| Gene: AK136654 | ID: uc008pzf.1_intron_0_0_chr3_89198316_f.5p | SPECIES: mm9 |
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| ....................ATCTTGGCGCAGATTCACTCAGACCCC........................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...................................................................................TGCTTAAGTGGGTTTGGGA.................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................TCTGAGGGACGCTTACAACTGGGC.............................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TGGCGCAGATTCACTCAGACCCCGAGa....................................................................................................................................................................................................... | 27 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................GGTGACGATAGAGACCTGGGTGGT................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................TTCAAACGGAGTCAAATCCCGCTCTCT........... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......CCTACAGTGGAGGGATCTTGGCGCA........................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................TCTGAGGGACGCTTACAACTGGGCTG............................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................TTTAAGTGCCCGACCCAAAGAATGGTAG........................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................TTACAACTGGGCTGGCGAcg...................................................................... | 20 | cg | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................................................................TCCTACTCGTTTCAAACGGAGTCAAATCC................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........TACAGTGGAGGGATCTTGGC.............................................................................................................................................................................................................................. | 20 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TGAGACCCTACAGTGGAGGGATCTTGGCGCAGATTCACTCAGACCCCGAGGTGACGATAGAGACCTGGGTGGTTTAGGATGTTTGCTTAAGTGGGTTTGGGAAAAACCGGTATTCGTATTTAAGTGCCCGACCCAAAGAATGGTAGTCTCTGAGGGACGCTTACAACTGGGCTGGCGATGCTATAGACCCCAAAAGGGCCCCTCCTACTCGTTTCAAACGGAGTCAAATCCCGCTCTCTAGGACCAGGTT .......................................................................((((.(((...(((((....((((.(((((.......((((....))))......)))))))))......)))))..)))...))))............................................................................................ .....................................................................70.............................................................................................165................................................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) |
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| ....................................................................................GCTTAAGTGGGTTTGGG..................................................................................................................................................... | 17 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................CCCGACCCAAAGAATG............................................................................................................ | 16 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................TTACAACTGGGCTGGCGATGCTATA................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............TGGAGGGATCTTGGCGCAGA......................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................CGTATTTAAGTGCCCGACCCAAAGAA.............................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................CACTCAGACCCCGAGGTGACGATA............................................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |