Gene: Slc25a44

ID: uc008pvd.1_intron_2_0_chr3_88225061_r.5p

SPECIES: mm9

chr3:88228496 88228745 -

(1) OTHER.ip

(8) OTHER.mut

(1) OVARY

(8) PIWI.ip

(4) PIWI.mut

(1) TDRD1.ip

(48) TESTES

Sense strand

TCCTGGCCGAGGAGCATGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGGGGTATGCCCGGGGACTCTGAATTGGCCGTGCAAGAGCCTGACAGAAGGTGCATAAAGGAGGGTGTCACGTGGAGTGTGTGGAGGGGATTGTCATGTGGTGTGTGTGATGGAGGATCACGTGGAAATCTATTGAAGACCAATGAAGACTAGGTGGAACCTCACCATGCCGGAGGGAGGAGGCTTAGATTGGGAGGCGACATA .........................................................................(((((((....((((......)))))))).......))).((((.(((......(((...(((((..((((((((..............))))))))..)))))........))).......))).))))............................................... ........................................................................73...................................................................................................................................206..........................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)	SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)	GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)	SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)	SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)	SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)	GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)	GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes)	GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)	SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)	GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTG...............................................................................................................................................................................................................	27	1	895.00	895.00	287.00	278.00	108.00	70.00	55.00	14.00	10.00	8.00	8.00	9.00	7.00	3.00	4.00	10.00	3.00	3.00	6.00	2.00	3.00	-	2.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCT................................................................................................................................................................................................................	26	1	269.00	269.00	67.00	69.00	15.00	30.00	5.00	13.00	10.00	10.00	16.00	6.00	2.00	-	4.00	3.00	1.00	-	2.00	5.00	-	-	2.00	-	1.00	-	1.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGA..............................................................................................................................................................................................................	28	1	105.00	105.00	23.00	16.00	16.00	8.00	13.00	8.00	5.00	2.00	-	1.00	4.00	-	2.00	-	-	-	-	1.00	-	-	2.00	-	-	-	-	2.00	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................TCTATTGAAGACCAATGAAGACTAGGTG................................................	28	1	35.00	35.00	12.00	11.00	2.00	6.00	2.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCC.................................................................................................................................................................................................................	25	1	30.00	30.00	8.00	6.00	3.00	1.00	1.00	-	2.00	2.00	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGAC.............................................................................................................................................................................................................	29	1	30.00	30.00	6.00	6.00	3.00	2.00	6.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGt..............................................................................................................................................................................................................	28	t	24.00	895.00	8.00	5.00	3.00	-	2.00	-	1.00	-	-	-	2.00	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-
...................................................................................................................................................................................TGAAGACCAATGAAGACTAGGTGGAAC............................................	27	1	23.00	23.00	3.00	6.00	3.00	3.00	2.00	1.00	3.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...TGGCCGAGGAGCATGAGAGACTGACAGC...........................................................................................................................................................................................................................	28	1	22.00	22.00	4.00	6.00	1.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	6.00	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................TTGAAGACCAATGAAGACTAGGTGGAAC............................................	28	1	18.00	18.00	3.00	4.00	-	-	1.00	2.00	2.00	-	-	2.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGGGG.......................................................................................................................................................................................................	27	1	16.00	16.00	4.00	5.00	3.00	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TGCAAGAGCCTGACAGAAGGTGCATA...................................................................................................................................................	26	1	16.00	16.00	3.00	-	-	2.00	-	2.00	1.00	1.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	1.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................TATTGAAGACCAATGAAGACTAGGTGG...............................................	27	1	13.00	13.00	4.00	3.00	-	1.00	-	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................TATTGAAGACCAATGAAGACTAGGTG................................................	26	1	13.00	13.00	4.00	4.00	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTa...............................................................................................................................................................................................................	27	a	11.00	269.00	1.00	3.00	-	-	-	-	-	2.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................TTGAAGACCAATGAAGACTAGGTGGA..............................................	26	1	10.00	10.00	-	3.00	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................TTGAAGACCAATGAAGACTAGGTGGAA.............................................	27	1	9.00	9.00	3.00	1.00	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTt...............................................................................................................................................................................................................	27	t	9.00	269.00	2.00	1.00	-	-	1.00	-	-	1.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGC..................................................................................................................................................................................................................	24	1	7.00	7.00	1.00	1.00	1.00	1.00	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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...................................................................................................................................................................................TGAAGACCAATGAAGACTAGGTGGAACC...........................................	28	1	6.00	6.00	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TGCAAGAGCCTGACAGAAGGTGCATAA..................................................................................................................................................	27	1	6.00	6.00	1.00	-	-	-	-	2.00	1.00	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................TAGGTGGAACCTCACCATGCCGGAG.............................	25	1	6.00	6.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	6.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...TGGCCGAGGAGCATGAGAGACTGACAG............................................................................................................................................................................................................................	27	1	6.00	6.00	-	4.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................TGCCCGGGGACTCTGAATTGGCCGTGC..........................................................................................................................................................................	27	1	5.00	5.00	-	1.00	1.00	1.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........GAGGAGCATGAGAGACTGACAGCTAG........................................................................................................................................................................................................................	26	1	5.00	5.00	-	1.00	2.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................TGGCCGTGCAAGAGCCTGACAGAAGGTGC......................................................................................................................................................	29	1	5.00	5.00	2.00	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................TGTGATGGAGGATCACGTGGAAATCT.........................................................................	26	1	5.00	5.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGGGGT......................................................................................................................................................................................................	28	1	5.00	5.00	2.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................AGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGA..............................................................................................................................................................................................................	26	1	5.00	5.00	-	-	2.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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........................TGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGG.........................................................................................................................................................................................................	25	1	4.00	4.00	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................AGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGAC.............................................................................................................................................................................................................	27	1	4.00	4.00	-	-	-	-	-	-	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACGt...........................................................................................................................................................................................................	31	t	4.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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...............................................................................................................................................................AGGATCACGTGGAAATCTATTGAAGACC...............................................................	28	1	4.00	4.00	-	1.00	2.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...TGGCCGAGGAGCATGAGAGACTGACA.............................................................................................................................................................................................................................	26	1	4.00	4.00	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................TGCCCGGGGACTCTGAATTGGCCGTG...........................................................................................................................................................................	26	1	4.00	4.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........GGAGCATGAGAGACTGACAGCTAGAG......................................................................................................................................................................................................................	26	1	4.00	4.00	-	1.00	-	-	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................GGATCACGTGGAAATCTATTGAAGACC...............................................................	27	1	3.00	3.00	-	-	-	1.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...TGGCCGAGGAGCATGAGAGACTGAa..............................................................................................................................................................................................................................	25	a	3.00	1.00	-	-	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................TGCCGGAGGGAGGAGGCTTAGATTGG...........	26	1	3.00	3.00	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGAa.............................................................................................................................................................................................................	29	a	3.00	105.00	2.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........GGAGCATGAGAGACTGACAGCTAGAGA.....................................................................................................................................................................................................................	27	1	3.00	3.00	-	-	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACt............................................................................................................................................................................................................	30	t	3.00	30.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-
.......................................................................................TGACAGAAGGTGCATAAAGGAGGGT..........................................................................................................................................	25	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................TGGAGGATCACGTGGAAATCTATTG.....................................................................	25	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................TGTCATGTGGTGTGTGTGATGGAGG........................................................................................	25	1	3.00	3.00	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................TGCCCGGGGACTCTGAATTGGCCGggca.........................................................................................................................................................................	28	ggca	3.00	0.00	1.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................TGTCATGTGGTGTGTGTGATGGAGGA.......................................................................................	26	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCcg...............................................................................................................................................................................................................	27	cg	2.00	30.00	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................TTGAAGACCAATGAAGACTAGGTGGAACC...........................................	29	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAA....................................................................................................................................................................................................................	22	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................GGCCGTGCAAGAGCCTGACAGAAGGTGC......................................................................................................................................................	28	1	2.00	2.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................GAGGATCACGTGGAAATCTATTGAAGACC...............................................................	29	1	2.00	2.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGactg...............................................................................................................................................................................................................	27	actg	2.00	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................TAGAGAAGCCTGACGAGGGGTATGCCC................................................................................................................................................................................................	27	1	2.00	2.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................TGTGATGGAGGATCACGTGGAAATCTAT.......................................................................	28	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TAAAGGAGGGTGTCACGTGGAGTGTG...........................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................TGAATTGGCCGTGCAAGAGCCTGACA..............................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TGACAGCTAGAGAAGCCTGACG............................................................................................................................................................................................................	22	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................CAGAAGGTGCATAAAGGAGGGTGTC.......................................................................................................................................	25	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCg................................................................................................................................................................................................................	26	g	2.00	30.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................TGCCCGGGGACTCTGAATTGGCCGTGCA.........................................................................................................................................................................	28	1	2.00	2.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGt..................................................................................................................................................................................................................	24	t	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................TATTGAAGACCAATGAAGACTAGGTGGA..............................................	28	1	2.00	2.00	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................TGTGGAGGGGATTGTCATGTGG.......................................................................................................	22	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................GAGAAGCCTGACGAGGGGTATGCCCGG..............................................................................................................................................................................................	27	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................TGCCCGGGGACTCTGAATTGGCCGggga.........................................................................................................................................................................	28	ggga	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................TGAAGACTAGGTGGAACCTCACCAT....................................	25	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCa................................................................................................................................................................................................................	26	a	2.00	30.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACGA...........................................................................................................................................................................................................	31	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................AGGATCACGTGGAAATCTATTGAAGAC................................................................	27	1	2.00	2.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................TATTGAAGACCAATGAAGACTAGGTGGAACC...........................................	31	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................TGTCATGTGGTGTGTGTGATGGAGGt.......................................................................................	26	t	2.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................TCTATTGAAGACCAATGAAGACTAGGT.................................................	27	1	2.00	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................GGATCACGTGGAAATCTATTGAAGAC................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACtt...........................................................................................................................................................................................................	31	tt	2.00	30.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGGG........................................................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGact................................................................................................................................................................................................................	26	act	2.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................CCCGGGGACTCTGAATTGGCCGTGCAt........................................................................................................................................................................	27	t	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................TGAATTGGCCGTGCAAGAGCCTGAC...............................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................GATTGTCATGTGGTGTGTGTGATGGA..........................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................CTGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGGGG.......................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................GAGGATCACGTGGAAATCTATTGAAGA.................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TGCAAGAGCCTGACAGAAGGTGCATAAt.................................................................................................................................................	28	t	1.00	6.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................CGAGGGGTATGCCCGGGGACTCTcaat...................................................................................................................................................................................	27	caat	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................TCTATTGAAGACCAATGAAGACcagg..................................................	26	cagg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................TGGAGTGTGTGGAGGGGATTGTCATGTtt.......................................................................................................	29	tt	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACG............................................................................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................GAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGGGGT......................................................................................................................................................................................................	35	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................TAGAGAAGCCTGACGAGGGGTATGCCCGt..............................................................................................................................................................................................	29	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................ACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGGGGTA.....................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TGCAAGAGCCTGACAGAAGGTGCATAg..................................................................................................................................................	27	g	1.00	16.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................TTGAAGACCAATGAAGACTAGGTGGAACaa..........................................	30	aa	1.00	18.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................TAGAGAAGCCTGACGAGGGGTATGCCCGG..............................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCatt...............................................................................................................................................................................................................	27	att	1.00	7.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................TGAAGACCAATGAAGACTAGGTGG...............................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............GCATGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGC..................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................TGTGGTGTGTGTGATGGAGGATCACGTG................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................GGGGACTCTGAATTGGCCGTGCAAG.......................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTat..............................................................................................................................................................................................................	28	at	1.00	269.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TAAAGGAGGGTGTCACGTGGAGTa.............................................................................................................................	24	a	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................TGAAGACTAGGTGGAACCTC.........................................	20	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................TGAATTGGCCGTGCAAGAGCCTGACAGAAag.........................................................................................................................................................	31	ag	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................TGGCCGTGCAAGAGCCTGACAGAAGGTctcc....................................................................................................................................................	31	ctcc	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................ATGTGGTGTGTGTGATGGAGGA.......................................................................................	22	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TGACAGCTAGAGAAGactg...............................................................................................................................................................................................................	19	actg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGt.........................................................................................................................................................................................................	25	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................ACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGG.........................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................TTGGCCGTGCAAGAGCCTGACAGAAGGggg......................................................................................................................................................	30	ggg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTta..............................................................................................................................................................................................................	28	ta	1.00	269.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................TGCCGGAGGGAGGAGGCTTAGATTGGt..........	27	t	1.00	3.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................TGCATAAAGGAGGGTGTCACGTGGA................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............GCATGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTG...............................................................................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................GACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACG............................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................GAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACG............................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................TGGAAATCTATTGAAGACCAATGAAGAC......................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTtt..............................................................................................................................................................................................................	28	tt	1.00	269.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................TATGCCCGGGGACTCTGAATTGGCCG.............................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGGGt.......................................................................................................................................................................................................	27	t	1.00	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................CAGCTAGAGAAGCCTGACGAGGGGTAT....................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGtct................................................................................................................................................................................................................	26	tct	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................AAGGTGCATAAAGGAGGGTGTCACG....................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................TGTGATGGAGGATCACGTGGAAATC..........................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................AGGTGCATAAAGGAGGGTGTCACGTGt.................................................................................................................................	27	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................TATGCCCGGGGACTCTGAATTGGCCGTGC..........................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................TGGAAATCTATTGAAGACCAATGAAG........................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................CGGGGACTCTGAATTGGCCGTGCAA........................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCa.................................................................................................................................................................................................................	25	a	1.00	7.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................TAGGTGGAACCTCACCATGCCGGAGGG...........................	27	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................TGTGGAGGGGATTGTCATGTGGTGTt...................................................................................................	26	t	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GAGCATGAGAGACTGACAGCTAGAGAA....................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................TCACCATGCCGGAGGGAGGAGGCTTAG................	27	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............ATGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTG...............................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGA.....................................................................................................................................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACttt..........................................................................................................................................................................................................	32	ttt	1.00	30.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................GACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGGGGT......................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................TGAATTGGCCGTGCAAGAGCCTGACAGA............................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TGCAAGAGCCTGACAGAAGGTGCA.....................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................TGCCCGGGGACTCTGAATTGGCCGgg...........................................................................................................................................................................	26	gg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................CCGGGGACTCTGAATTGGCCGTGgaag.......................................................................................................................................................................	27	gaag	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................GGAGGATCACGTGGAAATCTATTGA....................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................TGACAGAAGGTGCATAAAGGAGG............................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........GGAGCATGAGAGACTGACAGCTAGAag.....................................................................................................................................................................................................................	27	ag	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................TTGAAGACCAATGAAGACTAGGTG................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................CAGAAGGTGCATAAAGGAGGGTGTCA......................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAG..........................................................................................................................................................................................................	32	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...TGGCCGAGGAGCATGAGAGACTGACAGt...........................................................................................................................................................................................................................	28	t	1.00	6.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................TGAAGACCAATGAAGACTAGGTGGAAaa...........................................	28	aa	1.00	4.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................TCACGTGGAAATCTATTGAAGACCAATG...........................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................GAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGAC.............................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................GCCCGGGGACTCTGAATTGGC...............................................................................................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TAAAGGAGGGTGTCACGTGGAGTG.............................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................TGGCCGTGCAAGAGCCTGACAGAAGGggc......................................................................................................................................................	29	ggc	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................TGCCCGGGGACTCTGAATTGGCCGTGa..........................................................................................................................................................................	27	a	1.00	4.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................TGAAGACTAGGTGGAACCTCACCATGt..................................	27	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............CATGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCT................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...TGGCCGAGGAGCATGAGAGACTGA...............................................................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................TGCCGGAGGGAGGAGGCTTAGATTGt...........	26	t	1.00	6.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............CATGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCC.................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........AGGAGCATGAGAGACTGACAGCTAGt.......................................................................................................................................................................................................................	26	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................TGCCCGGGGACTCTGAATTGGCCGgtca.........................................................................................................................................................................	28	gtca	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................CCGTGCAAGAGCCTGACAGAAGGTGCA.....................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACa............................................................................................................................................................................................................	30	a	1.00	30.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGGcg.......................................................................................................................................................................................................	27	cg	1.00	4.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................ACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGGG........................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TAAAGGAGGGTGTCACGTGGAGTGTGT..........................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-
.......................CTGACAGCTAGAGAAGCCTG...............................................................................................................................................................................................................	20	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................TGCCCGGGGACTCTGAATTGGCCGggg..........................................................................................................................................................................	27	ggg	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................TGGCCGTGCAAGAGCCTGACAGAAGGT........................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................TGTGATGGAGGATCACGTGGAAA............................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................AGAAGCCTGACGAGGGGTATGCCCGGG.............................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.CCTGGCCGAGGAGCATGAGAGACTG................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................TGAAGACTAGGTGGAACCTCACCct....................................	25	ct	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...TGGCCGAGGAGCATGAGAGACTGACAGa...........................................................................................................................................................................................................................	28	a	1.00	6.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................AGCTAGAGAAGCCTGACGAGGGGTA.....................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................TCTGAATTGGCCGTGCAAGAGCCTGA................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................GAGCCTGACAGAAGGTGCATAAAGGAGGG...........................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGtt.............................................................................................................................................................................................................	29	tt	1.00	895.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAt....................................................................................................................................................................................................................	22	t	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................TCACCATGCCGGAGGGAGGAGGCTTA.................	26	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................TGAAGACTAGGTGGAACCTCACCA.....................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...TGGCCGAGGAGCATGAGAGACTGAC..............................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................TTGAAGACCAATGAAGACTAGctgg...............................................	25	ctgg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...TGGCCGAGGAGCATGAGAGACTGACAGCT..........................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................ACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGGGG.......................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................TGTCATGTGGTGTGTGTGATGGtgga.......................................................................................	26	tgga	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................CATGTGGTGTGTGTGATGGAGGATCAC...................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................TGTGATGGAGGATCACGTGGAAATCTATT......................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................CGGGGACTCTGAATTGGCCGTGCAAGA......................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................TGGCCGTGCAAGAGCCTGACAGAAGGTG.......................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGAtt............................................................................................................................................................................................................	30	tt	1.00	105.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGAaa............................................................................................................................................................................................................	30	aa	1.00	105.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................TGCATAAAGGAGGGTGTCACGTGG.................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................TCTGAATTGGCCGTGCAAGAGCCTGACAG.............................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TGCAAGAGCCTGACAGAAGGTGC......................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TGCAAGAGCCTGACAGAAGGTc.......................................................................................................................................................	22	c	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGg..................................................................................................................................................................................................................	24	g	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAG...................................................................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................TAGGTGGAACCTCACCATGCCGGAGG............................	26	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................TGAGAGACTGACAGCTAGAGAAa...................................................................................................................................................................................................................	23	a	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................TGGAAATCTATTGAAGACCAATGAAGACT.....................................................	29	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................TGCCCGGGGACTCTGAATTGGCCGTGCAt........................................................................................................................................................................	29	t	1.00	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................TGCAAGAGCCTGACAGAAGGTGCAT....................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..CTGGCCGAGGAGCATGAGAGACTGACA.............................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................TTGGCCGTGCAAGAGCCTGACAGAAGGTGC......................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................GTGCAAGAGCCTGACAGAAGGTGCAT....................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................CCTGACGAGGGGTATGCCCGGGGACTC........................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Antisense strand

TCCTGGCCGAGGAGCATGAGAGACTGACAGCTAGAGAAGCCTGACGAGGGGTATGCCCGGGGACTCTGAATTGGCCGTGCAAGAGCCTGACAGAAGGTGCATAAAGGAGGGTGTCACGTGGAGTGTGTGGAGGGGATTGTCATGTGGTGTGTGTGATGGAGGATCACGTGGAAATCTATTGAAGACCAATGAAGACTAGGTGGAACCTCACCATGCCGGAGGGAGGAGGCTTAGATTGGGAGGCGACATA .........................................................................(((((((....((((......)))))))).......))).((((.(((......(((...(((((..((((((((..............))))))))..)))))........))).......))).))))............................................... ........................................................................73...................................................................................................................................206..........................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)	SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)	GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)	SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)	SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)	SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)	GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)	GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)	SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes)	GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)	SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes)	GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
....GGCCGAGGAGCATGAGAGACTGACAGCTA.........................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................AGCCTGACAGAAGGTGCAT....................................................................................................................................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....GGCCGAGGAGCATGAGAGACTGACAGCT..........................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......CCGAGGAGCATGAGAGACTGACAGCTA.........................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................CGTGCAAGAGCCTGACAtc..............................................................................................................................................................	19	tc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-