(8)
OTHER.mut
(5)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(27)
TESTES

Sense strand
GAAACACCACAGTACAATCGTCTACCATTGGATGAAGTGGCTCCGGAGATGTGAGTGTGGGGGCGACTAGGAAGGGGGAGGCTGGAGAGATGGAGAAAATGCGGCCCCCAAAACACTCTGGGGTTTGCCCACCGAGCTGCTGCATTCAGTTGGGGTTCACATTAAAGATCGGGCGCGAGTGTTCCCTAGCCCAGACTCCATCCTAGGCACGGTTGCCCTGCTCTGCAGGGGGCTCATTGCTTGGAATTTT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
..................................................................................................................................ACCGAGCTGCTGCATTCAG..................................................................................................... 19 1 7.00 7.00 - - - - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TACCATTGGATGAAGTGGCTCCGGA........................................................................................................................................................................................................... 25 1 6.00 6.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TACCATTGGATGAAGTGGCTCCGGAG.......................................................................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TACCATTGGATGAAGTGGCTCCGGAGA......................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TAGGAAGGGGGAGGCTGGAGAGATG.............................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGATGAAGTGGCTCCGGAGATctac.................................................................................................................................................................................................... 26 ctac 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
....................TCTACCATTGGATGAAGTGGCTCCGG............................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGGAGAGATGGAGAAAATGCGGCCCC.............................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TAAAGATCGGGCGCGAGTGTTCCCT............................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGATGAAGTGGCTCCGGAGATGTG..................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
............................TGGATGAAGTGGCTCCGGAGATGTGAG................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................ATGAAGTGGCTCCGGAGAT........................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TAGGAAGGGGGAGGCTGGAGAGATGGAG........................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TACAATCGTCTACCATTGGATGAAGTGGC................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TTGGATGAAGTGGCTCCGGAGATGTGt.................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TTAAAGATCGGGCGCGAGTGTTCCC................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................GTCTACCATTGGATGAAGTGGCTCCGGA........................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GATGAAGTGGCTCCGGAGATt....................................................................................................................................................................................................... 21 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TTCACATTAAAGATCGGGCGCG......................................................................... 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GATGAAGTGGCTCCGGAGATc....................................................................................................................................................................................................... 21 c 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGATGAAGTGGCTCCGGAGATcta..................................................................................................................................................................................................... 25 cta 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CAGTTGGGGTTCACATTAAAGATCGGGC............................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
........................CCATTGGATGAAGTGGCTCCGGA........................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TGCATTCAGTTGGGGTTCACATTAta.................................................................................... 26 ta 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................ACCATTGGATGAAGTGGCTCCGGA........................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TACAATCGTCTACCATTGGATGAAttg................................................................................................................................................................................................................... 27 ttg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AGTTGGGGTTCACATTAAAGA.................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGCTGCATTCAGTTGGGGTTCACATT....................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................TTGGATGAAGTGGCTCCGG............................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGATGAAGTGGCTCCGGAGATGTGAGT.................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGGGGGCGACTAGGAAGGGGGAGG......................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................GCGACTAGGAAGGGGGAGGCTGG..................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGATGAAGTGGCTCCGGAGA......................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.......................................GCTCCGGAGATGTGAGTG................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
......................TACCATTGGATGAAGTGGCTCCGGAcgc........................................................................................................................................................................................................ 28 cgc 1.00 6.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CATTAAAGATCGGGCGCGAG....................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGATGAAGTGGCTCCGGAGATc....................................................................................................................................................................................................... 23 c 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGGATGAAGTGGCTCCGGAGATGTGA.................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GAAACACCACAGTACAATCGTCTACCATTGGATGAAGTGGCTCCGGAGATGTGAGTGTGGGGGCGACTAGGAAGGGGGAGGCTGGAGAGATGGAGAAAATGCGGCCCCCAAAACACTCTGGGGTTTGCCCACCGAGCTGCTGCATTCAGTTGGGGTTCACATTAAAGATCGGGCGCGAGTGTTCCCTAGCCCAGACTCCATCCTAGGCACGGTTGCCCTGCTCTGCAGGGGGCTCATTGCTTGGAATTTT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
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Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
........................................................................................................................................CTGCTGCATTCAGTTGGGGTTCACATTA...................................................................................... 28 1 14.00 14.00 3.00 7.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GCTGCTGCATTCAGTTGGGGTTCACATTA...................................................................................... 29 1 9.00 9.00 4.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - -
..AACACCACAGTACAATCGTCTACCA............................................................................................................................................................................................................................... 25 1 7.00 7.00 - 2.00 1.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGCTGCATTCAGTTGGGGTTCACATTAA..................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................GTTCCCTAGCCCAGACTCCATCCTA............................................. 25 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......CCACAGTACAATCGTCTACCATTGGA.......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGCTGCATTCAGTTGGGGTTCACATTA...................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................TCCCTAGCCCAGACTCCATCCTA............................................. 23 1 3.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CACCACAGTACAATCGTCTACCATTGGA.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................CGAGCTGCTGCATTCAGTTGGGGTTCACA......................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..............................................................................................................................................................................GCGAGTGTTCCCTAGCCCAGACTCCA.................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...ACACCACAGTACAATCGTCTACCA............................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GCGCGAGTGTTCCCTAGCCCA......................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CCGAGCTGCTGCATTCAGTTGGGGTTCA........................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CCAGACTCCATCCTAGGCACGGTTGCCC................................ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTGTGGGGGCGACTAGGAAGG............................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GCATTCAGTTGGGGTTCACATTAAAGA.................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................CGAGCTGCTGCATTCAGTTGGGGTTCACAT........................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................CATCCTAGGCACGGTTGCCCT............................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GAGCTGCTGCATTCAGTTGGGGTTCACA......................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GAGCTGCTGCATTCAGTTGGGGTTCACAa......................................................................................... 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................CGAGCTGCTGCATTCAGTTGGGGTTCA........................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................CAGACTCCATCCTAGGCACGGTTG................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
......CCACAGTACAATCGTCTACCATTGGATGA....................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CCACAGTACAATCGTCTACCAggtt............................................................................................................................................................................................................................... 25 ggtt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CTGCTGCATTCAGTTGGGGTTCACATTAAAGA.................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CAGTACAATCGTCTACCATTGGATG........................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................TCTACCATTGGATGAAGTGGCTCCGGA........................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGCTGCATTCAGTTGGGGTTCACATTAAA.................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GCATTCAGTTGGGGTTCACATTAAAGATC................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................CAGTTGGGGTTCACATTAAAGATC................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
........TACAATCGTCTACCtagt................................................................................................................................................................................................................................ 18 tagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.............................................................................................................................................GCATTCAGTTGGGGTTCACATT....................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GCTGCATTCAGTTGGGGTTCACATTAAA.................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................GTGTTCCCTAGCCCAGACTCCATCCTA............................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GCCCACCGAGCTGCTGCATTCAGTTG.................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CACAGTACAATCGTCTACCATTGGAttg.......................................................................................................................................................................................................................... 28 ttg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................ATCCTAGGCACGGTTGCCCTGCTCTt.......................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGATCGGGCGCGcgc......................................................................... 15 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..............................................................GCGACTAGGAAGGGGGAG.......................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................CTAGCCCAGACTCCA.................................................. 15 11 0.09 0.09 - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -