(1)
OTHER.ip
(2)
OTHER.mut
(5)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(24)
TESTES

Sense strand
GTTACCTCCCTCTGTTCTACCTAGCAGCAGCCTCTCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGCTCTGTCTCACCACATCAGTGTACAGATGTGTATCTGATGGGAAATACAGAAACTGTGGCTCATAGTGCCAGGTTCCAGAAGATTCTATGGTTGCCCATGGTATCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTCTGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGACTGGAAATACGTGGCCATGGTCATTGACCGAATCTTCCT
..................................................................................................(((((....((((...))))(((((.(((((((((((.(((..........)))..)))..))))).))).))))).......)))))................................................................
.........................................................................................90..................................................................................................190..........................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
...............................................................................................................................................................TGGTATCTGAGAGCTAGAATGACCCAT................................................................ 27 1 165.00 165.00 59.00 40.00 28.00 24.00 2.00 - 1.00 3.00 1.00 - 5.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTCTG........................................................... 27 1 121.00 121.00 27.00 29.00 15.00 17.00 6.00 9.00 1.00 9.00 3.00 - 2.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - -
..............................................................................................TCTGATGGGAAATACAGAAACTGTGGCT................................................................................................................................ 28 1 108.00 108.00 43.00 30.00 21.00 11.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTATCTGAGAGCTAGAATGACCCATG............................................................... 28 1 82.00 82.00 19.00 26.00 14.00 17.00 4.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTCTGT.......................................................... 28 1 61.00 61.00 23.00 20.00 6.00 7.00 1.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TCTGATGGGAAATACAGAAACTGTGGCTC............................................................................................................................... 29 1 50.00 50.00 13.00 11.00 5.00 3.00 6.00 3.00 - - 3.00 - 1.00 1.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - -
..............................................................................................TCTGATGGGAAATACAGAAACTGTGGC................................................................................................................................. 27 1 39.00 39.00 11.00 4.00 - 5.00 4.00 9.00 - - 3.00 - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - -
...............................................................................................................................................................TGGTATCTGAGAGCTAGAATGACCCA................................................................. 26 1 34.00 34.00 11.00 7.00 4.00 7.00 - 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGAGAGCTAGAATGACCCATGTCTGT.......................................................... 26 1 30.00 30.00 7.00 13.00 - - 1.00 2.00 6.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTCT............................................................ 26 1 23.00 23.00 12.00 1.00 3.00 3.00 - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - -
..................................TCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATG............................................................................................................................................................................................. 27 1 22.00 22.00 10.00 8.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCTACCTAGCAGCAGCCTCTCTGACCCT............................................................................................................................................................................................................... 28 1 20.00 20.00 9.00 5.00 4.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTATCTGAGAGCTAGAATGACCCATGT.............................................................. 29 1 19.00 19.00 5.00 3.00 5.00 3.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 -
.............................................................................................................................................................................................TGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGACTGG................................... 26 1 8.00 8.00 - - - - 4.00 1.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTATCTGAGAGCTAGAATGACCC.................................................................. 25 1 8.00 8.00 1.00 - - - 3.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................TCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGC............................................................................................................................................................................................ 28 1 8.00 8.00 1.00 2.00 - 1.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...............TCTACCTAGCAGCAGCCTCTCTGACCC................................................................................................................................................................................................................ 27 1 8.00 8.00 4.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TGTTCTACCTAGCAGCAGCCTCTCTGA................................................................................................................................................................................................................... 27 1 7.00 7.00 - 1.00 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - -
..................................TCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCAT.............................................................................................................................................................................................. 26 1 7.00 7.00 - 5.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGCTC.......................................................................................................................................................................................... 28 1 7.00 7.00 2.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTATCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTC............................................................. 30 1 6.00 6.00 - - - - 1.00 2.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TAGTGCCAGGTTCCAGAAGATTCTAT.................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 1.00 1.00 - - - - - - - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TATGGTTGCCCATGGTATCTGAGAGCT............................................................................ 27 1 6.00 6.00 - - - - - - 2.00 - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TGTCTGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGAC...................................... 27 1 5.00 5.00 - - - - 2.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TAGTGCCAGGTTCCAGAAGATTCTATG................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGGTGAAGGAGGACTGGAAAT............................... 25 1 5.00 5.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGAGAGCTAGAATGACCCATGTCTG........................................................... 25 1 5.00 5.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - -
..........................................TGCAGATTCTCTGGCCATGCTCTGTC...................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGCT........................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................TTCTCTGGCCATGCTCTGTCTCACCACATC............................................................................................................................................................................ 30 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATa............................................................................................................................................................................................. 27 a 4.00 7.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTCTACCTAGCAGCAGCCTCTCTGACCC................................................................................................................................................................................................................ 28 1 4.00 4.00 - 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTCTACCTAGCAGCAGCCTCTCTGACC................................................................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTC............................................................. 25 1 3.00 3.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TAGAATGACCCATGTCTGTGTTTGCAGG................................................. 28 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGGTGAAGGAGGACTGGAAATAC............................. 26 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTATCTGAGAGCTAGAATGACC................................................................... 24 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGGTGAAGGAGGACTGGAAA................................ 24 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTATCTGAGAGCTAGAATGACCCATa............................................................... 28 a 3.00 165.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TGATGGGAAATACAGAAACTGTGGCT................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TAGAATGACCCATGTCTGTGTTTGCAGGT................................................ 29 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................TCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGCT........................................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGACTGt................................... 26 t 3.00 0.00 - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTATCTGAGAGCTAGAATGACCaa................................................................. 26 aa 2.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGAGAGCTAGAATGACCCATGTCTGTG......................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................CTGAGAGCTAGAATGACCCATGTCTGT.......................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGACTGGAAA................................ 29 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................TGGTTGCCCATGGTATCTGAGAGCTA........................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................TCTCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCA............................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................GGAGGACTGGAAATACGTGGCCATG.................... 25 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGAAATACGTGGCCATGGTCATTGACCGA........ 30 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TATCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTCTG........................................................... 29 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCTGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGACT..................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TGTCTGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGA....................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTATCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTaa............................................................ 31 aa 2.00 19.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TCTGATGGGAAATACAGAAACTGTGG.................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TCCCTCTGTTCTACCTAGCAGCAGCCTC........................................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TGTTCTACCTAGCAGCAGCCTCTCTG.................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGt............................................................................................................................................................................................ 28 t 2.00 22.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGCTa.......................................................................................................................................................................................... 30 a 2.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGGTGAAGGAGGACTGGAAATAC............................. 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGGTGAAGGAGGACTGGAAATA.............................. 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGCCCATGGTATCTGAGAGCTAGAATGAC.................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TATGGTTGCCCATGGTATCTGAGAGCTA........................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................TGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGCTCT......................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGCCCATGGTATCTGAGAGCTAGAATGACC................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................CTCTGGCCATGCTCTGTCTCACCACAT............................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......TCCCTCTGTTCTACCTAGCAGCAGCCTCT....................................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAAGGAGGACTGGAAATACGTGGCC....................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGaa........................................................................................................................................................................................... 29 aa 2.00 22.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CTCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCA............................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGGTGAAGGAGGACTGGAAAaa.............................. 26 aa 1.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTATCTGAGAGCTAGAATGACCCATt............................................................... 28 t 1.00 165.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGTCTCACCACATCAGTGTACAGATGT............................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTCa............................................................ 26 a 1.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTCTGTGTT....................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TCTGATGGGAAATACAGAAACTGTGGtt................................................................................................................................ 28 tt 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGC............................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TGCAGATTCTCTGGCCATGCTCTGTCT..................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CCATGGTATCTGAGAGCTAGAATGACC................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CCAGAAGATTCTATGGTTGCCCATGGT....................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TCTGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGAC...................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................GAAGGAGGACTGGAAATACGTGGCCA...................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................ATCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTCTGT.......................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TGTCTGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGAg...................................... 27 g 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TTCTATGGTTGCCCATGGTATCTGAGA............................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.................TACCTAGCAGCAGCCTCTCTGACCCT............................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAGGACTGGAAATACGTGGCCATGGTC................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TGCTCTGTCTCACCACATCAGTGTACAG................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGCTCTt........................................................................................................................................................................................ 30 t 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TGCCCATGGTATCTGAGAGCTAGAATGACCC.................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TATGGTTGCCCATGGTATCTGAGAGCTAag......................................................................... 30 ag 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CATAGTGCCAGGTTCCAGAAGATTCccg.................................................................................................... 28 ccg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............TGTTCTACCTAGCAGCAGCCTCTCTGAC.................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTATCTGAGAGCTAGAATG...................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TGAAGGAGGACTGGAAATACGTGGCaaa..................... 28 aaa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCA............................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCATAGTGCCAGGTTCCAGAAGATTCTAT.................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CTACCTAGCAGCAGCCTCTCTGACCC................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TAGAATGACCCATGTCTGTGTTTGCAGt................................................. 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.................................CTCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCAT.............................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGACTGGA.................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................AGGAGGACTGGAAATACGTGGCCATGt................... 27 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCTACCTAGCAGCAGCCTCTCTGACC................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TGCAGATTCTCTGGCCATG............................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGAAATACGTGGCCATGGTCATTGAC........... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TCTCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCAT.............................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTCTGTGT........................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTCaatt......................................................... 29 aatt 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................ATGTGTATCTGATGGGAAATACAGAAACT...................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GCCCATGGTATCTGAGAGCTAGAATGACC................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TATGGTTGCCCATGGTATCTGAGAG.............................................................................. 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................CTGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGACT..................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TCTGATGGGAAATACAGAAACTGgct.................................................................................................................................. 26 gct 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................GGTATCTGAGAGCTAGAATGACCCATG............................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTATCTGAGAGCTAGAATGACCCATGc.............................................................. 29 c 1.00 82.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TTGCAGGTGAAGGAGGACTGGAAAa............................... 25 a 1.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTTGCAGGTGAAGGAGGACTGGAAAT............................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TGTCTGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGACT..................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TCTGATGGGAAATACAGAAACTGTGGCTa............................................................................................................................... 29 a 1.00 108.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TACCTCCCTCTGTTCTACCTAGCAGCA............................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGGTGAAGGAGGACTGGAAAT............................... 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TACAGATGTGTATCTGATGGGAAATACAGt.......................................................................................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TGTCTGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGtt...................................... 27 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CATAGTGCCAGGTTCCAGAAGATTCTA..................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TGCCAGGTTCCAGAAGATTCTATGGTT................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TAGTGCCAGGTTCCAGAAGATTCTATGG.................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................GTGTTTGCAGGTGAAGGAGGACTGGAAAa............................... 29 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................ATCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTCTGTGT........................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TATCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTC............................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TGGGAAATACAGAAACTGTGGCTCATAGT.......................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TGGAAATACGTGGCCATGGTCATTGACtgta....... 31 tgta 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATaatt.......................................................................................................................................................................................... 30 aatt 1.00 7.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TCTGATGGGAAATACAGAAACTGTGctc................................................................................................................................ 28 ctc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGGTGAAGGAGGACTGGAAATACGT........................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATG............................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TCTCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATG............................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................GCCTCTCTGACCCTGCAGATTCTCTGG.................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TGTCTGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGACTGGAA................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....................................TGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGC............................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GCAGGTGAAGGAGGACTGGAAATAC............................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGAGAGCTAGAATGACCCATGTCT............................................................ 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................CATGGTATCTGAGAGCTAGAATGACC................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGCa........................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 8.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TACCTAGCAGCAGCCTCTCTGACC................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TGGGAAATACAGAAACTGTGGCTCATAG........................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GTATCTGAGAGCTAGAATGACCCATGT.............................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TACGTGGCCATGGTCATTGACCGAATCTTCC. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TTCTACCTAGCAGCAGCCTCTCTGACCCT............................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................CAGAAGATTCTATGGTTGCCCATGGT....................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TGTCTGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGACTG.................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................CCCATGGTATCTGAGAGCTAGAATGAC.................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATaat........................................................................................................................................................................................... 29 aat 1.00 7.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................GGTGAAGGAGGACTGGAAATACGTG.......................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TACGTGGCCATGGTCATTGACCGAATCTTC.. 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................AGAGCTAGAATGACCCATGTCTGTGTT....................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................TGTGTATCTGATGGGAAATACAGAAAC....................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................AGTGCCAGGTTCCAGAAGATTCTATGG.................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..................................TCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGCTC.......................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TAGCAGCAGCCTCTCTGACCCTGCAatt......................................................................................................................................................................................................... 28 att 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGCa........................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AGGACTGGAAATACGTGGCCATGGTC................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGAGAGCTAGAATGACCCATGTCTGTGTT....................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TGTTCTACCTAGCAGCAGCCTCTCTGACC................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TATGGTTGCCCATGGTATCTGAGAGgct........................................................................... 28 gct 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
................................................................................................TGATGGGAAATACAGAAACTGTGGCTC............................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTATCTGAGAGCTAGAATGAC.................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGGTGAAGGAGGACTGGAAA................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GAGAGCTAGAATGACCCATGTCTGTGT........................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TCTGAGAGCTAGAATGACC................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GTTACCTCCCTCTGTTCTACCTAGCAGCAGCCTCTCTGACCCTGCAGATTCTCTGGCCATGCTCTGTCTCACCACATCAGTGTACAGATGTGTATCTGATGGGAAATACAGAAACTGTGGCTCATAGTGCCAGGTTCCAGAAGATTCTATGGTTGCCCATGGTATCTGAGAGCTAGAATGACCCATGTCTGTGTTTGCAGGTGAAGGAGGACTGGAAATACGTGGCCATGGTCATTGACCGAATCTTCCT
..................................................................................................(((((....((((...))))(((((.(((((((((((.(((..........)))..)))..))))).))).))))).......)))))................................................................
.........................................................................................90..................................................................................................190..........................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
................................................................................................................................GCCAGGTTCCAGAAG........................................................................................................... 15 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08