(7)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(31)
TESTES

Sense strand
CTACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGTAAGTGCCAGGTCATCTCCTGCGGTGCTGTCGGTGTGGGGAAAAGAGGGGAGTGGGAGAGAACTCGCTTCTGGCCAGAGTTCCGTTGCCCAGGGCAGGCAGGAAAGGGAGGACTGCAGGACGCTTTCCACATGGCCCGGGGTGGCGTTCTGGCCGTGGGAAGGCACGGACCCAACTCGGTGGGTGGTGGAAAAGGGCAG


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
...............................................................CATCTCCTGCGGTGCTGTCGGTGTGGGGAAAAGAGGGGAGTGGGAGAGAACT....................................................................................................................................... 52 1 84.00 84.00 84.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGat..................................................................................................................................................................................................... 29 at 29.00 0.00 - 6.00 4.00 1.00 - 2.00 1.00 4.00 2.00 2.00 1.00 - 2.00 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGatt.................................................................................................................................................................................................... 30 att 27.00 0.00 - 1.00 6.00 3.00 2.00 2.00 4.00 - 1.00 5.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtg...................................................................................................................................................................................................... 28 tg 24.00 0.00 - 6.00 1.00 6.00 2.00 - - - 1.00 - 2.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGTt..................................................................................................................................................................................................... 29 t 20.00 0.00 - 7.00 2.00 - - - - 6.00 - - - - - - - - - 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGa...................................................................................................................................................................................................... 28 a 14.00 0.00 - 4.00 5.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtgtc.................................................................................................................................................................................................... 30 tgtc 13.00 0.00 - - 3.00 3.00 5.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtgt..................................................................................................................................................................................................... 29 tgt 13.00 0.00 - 2.00 3.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGt....................................................................................................................................................................................................... 27 t 12.00 0.00 - 1.00 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - 2.00 - 1.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGattt................................................................................................................................................................................................... 31 attt 3.00 0.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAGTt............................................................................................................................................................................................................................. 28 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................GGTGGGTGGTGGAAAAa..... 17 a 2.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtgtc.................................................................................................................................................................................................... 28 tgtc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................GTGGCGTTCTGGtag............................................ 15 tag 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAGg.............................................................................................................................................................................................................................. 27 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TGTGAGAGAAGGTTAGTCAAGCac....................................................................................................................................................................................................................... 24 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGca..................................................................................................................................................................................................... 29 ca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGGGAAGGCACGGACCCAACTCGGTGGa................ 28 a 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtgtc.................................................................................................................................................................................................... 29 tgtc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TCGGTGGGTGGTGGtgc....... 17 tgc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTtgt.............................................................................................................................................................................................................................. 27 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.......................TTAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGa...................................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtg...................................................................................................................................................................................................... 26 tg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TTGTGAGAGAAGGTTAGTCAAGCTCc...................................................................................................................................................................................................................... 26 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtgac.................................................................................................................................................................................................... 30 tgac 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGgta................................................................................................................................................................................................................................ 25 gta 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAt............................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGTtac................................................................................................................................................................................................... 28 tac 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................CAGGTCATCTCCTGCGGTGCTGTCGGTG.................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.........................AGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGat..................................................................................................................................................................................................... 28 at 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAGTtt............................................................................................................................................................................................................................ 29 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACAcgt....................................................................................................................................................................................................... 27 cgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..ACTGGGTGTTGTGAGAGAAGtgtc................................................................................................................................................................................................................................ 24 tgtc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGgtct............................................................................................................................................................................................................................... 26 gtct 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGTAAt................................................................................................................................................................................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TCGGTGGGTGGTGGgcaa...... 18 gcaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGaaga................................................................................................................................................................................................... 31 aaga 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGaa..................................................................................................................................................................................................... 29 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGagga................................................................................................................................................................................................... 31 agga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGTg..................................................................................................................................................................................................... 27 g 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAGgt............................................................................................................................................................................................................................. 28 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGTc..................................................................................................................................................................................................... 29 c 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGtgg..................................................................................................................................................................................................... 29 tgg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGa...................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAGa.............................................................................................................................................................................................................................. 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................CGGTGGGTGGTGGAAAAG..... 18 10 0.10 0.10 - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTACTGGGTGTTGTGAGAGAAGGTTAGTCAAGCTCAGAACTCCAAACATGGTAAGTGCCAGGTCATCTCCTGCGGTGCTGTCGGTGTGGGGAAAAGAGGGGAGTGGGAGAGAACTCGCTTCTGGCCAGAGTTCCGTTGCCCAGGGCAGGCAGGAAAGGGAGGACTGCAGGACGCTTTCCACATGGCCCGGGGTGGCGTTCTGGCCGTGGGAAGGCACGGACCCAACTCGGTGGGTGGTGGAAAAGGGCAG


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014235(GSM319959)
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mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
........................................................GCCAGGTCATCTCCTGCGGTGCTGTC........................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................AGGACTGCAGGACGCTTTCCACAaa.................................................................... 25 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -