Gene: Bola1

ID: uc008qmg.1_intron_0_0_chr3_96001203_r

SPECIES: mm9

chr3:96001153 96001522 -

(11) OTHER.mut

(3) OVARY

(8) PIWI.ip

(4) PIWI.mut

(1) TDRD1.ip

(42) TESTES

Sense strand

CGGTTGTTAGATCAAGCGGTGGTACAGCAGGCTGCGCAGCAAGTACAAAGGTACCACCCTAGGGTTCGGAGAGACGATAGGGCTCTGACTCAGCCAAAAGGACCAAGTTGTACATTTTCCATTTTTCAGCTCCCAGCCATGCTTTCCCAGTGCCCTTAGTGCCTAGCGCTCTGGCCGCTCAATCGCCTTTGTCTCTCCGCTACCGGCGTAGAAGCCGCGTTAACCCGCCACGCAGAGTAGAGGCGGTTCCAGGGTGTGCTTGTCTGGGGTGCGTGGGCAGGGTGTGTGGACTCAGTCCCGTGTCCTTCGTTTCTCCGCAGCGAATGCTAAGTGCGCGATCGGCCCAGTGCATGGTCTCCATGGCCACGCG .........................................................................(((((..((..((............))..))..))))).......((((......((((((((.((.((...(((.(((.((..(((((...)))))..)).)))..(((((((((((.((((.((.....(((......)))(((......)))..)).)))))))))))))))...)))...)).)).)))))).)))))).............................................................................................. ........................................................................73.........................................................................................................................................................................................................276............................................................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	mjTestesWT1() Testes Data. (testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)	GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)	SRR042486(GSM539878) mouse ovaries [09-002]. (ovary)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)	GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary)	SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)	SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)
.............................................................................TAGGGCTCTGACTCAGCCAAAAGGACC..........................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	32.00	32.00	-	2.00	10.00	-	2.00	10.00	-	1.00	-	-	-	1.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTAAGTGCGCGATCGGCCCAGTGC....................	26	1	20.00	20.00	-	6.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	4.00	-	1.00	-	1.00	1.00	-	1.00	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................................GTCTGGGGTGCGTGGcg............................................................................................	17	cg	19.33	5.67	0.67	-	-	0.33	2.33	-	8.33	4.67	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................................GTCTGGGGTGCGTGGcgg...........................................................................................	18	cgg	15.00	5.67	0.33	-	-	0.33	1.00	-	7.67	2.00	1.33	2.00	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTAAGTGCGCGATCGGCCCAGTG.....................	25	1	15.00	15.00	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	3.00	3.00	-	-	1.00	-	2.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................GGAGAGACGATAGGGCTCTGACTCAGCC...................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	10.00	10.00	9.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................AGAGACGATAGGGCTCTGACTCAGCCAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	9.00	9.00	4.00	-	1.00	-	2.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................ACGATAGGGCTCTGACTCAGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................	21	1	7.00	7.00	7.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................TAGGGTTCGGAGAGACGATAGGGC...............................................................................................................................................................................................................................................................................................	24	1	7.00	7.00	7.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................................GTCTGGGGTGCGTGGcggg..........................................................................................	19	cggg	6.33	5.67	-	-	-	0.33	1.33	-	1.67	2.00	0.33	0.33	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....GTTAGATCAAGCGGTGGTACAGCAGGCTGC...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	30	1	6.00	6.00	-	-	-	-	-	-	6.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TAGGGCTCTGACTCAGCCAAAAGGAC...........................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	6.00	6.00	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................................GTCTGGGGTGCGTGG..............................................................................................	15	3	5.67	5.67	-	-	-	0.33	2.33	-	1.67	-	1.00	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................TAGGGTTCGGAGAGACGATAGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................	23	1	5.00	5.00	4.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TAGGGCTCTGACTCAGCCAAAAGGACCA.........................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	5.00	5.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................GGAGAGACGATAGGGCTCTGACTCAGCCA..................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	5.00	5.00	2.00	-	-	1.00	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................TAGGGTTCGGAGAGACGATAGGGCTC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	5.00	5.00	-	1.00	-	-	-	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................AGAGACGATAGGGCTCTGACTCAGCC...................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	4.00	4.00	-	-	1.00	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTAAGTGCGCGATCGGCCCAGT......................	24	1	4.00	4.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TAGGGCTCTGACTCAGCCAAAAGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	4.00	4.00	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TGTTAGATCAAGCGGTGGTACAGCAGGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	4.00	4.00	-	-	-	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGTGCGCGATCGGCCCAGTGCATG.................	26	1	4.00	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TGTTAGATCAAGCGGTGGTACAGCAGG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	4.00	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...TTGTTAGATCAAGCGGTGGTACAGCAG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....GTTAGATCAAGCGGTGGTACAGCAGG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................GTGGTACAGCAGGCTGCGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	19	1	3.00	3.00	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGTGCGCGATCGGCCCAGTGCAT..................	25	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................TGTCTCTCCGCTACCGGCGTAGAAGC...........................................................................................................................................................	26	1	3.00	3.00	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................TCTGGCCGCTCAATCGCC.......................................................................................................................................................................................	18	1	3.00	3.00	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................TGACTCAGCCAAAAGGACCAAGTTGT...................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	3.00	3.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................................................................TCCAGGGTGTGCTTGTCTGGGGTGC..................................................................................................	25	1	2.00	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................TGCTTTCCCAGTGCCCTTAGTGCCTA.............................................................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-
.....................................................................................TGACTCAGCCAAAAGGACCAAGTTG....................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	2.00	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TTAGATCAAGCGGTGGTA..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	18	1	2.00	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................GGAGAGACGATAGGGCTCTGACTCAGCCAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................	30	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................TAGGGTTCGGAGAGACGATAGGGCTCT............................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	2.00	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TTAGATCAAGCGGTGGTACAGCAGGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTCCGCAGCGAATGCTAAGTGCGCG.................................	27	1	2.00	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................GGAGAGACGATAGGGCTCTGACTCAGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	2.00	2.00	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TGTTAGATCAAGCGGTGGTACAGCAG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................CAGCAGGCTGCGCAGCAAGTACAAAGG...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TAGGGCTCTGACTCAGCCAAAAGGACCAA........................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................TACCACCCTAGGGTTCGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................	19	1	2.00	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................TAGTGCCTAGCGCTCTGGCCGC................................................................................................................................................................................................	22	1	2.00	2.00	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCAGGGTGTGTGGACTCAGTCCCGTG....................................................................	29	1	2.00	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................CAAAGGTACCACCCTAGGGTTCGGAGA..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................AGGGTTCGGAGAGACGATA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-
..............................................................GGTTCGGAGAGACGATAGGGCTCTGACTC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TGTTAGATCAAGCGGTGGTACAGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................................................................TTCCAGGGTGTGCTTGTCTGGGGTG...................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................CAAAAGGACCAAGTTGTACATTTTCCATT.......................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................TAGGGTTCGGAGAGACGATAGGGatc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	atc	1.00	5.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTAAGTGCGCGATCGGCCCAGccc....................	26	ccc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................TGTCTCTCCGCTACCGGCGTAGAAGCCGCG.......................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................GTAGAAGCCGCGTTAACCCGCCACGC.........................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..GTTGTTAGATCAAGCGGTGGTACAGCA.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................TTTTTCAGCTCCCAGCCATGCT...................................................................................................................................................................................................................................	22	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................AGAGACGATAGGGCTCTGACTCAGCCA..................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........TCAAGCGGTGGTACAGCAGGCTGCGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................GGAGAGACGATAGGGCTCTGACTCAGt....................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	t	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................TAGAAGCCGCGTTAACCCGCCACGCc........................................................................................................................................	26	c	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................TTTGTCTCTCCGCTACCGGCGTAGAA.............................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTAAGTGCGCGATCGGCCCAagc.....................	25	agc	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAAGTGCGCGATCGGCCC.........................	18	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................CAGCAGGCTGCGCAGCAAGTACAAAGt...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................AAAAGGACCAAGTTGTACATTTTCCATT.......................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................TCGGAGAGACGATAGGGCTCTGACTCA......................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTCCCGTGTCCTTCGTTTCTCCGCA...................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTGCGCGATCGGCCCAGTGCATG.................	25	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTAAGTGCGCGATCGGCCCAGTGt....................	26	t	1.00	15.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................TGCTTTCCCAGTGCCCTTAGTGCCTc.............................................................................................................................................................................................................	26	c	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....GTTAGATCAAGCGGTGGTACAGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................GATAGGGCTCTGACTCAGCCAAAAGGAC...........................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................ACAAAGGTACCACCCTAGGGTTCGGAG...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TAGGGCTCTGACTCAGCCAAAAGGACt..........................................................................................................................................................................................................................................................................	27	t	1.00	6.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................CAGGCTGCGCAGCAAGTACAAAGGTACCA..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTAAGTGCGCGATCGGCCCAGTGCA...................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....TGTTAGATCAAGCGGTGGTACAGCAGGCTGCGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	33	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................TAGGGTTCGGAGAGACGATAGGGgtct............................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	gtct	1.00	5.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGGCCCAGTGCATGGTCTCCATGGCCAC...	29	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................ACAAAGGTACCACCCTAGGGTTCGGAGA..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................TTAGTGCCTAGCGCTCTGGCCGCTCA.............................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................CACCCTAGGGTTCGGAGAGACGcta...................................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	cta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................CAGCAGGCTGCGCAGCAAGTACAAAGGTA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................TAGTGCCTAGCGCTCTGGCCGCTCA.............................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......TAGATCAAGCGGTGGTACAGCAGGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......TAGATCAAGCGGTGGTACAGCAGGC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TAGGGCTCTGACTCAGCCAAAAGGAta..........................................................................................................................................................................................................................................................................	27	ta	1.00	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................GAGACGATAGGGCTCTGACTCAGCC...................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................TCAGCCAAAAGGACCAAGTTGTACATTTc............................................................................................................................................................................................................................................................	29	c	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................TCCCAGTGCCCTTAGTGCCTAGCGCTCT......................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................TCGGAGAGACGATAGGGCTCTGACTC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................ACCCTAGGGTTCGGAGA..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................	17	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................TAGTGCCTAGCGCTCTGGCCGCTCAATC..........................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................GATAGGGCTCTGACTCAGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................TTCCATTTTTCAGCTCCCAGCCATGCT...................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............CAAGCGGTGGTACAGCAGGCTGCG..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................TGACTCAGCCAAAAGGACCAAGT......................................................................................................................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................CCTAGGGTTCGGAGAGACGATAGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-
............................................................................................GCCAAAAGGACCAAGTTG....................................................................................................................................................................................................................................................................	18	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................TTTCCCAGTGCCCTTAGTGCCTAGCGCTC.......................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCCGCAGCGAATGCTAAGTGCGCGATC..............................	29	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTAAGTGCGCGATCGGCCCAGcg.....................	25	cg	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................GGGCTCTGACTCAGCCAAAAGGACCA.........................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................GGGTTCGGAGAGACGATAGGGCT..............................................................................................................................................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................CCTTTGTCTCTCCGCTACCGG....................................................................................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................AGGTACCACCCTAGGGTTCGGAGAGAC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................GGAGAGACGATAGGGCTCTGAC.........................................................................................................................................................................................................................................................................................	22	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCGTTTCTCCGCAGCGAA..............................................	19	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................GGAGAGACGATAGGGCTCTGACTCAG.....................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCAGCGAATGCTAAGTGCGCGATCG.............................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................TACAAAGGTACCACCCTAGGGTTCGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................TCTCTCCGCTACCGGCGTAGAAGCCGCGTT.....................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................TGCTTTCCCAGTGCCCTTAGTGCCTAG............................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................AGAGACGATAGGGCTCTGACTCAGC....................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................TTTCAGCTCCCAGCCATGCTTTCCC..............................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCTCCGCAGCGAATGCTAAGTGCGCG.................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..GTTGTTAGATCAAGCGGTGGTACAGCAG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TAGGGCTCTGACTCAGCCAAAAGGACCAAGT......................................................................................................................................................................................................................................................................	31	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................CCTAGGGTTCGGAGAGACGA.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................	20	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TAGGGCTCTGACTCAGCCAAAAGGACCAAGTT.....................................................................................................................................................................................................................................................................	32	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................CCTAGGGTTCGGAGAGACGATAGGGCTCTG...........................................................................................................................................................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........TCAAGCGGTGGTACAGCAGGCT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	22	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-
............................AGGCTGCGCAGCAAGTA.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	17	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................................GTCTGGGGTGCGTGGct............................................................................................	17	ct	0.33	5.67	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.33	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Antisense strand

CGGTTGTTAGATCAAGCGGTGGTACAGCAGGCTGCGCAGCAAGTACAAAGGTACCACCCTAGGGTTCGGAGAGACGATAGGGCTCTGACTCAGCCAAAAGGACCAAGTTGTACATTTTCCATTTTTCAGCTCCCAGCCATGCTTTCCCAGTGCCCTTAGTGCCTAGCGCTCTGGCCGCTCAATCGCCTTTGTCTCTCCGCTACCGGCGTAGAAGCCGCGTTAACCCGCCACGCAGAGTAGAGGCGGTTCCAGGGTGTGCTTGTCTGGGGTGCGTGGGCAGGGTGTGTGGACTCAGTCCCGTGTCCTTCGTTTCTCCGCAGCGAATGCTAAGTGCGCGATCGGCCCAGTGCATGGTCTCCATGGCCACGCG .........................................................................(((((..((..((............))..))..))))).......((((......((((((((.((.((...(((.(((.((..(((((...)))))..)).)))..(((((((((((.((((.((.....(((......)))(((......)))..)).)))))))))))))))...)))...)).)).)))))).)))))).............................................................................................. ........................................................................73.........................................................................................................................................................................................................276............................................................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	mjTestesWT1() Testes Data. (testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)	GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)	SRR042486(GSM539878) mouse ovaries [09-002]. (ovary)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)	GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary)	SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)	SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)
............................................................................................................................................GCTTTCCCAGTGCCCTTAGTGCCTA.............................................................................................................................................................................................................	25	1	11.00	11.00	-	1.00	2.00	8.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTCCCGTGTCCTTCGTTTCTCCGCA...................................................	27	1	10.00	10.00	9.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................GCCAAAAGGACCAAGTTGTACATTTTCCA.........................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	8.00	8.00	-	-	3.00	1.00	3.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................GCCTAGCGCTCTGGCCGCTCAATCGCC.......................................................................................................................................................................................	27	1	6.00	6.00	6.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................TCCATTTTTCAGCTCCCAGCCATGCTT..................................................................................................................................................................................................................................	27	1	6.00	6.00	6.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................TCCCAGCCATGCTTTCCCAGTGCCCTTA....................................................................................................................................................................................................................	28	1	6.00	6.00	4.00	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGACTCAGTCCCGTGTCCTTCGTTT..........................................................	28	1	5.00	5.00	5.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGTGTCCTTCGTTTCTCCGCAGCGAA..............................................	27	1	4.00	4.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................CCAAGTTGTACATTTTCCATTTTTCA..................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	3.00	3.00	-	-	1.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................ATTTTTCAGCTCCCAGCCA.......................................................................................................................................................................................................................................	19	1	3.00	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACTCAGTCCCGTGTCCTTCGTTTCTC.......................................................	27	1	3.00	3.00	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................CCAAAAGGACCAAGTTGTACATTTTCCA.........................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................TCCATTTTTCAGCTCCCAGCCATGC....................................................................................................................................................................................................................................	25	1	3.00	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AATGCTAAGTGCGCGATCGGC...........................	21	1	3.00	3.00	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................................GCCACGCAGAGTAGAGGCGGTTCCA.......................................................................................................................	25	1	3.00	3.00	-	-	1.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCGTGTCCTTCGTTTCTCCGCAGCGAA..............................................	28	1	3.00	3.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGTGTCCTTCGTTTCTCCGCAGCGA...............................................	26	1	2.00	2.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTCCCGTGTCCTTCGTTTCT........................................................	22	1	2.00	2.00	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................TGGCCGCTCAATCGCCTTTGTCTCTCCG...........................................................................................................................................................................	28	1	2.00	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCGTTTCTCCGCAGCGA...............................................	18	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTTCGTTTCTCCGCAGCGA...............................................	21	1	2.00	2.00	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................GCCGCTCAATCGCCTTTGTCT................................................................................................................................................................................	21	1	2.00	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................GCCGCTCAATCGCCTTTGTCTCTCCG...........................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACTCAGTCCCGTGTCCTTCGTTTCTCC......................................................	28	1	2.00	2.00	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................CAGCCATGCTTTCCCAGTGCCCTTAaaa....................................................................................................................................................................................................................	28	aaa	2.00	0.00	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTAAGTGCGCGATCGGCCCAGTGCA...................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................TACATTTTCCATTTTTCAGCTCCCAGCCA.......................................................................................................................................................................................................................................	29	1	2.00	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................AGCCATGCTTTCCCAGTGCCCTTA....................................................................................................................................................................................................................	24	1	2.00	2.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................CCATGCTTTCCCAGTGCCCTTA....................................................................................................................................................................................................................	22	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................CCAGCCATGCTTTCCCAGTGCCCTTA....................................................................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................CAAAGGTACCACCCTAGGGTTCGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	2.00	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................CAGCCATGCTTTCCCAGTGCCCTTA....................................................................................................................................................................................................................	25	1	2.00	2.00	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................GCCTTTGTCTCTCCGCTACCGGCGTA................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................AGAAGCCGCGTTAAcgtc...................................................................................................................................................	18	cgtc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00
.......................................................................................................CAAGTTGTACATTTTCCATTTTTCA..................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGTGTCCTTCGtgtt.............................................................	16	tgtt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGTCCTTCGTTTCTCCGCAGCGAA..............................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCGATCGGCCCAGTGCATGGTCTCCA..........	28	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................GCCATGCTTTCCCAGTGCCCTTA....................................................................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................CCCAGCCATGCTTTCCCAGTGCCCTTA....................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................AAGTTGTACATTTTCCATTTTTCA..................................................................................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................CATGCTTTCCCAGTGCCCTTAGTGCCTA.............................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................AGCCAAAAGGACCAAGTTGTACATTTTCCA.........................................................................................................................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................CCGCTCAATCGCCTTTGTCTCTCCGCTA........................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................AGTTGTACATTTTCCATTTTTCAGCTCC.............................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................CCAGCCATGCTTTCCCAGTGCCCTTAtt....................................................................................................................................................................................................................	28	tt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................CCACGCAGAGTAGAGGCGGT...........................................................................................................................	20	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................GGACCAAGTTGTACATTTTCCATTTTT....................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................TCAGCTCCCAGCCATGCTTTCCCA.............................................................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................CCATTTTTCAGCTCCCAGCCATGCTTt..................................................................................................................................................................................................................................	27	t	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................CCACCCTAGGGTTCGGAGAGACGATA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................GACCAAGTTGTACATTTTCCATTTTTCA..................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................TACCACCCTAGGGTTCGGAGAGACGATA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................GCCTAGCGCTCTGGCCGCTCAATCGCCT......................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................CCAGCCATGCTTTCCCAGTGCCCTTAGT..................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................CGCCTTTGTCTCTCCGCTACCGGCGTA................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................TCTGACTCAGCCAAAAGGA............................................................................................................................................................................................................................................................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................................CCGCCACGCAGAGTAGAGGCGGTTCCA.......................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................TGTACATTTTCCATTTTTCAGCTCCCA...........................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................CGCTCAATCGCCTTTGTCTCTC.............................................................................................................................................................................	22	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................CCAGCCATGCTTTCCCAGTGCCCTTAa....................................................................................................................................................................................................................	27	a	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................GGACCAAGTTGTACATTTTCCATTTTTCA..................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................GCCAAAAGGACCAAGTTGTACATTTTCCAT........................................................................................................................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATGGTCTCCATGGCCACGCG	21	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGTCCTTCGTTTCTCCGCAGCGA...............................................	25	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGTGTCCTTCGTTTCTCCGCAGCGAAa..............................................	28	a	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................GGAGAGACGATAGGGCTCTGACTCAGCCA..................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................GCCAAAAGGACCAAGTTGTACATTTTCC..........................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGTTTCTCCGCAGCGA...............................................	16	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................CATTTTCCATTTTTCAGCTCCCAcaca...........................................................................................................................................................................................................................................	27	caca	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................CAGCAGGCTGCGCAGCAAGTACAAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................CAGCCATGCTTTCCCAGTGCCCTTAata....................................................................................................................................................................................................................	28	ata	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................CGCAGCAAGTACAAAGGTACCACCCTAa.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	a	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................CCTTTGTCTCTCCGCTA........................................................................................................................................................................	17	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................AGCCAAAAGGACCAAGTTGTACATTTTCC..........................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................GGACTCAGTCCCGTGTCCTTCGTTTCT........................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................GGTACCACCCTAGGGTTCGGAGAGACGA.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................CATTTTCCATTTTTCAccca..................................................................................................................................................................................................................................................	20	ccca	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................CATTTTTCAGCTCCCAGCCATGC....................................................................................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................................GCCACGCAGAGTAGAGGCGGT...........................................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCCTTCGTTTCTCCGCA...................................................	20	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................GCGTTAACCCGCCACGCAGAGTAGA.................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................ACCAAGTTGTACATTTTCCA.........................................................................................................................................................................................................................................................	20	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................CCAAGTTGTACATTTTCCAT........................................................................................................................................................................................................................................................	20	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-