chr3:94305144 94305393 -
(1)
OTHER.ip 		(10)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(50)
TESTES

Sense strand
TTATCTCTTTTGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTAAATATTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGCGGCTGTGTTGGCTTGGGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGTGCTGCTCCCATCGTGTCGGAGGGTTGTCTCCAGATCGGAGGCCCTGCTGCTCCTCAGTAACTCTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTCAGAATATTTTCCAGATGGCGAGGTCACAGCAGAGGGATGTGGCCACCTAGCC
..................................................((((((........))).))).((((((((...(((((....)))))....)))))))).............................................................................................................................................
..................................................51..........................................................111.........................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGG.................................................................................................................................................................................................................... 26 1 131.00 131.00 39.00 23.00 12.00 14.00 11.00 - 1.00 2.00 4.00 4.00 6.00 - 5.00 - 1.00 1.00 2.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGC............................................................................................................................................... 26 1 61.00 61.00 21.00 20.00 9.00 1.00 5.00 - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGCGC............................................................................................................................................. 28 1 61.00 61.00 15.00 12.00 12.00 7.00 8.00 - 1.00 - - - - 4.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGT................................................................................................................................................................................................................... 27 1 49.00 49.00 13.00 6.00 2.00 10.00 1.00 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 2.00 - - - 3.00 - 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTG.......................................................................................................................................... 25 1 34.00 34.00 10.00 4.00 4.00 1.00 - 2.00 7.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTA.................................................................................................................................................................................................................. 28 1 24.00 24.00 5.00 4.00 - 4.00 1.00 1.00 2.00 - - - - - 4.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGT......................................................................................................................................... 26 1 22.00 22.00 6.00 5.00 - 1.00 3.00 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTG..................................................................................................................................................................................................................... 25 1 20.00 20.00 1.00 3.00 2.00 1.00 4.00 - - 2.00 2.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
............................................TTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGCGGC................................................................................................................................................................................... 27 1 16.00 16.00 3.00 - 2.00 1.00 1.00 - - 1.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..........TGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTG..................................................................................................................................................................................................................... 27 1 16.00 16.00 6.00 2.00 1.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGT........................................................................................................................................... 30 1 14.00 14.00 - - - 2.00 - - - - - - - 7.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TTGGCTTGGGATTGTTGAATCCGGTT..................................................................................................................................................... 26 1 13.00 13.00 3.00 2.00 2.00 1.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAAATATTCAGAGTCCTCTGTGATGTG......................................................................................................................................................................................... 27 1 13.00 13.00 - - - - - 6.00 - 5.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGCGGC................................................................................................................................................................................... 29 1 11.00 11.00 4.00 - 1.00 1.00 - - - - - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..........................................................................................TGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGTGCT...................................................................................................................................... 26 1 11.00 11.00 5.00 2.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.................................................................................TGGGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGCG.............................................................................................................................................. 27 1 10.00 10.00 6.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGCGG.................................................................................................................................................................................... 28 1 9.00 9.00 3.00 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TTGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTG..................................................................................................................................................................................................................... 28 1 7.00 7.00 - - 1.00 3.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGTGCTGC.................................................................................................................................... 28 1 7.00 7.00 - - - - - - 3.00 - - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGt.................................................................................................................................................................................................................... 26 t 7.00 20.00 5.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGCTTGGGATTGTTGAATCCGGTTG.................................................................................................................................................... 26 1 7.00 7.00 5.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGCGGC................................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
......................................................................................TTGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTG.......................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - 1.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTAA................................................................................................................................................................................................................. 26 1 6.00 6.00 3.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTAAA................................................................................................................................................................................................................ 30 1 5.00 5.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TATTTTCCAGATGGCGAGGTCACAGC...................... 26 1 5.00 5.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCCAGATGGCGAGGTCACAGCAGAGG................. 26 1 5.00 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGG.................................................................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - 2.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGTGC....................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 1.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGCTTGGGATTGTTGAATCCGGTT..................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - 2.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................ATGTGAGCGGCTGTGTTGGCTTGGGAT................................................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TGTGATGTGAGCGGCTGTGTTGGCTT........................................................................................................................................................................ 26 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCCCATCGTGTCGGAGGGTTGTCTCCAGA....................................................................................................... 29 1 4.00 4.00 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGaa.................................................................................................................................................................................................................. 28 aa 4.00 131.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................TCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGCGG.................................................................................................................................................................................... 25 1 4.00 4.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGTGCTG..................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TTGGGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGC............................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TGGTAAATATTCAGAGTCCTCTGTGATG........................................................................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TGAGCCAGGTGGTAAATATTCAGAGTCCT................................................................................................................................................................................................... 29 1 4.00 4.00 - - - - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGTGAGCGGCTGTGTTGGCTTGGGAT................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGTGTTGGCTTGGGATTGTTGAATCC......................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGC...................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........TGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGt.................................................................................................................................................................................................................... 28 t 3.00 16.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TGCTCCCATCGTGTCGGAGGGTTGTC............................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
.................GAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTAAATATT............................................................................................................................................................................................................ 29 1 3.00 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTAA................................................................................................................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGT...................................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00
.....................................................................................................................CTCCCATCGTGTCGGAGGGTTGTCTCC.......................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGCG..................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTt.................................................................................................................................................................................................................. 28 t 3.00 49.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AATATTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGC...................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGCGG.................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TGAGCCAGGTGGTAAATATTCAGAGTCCTC.................................................................................................................................................................................................. 30 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AAAGACTGAGCCAGGTGGTAAATATTC........................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............AAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTA.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGTG........................................................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCC.......................................................................................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TATTTTCCAGATGGCGAGGTCAC......................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGTGt....................................................................................................................................... 25 t 2.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGg................................................................................................................................................................................................................... 27 g 2.00 131.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGTTGGCTTGGGATTGTTGAATCCGGTT..................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCCCATCGTGTCGGAGGGTTGTCTCCAGATC..................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.........................................................GTGATGTGAGCGGCTGTGT.............................................................................................................................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TTGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGG....................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TATTTTCCAGATGGCGAGGTCACAGCAGA................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCG............................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTG.......................................................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCAGCGCGTGTGCTGCTCCCATCGTG.......................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGT................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCCCATCGTGTCGGAGGGTTGTCTCCAGAT...................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................AAATATTCAGAGTCCTCTGTGATGTG......................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................GGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGCGC............................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TATTTTCCAGATGGCGAGGTCACAG....................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TCTGTGATGTGAGCGGCTGTGTTGGC.......................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAAATATTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGC...................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TTTGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGG....................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TTTTGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTG..................................................................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTAt................................................................................................................................................................................................................. 29 t 2.00 24.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTAAAT............................................................................................................................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TCTCTTTTGTAAAAGAGAAAGACTGAGCC.......................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................ATTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGCGG.................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AATATTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGCG..................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGTTGAATCCGGTTGTCAGCGagcg.......................................................................................................................................... 25 agcg 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................AATATTCAGAGTCCTCTGTGATGTGA........................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................ATTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAG....................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCaa........................................................................................................................................... 30 aa 1.00 61.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............AAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGT................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGata.................................................................................................................................................................................................................. 28 ata 1.00 20.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCCCATCGTGTCGGAGGGTTGTCTCCAGATta.................................................................................................... 32 ta 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGCGcg................................................................................................................................................................................... 27 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................GGCTTGGGATTGTTGAATCCGGTTGTC.................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGt............................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTTCAGAATATTTTCCAGATGGCGAGG............................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................AGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTAAAT............................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TTCCTTTCAGAATATTTTCCAGATGGCGAG.............................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGTTGAATCCGGTTGTCAGC............................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ATCCGGTTGTCAGCGCGTGTGCTGCTCC................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCACAGCAGAGGGATGTGGCCAtga.... 25 tga 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CTCTTTTGTAAAAGAGAAAGACTGAGCC.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGT......................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTCCAGATGGCGAGGTCACAGCAGAG.................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................GTAAATATTCAGAGTCCTCTGTGATGTG......................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TTGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGt.................................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAAATATTCAGAGTCCTCTGTGATGT.......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TGAGCCAGGTGGTAAATATTCAGAGTC..................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TTTTGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAG........................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTAAt................................................................................................................................................................................................................ 30 t 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGGATTGTTGAATCCGGTTG.................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GGGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGT........................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................AGAGTCCTCTGTGATGTGAGCGGCT.................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................GAAAGACTGAGCCAGGTGGTAAATATT............................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGTG........................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................GAGTCCTCTGTGATGTGAGCGGCTGg................................................................................................................................................................................ 26 g 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGT......................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGCGa.................................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................GTGTCGGAGGGTTGTCTCCAGATC..................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
......................................................TCTGTGATGTGAGCGGCTGTGTTGG........................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TCAGAATATTTTCCAGATGGCGAGG............................. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TGAGCCAGGTGGTAAATATTCAGAGTCCTCT................................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............AAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGG.................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGcgc.................................................................................................................................................................................................................... 26 cgc 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAAATATTCAGAGTCCTCTGTGATG........................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TTTGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGt.................................................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGa........................................................................................................................................... 30 a 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GAATATTTTCCAGATGGCGAGGTCACAGC...................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGGATTGTTGAATCCGGTTcagc................................................................................................................................................. 24 cagc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGTGC....................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCCCATCGTGTCGGAGGGTTGTCTCCAGATt..................................................................................................... 31 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TGGTAAATATTCAGAGTCCTCTGTGAT............................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTAAAT............................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGTGTTGGCTTGGGATTGTTGAATCCG........................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGG....................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TATTTTCCAGATGGCGAGGTCACAGCA..................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTag.................................................................................................................................................................................................................... 26 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCCTTTCAGAATATTTTCCAGATGGCGAGt............................. 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TATTTTCCAGATGGCGAGG............................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTCCAGATGGCGAGGTCACAGCAGAGt................. 27 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TCTCTTTTGTAAAAGAGAAAGACTGAGa........................................................................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TTTTTCCTTTCAGAATATTT........................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TGAGCCAGGTGGTAAATATTCAGt........................................................................................................................................................................................................ 24 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCCCATCGTGTCGGAGGGTTGTCTCCtgt....................................................................................................... 29 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCCTTTCAGAATATTTTCCAGATGGCGA............................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTa.......................................................................................................................................... 25 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGTGTTGGCTTGGGATTGTTGAATCCGG....................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..........................................TATTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGCGGCT.................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................CTCCCATCGTGTCGGAGGGTTGTCTC........................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGAATCCGGTTGTCAGCGCG............................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGCccgt........................................................................................................................................... 30 ccgt 1.00 61.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GTCGGAGGGTTGTCTCCAGATCGGAG................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGG....................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TTCAGAATATTTTCCAGATGGCGAGGT............................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGTTGGCTTGGGATTGTTGAATCCG........................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCatgt......................................................................................................................................... 26 atgt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCCCATCGTGTCGGAGGGTTGTCT............................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGGCTTGGGATTGTTGAATCCGGTTGTCA................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGTTGGCTTGGGATTGTTGAATCCGGT...................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TTGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGT................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGTGCT...................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAG........................................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGTG........................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................AGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTAAATA.............................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................TAAATATTCAGAGTCCTCTGTGATGc.......................................................................................................................................................................................... 26 c 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................GTTGGCTTGGGATTGTTGAATCCGGTT..................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGcgg.................................................................................................................................................................................................................... 26 cgg 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGTGAGCGGCTGTGTTGGCTTGGGtt................................................................................................................................................................... 26 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTA.................................................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGgg.......................................................................................................................................... 26 gg 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGagg.................................................................................................................................................................................................................... 26 agg 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................GAAAGACTGAGCCAGGTGGgt.................................................................................................................................................................................................................. 21 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TCCAGATGGCGAGGTCACAGCAGAGGGATttt........... 32 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTAAATAT............................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TCCTTTCAGAATATTTTCCAGATGGCGAGG............................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................ATGGCGAGGTCACAGCAGAGGGATGT............ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGTaa....................................................................................................................................... 28 aa 1.00 22.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCCCATCGTGTCGGAGGGTTG............................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...TCTCTTTTGTAAAAGAGAAAGAC................................................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AAAGACTGAGCCAGGTGGT................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGc................................................................................................................................................................................................................... 27 c 1.00 131.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTAAA................................................................................................................................................................................................................ 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TATTTTCCAGATGGCGAGGTCACAGCAG.................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCACAGCAGAGGGATGTGGCCACCTtt.. 27 tt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGa................................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 131.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TTTTCCTTTCAGAATATTTTCCAGATGGCt................................ 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TTGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGTGt....................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TATTTTCCAGATGGCGAGGTCACAtc...................... 26 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................GAGGGATGTGGCCACCTA... 18 10 0.10 0.10 - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TTATCTCTTTTGTAAAAGAGAAAGACTGAGCCAGGTGGTAAATATTCAGAGTCCTCTGTGATGTGAGCGGCTGTGTTGGCTTGGGATTGTTGAATCCGGTTGTCAGCGCGTGTGCTGCTCCCATCGTGTCGGAGGGTTGTCTCCAGATCGGAGGCCCTGCTGCTCCTCAGTAACTCTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTCAGAATATTTTCCAGATGGCGAGGTCACAGCAGAGGGATGTGGCCACCTAGCC
..................................................((((((........))).))).((((((((...(((((....)))))....)))))))).............................................................................................................................................
..................................................51..........................................................111.........................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
.............................................................................................................................................................TGCTCCTCAGTAACTaga........................................................................... 18 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TCAGAGTCCTCTGTggca............................................................................................................................................................................................... 18 ggca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -