chr3:94239019 94239268 -
(1)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(1)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(47)
TESTES

Sense strand
TCAATTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTCTAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGACCTGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAATCTGCCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCATGCGCCACCACGACCAGCTAATTTTATTTCTTTTCCAGGCTGGGAACCTGACAGTGCTATCAACTGACCCCCTGCTTCACCAAGATCC
.............................................................................(((((((.((((.....(((((.(((((.((..((.......)).)).)))))..))))).....)))).)))))))....(((....)))..................................................................................
............................................................................77.....................................................................................................180....................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGC............................................................................................................................................. 28 3 9.67 9.67 - 0.33 0.67 - 2.00 - 0.33 1.33 1.67 - - - - - - - - 0.67 - 0.67 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - 0.33
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCT........................................................................................................................................... 30 3 8.33 8.33 - - - - 2.00 - - 2.33 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 0.33 - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCC............................................................................................................................................ 29 3 7.67 7.67 - 0.33 - - 1.67 - - 4.00 0.67 - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTC.......................................................................................................................................... 31 3 6.33 6.33 - - - - 2.67 - - 1.67 0.67 - - - - - - - - 0.33 - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTt.......................................................................................................................................... 31 t 5.67 8.33 - - - - 2.67 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGG.............................................................................................................................................. 27 3 5.00 5.00 - - - - - - 0.33 1.67 0.33 - - - - - - - - 0.67 - 0.67 - - - - - - - 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - 0.33 0.33 - -
....................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCGCCACCACGAt.......................................................................... 28 t 5.00 0.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTa.......................................................................................................................................... 31 a 4.33 8.33 - - - - 1.00 - - - 2.67 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GTAGATCAGGCTGGCCTCGAtt...................................................................................................................................... 22 tt 4.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGTAGATCAGGCTGGCCTCGAAta..................................................................................................................................... 24 ta 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCGCCAatc.............................................................................. 24 atc 2.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TTTCTCTGTGTAGACCTGGCTGTaaaa....................................................................................................................................................................... 27 aaaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCGCCAaaaa............................................................................. 25 aaaa 2.00 0.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAAaa..................................................................................................................................... 25 aa 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCGCCACCACGAaa......................................................................... 29 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................CCCTGCTTCACCAAGATCC 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................CAGGCTGGCCTCGAACTCAGAATag............................................................................................................................. 25 ag 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAAgtat................................................................................................................................... 27 gtat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGTAGATCAGGCTGGCCaaa......................................................................................................................................... 21 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TTTCTCTGTGTAGACCTGGCTGTata........................................................................................................................................................................ 26 ata 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTCTCTGTGTAGACCTGGCTGTCCTGGAAga.................................................................................................................................................................. 31 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGTAGATCAGGCTGGaa............................................................................................................................................ 18 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................GCTGGGATTAAAGGCATGCGCCAaaa.............................................................................. 26 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCGCCACatt............................................................................. 25 att 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCGCCACattg............................................................................ 26 attg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAACTata.................................................................................................................................. 29 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................CTGGGATTAAAGGCATGCGCCACCACGAaa......................................................................... 30 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................TTTCTCTGTGTAGACCTGGCTGTaata....................................................................................................................................................................... 27 aata 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCGCCACaaaa............................................................................ 26 aaaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCGCCACCACGtt.......................................................................... 28 tt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAAaaa.................................................................................................................................... 26 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TAGATCAGGCTGGCCTCGAttt..................................................................................................................................... 22 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTG............................................................................................................................................... 26 3 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - -
..................................................................TAGACCTGGCTGTCCTGGgt.................................................................................................................................................................... 20 gt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAt....................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTtt......................................................................................................................................... 32 tt 1.00 8.33 - - - - - - - 0.67 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ATCAACTGACCCCCTGCTTCACCAAGATC. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TCTCTGTGTAGACCTGGCTGgcca........................................................................................................................................................................ 24 gcca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CTCGAACTCAGAATCTGCCTaaa...................................................................................................................... 23 aaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................GGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGt.............................................................................................................................................. 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAAa...................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAAaaca................................................................................................................................... 27 aaca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TCTGTGTAGACCTGGCTGTCCTGGgaa................................................................................................................................................................... 27 gaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCAATTTGTAGATCAGGCTtgt............................................................................................................................................. 22 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................................................................................TTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGttt............................................................................................................................... 32 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGTAGATCAGGCTGtcta........................................................................................................................................... 19 tcta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TCGAACTCAGAATCTGCCTaaa...................................................................................................................... 22 aaa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GGATTAAAGGCATGCGCCACCACGAaa......................................................................... 27 aa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................CTCTGTGTAGACCTGGCTGTCata....................................................................................................................................................................... 24 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................CTGGGAACCTGACAGcttc.............................. 19 cttc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TTTTCTAGACAGGGTTTCTCTttga....................................................................................................................................................................................... 25 ttga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCGCCAatta............................................................................. 25 atta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAAatca................................................................................................................................... 27 atca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGTAGATCAGGCTGGCCaga......................................................................................................................................... 21 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCGCCACattt............................................................................ 26 attt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCGCCAatt.............................................................................. 24 att 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCAATTTGTAGATCAGGCTGGC............................................................................................................................................. 22 13 0.77 0.77 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - 0.08 - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.38 -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCT................................................................................................................................................ 25 4 0.75 0.75 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTG............................................................................................................................................... 27 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCttt.......................................................................................................................................... 31 ttt 0.67 9.67 - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTCt......................................................................................................................................... 32 t 0.67 6.33 - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCC............................................................................................................................................ 30 3 0.67 0.67 - - - - 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................CCTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGG.............................................................................................................................................. 29 3 0.67 0.67 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGC............................................................................................................................................. 29 3 0.67 0.67 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGG.............................................................................................................................................. 28 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCa............................................................................................................................................ 29 a 0.67 9.67 - - - - 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAAC...................................................................................................................................... 29 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - 0.20 - 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCT................................................................................................................................................ 26 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - -
....................................................................................AACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCC............................................................................................................................................ 26 7 0.43 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.29 - 0.14 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAA....................................................................................................................................... 28 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAACT..................................................................................................................................... 30 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTat......................................................................................................................................... 32 at 0.33 8.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCc........................................................................................................................................... 31 c 0.33 0.67 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGTCCTGGAACTCAATTTGTAGATCAGG.................................................................................................................................................. 28 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TGTCCTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGt................................................................................................................................................. 29 t 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCT........................................................................................................................................... 31 3 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTCc......................................................................................................................................... 32 c 0.33 6.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTtc......................................................................................................................................... 32 tc 0.33 8.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTta......................................................................................................................................... 32 ta 0.33 8.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCa........................................................................................................................................... 31 a 0.33 0.67 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCtt........................................................................................................................................... 30 tt 0.33 9.67 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTCa......................................................................................................................................... 32 a 0.33 6.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCt............................................................................................................................................ 29 t 0.33 9.67 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TCCTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCT................................................................................................................................................ 28 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGa............................................................................................................................................. 29 a 0.33 0.67 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTaa......................................................................................................................................... 32 aa 0.33 8.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGGGATTAAAGGCATGCGCCACCACGACC......................................................................... 29 17 0.29 0.29 - - - 0.12 - 0.06 - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTtc.............................................................................................................................................. 27 tc 0.25 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................CCTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGC................................................................................................................................................. 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGAACTCAATTTGTAGATCAGGC................................................................................................................................................. 24 5 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AATTTGTAGATCAGGCTGGCCTCG......................................................................................................................................... 24 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AATTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGA........................................................................................................................................ 25 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - -
.........................................................................................AATTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAAC...................................................................................................................................... 27 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGACCTGGC.............................................................................................................................................................................. 29 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CAATTTGTAGATCAGGCTGGC............................................................................................................................................. 21 13 0.15 0.15 - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 -
.....................................................................................ACTCAATTTGTAGATCAGGC................................................................................................................................................. 20 14 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................CTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCC............................................................................................................................................ 24 9 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................CGAACTCAGAATCTGCCTGCCTCTGCCTC.............................................................................................................. 29 18 0.11 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................CTCAATTTGTAGATCAGGCTGGC............................................................................................................................................. 23 11 0.09 0.09 - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CAATTTGTAGATCAGGCTG............................................................................................................................................... 19 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CAATTTGTAGATCAGGCTGaca............................................................................................................................................ 22 aca 0.07 0.07 - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AATTTGTAGATCAGGCTGGC............................................................................................................................................. 20 16 0.06 0.06 - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TCAATTTGTAGATCAGGC................................................................................................................................................. 18 19 0.05 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.05 - -

Antisense strand
TCAATTTTATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTCTAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGACCTGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAATCTGCCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCATGCGCCACCACGACCAGCTAATTTTATTTCTTTTCCAGGCTGGGAACCTGACAGTGCTATCAACTGACCCCCTGCTTCACCAAGATCC
.............................................................................(((((((.((((.....(((((.(((((.((..((.......)).)).)))))..))))).....)))).)))))))....(((....)))..................................................................................
............................................................................77.....................................................................................................180....................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
...............................................................................................TCAGGCTGGCCTCGAACTCAGActgt................................................................................................................................. 26 ctgt 12.00 0.00 10.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GGCTGGCCTCGAACTCAgctc................................................................................................................................... 21 gctc 11.00 0.00 - - - - - - - - - 5.00 4.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TCAGGCTGGCCTCGAACTCAGActga................................................................................................................................. 26 ctga 7.00 0.00 5.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................ATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAaaa................................................................................................................................. 26 aaa 6.00 0.00 - - 3.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................AGATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAtt................................................................................................................................. 27 tt 4.00 0.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................ATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAaat................................................................................................................................. 26 aat 4.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TAGATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAaatt................................................................................................................................. 30 aatt 4.00 0.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................ATCTGCCTGCCTCTGCCTCCCGAaat.......................................................................................................... 26 aat 4.00 0.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................GGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAggt......................................................................................................................................................... 27 ggt 3.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................ATCTGCCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGaa....................................................................................................... 28 aa 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAttt.............................................................................................. 30 ttt 3.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAtc............................................................................................ 26 tc 3.00 0.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAtaga.............................................................................................. 27 taga 2.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................CGAGTGCTGGGATTAAAGGCAta........................................................................................ 23 ta 2.00 0.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................ATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAagt................................................................................................................................. 26 agt 2.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................ATCTGCCTGCCTCTGCCTCCCGAaa.......................................................................................................... 25 aa 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAt......................................................................................................................................................... 26 t 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAcca................................................................................................................................. 25 cca 2.00 0.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGAtaa................................................................................................. 27 taa 2.00 0.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CATGCGCCACCACGACCAGCTA.................................................................... 22 2 2.00 2.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcgt............................................................................................ 26 cgt 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................ATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAag................................................................................................................................. 25 ag 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAaaat................................................................................................................................. 26 aaat 2.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TCAGGCTGGCCTCGAACTCAGActa................................................................................................................................. 25 cta 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................CAGGCTGGCCTCGAACTCAGAATCTt............................................................................................................................. 26 t 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GAATCTGCCTGCCTCTGCCTCCCGAcaa.......................................................................................................... 28 caa 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcgc............................................................................................ 26 cgc 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................GCATGCGCCACCACGACCAGCTA.................................................................... 23 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TCCCGAGTGCTGGGATTAAcc............................................................................................. 21 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.......................................................................TGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTt.......................................................................................................................................................... 25 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAagtt................................................................................................................................. 26 agtt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TGGCCTCGAACTCAGAATCTcc............................................................................................................................. 22 cc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAtta.............................................................................................. 30 tta 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGGCTGTCCTGGAACTCAATtac.............................................................................................................................................................. 23 tac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GATCAGGCTGGCCTCGAACTCAata................................................................................................................................... 25 ata 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAtagc......................................................................................................................................................... 29 tagc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcgc............................................................................................ 28 cgc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAcacc.............................................................................................. 27 cacc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................ATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAgtaa................................................................................................................................. 27 gtaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAcgta.............................................................................................. 27 cgta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAtaac............................................................................................ 28 taac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................ATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAaaat................................................................................................................................. 27 aaat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................ATCTGCCTGCCTCTGCCTCCCGAGaa......................................................................................................... 26 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................GCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGtaaa................................................................................................... 26 taaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAActaa............................................................................................ 29 ctaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................CTGGAACTCAATTTGTAtgt......................................................................................................................................................... 20 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAtaaa............................................................................................. 28 taaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TGCGCCACCACGACCAGCcgca...................................................................... 22 cgca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTActgc.............................................................................................. 27 ctgc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GCGCCACCACGACCAGCTActg.................................................................... 22 ctg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................CTTTTCCAGGCTGGGAACCTGACAGTGCTA............................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAcg................................................................................................................................. 24 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATtaga................................................................................................ 25 taga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TCAGGCTGGCCTCGAACTCAGaatt.................................................................................................................................. 25 aatt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TGTAGATCAGGCTGGCCTCGcc......................................................................................................................................... 22 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAtggt......................................................................................................................................................... 29 tggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................CTGCCTGCCTCTGCCTCCCGAGTtat........................................................................................................ 26 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAaagc......................................................................................................................................................... 29 aagc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGTAGACCTGGCTGTCCTGGAACTCAaaa................................................................................................................................................................ 29 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................CTCTGTGTAGACCTGGcca............................................................................................................................................................................... 19 cca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.........................................................................................ATTTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAACTCAa................................................................................................................................... 30 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.......................................................................GGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTgt.......................................................................................................................................................... 25 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcact............................................................................................ 27 cact 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...................................................................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcggg............................................................................................ 27 cggg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TAAAGGCATGCGCCACCACGcc............................................................................ 22 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................AGATCAGGCTGGCCTCGAACTCAta................................................................................................................................... 25 ta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................AGATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAgcga................................................................................................................................. 29 gcga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................ACCACGACCAGCTAATTTTATTTCTT........................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TGTCCTGGAACTCAATTTGTAtcca......................................................................................................................................................... 25 tcca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAggaa......................................................................................................................................................... 28 ggaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTggtt.......................................................................................................................................................... 27 ggtt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................GATCAGGCTGGCCTCGAACTCAcat................................................................................................................................... 25 cat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAtatt.............................................................................................. 27 tatt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAActgc............................................................................................ 29 ctgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................CGCCACCACGACCAGCTAATTTTA.............................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAtta............................................................................................ 28 tta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TTGTAGATCAGGCTGGCCTCGAACTCAtt................................................................................................................................... 29 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAtaa............................................................................................. 27 taa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAttaa.............................................................................................. 27 ttaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................ATGCGCCACCACGACCAGCTAATTTTA.............................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................GTAGATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAtaa................................................................................................................................. 30 taa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................ATGCGCCACCACGACCAGCTAATTTT............................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAatg................................................................................................................................ 26 atg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................AGATCAGGCTGGCCTCGAACTct..................................................................................................................................... 23 ct 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAtta.............................................................................................. 26 tta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAttt......................................................................................................................................................... 28 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................CCTGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAc......................................................................................................................................................... 28 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAtgt............................................................................................ 28 tgt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAtta............................................................................................ 27 tta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcgg............................................................................................ 26 cgg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................GCTGGCCTCGAACTCAGAATCTt............................................................................................................................. 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTagt.......................................................................................................................................................... 27 agt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGTCCTGGAACTCAATTTGTAGATCAGGCt................................................................................................................................................. 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGCCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGcaaa.................................................................................................... 30 caaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAac......................................................................................................................................................... 27 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................GCTGGCCTCGAACTCAGAATCTGttt............................................................................................................................ 26 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GCGCCACCACGACCAGCTAATTTTA.............................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TAGATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGag.................................................................................................................................. 27 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAggtt......................................................................................................................................................... 28 ggtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAtta............................................................................................. 26 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAtagt............................................................................................ 28 tagt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GGCTGGCCTCGAACTCAGAggta................................................................................................................................. 23 ggta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAccac............................................................................................ 27 ccac 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGCCTCTGCCTCCCGAGTGcct....................................................................................................... 22 cct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TCGAACTCAGAATCTGCCTGCCTCTaaa................................................................................................................... 28 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCATGcgc...................................................................................... 28 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................CTGGCCTCGAACTCAGAATCTactg............................................................................................................................. 25 actg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................ATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAaga................................................................................................................................. 26 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAcaa................................................................................................................................. 25 caa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAcgtg............................................................................................ 27 cgtg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................CTGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAcg......................................................................................................................................................... 28 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TGCCTCCCGAGTGCTGtc.................................................................................................... 18 tc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................AGACCTGGCTGTCCTGGAACTCAcaga................................................................................................................................................................ 27 caga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................ATCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAga................................................................................................................................. 25 ga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAttta.............................................................................................. 27 ttta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAtct............................................................................................ 27 tct 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGCCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGtttt....................................................................................................... 27 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................ATGCGCCACCACGACCAGCTA.................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................ACCTGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTA......................................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAGATCA.................................................................................................................................................... 30 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................AAAGGCATGCGCCACCACGACCAGCTA.................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAGATCA.................................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................AAGGCATGCGCCACCACGACCAGCTAa.................................................................... 27 a 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................GGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAGATCAG................................................................................................................................................... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AAGGCATGCGCCACCACGACCAGCTA.................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................AAGGCATGCGCCACCACGACCAGCTAaa.................................................................... 28 aa 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................GCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAGATCA.................................................................................................................................................... 28 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAATCT............................................................................................................................. 26 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TGGCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAGAT...................................................................................................................................................... 28 3 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................GCTGTCCTGGAACTCAATTTGTAGATCAG................................................................................................................................................... 29 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................ATTAAAGGCATGCGCCACCACGACCAGCT..................................................................... 29 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GGATTAAAGGCATGCGCCACCACGACCA........................................................................ 28 5 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ACTCAATTTGTAGATCAGGCTGGCC............................................................................................................................................ 25 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - -
..........................................................................................................................................................TAAAGGCATGCGCCACCACGACC......................................................................... 23 19 0.05 0.05 - - - - - - - - - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -