(12)
OTHER.mut
(4)
OVARY
(3)
PIWI.ip
(31)
TESTES

Sense strand
ACAGCTCTCTGATGAGGATACAGGAACACTGGTGGTAGGGGCTCCATCTCTGATGTTCAGGGGCTCTGGAACTTACCCAGCATGCATTGAGCACAGCTCAAGCATCTGTGAGGGGCCAGAGCCCGGGTGCTGTAGGCACTGGCTTGCCCCGCTTCTGCCATCTCTGCTCACCCCTCCTCCTCTCTCCTCCCTCCTTTCAGATGGAAAGAACCAGCTGCTTCTGGCTCTGCTCAAGTGCACAGGTAGGAAT
.........................................................................................................(((.((((((..((((...(((((..(((((...((((..((...))....))))..))))).)))))........))))..))))))....)))..................................................
....................................................................................................101................................................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtt............................................................................................................... 20 tt 1400.00 82.00 1133.00 86.00 53.00 14.00 25.00 31.00 40.00 18.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCttt.............................................................................................................. 21 ttt 1224.00 82.00 933.00 162.00 45.00 22.00 15.00 15.00 25.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCt................................................................................................................ 19 t 392.00 82.00 197.00 23.00 61.00 7.00 30.00 49.00 17.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtta.............................................................................................................. 21 tta 242.00 82.00 174.00 31.00 6.00 11.00 11.00 1.00 6.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCA................................................................................................................ 15 1 177.00 177.00 32.00 64.00 20.00 1.00 6.00 3.00 - 10.00 22.00 6.00 - 5.00 6.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtat.............................................................................................................. 18 tat 147.00 0.00 55.00 56.00 5.00 6.00 4.00 6.00 4.00 - 1.00 - 2.00 - - 1.00 1.00 - 2.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCA................................................................................................................ 16 1 118.00 118.00 35.00 22.00 10.00 5.00 15.00 17.00 - - 2.00 6.00 - 3.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCttta............................................................................................................. 19 ttta 116.00 0.00 35.00 59.00 3.00 6.00 4.00 1.00 - - - 2.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCAtt.............................................................................................................. 17 tt 110.00 177.00 3.00 1.00 15.00 69.00 5.00 - - 11.00 - 1.00 - 1.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAtt.............................................................................................................. 18 tt 108.00 118.00 10.00 2.00 21.00 41.00 8.00 1.00 4.00 2.00 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 3.00 2.00 3.00 - 5.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 -
.........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCtt............................................................................................................... 18 tt 101.00 5.00 35.00 2.00 4.00 7.00 1.00 2.00 8.00 6.00 1.00 2.00 8.00 1.00 - 4.00 6.00 2.00 4.00 - 2.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - -
.........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCttt.............................................................................................................. 19 ttt 95.00 5.00 38.00 19.00 1.00 2.00 2.00 3.00 2.00 - - - 3.00 - - 4.00 5.00 5.00 3.00 - - 2.00 1.00 1.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGC................................................................................................................. 18 1 82.00 82.00 20.00 8.00 31.00 3.00 4.00 2.00 12.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCttc.............................................................................................................. 18 ttc 81.00 0.00 17.00 16.00 21.00 10.00 3.00 1.00 3.00 - - 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - 4.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCta............................................................................................................... 20 ta 73.00 82.00 48.00 11.00 4.00 - - 8.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtg............................................................................................................... 17 tg 58.00 0.00 22.00 4.00 15.00 11.00 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtc............................................................................................................... 17 tc 48.00 0.00 12.00 3.00 20.00 - - - 4.00 - 6.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtga.............................................................................................................. 18 tga 35.00 0.00 9.00 6.00 1.00 16.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGG.................................................................................................................. 17 1 31.00 31.00 2.00 10.00 7.00 1.00 8.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCA................................................................................................................ 19 1 28.00 28.00 10.00 4.00 6.00 - 3.00 2.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtct.............................................................................................................. 18 tct 27.00 0.00 1.00 6.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - 1.00 2.00 - - - - 2.00 1.00 1.00 - 4.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCAt............................................................................................................... 16 t 25.00 177.00 2.00 8.00 - 2.00 6.00 1.00 - 4.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GGGTGCTGTAGGCAtt.............................................................................................................. 16 tt 23.00 0.00 - - - - - - - - 3.00 14.00 - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCAa............................................................................................................... 16 a 18.00 177.00 15.00 - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCtta.............................................................................................................. 19 tta 18.00 5.00 7.00 2.00 - 4.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCAC............................................................................................................... 16 1 16.00 16.00 1.00 1.00 - - 12.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGtttt.............................................................................................................. 18 tttt 14.00 0.00 - - - - - - - - - - 5.00 - - 4.00 - 2.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCt................................................................................................................ 17 t 14.00 5.00 4.00 2.00 7.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCctt.............................................................................................................. 18 ctt 12.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - 2.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCttat............................................................................................................. 19 ttat 12.00 0.00 - 4.00 1.00 2.00 - 1.00 - 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAt............................................................................................................... 17 t 11.00 118.00 3.00 2.00 3.00 - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCttta............................................................................................................. 18 ttta 11.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - 2.00 - 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - 3.00 - - - - - - 1.00 - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCtc............................................................................................................... 16 tc 11.00 0.00 - - - - - - - - 4.00 1.00 - 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtatt............................................................................................................. 19 tatt 11.00 0.00 - 2.00 - - - - 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAag.............................................................................................................. 18 ag 9.00 118.00 1.00 - - - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtttc............................................................................................................. 19 tttc 9.00 0.00 1.00 3.00 - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCgtt.............................................................................................................. 18 gtt 9.00 0.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - 5.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtgt.............................................................................................................. 18 tgt 9.00 0.00 2.00 - 1.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtttt............................................................................................................. 22 tttt 8.00 82.00 4.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAG................................................................................................................... 16 1 7.00 7.00 1.00 3.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCg................................................................................................................ 16 g 7.00 0.00 2.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCAa............................................................................................................... 20 a 7.00 28.00 3.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGgttt.............................................................................................................. 18 gttt 7.00 0.00 - - - - - - - - - - 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCttg.............................................................................................................. 21 ttg 6.00 82.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtaa.............................................................................................................. 21 taa 5.00 82.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAa............................................................................................................... 17 a 5.00 118.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAaa.............................................................................................................. 18 aa 5.00 118.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGC................................................................................................................. 16 1 5.00 5.00 - - 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCAt............................................................................................................... 20 t 4.00 28.00 1.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtc............................................................................................................... 20 tc 4.00 82.00 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCAta.............................................................................................................. 17 ta 4.00 177.00 - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCta............................................................................................................... 18 ta 4.00 5.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCttag............................................................................................................. 19 ttag 4.00 0.00 - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGt................................................................................................................. 15 t 4.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCgt............................................................................................................... 20 gt 3.00 82.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAtc.............................................................................................................. 18 tc 3.00 118.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCg................................................................................................................ 19 g 3.00 82.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtca.............................................................................................................. 18 tca 3.00 0.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCgaa.............................................................................................................. 18 gaa 3.00 0.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtttg............................................................................................................. 19 tttg 3.00 0.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCc................................................................................................................ 15 c 3.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGtttt.............................................................................................................. 17 tttt 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCAtt.............................................................................................................. 21 tt 3.00 28.00 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCttct............................................................................................................. 19 ttct 3.00 0.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCga............................................................................................................... 17 ga 3.00 0.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCttc.............................................................................................................. 17 ttc 3.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCtg............................................................................................................... 16 tg 3.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGttt............................................................................................................... 17 ttt 3.00 0.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGtttt.............................................................................................................. 21 tttt 2.00 31.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCc................................................................................................................ 19 c 2.00 82.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGgtt............................................................................................................... 17 gtt 2.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAC............................................................................................................... 17 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGtt................................................................................................................ 16 tt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCttta............................................................................................................. 22 ttta 2.00 82.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGttt............................................................................................................... 16 ttt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................GCCCGGGTGCTGTAGGCt................................................................................................................ 18 t 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCttc.............................................................................................................. 21 ttc 2.00 82.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAg............................................................................................................... 17 g 2.00 118.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtat.............................................................................................................. 21 tat 2.00 82.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGatt............................................................................................................... 20 att 2.00 31.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGta................................................................................................................ 16 ta 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGgtt............................................................................................................... 16 gtt 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGgt................................................................................................................ 16 gt 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtata............................................................................................................. 19 tata 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCct............................................................................................................... 17 ct 2.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCgt............................................................................................................... 17 gt 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtgg.............................................................................................................. 18 tgg 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGG.................................................................................................................. 15 2 1.50 1.50 - 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCct............................................................................................................... 18 ct 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGtttg.............................................................................................................. 18 tttg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGt................................................................................................................. 18 t 1.00 31.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtac.............................................................................................................. 18 tac 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGtct................................................................................................................ 19 tct 1.00 7.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCttcg............................................................................................................. 18 ttcg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCctg.............................................................................................................. 18 ctg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtgc.............................................................................................................. 18 tgc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCctc.............................................................................................................. 18 ctc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCtaa.............................................................................................................. 19 taa 1.00 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGcctc............................................................................................................... 16 cctc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCAgt.............................................................................................................. 21 gt 1.00 28.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtg............................................................................................................... 20 tg 1.00 82.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGttt............................................................................................................... 20 ttt 1.00 31.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGgttt.............................................................................................................. 21 gttt 1.00 31.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCACa.............................................................................................................. 17 a 1.00 16.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGaaa............................................................................................................... 20 aaa 1.00 31.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAac.............................................................................................................. 18 ac 1.00 118.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCct............................................................................................................... 16 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGgtt............................................................................................................... 20 gtt 1.00 31.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCc................................................................................................................ 16 c 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCtat.............................................................................................................. 17 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCttca............................................................................................................. 19 ttca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGgggt.............................................................................................................. 18 gggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCtttt............................................................................................................. 20 tttt 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCg................................................................................................................ 15 g 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGtttc.............................................................................................................. 18 tttc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCttta............................................................................................................. 20 ttta 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtatt............................................................................................................. 22 tatt 1.00 82.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCgttt............................................................................................................. 22 gttt 1.00 82.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGgtta.............................................................................................................. 18 gtta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtac.............................................................................................................. 21 tac 1.00 82.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGattt.............................................................................................................. 21 attt 1.00 31.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGtatt.............................................................................................................. 17 tatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CTTCTGGCTCTGCTCAAGTGCACAGacac.... 29 acac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAta.............................................................................................................. 18 ta 1.00 118.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCAat.............................................................................................................. 17 at 1.00 177.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCAg............................................................................................................... 16 g 1.00 177.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCtga.............................................................................................................. 17 tga 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCtct.............................................................................................................. 17 tct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCgc............................................................................................................... 17 gc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGgttt.............................................................................................................. 17 gttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGa................................................................................................................. 18 a 1.00 31.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCA................................................................................................................ 17 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCtgg.............................................................................................................. 17 tgg 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCtatt............................................................................................................. 18 tatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
....................CAGGAACACTGGTGGTAGGGGCTCC............................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
............................................................................................................................GGGTGCTGTAGGCAC............................................................................................................... 15 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGtttt.............................................................................................................. 19 tttt 0.50 1.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................GGTGCTGTAGGCACT.............................................................................................................. 15 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
ACAGCTCTCTGATGAGGATACAGGAACACTGGTGGTAGGGGCTCCATCTCTGATGTTCAGGGGCTCTGGAACTTACCCAGCATGCATTGAGCACAGCTCAAGCATCTGTGAGGGGCCAGAGCCCGGGTGCTGTAGGCACTGGCTTGCCCCGCTTCTGCCATCTCTGCTCACCCCTCCTCCTCTCTCCTCCCTCCTTTCAGATGGAAAGAACCAGCTGCTTCTGGCTCTGCTCAAGTGCACAGGTAGGAAT
.........................................................................................................(((.((((((..((((...(((((..(((((...((((..((...))....))))..))))).)))))........))))..))))))....)))..................................................
....................................................................................................101................................................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
............................................................................................................................................................................................................GAACCAGCTGCTTCTGacc........................... 19 acc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................CCATCTCTGATGTTCAG.............................................................................................................................................................................................. 17 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -