(1)
OTHER.ip
(8)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(8)
PIWI.ip
(5)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(46)
TESTES

Sense strand
CAGATGATCGGCGCCATCATGTTTTAGGGCCTGGTGAAGCCACAGCCCTGGTAAGTCAGTTCATGGAAAAAGTAACCCAACACATGACAAATAGATGGATGAGGAGGAGGCAGACGTAGCCCTGATTTCGAAGCCAGGCTAGTCTACAGGACGAGCTATAGGACGGCCATGGCCACACACAGAAACCCTGTCTCGAAAACAAAGAAAAAGAATGAAAGAAAGGGAAGGAGGGAGGAAGGCAAGGGTTGGG
...................................................................................................(((((.((.(((.......)))))..)))))..((((((((..((((.((......)).))))..)))).)))).............................................................................
...............................................................................80............................................................................................174..........................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
................................................................................................................................................TACAGGACGAGCTATAGGACGGCCAT................................................................................ 26 1 40.00 40.00 11.00 10.00 - 7.00 - 8.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGAGG............................................................................................................................................ 26 2 28.50 28.50 2.50 6.50 6.00 0.50 2.00 - 2.50 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 0.50 - 0.50 0.50 - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGAG............................................................................................................................................. 25 2 18.50 18.50 1.00 4.00 2.00 1.00 1.50 1.00 1.50 1.50 - - - - - 0.50 0.50 - 2.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - 0.50 -
................................................................................................................................................TACAGGACGAGCTATAGGACGGCCATG............................................................................... 27 1 6.00 6.00 1.00 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGAGGC........................................................................................................................................... 27 2 5.50 5.50 1.50 0.50 1.00 - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50
................................................................................................................................................TACAGGACGAGCTATAGGACGGCCA................................................................................. 25 1 5.00 5.00 1.00 - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCGAAGCCAGGCTAGTCTACAGGACG................................................................................................. 26 1 5.00 5.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGA.............................................................................................................................................. 24 2 4.50 4.50 - - - 0.50 2.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TGATTTCGAAGCCAGGCTAGTCTACAG..................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCGAAGCCAGGCTAGTCTACAGGACGA................................................................................................ 27 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGAGGCAGt........................................................................................................................................ 30 t 2.50 0.50 - - - - - - - - 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGAGGCA.......................................................................................................................................... 28 2 2.50 2.50 0.50 - 0.50 - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGG............................................................................................................................................... 23 2 2.00 2.00 - - - - 1.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCGAAGCCAGGCTAGTCTACAGGACGt................................................................................................ 27 t 2.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TGATTTCGAAGCCAGGCTAGTCTACA...................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TACAGGACGAGCTATAGGACGGCCATGGCCtt.......................................................................... 32 tt 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TGGCCACACACAGAAACCCTGTCTCGAAt.................................................... 29 t 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TAGTCTACAGGACGAGCTATAGGACGG.................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TACAGGACGAGCTATAGGACGGCCATGG.............................................................................. 28 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TAGTCTACAGGACGAGCTATAGGACGGCCAT................................................................................ 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GTCTACAGGACGAGCTATAGGACGGCCA................................................................................. 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TACAGGACGAGCTATAGGACGGCCATGt.............................................................................. 28 t 2.00 6.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGTCAGTTCATGGAAAAAGTAACC............................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGAAAGAAAGGGAAGGAGGGAGGAAG............ 26 2 1.50 1.50 - - 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TAGATGGATGAGGAGGAGGCAGAC....................................................................................................................................... 24 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................GAAAAAGAATGAAAGAAAGGGAAGGA..................... 26 2 1.50 1.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGGAAAAAGTAACCCAACACATGACAAATA............................................................................................................................................................. 30 2 1.50 1.50 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................ACAAATAGATGGATGAGGAGGAGGCAGACG...................................................................................................................................... 30 2 1.50 1.50 - - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGAGt............................................................................................................................................ 26 t 1.50 18.50 0.50 - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TACAGGACGAGCTATAGGACGGCCATGGCCttt......................................................................... 33 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TAGGACGGCCATGGCCACACACAGAAACCC.............................................................. 30 2 1.00 1.00 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TAGTCTACAGGACGAGCTATAGGACG..................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAGTCAGTTCATGGAAAAAGTAAC.............................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GTCTACAGGACGAGCTATAGGACGGC................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCGAAGCCAGGCTAGTCTACAGGAC.................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AGGACGAGCTATAGGACGGCCATGGC............................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................GTCTCGAAAACAAAGAAAAAGAATGAAAGA............................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGAGGt........................................................................................................................................... 27 t 1.00 28.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TTTCGAAGCCAGGCTAGTCTACAGGACGA................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................AAGAAAAAGAATGAAAGAAAGGGAAGGAGG................... 30 2 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................CGAGCTATAGGACGGCCATGGCCACAC........................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................GAGGCAGACGTAGCCCTGATTTCGAAGCC................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGTCTCGAAAACAAAGAAAAAGAATGAAAGA............................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................TGGCCACACACAGAAACCCTGTCTCGA...................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................CTAGTCTACAGGACGAGCTATAGGACGGCCtt................................................................................ 32 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................ACAGGACGAGCTATAGGACGGCCATG............................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGtag............................................................................................................................................. 25 tag 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGAa............................................................................................................................................. 25 a 1.00 4.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TAGTCTACAGGACGAGCTATAGGACGGCCt................................................................................. 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TAGTCTACAGGACGAGCTATAGGACGGCCATa............................................................................... 32 a 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GTCTACAGGACGAGCTATAGGACGGCCATG............................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GTCTACAGGACGAGCTATAGGACGGCC.................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGTCAGTTCATGGAAAAAGTAACCa............................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAGTCAGTTCATGGAAAAAGTAACt............................................................................................................................................................................. 29 t 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGAAAGAAAGGGAAGGAGGGAGGAAGGCttt....... 31 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGAGGCAtt........................................................................................................................................ 30 tt 1.00 2.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAGTCAGTTCATGGAAAAAG.................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GCCATCATGTTTTAGGGCCTGGTGta.................................................................................................................................................................................................................... 26 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............................................................................................................................................AGTCTACAGGACGAGCTATAGGACGGCCATt............................................................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGTCAGTTCATGGAAAAAGTAACCCAACA........................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TACAGGACGAGCTATAGGACGGCCATGGCCAtt......................................................................... 33 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TAGTCTACAGGACGAGCTATAGGACGGCCATt............................................................................... 32 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAGTCAGTTCATGGAAAAAGcaa............................................................................................................................................................................... 27 caa 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TGGTAAGTCAGTTCATGGAAAAAGTAACCC............................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGAAAGAAAGGGAAGGAGGGAGG............... 23 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - -
.AGATGATCGGCGCCATCATGT.................................................................................................................................................................................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - -
................TCATGTTTTAGGGCCTGGTGAAGCCACA.............................................................................................................................................................................................................. 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGAGGCAta........................................................................................................................................ 30 ta 0.50 2.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................ACAAATAGATGGATGAGGAGGAGGCA.......................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................AGAAAAAGAATGAAAGAAAGGGAAGG...................... 26 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TAGATGGATGAGGAGGAGGC........................................................................................................................................... 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CAGGCTAGTCTACAGGACGAG............................................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - -
.........................AGGGCCTGGTGAAGCCACAGCC........................................................................................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CTGGTGAAGCCACAGCCCTGG....................................................................................................................................................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................GACAAATAGATGGATGAGGAGGAGG............................................................................................................................................ 25 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGGAAAAAGTAACCCAACACATGACAAATAGA........................................................................................................................................................... 32 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGGAAAAAGTAACCCAACACATGACAAATAG............................................................................................................................................................ 31 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................ATGTTTTAGGGCCTGGTGAAGCCA................................................................................................................................................................................................................ 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGAGGCt.......................................................................................................................................... 28 t 0.50 5.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GTTTTAGGGCCTGGTGAAGC.................................................................................................................................................................................................................. 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - -
................................................................................CACATGACAAATAGATGGATGAGGAGG............................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGAAAGAAAGGGAAGGAGGGAGGAA............. 25 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AATAGATGGATGAGGAGG............................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................CAAATAGATGGATGAGGAGGAGGCAG......................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGGAAAAAGTAACCCAACACATGACAAAT.............................................................................................................................................................. 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AGATGATCGGCGCCATCATGTTTTA................................................................................................................................................................................................................................ 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................GGGAGGAAGGCAAGGGTT... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGAGGCAt......................................................................................................................................... 29 t 0.50 2.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................TAGATGGATGAGGAGGAGGCAGACGT..................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CACATGACAAATAGATGGATGAGGAG................................................................................................................................................ 26 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TGGATGAGGAGGAGGCAGACG...................................................................................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGAGGCAGA........................................................................................................................................ 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGACAAATAGATGGATGAGGAGGAGGCAG......................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................GATGGATGAGGAGGAGGCAGAC....................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TAGGACGGCCATGGCCACACACAGAAACCCT............................................................. 31 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CAGATGATCGGCGCCATCATGTTTTAGGGCCTGGTGAAGCCACAGCCCTGGTAAGTCAGTTCATGGAAAAAGTAACCCAACACATGACAAATAGATGGATGAGGAGGAGGCAGACGTAGCCCTGATTTCGAAGCCAGGCTAGTCTACAGGACGAGCTATAGGACGGCCATGGCCACACACAGAAACCCTGTCTCGAAAACAAAGAAAAAGAATGAAAGAAAGGGAAGGAGGGAGGAAGGCAAGGGTTGGG
...................................................................................................(((((.((.(((.......)))))..)))))..((((((((..((((.((......)).))))..)))).)))).............................................................................
...............................................................................80............................................................................................174..........................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
................................................................................................................................................................................CAGAAACCCTGTCTCGAAAgca.................................................... 22 gca 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CTACAGGACGAGCTATAGGACGGCCA................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -