(8)
OTHER.mut
(2)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(34)
TESTES

Sense strand
AGCTCCCAGCAGCAGGGAGGGGTCTTGAGAAAGAGCTGCCTCTTTCAGTTTCAAAGTCTTCGTTTCTTTCTCCACCTCGGCAGAAGCAGGTCTCCAAGGTGTTGTCCCTTCGGTATGCTTCCTTGCCAGATGGTAGTGACACACTAAAGAGCGATGAGCTGGCTGTTGGGAAACGCTAATTGTTTCTCCTCCCGCTGCAGAGGGCCCGATAGATATAAACATGAGTGAGATCGCAATGGACGATATTCAT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
.......................................................................................................................................................................................................................TAAACATGAGTGAGATCGCAATGGAC......... 26 1 66.00 66.00 26.00 25.00 6.00 1.00 3.00 - - 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAAACATGAGTGAGATCGCAATGGACG........ 27 1 21.00 21.00 10.00 3.00 4.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TATAAACATGAGTGAGATCGCAATGGAC......... 28 1 16.00 16.00 4.00 3.00 3.00 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGCAGGTCTCCAAGGTG..................................................................................................................................................... 17 4 12.25 12.25 - - - - 1.25 6.75 - - 0.25 - 3.00 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAAACATGAGTGAGATCGCAATGGACGA....... 28 1 6.00 6.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TAGATATAAACATGAGTGAGATCGCAA.............. 27 1 3.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................ATAAACATGAGTGAGATCGCAATGGAC......... 27 1 3.00 3.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................GCAGGTCTCCAAGGTG..................................................................................................................................................... 16 6 2.67 2.67 - - - - - 1.67 - - - - - 0.67 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................ACATGAGTGAGATCGCAATGGACGAT...... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGAGGGCCCGATAGATAT.................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................AACATGAGTGAGATCGCAATGGACGAT...... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................ATAAACATGAGTGAGATCGCAATGGACG........ 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGCAGGTCTCCAAGGTGT.................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGCAGGTCTCCAAGGggaa................................................................................................................................................... 19 ggaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGAGTGAGATCGCAATGGACGATATT... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................AACATGAGTGAGATCGCAATGGACGA....... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................CATGAGTGAGATCGCAATGGAC......... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................CAGGTCTCCAAGGTG..................................................................................................................................................... 15 10 1.90 1.90 - - - - - - - - - 0.20 0.20 0.80 0.30 - - - - 0.10 - 0.30 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................GCAGGTCTCCAAGGT...................................................................................................................................................... 15 11 1.18 1.18 - - - - - - 0.64 - - - - 0.09 - 0.09 - - - 0.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GGTCTCCAAGGTGTacag................................................................................................................................................ 18 acag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AGATATAAACATGAGTGAGATCGCAA.............. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TATAAACATGAGTGAGATCGCAATGGACGt....... 30 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TATAAACATGAGTGAGATCGCAATGGACG........ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
............................................................................................................................................................................................................................ATGAGTGAGATCGCAATGGACGA....... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................CAGAGGGCCCGATAGATATAAACATGA.......................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGAGTGAGATCGCAATGGAC......... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAAACATGAGTGAGATCGCAATGGACa........ 27 a 1.00 66.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AAACATGAGTGAGATCGCAATGGACGA....... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................CAGGTCTCCAAGGTaaaa.................................................................................................................................................. 18 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................AGTGAGATCGCAATGGAtt........ 19 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGAGTGAGATCGCAATGGACG........ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAAACATGAGTGAGATCGCAATGGACGATA..... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGCAGAGGGCCCGATAGATATAAACAT............................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGCAGGTCTCCAAGGT...................................................................................................................................................... 16 5 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - 0.20 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AGATATAAACATGAGTGAGATCGCA............... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TATAAACATGAGTGAGATCGCAATGGACGA....... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................AAGCAGGTCTCCAAGGTGaac.................................................................................................................................................. 21 aac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TATAAACATGAGTGAGATCGCAATGG........... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TGAGTGAGATCGCAATGGACGATATac.. 27 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TAGATATAAACATGAGTGAGATCGCA............... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAAACATGAGTGAGATCGCAATG............ 23 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAAACATGAGTGAGATCGCAATGGACGAT...... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAAACATGAGTGAGATCGCAATGGA.......... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAAACATGAGTGAGATCGCAATGGACaa....... 28 aa 1.00 66.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................GCAGGTCTCCAAGGTGcac.................................................................................................................................................. 19 cac 0.33 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 -
....................................................................................AGCAGGTCTCCAAGGTGatc.................................................................................................................................................. 20 atc 0.25 12.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AGCAGGTCTCCAAGGTGaacg................................................................................................................................................. 21 aacg 0.25 12.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................GCAGGTCTCCAAGGTGaact................................................................................................................................................. 20 aact 0.17 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................CAGGTCTCCAAGGTGcac.................................................................................................................................................. 18 cac 0.10 1.90 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10
.....................................................................................GCAGGTCTCCAAGGTtaa................................................................................................................................................... 18 taa 0.09 1.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
AGCTCCCAGCAGCAGGGAGGGGTCTTGAGAAAGAGCTGCCTCTTTCAGTTTCAAAGTCTTCGTTTCTTTCTCCACCTCGGCAGAAGCAGGTCTCCAAGGTGTTGTCCCTTCGGTATGCTTCCTTGCCAGATGGTAGTGACACACTAAAGAGCGATGAGCTGGCTGTTGGGAAACGCTAATTGTTTCTCCTCCCGCTGCAGAGGGCCCGATAGATATAAACATGAGTGAGATCGCAATGGACGATATTCAT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
...............................................TCAAAGTCTTCGTTTtgg......................................................................................................................................................................................... 18 tgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
....................................................................................AGCAGGTCTCCAAGGTG..................................................................................................................................................... 17 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -