTTCCAGGACCTATGTGGA......................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................AATAGGCTGAAACTCCCCGATCGTGGC............................ 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAGGCTGAAACTCCCCGATCGTGGCC........................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................AGGAGACATAGAAGGAATTCTGC.... 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50
...................................................................................................TGACTACTTCTGAATTGAGCGTGCT.............................................................................................................................. 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................CTACTTCTGAATTGAGCGTGCTTTGG.......................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTCCTTTTAATAGGCTGAAACTCCCC..................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TTCCAGGACCTATGTGGATTTGA.................................................................................................................................................... 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TGTTGTGCACTTGTTTCCAGGA................................................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGAATTGAGCGTGCTTTGGG......................................................................................................................... 20 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TAGCATTTTCCTTTTAATAGGCTGAAACTC........................................ 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGAGAAGGGTTGTGCCATCTGTGTC........................................................................................................................................................................................................ 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - -
.............................................................................................TGGATTTGACTACTTCTGAATTGAGCGT................................................................................................................................. 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................ACAACGAGTTTGAACTGAAGCTAGCAT................................................................ 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................CCAGGACCTATGTGGATTTGACTACTTCT............................................................................................................................................ 29 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TTCGAACAACGAGTTTGAACTGAAG....................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TTTTAATAGGCTGAAACTCCCCGATC................................. 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................CCGATCGTGGCCAGGAGAC.................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGAAGGCTCTTCGAACAACGAGTTTG............................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGATTTGACTACTTCTGAATTGAGCG.................................................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TAATAGGCTGAAACTCCC...................................... 18 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGTGGATTTGACTACTTCTGAATTGA..................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................GGAGACATAGAAGGAATTCTGCAGGC 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................GAAGCTAGCATTTTCCTTTTAATAGGCTG.............................................. 29 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TAAAGCACAAGGAAGGCTCTTCGAACAA....................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGGGATGTGCAGCCCCTCAGAGAAGGG........................................................................................................................................................................................................................ 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CGAACAACGAGTTTGAACTGAAGCTA.................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................AGCACAAGGAAGGCTCTTCGAACAAC...................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCCCCGATCGTGGCCAGGAGACA................... 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................AACAACGAGTTTGAACTGAAGCTAGCA................................................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGGCACTGGTAAAGCACAAGGAAGGCTCTT.............................................................................................. 31 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TTCCAGGACCTATGTGGATTTGACTACT............................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................CAAGGAAGGCTCTTCGAACAACGAGT.................................................................................. 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................ACATAGAAGGAATTCTGCAGGC 22 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GAGAAGGGTTGTGCCATCTGTGTCAC...................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GAACAACGAGTTTGAACTGAAGCT..................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGGCACTGGTAAAGCACAAGGAAG.................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................AAGCACAAGGAAGGCTCTTCGAACA........................................................................................ 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGTGGATTTGACTACTTCTGAATTGAGCG.................................................................................................................................. 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGAGCGTGCTTTGGGCACTGGTAA................................................................................................................ 24 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................AGGACCTATGTGGATTTGACTACTTCTGA.......................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGGCACTGGTAAAGCACAAGGAAGGCTCT............................................................................................... 30 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGGAAGGCTCTTCGAACAAC...................................................................................... 20 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GAAGGCTCTTCGAACAACGAGTTTGAACT........................................................................... 29 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TACTTCTGAATTGAGCGTGCTTTG........................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TCAGAGAAGGGTTGTGCCATCTGTG.......................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGGGCACTGGTAAAGC............................................................................................................. 16 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GAGGGAATGGGATGTGCAGCCCCTCAGAGAAGGGTTGTGCCATCTGTGTCACACAGATGGGGTGTTGTTGTGCACTTGTTTCCAGGACCTATGTGGATTTGACTACTTCTGAATTGAGCGTGCTTTGGGCACTGGTAAAGCACAAGGAAGGCTCTTCGAACAACGAGTTTGAACTGAAGCTAGCATTTTCCTTTTAATAGGCTGAAACTCCCCGATCGTGGCCAGGAGACATAGAAGGAATTCTGCAGGC
...................................................................................................((.(((((((......((((...(((((.((.........)).)))))...)))).((((((.....))))))...)))).))))).................................................................
..............................................................................................95........................................................................................185...............................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
........................................................................................................................................AAAGCACAAGGAAGGCTCTTCGAACAAC...................................................................................... 28 2 2.00 2.00 - - 1.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................ACTGAAGCTAGCATTTTCCTTTTAATAcc................................................... 29 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................GGAGACATAGAAGGAATTCTGCAGGC 26 2 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................AAGCACAAGGAAGGCTCTTCGAACAACGA.................................................................................... 29 2 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CTCTTCGAACAACGAGTTTGAACTGAa......................................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CAAGGAAGGCTCTTCGAACAACcttt...................................................................................... 26 cttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................GTTGTTGTGCACTTGTTTCCAGGACCTA............................................................................................................................................................... 28 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - -
.................................................................................CCAGGACCTATGTGGATTTGACTACTTC............................................................................................................................................. 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGGGGTGTTGTTGTGCACTTGTTTCCAG..................................................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................AACAACGAGTTTGAACTGAAGCTAGCATT............................................................... 29 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCCCCGATCGTGGCCAGGAGACATA................. 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................GATGGGGTGTTGTTGTGCACTTGTTTCCAG..................................................................................................................................................................... 30 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TCCCCGATCGTGGCCAGGAGACATAGAA.............. 28 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CCCCGATCGTGGCCAGGAGACATAGAA.............. 27 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGGAAGGCTCTTCGAACAACGAGTTTGAA............................................................................. 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CGAACAACGAGTTTGAACTGAAGCTAGCA................................................................. 29 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AAAGCACAAGGAAGGCTCTTCGAACAA....................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................AGATGGGGTGTTGTTGTGCACTTGTTTC........................................................................................................................................................................ 28 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................AAGCTAGCATTTTCCTTTTAATAGGCTG.............................................. 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................ACTGAAGCTAGCATTTTCCTTTTAA..................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TTCTGAATTGAGCGTGCTTTGGGCACTG.................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
....................................................................................GGACCTATGTGGATTTGACTACTTCTGAA......................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................CTGAAGCTAGCATTTTCCTTTTAATA................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TATGTGGATTTGACTACTTCTGAATTGA..................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................AAAGCACAAGGAAGGCTCTTCGAACAACG..................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GGTGTTGTTGTGCACTTGTTTCCAGGACCTA............................................................................................................................................................... 31 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TCCAGGACCTATGTGGATTTGACTACTTC............................................................................................................................................. 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -
.....................................................................................GACCTATGTGGATTTGACTACTTCTGAA......................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CAACGAGTTTGAACTGAAGCTAGCA................................................................. 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GGTGTTGTTGTGCACTTGTTTCCAGGAC.................................................................................................................................................................. 28 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................GCTAGCATTTTCCTTTTAATAGGCTG.............................................. 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ATAGGCTGAAACTCCCCGATCGTGGCCA.......................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................GGGTGTTGTTGTGCACTTGTTTCCAGGACCTA............................................................................................................................................................... 32 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - -