(1)
OTHER.ip
(6)
OTHER.mut
(7)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(33)
TESTES

Sense strand
TGGCTGTTCAAAGATGCGTGGTGCGGATCCGTTCAGACTTGAAGGCAGAGGTTAGTACTCTCAACCACTGAATGGCGTTATGCATGAAGTCTTAACTTAGCACAGCACCATTTAGAATTGCTCCTTTTTCCCGGCCCAGGCTCTGGCGTCAGCAATAGCATCAACCAAGGTCATGAAAGCTCAGCAAGT
..................................................(((((............((((((((.(((.(((...((((....)))).))).))).)))))))).................(((....))))))))..........................................
..................................................51................................................................................................149......................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
..................................................GTTAGTACTCTCAACCACTGAATGGCGTT.............................................................................................................. 29 1 11.00 11.00 - 3.00 5.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGCGGATCCGTTCAGACTTGAAGGCA.............................................................................................................................................. 26 1 11.00 11.00 - 4.00 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................GATCCGTTCAGACTTGAAGGCAGAGG.......................................................................................................................................... 26 1 11.00 11.00 - - - 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TCCGTTCAGACTTGAAGGCAGAGGctc....................................................................................................................................... 27 ctc 9.00 0.00 - 2.00 2.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTTAGTACTCTtcg............................................................................................................................. 15 tcg 7.00 0.00 6.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTTAGTACTCTCAACCACTGAATGGCGT............................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 - 1.00 2.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTTAGTACTCTCAACCACTGAATGGCG................................................................................................................ 27 1 5.00 5.00 - 1.00 - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...........................TCCGTTCAGACTTGAAGGCAGAGGctct...................................................................................................................................... 28 ctct 4.00 0.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTTAGTACTCTgcgc............................................................................................................................ 16 gcgc 4.00 0.00 - - - - - - - 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTTAGTACTCTtcgt............................................................................................................................ 16 tcgt 4.00 0.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTTAGTACTCTgagt............................................................................................................................ 16 gagt 4.00 0.00 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTTAGTACTCTgcga............................................................................................................................ 16 gcga 4.00 0.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TCCGTTCAGACTTGAAGGCAGAGGct........................................................................................................................................ 26 ct 3.00 0.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTTAGTACTCTacg............................................................................................................................. 15 acg 3.00 0.00 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CAAAGATGCGTGGTGCGGATCCGTTC........................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
................................................................................................................................................................TCAACCAAGGTCATGAAAGCTCAGCAA.. 27 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTTAGTACTCTgggt............................................................................................................................ 16 gggt 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGCGGATCCGTTCAGACTTGAAGGCAG............................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GATCCGTTCAGACTTGAAGGCAGAGGc......................................................................................................................................... 27 c 2.00 11.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
......................GCGGATCCGTTCAGACTTGAAGGCAG............................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TCAAAGATGCGTGGTGCGGATCCGTTC........................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTTAGTACTCggcg............................................................................................................................. 15 ggcg 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CGTGGTGCGGATCCGTTCAGACTTGAAGG................................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGCATCAACCAAGGTCATGAAAGC......... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00
..............................................AGAGGTTAGTACTCTgcg............................................................................................................................. 18 gcg 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGCGGATCCGTTCAGACTTGAAGGC............................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................ATCCGTTCAGACTTGAAGGCAGAGGct........................................................................................................................................ 27 ct 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TCAACCAAGGTCATGAAAGCTCAGCAAGT 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGCATCAACCAAGGTCATGAAAGCTC....... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TCTGGCGTCAGCAATAGCATCAACCAA..................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TTCAAAGATGCGTGGTGCGGATCCGTT............................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGCGGATCCGTTCAGACTTGAAGGCAGA............................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TGTTCAAAGATGCGTGGTGCGGctcc............................................................................................................................................................... 26 ctcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GGATCCGTTCAGACTTGAAGGCAGAGG.......................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................AGAGGTTAGTACTCTgc.............................................................................................................................. 17 gc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CGTTCAGACTTGAAGGCAGAGGctct...................................................................................................................................... 26 ctct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................GTTAGTACTCTCAACCACTGAATGGCGTTA............................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTTAGTACTCTgcgg............................................................................................................................ 16 gcgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GATCCGTTCAGACTTGAAGGCAGAGGctc....................................................................................................................................... 29 ctc 1.00 11.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TCAACCAAGGTCATGAAAGCTCAGCA... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................AGAGGTTAGTACTCTgcgt............................................................................................................................ 19 gcgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TCCGTTCAGACTTGAAGGCAGAGGctt....................................................................................................................................... 27 ctt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TCAACCAAGGTCATGAAAGCTCAGCAAG. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTTAGTACTCTgcg............................................................................................................................. 16 gcg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CGTTCAGACTTGAAGGCAGAGGcact...................................................................................................................................... 26 cact 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...CTGTTCAAAGATGCGTGGTGCGGATC................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................AGCATCAACCAAGGTCATGAAAGCTCAG..... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TTCCCGGCCCAGGCacca............................................ 18 acca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.........................................................................................................................................AGGCTCTGGCGTCAGCAATAGCATC........................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
......TTCAAAGATGCGTGGTGCGGATCCGT............................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGCATCAACCAAGGTCATGAAAGCTCAGC.... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TCAACCAAGGTCATGAAAGCTCAtc.... 25 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...............GCGTGGTGCGGATCCGTTCAGACTT..................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GTGCGGATCCGTTCAGACTTGAAGGCA.............................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................GTCATGAAAGCTCAGCAAG. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TGCGGATCCGTTCAGACTTGAAGGCAGt............................................................................................................................................ 28 t 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TAGCATCAACCAAGGTCATGAAAGCT........ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................GCATCAACCAAGGTCATGAAAGCT........ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...............................................GAGGTTAGTACTCTgcg............................................................................................................................. 17 gcg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CAAAGATGCGTGGTGCGGATCCGTTCA.......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTTAGTACTCTgcgt............................................................................................................................ 17 gcgt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TGGCTGTTCAAAGATGCGTGGTGCGGATCCGTTCAGACTTGAAGGCAGAGGTTAGTACTCTCAACCACTGAATGGCGTTATGCATGAAGTCTTAACTTAGCACAGCACCATTTAGAATTGCTCCTTTTTCCCGGCCCAGGCTCTGGCGTCAGCAATAGCATCAACCAAGGTCATGAAAGCTCAGCAAGT
..................................................(((((............((((((((.(((.(((...((((....)))).))).))).)))))))).................(((....))))))))..........................................
..................................................51................................................................................................149......................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)