chr3:87723578 87723827 +
(1)
OTHER.ip 		(9)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(45)
TESTES

Sense strand
GTGGGGACTGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGTTGCGGGGAGGTGAGGCTACTCAGCGACGGGGAAGGTCGGAAGGTGGATAAGCGAAGGGACTTCTTTTCCTAGTTTTAAACTGAGCCTTGGGCTCCTCTTTTGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGCATATCGGGGTGAGTCTGACGAGGGAATTACTTGAGGCGGTGACCTGAGGACTTGTACTGAGAAGAAAGCCAGCCCCACCACGGAA
....................................................(((....)))..((((.......)))).......((((.(((...((.((((...(((((((........(((((...))))).......)))))))....))))))...))).))))................................................................................
....................................................53.....................................................................................................................172............................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
........TGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAA........................................................................................................................................................................................................................ 26 1 145.00 145.00 55.00 56.00 7.00 12.00 - 5.00 - - - - 1.00 4.00 - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - -
........TGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAA....................................................................................................................................................................................................................... 27 1 64.00 64.00 22.00 18.00 5.00 4.00 - 8.00 - - - - 1.00 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGCATA.................................................................................. 27 1 31.00 31.00 8.00 3.00 7.00 4.00 - 4.00 - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
........TGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGA......................................................................................................................................................................................................................... 25 1 28.00 28.00 8.00 8.00 3.00 5.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TAGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGTT................................................................................................................................................................................................................ 26 1 24.00 24.00 9.00 5.00 2.00 3.00 1.00 - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGCAT................................................................................... 26 1 23.00 23.00 5.00 7.00 - 1.00 - 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGGACGTTGGAGCTATCCGCATATCGGGc............................................................................ 30 c 21.00 0.00 1.00 - 2.00 - 3.00 - - 2.00 - - - - - - 4.00 1.00 6.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGAGGACTTGTACTGAGAAGAAAGCC............... 26 1 21.00 21.00 3.00 - - 1.00 7.00 1.00 1.00 3.00 - - - - - 2.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GAGAACGCACGTGGAAAGAAAGTTG............................................................................................................................................................................................................... 25 1 16.00 16.00 4.00 2.00 7.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGACGAGGGAATTACTTGAGGCGGT............................................. 25 1 13.00 13.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGGACGTTGGAGCTATCCGCATATC................................................................................ 26 1 13.00 13.00 - - - - 1.00 - 3.00 2.00 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAAG...................................................................................................................................................................................................................... 28 1 12.00 12.00 6.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..................GAGAACGCACGTGGAAAGAAAGTTGC.............................................................................................................................................................................................................. 26 1 11.00 11.00 - - 1.00 - 3.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TACTCAGCGACGGGGAAGGTCGGAAGG...................................................................................................................................................................... 27 1 11.00 11.00 7.00 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TACTCAGCGACGGGGAAGGTCGGAAG....................................................................................................................................................................... 26 1 10.00 10.00 3.00 3.00 1.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TAAGCGAAGGGACTTCTTTTCCTAGT........................................................................................................................................ 26 1 8.00 8.00 - - - - - - - - - - - - 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - -
..................................AGAAAGTTGCGGGGAGGTGAGGCTA............................................................................................................................................................................................... 25 1 7.00 7.00 3.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAAt...................................................................................................................................................................................................................... 28 t 7.00 64.00 2.00 2.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGACGAGGGAATTACTTGAGGCGGTG............................................ 26 1 7.00 7.00 - - 1.00 - - 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TAGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGTTG............................................................................................................................................................................................................... 27 1 7.00 7.00 2.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................CGGAAGGTGGATAAGCGAAGGGACTTC.................................................................................................................................................. 27 1 7.00 7.00 - - 5.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................ATCGGGGTGAGTCTGACGAGGG............................................................. 22 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TCCTCTTTTGCTAGGACGTTGGAGCTA.......................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - 1.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAt....................................................................................................................................................................................................................... 27 t 5.00 145.00 2.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGCGGTGACCTGAGGACTTGTACTGAGAAGA.................... 31 1 5.00 5.00 - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGACGAGGGAATTACTTGAGGCGG.............................................. 24 1 5.00 5.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAA........................................................................................................................................................................................................................ 25 1 4.00 4.00 2.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................GAAGGTCGGAAGGTGGATAAGCGA........................................................................................................................................................... 24 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAAGt..................................................................................................................................................................................................................... 29 t 4.00 12.00 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................GGGGAAGGTCGGAAGGTGGATAAGC............................................................................................................................................................. 25 1 4.00 4.00 - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TGGAGCTATCCGCATATCGGGctgg......................................................................... 25 ctgg 3.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGACGAGGGAATTACTTGAGGCGGg............................................. 25 g 3.00 5.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGCATt.................................................................................. 27 t 3.00 23.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GGACTGCGGACGTAGAGA.................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TTTTGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGCATA.................................................................................. 30 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TTTTGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGCAT................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TTTGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGCAT................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................GGAAGGTCGGAAGGTGGA.................................................................................................................................................................. 18 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................TTGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGCAT................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAAa...................................................................................................................................................................................................................... 28 a 3.00 64.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGAGGACTTGTACTGAGAAGAAAGC................ 25 1 3.00 3.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGCA.................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TCTGACGAGGGAATTACTTGAGGCGGTGACCTGA...................................... 34 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TAGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGT................................................................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAAG...................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGTT................................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TAAGCGAAGGGACTTCTTTTCCTAG......................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GGACTGCGGACGTAGAGAACGCACGT............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CGGACGTAGAGAACGCACGTGG.......................................................................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAAG...................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......ACTGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGA......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGGACGTTGGAGCTATCCGCATATCGG.............................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TTTTGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGC..................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................................CGGGGAAGGTCGGAAGGTG.................................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TCTGACGAGGGAATTACTTGAGGCGG.............................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........GCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAA....................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGAGGACTTGTACTGAGAAGAAAGCCAGC............ 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGGGGACTGCGGACGTAGAGAACGCACt............................................................................................................................................................................................................................. 28 t 2.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TAAGCGAAGGGACTTCTTTTCCTAGTT....................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TACTCAGCGACGGGGAAGGTCGGAA........................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................CGGTGACCTGAGGACTTGTACTGAGA....................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGACGAGGGAATTACTTGAGGCGGgg............................................ 26 gg 2.00 5.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CGTAGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGT................................................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAt........................................................................................................................................................................................................................ 26 t 2.00 28.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAAGA..................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TTTGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGCATA.................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TCTTTTGCTAGGACGTTGGAGCTATCC....................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGGACGTTGGAGCTATCCGCATATCGGGt............................................................................ 30 t 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................CTCTTTTGCTAGGACGTTGGAGCTA.......................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGGAAAGAAAGTTGCGGGGAGGacgt................................................................................................................................................................................................... 26 acgt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TAGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGat................................................................................................................................................................................................................ 26 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................TAGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGTTGC.............................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CGGACGTAGAGAACGCACG............................................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGACGAGGGAATTACTTGAGGCGGTGACC......................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................CTTTTGCTAGGACGTTGGAGCTAT......................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGGGCTCCTCTTTTGCTAGGACGTTGGt.............................................................................................. 28 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CGTAGAGAACGCACGTGGAAAGAAAG.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GAACGCACGTGGAAAGAAAG.................................................................................................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TTGGAGCTATCCGCATATCGGGctg.......................................................................... 25 ctg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............ACGTAGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGT................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GCTAGGACGTTGGAGCTAT......................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AGCGAAGGGACTTCTTTTCCTAGT........................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................AGTTTTAAACTGAGCCTTGGGCTCC.................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGGACGTTGGAGCTATCCGCATA.................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TACTGAGAAGAAAGCCAGCCCCA........ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TCTTTTGCTAGGACGTTGGAGCTATC........................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TAGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGTTGt.............................................................................................................................................................................................................. 28 t 1.00 7.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GGAAGGTGGATAAGCGAA.......................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GAACGCACGTGGAAAGAAAGTTGC.............................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.........GCGGACGTAGAGAACGCACGTGGA......................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGgat................................................................................... 26 gat 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGAACGCACGTGGAAAGAAAGTTGC.............................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGGAAAGAAAGTTGCGGGGAGGTGAG................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................AGGTCGGAAGGTGGATAAGCG............................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
........TGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAtt...................................................................................................................................................................................................................... 28 tt 1.00 145.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................ACCTGAGGACTTGTACTGAGAAGAAAGC................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TCTGACGAGGGAATTACTTGAGGCGGT............................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TTGCGGGGAGGTGAGGCTACTCAGC......................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................CGACGGGGAAGGTCGGAAGG...................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................AGGACGTTGGAGCTATCCGCATATCGGGc............................................................................ 29 c 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................GGAAAGAAAGTTGCGGGGAGGTGAGa.................................................................................................................................................................................................. 26 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AAGAAAGTTGCGGGGAGGTGAGGCTAC.............................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AAGCGAAGGGACTTCTTTTCCTAG......................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAAGAAt................................................................................................................................................................................................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AAGCGAAGGGACTTCTTTTCCTAGT........................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TTTTGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGCct................................................................................... 29 ct 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGTTG............................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................AACTGAGCCTTGGGCTCC.................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.TGGGGACTGCGGACGTAGAGAACG................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GTGAGTCTGACGAGGGAATTACTTGA................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGGATAAGCGAAGGGACTTCTTTTCC............................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AGGACTTGTACTGAGAAGAAAGCCAGC............ 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGCACGTGGAAAGAAAGTTGCGGGGA......................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGGACGTTGGAGCTATCCGC..................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TACTGAGAAGAAAGCCAGCCCCACCAC.... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................AAAGAAAGTTGCGGGGAGGTGAG................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGGGGACTGCGGACGTAGAGAACGCAC.............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TAGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGTTa............................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 24.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............ACGTAGAGAACGCACGTGGAAAGAAAtt................................................................................................................................................................................................................. 28 tt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGCATATC................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GGACGTAGAGAACGCACGTGGAAAG...................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCGGAAGGTGGATAAGC............................................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................AGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGTTGC.............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGAGGACTTGTACTGAGAAGA.................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TCAGCGACGGGGAAGGTCGGAAGGg..................................................................................................................................................................... 25 g 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............GTAGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGT................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GAAGGTGGATAAGCGAAGGGACTTCTT................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGCc.................................................................................... 25 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................ACGTGGAAAGAAAGTTGC.............................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TCCTCTTTTGCTAGGACGTTGGAGC............................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GAGGACTTGTACTGAGAAGAAAGCCAGC............ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAAGAA.................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GGAAGGTGGATAAGCGAAGGGACTTC.................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GACTGCGGACGTAGAGAACGCACGTG........................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CGTTGGAGCTATCCGCATATCGGGctg.......................................................................... 27 ctg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................ACGGGGAAGGTCGGAAGG...................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TTGGGCTCCTCTTTTGCTAGGACGTT................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................AAGGTCGGAAGGTGGATAAGCGAAGG........................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TCGGGGTGAGTCTGACGAGGG............................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................AAAGAAAGTTGCGGGGAGGTGAGGCT................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................GACGTTGGAGCTATCCGCATATCGGGct........................................................................... 28 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................AGAAAGTTGCGGGGAGGTGAGGCT................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TCTGACGAGGGAATTACTTGAtgcg............................................... 25 tgcg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TGGAAAGAAAGTTGCGGGGAGGTG..................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTCGGAAGGTGGATAAGC............................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TATCCGCATATCGGGGTGAGTCTGAC.................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...GGGACTGCGGACGTAGAGAACGCACGTGG.......................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GGACTTGTACTGAGAAGAAAGCCAGCCC.......... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................CTGACGAGGGAATTACTTGAGGCGGgg............................................ 27 gg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................GAAGGTCGGAAGGTGGATAAGCGAAGt........................................................................................................................................................ 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................TACTGAGAAGAAAGCCAGCCCCACC...... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TAGGACGTTGGAGCTATCCGCATATCGGGa............................................................................ 30 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGGGCTCCTCTTTTGCTAGGACGTT................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
............................GTGGAAAGAAAGTTGCGGG........................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......CTGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGA......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TATCGGGGTGAGTCTGACGAGGGAAT.......................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................GAGAACGCACGTGGAAAGAAAG.................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TCCTCTTTTGCTAGGACGTTGGAGCT........................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TCCTCTTTTGCTAGGACGTTGGAGCTATC........................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................GCGACGGGGAAGGTCGGAAGG...................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGGCTACTCAGCGACGGGGAAGGTC............................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................AGGACTTGTACTGAGAAGA.................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TCCGCATATCGGGGTGAGTCTGACG................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGCGGACGTAGAGAACGCACGTG........................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................TGACGAGGGAATTACTTGAGGCGGTGgc.......................................... 28 gc 1.00 7.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................GGCTCCTCTTTTGCTAGGACGTTGGAGC............................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AAGCGAAGGGACTTCTTTTCCTAGTT....................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TGGAGCTATCCGCATATCGGGc............................................................................ 22 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GTGGGGACTGCGGACGTAGAGAACGCACGTGGAAAGAAAGTTGCGGGGAGGTGAGGCTACTCAGCGACGGGGAAGGTCGGAAGGTGGATAAGCGAAGGGACTTCTTTTCCTAGTTTTAAACTGAGCCTTGGGCTCCTCTTTTGCTAGGACGTTGGAGCTATCCGCATATCGGGGTGAGTCTGACGAGGGAATTACTTGAGGCGGTGACCTGAGGACTTGTACTGAGAAGAAAGCCAGCCCCACCACGGAA
....................................................(((....)))..((((.......)))).......((((.(((...((.((((...(((((((........(((((...))))).......)))))))....))))))...))).))))................................................................................
....................................................53.....................................................................................................................172............................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
..............................................................AGCGACGGGGAAGGTCGGAAGGTGGA.................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GCTCCTCTTTTGCTAGGACGTTGGAGCTA.......................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................TTAAACTGAGCCTTGGGCTCCTCTTTTGCTA........................................................................................................ 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TCCTCTTTTGCTAGGACGTTGGAGCTA.......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GATAAGCGAAGGGACTTCTTTTCCTA.......................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -