chr2:164719066 164719250 -
(1)
OTHER.ip 		(10)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(48)
TESTES

Sense strand
CTAACGCACACCAACGAGAAGCCATTCTCATGCCACGTCTGCGGGCAGCGGTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAAGGGACTTGCATGCACACACCTGGTAGAGCTATCTGATGCCCACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAACGGGCACCTCAAATTCCACATCCAGCGGCTACATAGCA
...............................................................(((...(((....((((.......(((..((..(((.....)))..)).))).......)))))))))).....................................................
...............................................................64.....................................................................135................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
....................................................................AAGAACAAGGGACTTGCATGCACACACC......................................................................................... 28 1 21.00 21.00 5.00 4.00 1.00 1.00 8.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TTCAACAGGAACGGGCACCTCAAATT....................... 26 1 19.00 19.00 4.00 5.00 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 3.00 - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAAG............................................................................................................ 27 1 15.00 15.00 2.00 2.00 - - 3.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..................................................GTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAA............................................................................................................. 26 1 14.00 14.00 4.00 5.00 - - 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................AAGAACAAGGGACTTGCATGCACACA........................................................................................... 26 1 13.00 13.00 3.00 - 1.00 - 5.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TAAGAACAAGGGACTTGCATGCACACA........................................................................................... 27 1 12.00 12.00 3.00 4.00 - - 2.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACA.............................................................................................................. 25 1 12.00 12.00 1.00 1.00 - - 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................AGGGACTTGCATGCACACACCTGGTA.................................................................................... 26 1 11.00 11.00 3.00 2.00 1.00 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TAAGAACAAGGGACTTGCATGCACAC............................................................................................ 26 1 10.00 10.00 1.00 1.00 - 1.00 1.00 - 2.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................AAGAACAAGGGACTTGCATGCACACAC.......................................................................................... 27 1 8.00 8.00 1.00 1.00 - - 2.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAAGt........................................................................................................... 28 t 6.00 15.00 - 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TTCAACAGGAACGGGCACCTCAAATTC...................... 27 1 6.00 6.00 - - 1.00 - 4.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................AGAACAAGGGACTTGCATGCACACACC......................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - 3.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAAGG........................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 1.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................AAGAACAAGGGACTTGCATGCACAC............................................................................................ 25 1 4.00 4.00 - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAAC............................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TCAACAGGAACGGGCACCTCAAATTC...................... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TAAGAACAAGGGACTTGCATGCACACACC......................................................................................... 29 1 3.00 3.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TCAACAGGAACGGGCACCTCAAATTCC..................... 27 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................AAGAACAAGGGACTTGCATGCACACACCT........................................................................................ 29 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................GGGACTTGCATGCACACACCTGGTAGAGCT............................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................AAGGGACTTGCATGCACACACCTGGTA.................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGGCTAAGAACAAGGGACTTGCATGC................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAAt............................................................................................................ 27 t 2.00 14.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAAG............................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CGAGAAGCCATTCTCATGCCACGTCTGt............................................................................................................................................... 28 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAA................................................................................................................ 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TTCAACAGGAACGGGCACCTCAAAT........................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................CAAGGGACTTGCATGCACACACCTGGT..................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGGAGATGGCTAAGAACAAGG........................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................GAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAA............................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................ACAAGGGACTTGCATGCACACACCTGGT..................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TTCAACAGGAACGGGCACCTCAAATTCC..................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................GCTGGAGATGGCTAAGAACAAGGGACT....................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................AGGGACTTGCATGCACACACCTGGTAGA.................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GCCATTCTCATGCCACGT................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TAAGAACAAGGGACTTGCATGCACA............................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TCAACAGGAACGGGCACCTCAAAT........................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................AGAACAAGGGACTTGCATGCACACACCTGGT..................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................GTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACcag............................................................................................................ 27 cag 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................GCATGCACACACCTGGTAGAGCTAT............................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAAGGt.......................................................................................................... 28 t 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................ACAAGGGACTTGCATGCACACACCTGG...................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAAa............................................................................................................... 24 a 1.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................AACAAGGGACTTGCATGCACACACCTGt...................................................................................... 28 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAAt............................................................................................................... 24 t 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAAGGG.......................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................CACACACCTGGTAGAGCTATC............................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.......................................................................AACAAGGGACTTGCATGCACACACCTG....................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGGAGATGGCTAAGAACAAGGGACTTG..................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ATGGCTAAGAACAAGGGACTTGCATG................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGGCTGGAGATGGCTAAGAACAAGGG.......................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................CTGGAGATGGCTAAGAACAAGGGACTT...................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TTCAACAGGAACGGGCACCTCAcctt....................... 26 cctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..........................................................................AAGGGACTTGCATGCACACACCTGG...................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGGCTGGAGATGGCTAAGAACAAGGGAC........................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................GGAGATGGCTAAGAACAAGGGACTTGC.................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TAAGAACAAGGGACTTGCATGCACACtt.......................................................................................... 28 tt 1.00 10.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TTCAACAGGAACGGGCACCTCAAATTCCAC................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................GGAGATGGCTAAGAACAAGGGACTTGCAT.................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAAGG........................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............AACGAGAAGCCATTCTCATGCCACGTC.................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAAGGGA......................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................AGAACAAGGGACTTGCATGCACACACCT........................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CAAATTCCACATCCAGCGGCTACATAGC. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................TTCAACAGGAACGGGCACCTCAAATTCCACt.................. 31 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
...................................................................TAAGAACAAGGGACTTGCATGCACACACt......................................................................................... 29 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................AGGGACTTGCATGCACACACCTGGTAGAG................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................AGGGACTTGCATGCACACAC.......................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................CCTGGTAGAGCTATCTGATGC...................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...........................................................................................................TCTGATGCCCACTCTTCCCTCTCCACAG.................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TCAAATTCCACATCCAGCGGCTACATAGC. 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TAAGAACAAGGGACTTGCATGCA............................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................GAGATGGCTAAGAACAAGGGACTTGCAT.................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................AGAACAAGGGACTTGCATGCACACAC.......................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TTTCAACAGGAACGGGCACCTCAAATTC...................... 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................ACCTGGTAGAGCTATCTGATGC...................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................TGGCTAAGAACAAGG........................................................................................................... 15 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTAACGCACACCAACGAGAAGCCATTCTCATGCCACGTCTGCGGGCAGCGGTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAAGGGACTTGCATGCACACACCTGGTAGAGCTATCTGATGCCCACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAACGGGCACCTCAAATTCCACATCCAGCGGCTACATAGCA
...............................................................(((...(((....((((.......(((..((..(((.....)))..)).))).......)))))))))).....................................................
...............................................................64.....................................................................135................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
........................................................................................................................CTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGA....................................... 26 1 85.00 85.00 23.00 24.00 13.00 19.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACA.......................................... 26 1 68.00 68.00 22.00 12.00 10.00 8.00 2.00 5.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGA....................................... 27 1 63.00 63.00 22.00 6.00 19.00 8.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACA.......................................... 25 1 43.00 43.00 15.00 7.00 4.00 6.00 - 2.00 5.00 - - - - - - - - 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAA...................................... 26 1 31.00 31.00 8.00 9.00 6.00 7.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGA....................................... 25 1 29.00 29.00 7.00 8.00 5.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................CCCACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCA............................................. 26 1 21.00 21.00 6.00 3.00 2.00 3.00 1.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CCACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCA............................................. 25 1 15.00 15.00 5.00 3.00 - - 2.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GCCCACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCA............................................. 27 1 11.00 11.00 5.00 - - 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
........................................................................................................................CTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAA...................................... 27 1 11.00 11.00 2.00 5.00 - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................AGGGACTTGCATGCACACACCTGGTA.................................................................................... 26 1 10.00 10.00 - - - - - - - - 6.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAA...................................... 25 1 9.00 9.00 3.00 2.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CCTCAAATTCCACATCCAGCGGCTACA..... 27 1 8.00 8.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACA.......................................... 24 1 6.00 6.00 - - - - 1.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GCACACCAACGAGAAGCCATTCTCA........................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAA............................................ 25 1 5.00 5.00 1.00 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGA....................................... 24 1 4.00 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CCACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAA............................................ 26 1 4.00 4.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................ACCTCAAATTCCACATCCAGCGGCTACA..... 28 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGA....................................... 28 1 4.00 4.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...ACGCACACCAACGAGAAGCCATTCTCA........................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAt....................................... 27 t 4.00 0.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CCCTCTCCACAGTTTCAACAGGA....................................... 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAA...................................... 28 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACA.......................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................CATGCACACACCTGGTAGAGCTATCTG.......................................................................... 27 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............AACGAGAAGCCATTCTCATGCCACGTCTG................................................................................................................................................ 29 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................CAAGGGACTTGCATGCACACACCTGGTA.................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................ACCTCAAATTCCACATCCAGCGGCTA....... 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................GGGACTTGCATGCACACACCTGGTA.................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................AAGGGACTTGCATGCACACACCTGGTA.................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGG........................................ 26 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................GAAGCCATTCTCATGCCACGTCTGCGG............................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ATGCACACACCTGGTAGAGCTATCTGA......................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................CATGCACACACCTGGTAGAGCTATCTGA......................................................................... 28 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCA............................................. 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAa....................................... 26 a 2.00 0.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................AAATTCCACATCCAGCGGCTACATAGCA 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAaa....................................... 27 aa 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................CTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAa.......................................... 26 a 2.00 0.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................CACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCA............................................. 24 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAG......................................... 26 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CATTCTCATGCCACGTCTGCGGGCAt.......................................................................................................................................... 26 t 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGA....................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CGCACACCAACGAGAAGCCATTCTCA........................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GCCATTCTCATGCCACGTCTGCGGGC........................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAAaa............................................................................................................. 27 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................GCATGCACACACCTGGTAGAGCTA.............................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...................................................................................GCATGCACACACCTGGTAGAGCTATC............................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CAACGAGAAGCCATTCTCATGCCACGt.................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CGCACACCAACGAGAAGCCATTCTC............................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GCCCACTCTTCCCTCTCCACAGTTTC.............................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TATCTGATGCCCACTCTTCCCTCTCCACA................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................CAAATTCCACATCCAGCGGCTACATAGCA 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................CTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAcgt....................................... 29 cgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
............................................................................................................CTGATGCCCACTCTTCCCTCTCCA..................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CCACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAttt............................................. 28 ttt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CACGTCTGCGGGCAGCGGTGAGGCTGGAt............................................................................................................................ 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................GCCCACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAA............................................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GCACACACCTGGTAGAGCTATCTGA......................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GCGGGCAGCGGTGAGGCTGGAGATGGCTA.................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAg....................................... 25 g 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................TTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAAaa...................................... 28 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................AGCGGTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAA................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................GCATGCACACACCTGGTAGAGCTATCTGA......................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AACGCACACCAACGAGAAGCCATTCTCAt........................................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................ATGCCCACTCTTCCCTCTCCAa..................................................... 22 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................AAATTCCACATCCAGCGGCTACATA... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
TAACGCACACCAACGAGAAGCCAtc................................................................................................................................................................. 25 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................................................................................CCACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAAaa............................................ 28 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGG........................................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAACGG................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGGCTGGAGATGGCTAAGAACAA............................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................AAGGGACTTGCATGCACACACCTGGT..................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAAC........................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CCACTCTTCCCTCTCCACAGTTTC.............................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................ATGCCCACTCTTCCCTCTCCACAGTT................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................CTTCCCTCTCCACAGTTTCAACA.......................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAA...................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
......CACACCAACGAGAAGCCATTCTCATG......................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAAC..................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................GGACTTGCATGCACACACCTGGTA.................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TCTGCGGGCAGCGGTGAGGCTGGAGA.......................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................AGTTTCAACAGGAACGGGCACCTCAAA......................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAAt............................................ 26 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................AATTCCACATCCAGCGGCTACATAGCA 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAt.......................................... 28 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....CACACCAACGAGAAGCCATTCTCAt........................................................................................................................................................... 25 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TCCCTCTCCACAGTTTCA............................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................GCACCTCAAATTCCACATCCAGCGG.......... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................CACCTCAAATTCCACATCCAGCGGCT........ 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................CTTCCCTCTCCACAGTTTCAACAGGAAC..................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCTCTCCACAGTTTCAACAGGAA...................................... 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................CATGCACACACCTGGTAGAGCTATCTGAt......................................................................... 29 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................CAGTTTCAACAGGAACGGGCACCTCAAA......................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................CCCACTCTTCCCTCTCCACAGTTTC.............................................. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TGCACACACCTGGTAGAGCTATCTGA......................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................CCACATCCAGCGGCTACATAGCAgatt 27 gatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............AAGCCATTCTCATGCCACGTCTGCGttc.............................................................................................................................................. 28 ttc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................CCCACTCTTCCCTCTCCACAGTTTCAt............................................. 27 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TTCCCTCTCCACAGTTTCAACA.......................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TCAAATTCCACATCCA.............. 16 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - -