| Gene: AK005093 | ID: uc008ohh.1_intron_0_0_chr2_177758087_f.5p | SPECIES: mm9 |
![]() |
|
(7) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(7) PIWI.ip |
(2) PIWI.mut |
(31) TESTES |
| CTACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGTAAGTGCCAGGTCATCTCCTGCGGTGCTGTCGGTGTGGGGAAAAGAGGGGAGTGGGAGAGAACTCGCTTCTGGCCAGAGTTCCGTTGCCCAGGGCAGGCAGGAAAGGGAGGACTGCAGGACGCTTTCCACATGGCCCGGGGTGGCGTTCTGGCCGTGGGAAGGCACGGACCCAACTCGGTGGGTGGTGGAAAAGGGCAG |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...............................................................CATCTCCTGCGGTGCTGTCGGTGTGGGGAAAAGAGGGGAGTGGGAGAGAACT....................................................................................................................................... | 52 | 1 | 84.00 | 84.00 | 84.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGat..................................................................................................................................................................................................... | 29 | at | 29.00 | 0.00 | - | 6.00 | 4.00 | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | 4.00 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGatt.................................................................................................................................................................................................... | 30 | att | 27.00 | 0.00 | - | 1.00 | 6.00 | 3.00 | 2.00 | 2.00 | 4.00 | - | 1.00 | 5.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtg...................................................................................................................................................................................................... | 28 | tg | 24.00 | 0.00 | - | 6.00 | 1.00 | 6.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGTt..................................................................................................................................................................................................... | 29 | t | 20.00 | 0.00 | - | 7.00 | 2.00 | - | - | - | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGa...................................................................................................................................................................................................... | 28 | a | 14.00 | 0.00 | - | 4.00 | 5.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtgtc.................................................................................................................................................................................................... | 30 | tgtc | 13.00 | 0.00 | - | - | 3.00 | 3.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtgt..................................................................................................................................................................................................... | 29 | tgt | 13.00 | 0.00 | - | 2.00 | 3.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGt....................................................................................................................................................................................................... | 27 | t | 12.00 | 0.00 | - | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGattt................................................................................................................................................................................................... | 31 | attt | 3.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAGTt............................................................................................................................................................................................................................. | 28 | t | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................................................GGTGGGTGGTGGAAAAa..... | 17 | a | 2.00 | 0.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................GTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtgtc.................................................................................................................................................................................................... | 28 | tgtc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................................................GTGGCGTTCTGGtag............................................ | 15 | tag | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAGg.............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........TGTGAGAGAAGGTTAGTCAAGCac....................................................................................................................................................................................................................... | 24 | ac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGca..................................................................................................................................................................................................... | 29 | ca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................................................................TGGGAAGGCACGGACCCAACTCGGTGGa................ | 28 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................AGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtgtc.................................................................................................................................................................................................... | 29 | tgtc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................TCGGTGGGTGGTGGtgc....... | 17 | tgc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTtgt.............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | tgt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................TTAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGa...................................................................................................................................................................................................... | 29 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................GTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtg...................................................................................................................................................................................................... | 26 | tg | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........TTGTGAGAGAAGGTTAGTCAAGCTCc...................................................................................................................................................................................................................... | 26 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtgac.................................................................................................................................................................................................... | 30 | tgac | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGgta................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | gta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAt............................................................................................................................................................................................................................... | 26 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................TCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGTtac................................................................................................................................................................................................... | 28 | tac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................CAGGTCATCTCCTGCGGTGCTGTCGGTG.................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| .........................AGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGat..................................................................................................................................................................................................... | 28 | at | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAGTtt............................................................................................................................................................................................................................ | 29 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACAcgt....................................................................................................................................................................................................... | 27 | cgt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..ACTGGGTGTTGTGAGAGAAGtgtc................................................................................................................................................................................................................................ | 24 | tgtc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGgtct............................................................................................................................................................................................................................... | 26 | gtct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGTAAt................................................................................................................................................................................................... | 31 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................................................................................................TCGGTGGGTGGTGGgcaa...... | 18 | gcaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGaaga................................................................................................................................................................................................... | 31 | aaga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGaa..................................................................................................................................................................................................... | 29 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGagga................................................................................................................................................................................................... | 31 | agga | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................GTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGTg..................................................................................................................................................................................................... | 27 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAGgt............................................................................................................................................................................................................................. | 28 | gt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGTc..................................................................................................................................................................................................... | 29 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtgg..................................................................................................................................................................................................... | 29 | tgg | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................AGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGa...................................................................................................................................................................................................... | 27 | a | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAGa.............................................................................................................................................................................................................................. | 27 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................................................................................CGGTGGGTGGTGGAAAAG..... | 18 | 10 | 0.10 | 0.10 | - | - | - | 0.10 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| CTACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGTAAGTGCCAGGTCATCTCCTGCGGTGCTGTCGGTGTGGGGAAAAGAGGGGAGTGGGAGAGAACTCGCTTCTGGCCAGAGTTCCGTTGCCCAGGGCAGGCAGGAAAGGGAGGACTGCAGGACGCTTTCCACATGGCCCGGGGTGGCGTTCTGGCCGTGGGAAGGCACGGACCCAACTCGGTGGGTGGTGGAAAAGGGCAG |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ........................................................GCCAGGTCATCTCCTGCGGTGCTGTC........................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................AGGACTGCAGGACGCTTTCCACAaa.................................................................... | 25 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |