(6)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(30)
TESTES

Sense strand
AGACTGGACAGACACCGAGAGGTGGAGCTGAGCCAATACGAGGCTAAGGGGTAAATCTGACTCACCCGAGAGGCCGGAACTGACCTGCTGCAAACTACCAAGGAACTTCGCTAGGCTGGGTGGCTAGAACGGGGGGGGGGGGGGGGGACCTGTAAACTATGCTAAGGCTACCTCTTCTATTTGAGACCCAAGTCTGAAACAGGACAGGAAAGTGGATTTGCTCTTCGTCCAGGTAGTGAGTGATTTCAGG
..............................................................................................(((((.((...((.....)).)).)))))........((..((((..(((....))).........((....))..))))..))........................................................................
..........................................................................................91........................................................................................181...................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
..................................................................................................................................................................................................TGAAACAGGACAGGAAAGTGGATTT............................... 25 1 33.00 33.00 1.00 6.00 1.00 - 2.00 1.00 - 3.00 3.00 - - 1.00 3.00 1.00 2.00 - 2.00 - 3.00 - - - 1.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - -
....................................TACGAGGCTAAGGGGTAAATCTGACTC........................................................................................................................................................................................... 27 1 17.00 17.00 2.00 3.00 - - - - - - - 7.00 3.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGAAACAGGACAGGAAAGTGGATTTGC............................. 27 1 15.00 15.00 2.00 - - - 2.00 5.00 - - - - - - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - -
....................................TACGAGGCTAAGGGGTAAATCTGACT............................................................................................................................................................................................ 26 1 12.00 12.00 4.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGAAACAGGACAGGAAAGTGGATT................................ 24 1 12.00 12.00 3.00 2.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGAAACAGGACAGGAAAGTGGATTTGCTC........................... 29 1 11.00 11.00 1.00 1.00 1.00 2.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGTAAACTATGCTAAGGCTACCTCTTC......................................................................... 27 1 11.00 11.00 - - - - 4.00 3.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - -
....................................................................................................AGGAACTTCGCTAGGCTGGGTGGC.............................................................................................................................. 24 1 11.00 11.00 - - - 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TACCAAGGAACTTCGCTAGGCTGGGTGGC.............................................................................................................................. 29 1 9.00 9.00 2.00 - 3.00 - - - 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TACCAAGGAACTTCGCTAGGCTGGG.................................................................................................................................. 25 1 6.00 6.00 - - 1.00 - - - 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TACCAAGGAACTTCGCTAGGCTGGGTGG............................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - -
...............................................................................................TACCAAGGAACTTCGCTAGGCTGGGT................................................................................................................................. 26 1 5.00 5.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGAAACAGGACAGGAAAGTGGATTTG.............................. 26 1 5.00 5.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GACTGGACAGACACCGAGAGGTGGAGCT............................................................................................................................................................................................................................. 28 1 5.00 5.00 - - - - - - - 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGAAACAGGACAGGAAAGTGGA.................................. 22 1 4.00 4.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
........................................................................................TGCAAACTACCAAGGAACTTCGCTAG........................................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
....................................................................................................AGGAACTTCGCTAGGCTGGGTGGCTA............................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGACTCACCCGAGAGGCCGGAACTGA....................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.GACTGGACAGACACCGAGAGGTGGAGC.............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
................................................................................................................................................................................................TCTGAAACAGGACAGGAAAGTGGATT................................ 26 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TAGGCTGGGTGGCTAGAACGGGG.................................................................................................................... 23 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TTGAGACCCAAGTCTGAAACAGGACAGG.......................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGAAACAGGACAGGAAAGTGGATTTGCTCT.......................... 30 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.................................................................................................................................................................................TATTTGAGACCCAAGTCTGAAACAGGACA............................................ 29 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TTCTATTTGAGACCCAAGTCTGAAAC.................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TACCAAGGAACTTCGCTAGGCTGGGTG................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGCTCTTCGTCCAGGTAGTGAGTGA....... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGACTCACCCGAGAGGCCGGAACTGACC..................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTGCTCTTCGTCCAGGTAGTGAGTG........ 25 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CCTGTAAACTATGCTAAGGCTACCTC............................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GTGGATTTGCTCTTCGTCCAGGTAGT............. 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.........................................................................................................................................................................................................................TTGCTCTTCGTCCAGGTAGTGAGTGA....... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................AGGAACTTCGCTAGGCTGGGTGG............................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CAGGACAGGAAAGTGGATTT............................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGCTCTTCGTCCAGGTAGTGAGTGATTT.... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................AAACAGGACAGGAAAGTGGATTTGCTCT.......................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GGTGGAGCTGAGCCAATACGAGGCTAAGG......................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGGACAGACACCGAGAGGTGGAGCTGA........................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................................................GGGTAAATCTGACTCACCCGAGAGGCC............................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CGCTAGGCTGGGTGGCTAGAACGGG..................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGACTCACCCGAGAGGCCGGAACTGACCTGt.................................................................................................................................................................. 31 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGAAACAGGACAGGAAAGTGGATTTa.............................. 26 a 1.00 33.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................GAACTGACCTGCTGCAAACTACCAAG.................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGCAAACTACCAAGGAACTTCGCTAGGC...................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....TGGACAGACACCGAGAGGTGGAGCTGAGC......................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............CGAGAGGTGGAGCTGAGC......................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GACTGGACAGACACCGAGA...................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TACGAGGCTAAGGGGTAAATCTGAC............................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................AGGAACTTCGCTAGGCTGGGgggc.............................................................................................................................. 24 gggc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................GTCTGAAACAGGACAGGAAAGTGGATT................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGAAACAGGACAGGAAAGTGGATTTGCT............................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGACTCACCCGAGAGGC................................................................................................................................................................................ 17 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TTCGTCCAGGTAGTGAGTGATTTCt.. 25 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...................................................................................................AAGGAACTTCGCTAGGCTGGGTGG............................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGAGACCCAAGTCTGAAACAGGACAGGA......................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TTTGCTCTTCGTCCAGGTAGTGAGT......... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGAAACAGGACAGGAAAGTGGATTTGCTCTTt........................ 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TTTGAGACCCAAGTCTGAAACA................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TTTGAGACCCAAGTCTGAAACAGGACAG........................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................GGATTTGCTCTTCGTCCAGGTAGT............. 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GAAAGTGGATTTGCTCTTCGTCCAG.................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TGAAACAGGACAGGAAAGTGGATTTGCTCa.......................... 30 a 1.00 11.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCTGAAACAGGACAGGAAAGTGGATTT............................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................CAAGGAACTTCGCTAGGCTGGGTGGCT............................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................TACGAGGCTAAGGGGTAAATCTGcct............................................................................................................................................................................................ 26 cct 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GAGGTGGAGCTGAGCCAATACGAGGCTA............................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TGAGCCAATACGAGGCTAAGGGGTA..................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TGAGACCCAAGTCTGAAACAGGACAGGAAAGT..................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGATTTGCTCTTCGTCCAGGTAGTG............ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGACTCACCCGAGAGGCCGG............................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.......................................................TCTGACTCACCCGAGAGGCCGGAACTGt....................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TCGTCCAGGTAGTGAGTGATTTCAGG 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................ACAGGACAGGAAAGTGGATTTGCTCT.......................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TTGCTCTTCGTCCAGGTAGTGAGTGt....... 26 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................................TACCAAGGAACTTCGCTAGGCTGG................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCTTCGTCCAGGTAGTGAGTGA....... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGCAAACTACCAAGGAACTTCGCTcg........................................................................................................................................ 26 cg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TTTGAGACCCAAGTCTGAAACAGGACA............................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGCTCTTCGTCCAGGTAGTGAGTGATTTC... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TACCAAGGAACTTCGCTAGGCTGGcc................................................................................................................................. 26 cc 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TTGAGACCCAAGTCTGAAACAGGACAGc.......................................... 28 c 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..ACTGGACAGACACCGAGAGGTGGAGC.............................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...............................................................................................................TAGGCTGGGTGGCTAGAACGG...................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CTAAGGGGTAAATCTGACT............................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TACCTCTTCTATTTGAGACCCAAGTCTGA..................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................GTGGCTAGAACGGGGGGG................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.....................................................................................TGCTGCAAACTACCAAGGAACTTCGCTA......................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCTTCGTCCAGGTAGTGAGTGATTTC... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................AGGAACTTCGCTAGGCTGGGTGGCT............................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TACGAGGCTAAGGGGTAAATCTGA.............................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGGTGGAGCTGAGCCAATgc................................................................................................................................................................................................................... 20 gc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................GTCTGAAACAGGACAGGAAAGTGGA.................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GAGAGGTGGAGCTGAGCC........................................................................................................................................................................................................................ 18 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AGACTGGACAGACACCGAGAGGTGGAGCTGAGCCAATACGAGGCTAAGGGGTAAATCTGACTCACCCGAGAGGCCGGAACTGACCTGCTGCAAACTACCAAGGAACTTCGCTAGGCTGGGTGGCTAGAACGGGGGGGGGGGGGGGGGACCTGTAAACTATGCTAAGGCTACCTCTTCTATTTGAGACCCAAGTCTGAAACAGGACAGGAAAGTGGATTTGCTCTTCGTCCAGGTAGTGAGTGATTTCAGG
..............................................................................................(((((.((...((.....)).)).)))))........((..((((..(((....))).........((....))..))))..))........................................................................
..........................................................................................91........................................................................................181...................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
...........................................................................................................................................................................CTCTTCTATTTGAGACCCAAGTCTGAA.................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................CCTGCTGCAAACTACCAAGGAACTTC............................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...........................................................................................................................................................................................................................GCTCTTCGTCCAGGTA............... 16 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -