| Gene: Cdh22 | ID: uc008nxc.1_intron_10_0_chr2_165006960_r.5p | SPECIES: mm9 |
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(1) OTHER.ip |
(12) OTHER.mut |
(3) OVARY |
(2) PIWI.ip |
(1) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(33) TESTES |
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| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGCgg................................................................................... | 22 | gg | 1681.00 | 1344.00 | 738.00 | 248.00 | 93.00 | 189.00 | 150.00 | 186.00 | 18.00 | 49.00 | 9.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGC..................................................................................... | 20 | 1 | 1344.00 | 1344.00 | 871.00 | 34.00 | 258.00 | 51.00 | 59.00 | - | 56.00 | 8.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGGGG...................................................................................... | 20 | 2 | 129.00 | 129.00 | 25.00 | 72.50 | 1.50 | 12.50 | - | 7.00 | 2.50 | 6.00 | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGG....................................................................................... | 18 | 3 | 50.33 | 50.33 | 23.33 | 12.67 | 6.67 | 2.33 | 1.00 | - | 3.33 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GCGCGGGCTCCGGGGC..................................................................................... | 16 | 2 | 46.50 | 46.50 | 3.00 | 5.50 | 32.50 | 2.00 | - | - | 2.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGG...................................................................................... | 17 | 2 | 34.50 | 34.50 | 6.00 | 10.00 | 10.50 | 2.50 | - | 3.50 | 1.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .....................................................................................................................................................GCGCGGGCTCCGGGG...................................................................................... | 15 | 4 | 20.25 | 20.25 | 5.00 | 3.25 | 8.00 | 1.00 | - | 2.25 | 0.50 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGG........................................................................................ | 18 | 3 | 18.33 | 18.33 | 7.67 | 5.00 | - | 1.33 | - | 0.33 | 3.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGG....................................................................................... | 16 | 5 | 13.40 | 13.40 | 4.20 | 4.40 | 2.60 | 0.40 | - | 0.40 | 0.20 | 0.60 | - | - | 0.20 | - | - | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGG....................................................................................... | 17 | 3 | 10.67 | 10.67 | - | 2.33 | 5.33 | 1.00 | - | - | 1.67 | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCggtg................................................................................. | 22 | ggtg | 10.00 | 474.00 | - | - | - | - | 9.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGG........................................................................................ | 17 | 3 | 8.33 | 8.33 | 4.00 | 0.33 | 0.67 | - | 0.33 | - | 2.00 | 0.33 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCggt.................................................................................. | 21 | ggt | 5.00 | 474.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCG......................................................................................... | 17 | 3 | 4.33 | 4.33 | 2.67 | 1.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGGGCggt.................................................................................. | 22 | ggt | 4.00 | 944.00 | - | 1.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGGGCga................................................................................... | 21 | ga | 4.00 | 944.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGG........................................................................................ | 16 | 3 | 4.00 | 4.00 | 2.67 | 0.33 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGGGGCAA................................................................................... | 23 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCG......................................................................................... | 16 | 3 | 3.00 | 3.00 | - | 2.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGGGCAA................................................................................... | 21 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGG........................................................................................ | 15 | 5 | 3.00 | 3.00 | 0.80 | 0.80 | - | - | - | 1.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGCgc................................................................................... | 22 | gc | 3.00 | 1344.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCAA................................................................................... | 20 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCgc................................................................................... | 20 | gc | 3.00 | 474.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGGGCA.................................................................................... | 20 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................GGCGCGGGCTCCGGG....................................................................................... | 15 | 7 | 2.86 | 2.86 | 0.71 | 0.71 | 1.14 | - | - | - | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGGGCtgc.................................................................................. | 22 | tgc | 2.00 | 944.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGGGCggag................................................................................. | 23 | ggag | 2.00 | 944.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGCgggg................................................................................. | 24 | gggg | 2.00 | 1344.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGGGGCgc................................................................................... | 23 | gc | 2.00 | 383.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGCgccg................................................................................. | 24 | gccg | 2.00 | 1344.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGGGGCggtg................................................................................. | 25 | ggtg | 2.00 | 383.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGGGGCggt.................................................................................. | 24 | ggt | 2.00 | 383.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGtggc.................................................................................. | 21 | tggc | 2.00 | 34.50 | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGCgt................................................................................... | 22 | gt | 2.00 | 1344.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGCggag................................................................................. | 24 | ggag | 2.00 | 1344.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGGGCggtg................................................................................. | 23 | ggtg | 2.00 | 944.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCtggg................................................................................. | 22 | tggg | 2.00 | 474.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCga................................................................................... | 20 | ga | 2.00 | 474.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGCAA................................................................................... | 22 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGaggc.................................................................................. | 23 | aggc | 1.50 | 137.00 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGagg................................................................................... | 22 | agg | 1.50 | 137.00 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGac..................................................................................... | 20 | ac | 1.33 | 50.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGGGGCggag................................................................................. | 25 | ggag | 1.00 | 383.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCAgc.................................................................................. | 21 | gc | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGGGGgggc.................................................................................. | 24 | gggc | 1.00 | 129.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCggcc................................................................................. | 22 | ggcc | 1.00 | 474.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................GGCGCGGGCTCCGGGGCga................................................................................... | 19 | ga | 1.00 | 95.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGCgga.................................................................................. | 23 | gga | 1.00 | 1344.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGGGCc.................................................................................... | 20 | c | 1.00 | 944.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................AGACAGGGACTTTCCtaga....................... | 19 | taga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................CCCCTCCCCGGCGGcgac........................................ | 18 | cgac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCggag................................................................................. | 22 | ggag | 1.00 | 474.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGaggc.................................................................................. | 21 | aggc | 1.00 | 34.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGCggt.................................................................................. | 23 | ggt | 1.00 | 1344.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCAg................................................................................... | 20 | g | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGGGGCgcc.................................................................................. | 24 | gcc | 1.00 | 383.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCt.................................................................................... | 19 | t | 1.00 | 474.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............GGCGCGGACCAGGGga............................................................................................................................................................................................................................ | 16 | ga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCG......................................................................................... | 15 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | 0.67 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCtggg....................................................................................... | 17 | tggg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGCAgcg................................................................................. | 24 | gcg | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGGGCgga.................................................................................. | 22 | gga | 1.00 | 944.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................GGCGCGGGCTCCGGGGCggca................................................................................. | 21 | ggca | 1.00 | 95.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGGGGCgtcg................................................................................. | 25 | gtcg | 1.00 | 383.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................CGCGGGCTCCGGGtcg.................................................................................... | 16 | tcg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGCtgca................................................................................. | 24 | tgca | 1.00 | 1344.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGCgacg................................................................................. | 24 | gacg | 1.00 | 1344.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGGGCggct................................................................................. | 23 | ggct | 1.00 | 944.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGGGGCtg................................................................................... | 23 | tg | 1.00 | 383.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGCggct................................................................................. | 24 | ggct | 1.00 | 1344.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCAcca................................................................................. | 22 | cca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGGGGCgtc.................................................................................. | 24 | gtc | 1.00 | 383.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCgcc.................................................................................. | 21 | gcc | 1.00 | 474.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............GGCGCGGACCAGGGgaa........................................................................................................................................................................................................................... | 17 | gaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................................................TCCCCGGCGGGGAGc....................................... | 15 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGGGGCgggt................................................................................. | 25 | gggt | 1.00 | 383.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCgac.................................................................................. | 21 | gac | 1.00 | 474.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGGGag.................................................................................... | 20 | ag | 1.00 | 56.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGCggca................................................................................. | 22 | ggca | 1.00 | 474.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGGGCAgcg................................................................................. | 23 | gcg | 1.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GGCGCGGCGCGGGCTCCGGGGCggcg................................................................................. | 26 | ggcg | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................GGCGCGGGCTCCGGGGCtgca................................................................................. | 21 | tgca | 1.00 | 95.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGCggcc................................................................................. | 24 | ggcc | 1.00 | 1344.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GGCGCGGCGCGGGCTCCGGGGCggc.................................................................................. | 25 | ggc | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCC.......................................................................................... | 15 | 4 | 0.75 | 0.75 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGGt....................................................................................... | 19 | t | 0.67 | 18.33 | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGaacg................................................................................... | 22 | aacg | 0.67 | 50.33 | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GCGCGGGCTCCGGGGCtg................................................................................... | 18 | tg | 0.50 | 46.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................GGCGCGGGCTCCGGGGa..................................................................................... | 17 | a | 0.50 | 23.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGtg.................................................................................... | 19 | tg | 0.50 | 34.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGa..................................................................................... | 20 | a | 0.50 | 137.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGag.................................................................................... | 19 | ag | 0.50 | 34.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GCGCGGGCTCCGGGGCggag................................................................................. | 20 | ggag | 0.50 | 46.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGggg................................................................................... | 22 | ggg | 0.50 | 137.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGGGgg.................................................................................... | 20 | gg | 0.50 | 56.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGGgg.................................................................................... | 19 | gg | 0.50 | 34.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGgg.................................................................................... | 21 | gg | 0.50 | 137.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GCGCGGGCTCCGGGGCggtg................................................................................. | 20 | ggtg | 0.50 | 46.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGGag.................................................................................... | 21 | ag | 0.50 | 137.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................GCGCGGGCTCCGGGGCggca................................................................................. | 20 | ggca | 0.50 | 46.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCtgg........................................................................................ | 18 | tgg | 0.44 | 0.11 | - | 0.44 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................CGGCGCGGGCTCCGGGacgg................................................................................... | 20 | acgg | 0.40 | 13.40 | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCCGag....................................................................................... | 19 | ag | 0.33 | 4.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGa...................................................................................... | 19 | a | 0.33 | 50.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GGCGCGGCGCGGGCTCCGG........................................................................................ | 19 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGcgc..................................................................................... | 19 | cgc | 0.33 | 4.00 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGccg.................................................................................... | 21 | ccg | 0.33 | 50.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGacgg................................................................................... | 22 | acgg | 0.33 | 50.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................GGCGCGGCGCGGGCTCCGGG....................................................................................... | 20 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGcggc.................................................................................... | 20 | cggc | 0.33 | 4.00 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGagc..................................................................................... | 19 | agc | 0.33 | 4.00 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GCGGCGCGGGCTCCGGGtcgg................................................................................... | 21 | tcgg | 0.33 | 10.67 | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGGtc..................................................................................... | 20 | tc | 0.33 | 50.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................CGCGGCGCGGGCTCCGGagc..................................................................................... | 20 | agc | 0.33 | 8.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCC.......................................................................................... | 16 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTCtggg....................................................................................... | 19 | tggg | 0.22 | 0.11 | - | - | 0.11 | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................GCGCGGCGCGGGCTC........................................................................................... | 15 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TGCTGGCGTCCCAAGGCGCGGACCAGGGTGCAGTCCGGCCGCTCCCCAAGGTAAGAGCGCGCGGCACCCGCGGGAGGACAACCGATCGCCGCTGGGGAAGGCTGCGGGCCGGGAGGGTGCACGGGCCGGGGAGAGGCGGGCGCGGCGCGGCGCGGGCTCCGGGGCAACAGCTGAAGCGCGCCCATCCCGCGCCCCCTCCCCGGCGGGGAGACAGGGACTTTCCCACGTCCAAACTTTCCCCGGCGCGGAG .....................................................................................................((.(((.(((..........))).))).)).((((.((((((((...((.(((.(((.(((........))).))).)))))...)))))))))))).................................................... ....................................................................................................101................................................................................................200................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR051941(GSM545785) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) | SRR042486(GSM539878) mouse ovaries [09-002]. (ovary) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR037898(GSM510434) ovary_rep3. (ovary) | SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ........................................................................................................................................................................................................................................TCCCCGGCGCGGAGggtg | 18 | ggtg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................CTCCCCGGCGGGGAGAcca....................................... | 19 | cca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................CTCCCCGGCGGGGAcca......................................... | 17 | cca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |