(6)
OTHER.mut
(5)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(31)
TESTES

Sense strand
CGCCTCTGCCTCGGTGTTAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAGTCGTCCTCGGTAAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAAGGTTTTCGGGACAGATAGCTCCCTTCAGATTCACCTTCGCTCCCACACCGGAGAGAGACCTTACGTGTGCCCTATCTGTGGTCACCGCTTCACCACCAAGGGCAATCTCAAGGTCCACTTACAACGACACCCTGAGGTGAAGGCAAACCCCCAGCTGTTGGCCGAATTCCAG
......................................................((((..(((.((((.(((((((.........)))))))......................((.((((......)))).)).)))))))))))(((((....(((((.........)))))..))))).....................................................................
..................................................51.................................................................................................................................182..................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
...................................................TAAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCA............................................................................................................................................................................. 26 1 28.00 28.00 10.00 5.00 4.00 5.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
....................................................AAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAA............................................................................................................................................................................ 26 1 20.00 20.00 4.00 4.00 7.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TCGGTGTTAGATGTCAAGGCCAAGGA...................................................................................................................................................................................................................... 26 1 16.00 16.00 4.00 1.00 4.00 3.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGTTAGATGTCAAGGCCAAGGACGAA.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 14.00 14.00 5.00 4.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
....................................................AAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAAG........................................................................................................................................................................... 27 1 13.00 13.00 3.00 5.00 2.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAGTCGT............................................................................................................................................................................................................. 29 1 12.00 12.00 2.00 1.00 1.00 - 3.00 - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..............TGTTAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAG................................................................................................................................................................................................................. 27 1 10.00 10.00 4.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TAGGTACTGTCCCAAGGTTTTCGGGA................................................................................................................................................................. 26 1 10.00 10.00 1.00 3.00 2.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CAAGTGTAGGTACTGTCCCAAGGTTT....................................................................................................................................................................... 26 1 8.00 8.00 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 -
..........TCGGTGTTAGATGTCAAGGCCAAGGAC..................................................................................................................................................................................................................... 27 1 8.00 8.00 - 3.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............TGTTAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAGTC............................................................................................................................................................................................................... 29 1 8.00 8.00 4.00 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TCGGTGTTAGATGTCAAGGCCAAGGACGA................................................................................................................................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 2.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTGCCTCGGTGTTAGATGTCAAGGCC........................................................................................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAGTCGT............................................................................................................................................................................................................. 28 1 6.00 6.00 - 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....TCTGCCTCGGTGTTAGATGTCAAGGC............................................................................................................................................................................................................................ 26 1 6.00 6.00 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TCGGTGTTAGATGTCAAGGCCAAGGACG.................................................................................................................................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 5.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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...............................................TCGGTAAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCC.............................................................................................................................................................................. 29 1 5.00 5.00 2.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAGTCGTC............................................................................................................................................................................................................ 29 1 5.00 5.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGCCTCGGTGTTAGATGTCAAGGCCAAG........................................................................................................................................................................................................................ 28 1 5.00 5.00 - 1.00 1.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGCCTCGGTGTTAGATGTCAAGGCCA.......................................................................................................................................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - - 2.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TCCTCGGTAAGCACAAGTGTAGGTACTGTC................................................................................................................................................................................ 30 1 4.00 4.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TCGGTGTTAGATGTCAAGGCCAAGG....................................................................................................................................................................................................................... 25 1 4.00 4.00 - 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TCGTCCTCGGTAAGCACAAGTGTAGGTA..................................................................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAAG........................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................CGAAGTCGTCCTCGGTAAGCACAAGT............................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAGTC............................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.........................................TCGTCCTCGGTAAGCACAAGTGTAGGT...................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TGTTAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAGT................................................................................................................................................................................................................ 28 1 3.00 3.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGCCTCGGTGTTAGATGTCAAGGCCAA......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAA............................................................................................................................................................................ 27 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAGTC............................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TCTGTGGTCACCGCTTCACCACCAAGG....................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCCCACACCGGAGAGAGACCTTACGTG......................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
....TCTGCCTCGGTGTTAGATGTCAAGGCCA.......................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAAGG.......................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TTCACCTTCGCTCCCACACCGGAGAGA.................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................ACAAGTGTAGGTACTGTCCCAAGGTT........................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAGT................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................CGAAGTCGTCCTCGGTAAGCACAAGTG........................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - -
....................................................AAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAAGGT......................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CAAGTGTAGGTACTGTCCCAAGGTT........................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
......................................................................................................................................................TATCTGTGGTCACCGCTTCACCACCA.......................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GGTGTTAGATGTCAAGGCCAAGGACGA................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TAGCTCCCTTCAGATTCACCTTCGCTCC................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGTAGGTACTGTCCCAAGGTTTTCGGGA................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAAGGTc........................................................................................................................................................................ 29 c 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................CAAGTGTAGGTACTGTCCCAAGGctt....................................................................................................................................................................... 26 ctt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................GTGTAGGTACTGTCCCAAGGTTTTCGG................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................CGTCCTCGGTAAGCACAAGTGTAGGTA..................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAG................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TCCTCGGTAAGCACAAGTGTAGGTACT................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAAGG.......................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAGTCatc............................................................................................................................................................................................................ 29 atc 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTGCCTCGGTGTTAGATGTCAAGG............................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................ACGAAGTCGTCCTCGGTAAGCACAcg............................................................................................................................................................................................. 26 cg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TCGGTAAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCA............................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GGTTTTCGGGACAGATAGCTCCCTTCA................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TACAACGACACCCTGAGGTGAAGGCAA.......................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TCGGTAAGCACAAGTGTAGGTACTGTC................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................ACGAAGTCGTCCTCGGTAAGCACAAG............................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
..................................................GTAAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCA............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................AAGTCGTCCTCGGTAAGCACAAGTGTA......................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TAGGTACTGTCCCAAGGTTTTCGGG.................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................CACCTTCGCTCCCACACCGGAGAGAGA.................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................TTAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAG................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAGTCGTC............................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGCCTCGGTGTTAGATGTCAAGGCC........................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.............................CCAAGGACGAAGcat.............................................................................................................................................................................................................. 15 cat 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAA............................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................CTCGGTAAGCACAAGTGTAGGTACTGTC................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAAGGT......................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAAG........................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................ACCAAGGGCAATCTCAAGGTCCACTTA................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAAGGTT........................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TCCCTTCAGATTCACCTTCGCTCCCACAC............................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TCTGTGGTCACCGCTTCACCACCAAGGGC..................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CGGTGTTAGATGTCAAGGCCAAGGACG.................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TTCGGGACAGATAGCTCCCTTCAGATTC............................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..........TCGGTGTTAGATGTCAAGGCCAAGGACa.................................................................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 8.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................CGTCCTCGGTAAGCACAAGTGTAGG....................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..CCTCTGCCTCGGTGTTAGATGTCAA............................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....CTGCCTCGGTGTTAGATGTCAAGGC............................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................AGTGTAGGTACTGTCCCAAGGTTTTCGG................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................GAAGTCGTCCTCGGTAAGC.................................................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TCTCAAGGTCCACTTACAACGACACCC........................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................GTGGTCACCGCTTCACCACCAAGGGC..................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAAGGT......................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAAGG.......................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CTCGGTGTTAGATGTCAAGGCCAAGGAC..................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGTAGGTACTGTCCCAAGGTTTTCGGG.................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................GACCTTACGTGTGCCCTATCTGTGGc.......................................................................................... 26 c 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TCGTCCTCGGTAAGCACAAGTGTAGG....................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................GCTGTTGGCCGAATTCC.. 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................AAGTGTAGGTACTGTCCCAAGGTTTT...................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TAGCTCCCTTCAGATTCACCTTCGC.................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCt............................................................................................................................................................................. 26 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GTCCTCGGTAAGCACAAGTGTAGGTA..................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAGTCG.............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TCTGTGGTCACCGCTTCACCACCAAGGG...................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................AGATGTCAAGGCCAAGGA...................................................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -

Antisense strand
CGCCTCTGCCTCGGTGTTAGATGTCAAGGCCAAGGACGAAGTCGTCCTCGGTAAGCACAAGTGTAGGTACTGTCCCAAGGTTTTCGGGACAGATAGCTCCCTTCAGATTCACCTTCGCTCCCACACCGGAGAGAGACCTTACGTGTGCCCTATCTGTGGTCACCGCTTCACCACCAAGGGCAATCTCAAGGTCCACTTACAACGACACCCTGAGGTGAAGGCAAACCCCCAGCTGTTGGCCGAATTCCAG
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..................................................51.................................................................................................................................182..................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
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SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
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SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
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SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR014231(GSM319955)
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SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
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18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
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18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
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cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
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10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
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small RNA sequencing; sample 1. (testes)
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small RNA sequencing; sample 3. (testes)
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testes_rep4. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
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Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
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mouse testicular tissue [09-002]. (testes)
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...............................................................................................................................................TGCCCTATCTGTGGTCtt......................................................................................... 18 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -