| Gene: Setd6 | ID: uc008nym.1_intron_9_0_chr2_166402206_r.3p | SPECIES: mm9 |
![]() |
![]() |
|
(12) OTHER.mut |
(4) OVARY |
(3) PIWI.ip |
(31) TESTES |
| ACAGCTCTCTGATGAGGATACAGGAACACTGGTGGTAGGGGCTCCATCTCTGATGTTCAGGGGCTCTGGAACTTACCCAGCATGCATTGAGCACAGCTCAAGCATCTGTGAGGGGCCAGAGCCCGGGTGCTGTAGGCACTGGCTTGCCCCGCTTCTGCCATCTCTGCTCACCCCTCCTCCTCTCTCCTCCCTCCTTTCAGATGGAAAGAACCAGCTGCTTCTGGCTCTGCTCAAGTGCACAGGTAGGAAT .........................................................................................................(((.((((((..((((...(((((..(((((...((((..((...))....))))..))))).)))))........))))..))))))....))).................................................. ....................................................................................................101................................................................................................200................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR037899(GSM510435) ovary_rep4. (ovary) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtt............................................................................................................... | 20 | tt | 1400.00 | 82.00 | 1133.00 | 86.00 | 53.00 | 14.00 | 25.00 | 31.00 | 40.00 | 18.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCttt.............................................................................................................. | 21 | ttt | 1224.00 | 82.00 | 933.00 | 162.00 | 45.00 | 22.00 | 15.00 | 15.00 | 25.00 | 7.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCt................................................................................................................ | 19 | t | 392.00 | 82.00 | 197.00 | 23.00 | 61.00 | 7.00 | 30.00 | 49.00 | 17.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtta.............................................................................................................. | 21 | tta | 242.00 | 82.00 | 174.00 | 31.00 | 6.00 | 11.00 | 11.00 | 1.00 | 6.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCA................................................................................................................ | 15 | 1 | 177.00 | 177.00 | 32.00 | 64.00 | 20.00 | 1.00 | 6.00 | 3.00 | - | 10.00 | 22.00 | 6.00 | - | 5.00 | 6.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtat.............................................................................................................. | 18 | tat | 147.00 | 0.00 | 55.00 | 56.00 | 5.00 | 6.00 | 4.00 | 6.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCA................................................................................................................ | 16 | 1 | 118.00 | 118.00 | 35.00 | 22.00 | 10.00 | 5.00 | 15.00 | 17.00 | - | - | 2.00 | 6.00 | - | 3.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCttta............................................................................................................. | 19 | ttta | 116.00 | 0.00 | 35.00 | 59.00 | 3.00 | 6.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCAtt.............................................................................................................. | 17 | tt | 110.00 | 177.00 | 3.00 | 1.00 | 15.00 | 69.00 | 5.00 | - | - | 11.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAtt.............................................................................................................. | 18 | tt | 108.00 | 118.00 | 10.00 | 2.00 | 21.00 | 41.00 | 8.00 | 1.00 | 4.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 3.00 | 2.00 | 3.00 | - | 5.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| .........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCtt............................................................................................................... | 18 | tt | 101.00 | 5.00 | 35.00 | 2.00 | 4.00 | 7.00 | 1.00 | 2.00 | 8.00 | 6.00 | 1.00 | 2.00 | 8.00 | 1.00 | - | 4.00 | 6.00 | 2.00 | 4.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - |
| .........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCttt.............................................................................................................. | 19 | ttt | 95.00 | 5.00 | 38.00 | 19.00 | 1.00 | 2.00 | 2.00 | 3.00 | 2.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | 4.00 | 5.00 | 5.00 | 3.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGC................................................................................................................. | 18 | 1 | 82.00 | 82.00 | 20.00 | 8.00 | 31.00 | 3.00 | 4.00 | 2.00 | 12.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCttc.............................................................................................................. | 18 | ttc | 81.00 | 0.00 | 17.00 | 16.00 | 21.00 | 10.00 | 3.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCta............................................................................................................... | 20 | ta | 73.00 | 82.00 | 48.00 | 11.00 | 4.00 | - | - | 8.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtg............................................................................................................... | 17 | tg | 58.00 | 0.00 | 22.00 | 4.00 | 15.00 | 11.00 | 5.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtc............................................................................................................... | 17 | tc | 48.00 | 0.00 | 12.00 | 3.00 | 20.00 | - | - | - | 4.00 | - | 6.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtga.............................................................................................................. | 18 | tga | 35.00 | 0.00 | 9.00 | 6.00 | 1.00 | 16.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGG.................................................................................................................. | 17 | 1 | 31.00 | 31.00 | 2.00 | 10.00 | 7.00 | 1.00 | 8.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCA................................................................................................................ | 19 | 1 | 28.00 | 28.00 | 10.00 | 4.00 | 6.00 | - | 3.00 | 2.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtct.............................................................................................................. | 18 | tct | 27.00 | 0.00 | 1.00 | 6.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | 4.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCAt............................................................................................................... | 16 | t | 25.00 | 177.00 | 2.00 | 8.00 | - | 2.00 | 6.00 | 1.00 | - | 4.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................GGGTGCTGTAGGCAtt.............................................................................................................. | 16 | tt | 23.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | 14.00 | - | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCAa............................................................................................................... | 16 | a | 18.00 | 177.00 | 15.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCtta.............................................................................................................. | 19 | tta | 18.00 | 5.00 | 7.00 | 2.00 | - | 4.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCAC............................................................................................................... | 16 | 1 | 16.00 | 16.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 12.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGtttt.............................................................................................................. | 18 | tttt | 14.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.00 | - | - | 4.00 | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCt................................................................................................................ | 17 | t | 14.00 | 5.00 | 4.00 | 2.00 | 7.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCctt.............................................................................................................. | 18 | ctt | 12.00 | 0.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCttat............................................................................................................. | 19 | ttat | 12.00 | 0.00 | - | 4.00 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAt............................................................................................................... | 17 | t | 11.00 | 118.00 | 3.00 | 2.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCttta............................................................................................................. | 18 | ttta | 11.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCtc............................................................................................................... | 16 | tc | 11.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | 1.00 | - | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtatt............................................................................................................. | 19 | tatt | 11.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 9.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAag.............................................................................................................. | 18 | ag | 9.00 | 118.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtttc............................................................................................................. | 19 | tttc | 9.00 | 0.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCgtt.............................................................................................................. | 18 | gtt | 9.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtgt.............................................................................................................. | 18 | tgt | 9.00 | 0.00 | 2.00 | - | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtttt............................................................................................................. | 22 | tttt | 8.00 | 82.00 | 4.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAG................................................................................................................... | 16 | 1 | 7.00 | 7.00 | 1.00 | 3.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCg................................................................................................................ | 16 | g | 7.00 | 0.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCAa............................................................................................................... | 20 | a | 7.00 | 28.00 | 3.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGgttt.............................................................................................................. | 18 | gttt | 7.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCttg.............................................................................................................. | 21 | ttg | 6.00 | 82.00 | 5.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtaa.............................................................................................................. | 21 | taa | 5.00 | 82.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAa............................................................................................................... | 17 | a | 5.00 | 118.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAaa.............................................................................................................. | 18 | aa | 5.00 | 118.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGC................................................................................................................. | 16 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | 3.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCAt............................................................................................................... | 20 | t | 4.00 | 28.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtc............................................................................................................... | 20 | tc | 4.00 | 82.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCAta.............................................................................................................. | 17 | ta | 4.00 | 177.00 | - | - | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCta............................................................................................................... | 18 | ta | 4.00 | 5.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCttag............................................................................................................. | 19 | ttag | 4.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGt................................................................................................................. | 15 | t | 4.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCgt............................................................................................................... | 20 | gt | 3.00 | 82.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAtc.............................................................................................................. | 18 | tc | 3.00 | 118.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCg................................................................................................................ | 19 | g | 3.00 | 82.00 | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtca.............................................................................................................. | 18 | tca | 3.00 | 0.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCgaa.............................................................................................................. | 18 | gaa | 3.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtttg............................................................................................................. | 19 | tttg | 3.00 | 0.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCc................................................................................................................ | 15 | c | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGtttt.............................................................................................................. | 17 | tttt | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCAtt.............................................................................................................. | 21 | tt | 3.00 | 28.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCttct............................................................................................................. | 19 | ttct | 3.00 | 0.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCga............................................................................................................... | 17 | ga | 3.00 | 0.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCttc.............................................................................................................. | 17 | ttc | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCtg............................................................................................................... | 16 | tg | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGttt............................................................................................................... | 17 | ttt | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGtttt.............................................................................................................. | 21 | tttt | 2.00 | 31.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCc................................................................................................................ | 19 | c | 2.00 | 82.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGgtt............................................................................................................... | 17 | gtt | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAC............................................................................................................... | 17 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGtt................................................................................................................ | 16 | tt | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCttta............................................................................................................. | 22 | ttta | 2.00 | 82.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGttt............................................................................................................... | 16 | ttt | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................GCCCGGGTGCTGTAGGCt................................................................................................................ | 18 | t | 2.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCttc.............................................................................................................. | 21 | ttc | 2.00 | 82.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAg............................................................................................................... | 17 | g | 2.00 | 118.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtat.............................................................................................................. | 21 | tat | 2.00 | 82.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGatt............................................................................................................... | 20 | att | 2.00 | 31.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGta................................................................................................................ | 16 | ta | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGgtt............................................................................................................... | 16 | gtt | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGgt................................................................................................................ | 16 | gt | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtata............................................................................................................. | 19 | tata | 2.00 | 0.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCct............................................................................................................... | 17 | ct | 2.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCgt............................................................................................................... | 17 | gt | 2.00 | 0.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtgg.............................................................................................................. | 18 | tgg | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGG.................................................................................................................. | 15 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCct............................................................................................................... | 18 | ct | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGtttg.............................................................................................................. | 18 | tttg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGt................................................................................................................. | 18 | t | 1.00 | 31.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtac.............................................................................................................. | 18 | tac | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGtct................................................................................................................ | 19 | tct | 1.00 | 7.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCttcg............................................................................................................. | 18 | ttcg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCctg.............................................................................................................. | 18 | ctg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCtgc.............................................................................................................. | 18 | tgc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCctc.............................................................................................................. | 18 | ctc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCtaa.............................................................................................................. | 19 | taa | 1.00 | 5.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGcctc............................................................................................................... | 16 | cctc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCAgt.............................................................................................................. | 21 | gt | 1.00 | 28.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtg............................................................................................................... | 20 | tg | 1.00 | 82.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGttt............................................................................................................... | 20 | ttt | 1.00 | 31.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGgttt.............................................................................................................. | 21 | gttt | 1.00 | 31.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCACa.............................................................................................................. | 17 | a | 1.00 | 16.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGaaa............................................................................................................... | 20 | aaa | 1.00 | 31.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAac.............................................................................................................. | 18 | ac | 1.00 | 118.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCct............................................................................................................... | 16 | ct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGgtt............................................................................................................... | 20 | gtt | 1.00 | 31.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCc................................................................................................................ | 16 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCtat.............................................................................................................. | 17 | tat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCttca............................................................................................................. | 19 | ttca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGgggt.............................................................................................................. | 18 | gggt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCtttt............................................................................................................. | 20 | tttt | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCg................................................................................................................ | 15 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGtttc.............................................................................................................. | 18 | tttc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCttta............................................................................................................. | 20 | ttta | 1.00 | 5.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtatt............................................................................................................. | 22 | tatt | 1.00 | 82.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCgttt............................................................................................................. | 22 | gttt | 1.00 | 82.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGgtta.............................................................................................................. | 18 | gtta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGCtac.............................................................................................................. | 21 | tac | 1.00 | 82.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGattt.............................................................................................................. | 21 | attt | 1.00 | 31.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGtatt.............................................................................................................. | 17 | tatt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................CTTCTGGCTCTGCTCAAGTGCACAGacac.... | 29 | acac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCAta.............................................................................................................. | 18 | ta | 1.00 | 118.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCAat.............................................................................................................. | 17 | at | 1.00 | 177.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCAg............................................................................................................... | 16 | g | 1.00 | 177.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCtga.............................................................................................................. | 17 | tga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCtct.............................................................................................................. | 17 | tct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................CCGGGTGCTGTAGGCgc............................................................................................................... | 17 | gc | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGgttt.............................................................................................................. | 17 | gttt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................AGCCCGGGTGCTGTAGGa................................................................................................................. | 18 | a | 1.00 | 31.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGCA................................................................................................................ | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCtgg.............................................................................................................. | 17 | tgg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................CGGGTGCTGTAGGCtatt............................................................................................................. | 18 | tatt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................CAGGAACACTGGTGGTAGGGGCTCC............................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 |
| ............................................................................................................................GGGTGCTGTAGGCAC............................................................................................................... | 15 | 4 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................CCCGGGTGCTGTAGGtttt.............................................................................................................. | 19 | tttt | 0.50 | 1.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................GGTGCTGTAGGCACT.............................................................................................................. | 15 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ACAGCTCTCTGATGAGGATACAGGAACACTGGTGGTAGGGGCTCCATCTCTGATGTTCAGGGGCTCTGGAACTTACCCAGCATGCATTGAGCACAGCTCAAGCATCTGTGAGGGGCCAGAGCCCGGGTGCTGTAGGCACTGGCTTGCCCCGCTTCTGCCATCTCTGCTCACCCCTCCTCCTCTCTCCTCCCTCCTTTCAGATGGAAAGAACCAGCTGCTTCTGGCTCTGCTCAAGTGCACAGGTAGGAAT .........................................................................................................(((.((((((..((((...(((((..(((((...((((..((...))....))))..))))).)))))........))))..))))))....))).................................................. ....................................................................................................101................................................................................................200................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR037903(GSM510439) testes_rep4. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR037899(GSM510435) ovary_rep4. (ovary) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR037900(GSM510436) testes_rep1. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ............................................................................................................................................................................................................GAACCAGCTGCTTCTGacc........................... | 19 | acc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................CCATCTCTGATGTTCAG.............................................................................................................................................................................................. | 17 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |