| Gene: Dbndd2 | ID: uc008nux.1_intron_3_0_chr2_164316045_f | SPECIES: mm9 |
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(9) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(7) PIWI.ip |
(4) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(39) TESTES |
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Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes) |
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| ......................................TTTTCTTCTGAGGTAGGACTTCCAAGT...................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............................................TCTGAGGTAGGACTTCCAAGTGAGACTTG.............................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................AGACTTGAGAGGTGAGGTGGGACAAG........................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................TGAGGTAGGACTTCCAAGTGAGACTTGtt............................................................................................................................ | 29 | tt | 1.00 | 8.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................CTGAGGTAGGACTTCCAAGTGAGACT................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................TCCAAGTGAGACTTGAGAGGTGAGG.................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................AGGTAGGACTTCCAAGTGAGACTTGAG............................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................GGTAGGACTTCCAAGTGAGACTTGAGA........................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................AGTGAGACTTGAGAGGTGAGGTGGGAC.............................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................CCAAGTGAGACTTGAGAGGTGAtgtg.................................................................................................................. | 26 | tgtg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................TGAGGTGGGACAAGACGCAGCTGCTTT.............................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................CCAAGTGAGACTTGAGAGGTGAGGTGt................................................................................................................. | 27 | t | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................TAAGCCAGTGTCTCTGAGGGGATG................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ...........TATCCTGCTGCCACGCCCCCACAGTGCTTT.............................................................................................................................................................. | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................GTGCTTTTCTTCTGAGGTAGGACTTCC.......................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................TAGTCCCCTCCTGCCCCCAGATGATCCT................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................TGAGGTAGGACTTCCAAGTGAGACT................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................TCTTCTGAGGTAGGACTTCCAAGTGAGACT................................................................................................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................AGAGGTGAGGTGGGACAAGACGCAGC.................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................CCTCCTGCCCCCAGATGATCCTGTTG............................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGTTGTCTTCCACAGAGTCTCCTAAtt...................................... | 27 | tt | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....CTAACGCTATCCTGCTGCCACGCCCC......................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............TCCTGCTGCCACGCCCCCACAGTGCTT............................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................TGAGGTAGGACTTCCAAGTGAGACTTt.............................................................................................................................. | 27 | t | 1.00 | 10.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................TGATCCTGTTGTCTTCCACAGAGTCTC............................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................CAGATGATCCTGTTGTCTTCCACAGAGT............................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................TGCTTTCTTAGTCCCCTCCTGCCC............................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................GAGACTTGAGAGGTGAGGTGGGACAA............................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................CCAAGTGAGACTTGAGAGGTGAGGTG.................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................TGAGAGGTGAGGTGGGACAAGACGC....................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................GATGATCCTGTTGTCTTCCACAGAGT............................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................AAGTGAGACTTGAGAGGTGAGGTGGGt............................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................GTGAGACTTGAGAGGTGAGGTGGGAC.............................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................TCCTAAGCCAGTGTCTCTGAGGGGATGTT................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................CGCAGCTGCTTTCTTAGTCCCCTCC................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................TAGGACTTCCAAGTGAGACTTGAGAGGTGA...................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................CCACAGTGCTTTTCTTCTGAGGTAGG................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................GAGGTAGGACTTCCAAGTGAGACTTGA............................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................CCCCCACAGTGCTTTTCTTCTGAGGT................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................TCCAAGTGAGACTTGAGAGGTGAGGTG.................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................TAAGCCAGTGTCTCTGAGGGGATGTTt................ | 27 | t | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................AGTGAGACTTGAGAGGTGAGGTGt................................................................................................................. | 24 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................TCTTCTGAGGTAGGACTTCCAAGTGAG................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................AGGACTTCCAAGTGAGACTTGAG............................................................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................TGCTTTTCTTCTGAGGTAGGACTTCCAAGT...................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................GGGACAAGACGCAGCTGCTTTCTTAG......................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TCTGAGGTAGGACTTCCAAGTGcgac................................................................................................................................. | 26 | cgac | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................TGAGACTTGAGAGGTGAGGTGGGACAAGA.......................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................GGTAGGACTTCCAAGTGAGACTTGAGAG.......................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................TCTGAGGTAGGACTTCCAAGTGAGACTTGA............................................................................................................................. | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGTTGTCTTCCACAGAGTCTCCTAAGCCA.................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................................GTCTCTGAGGGGATGTTCTGAGGA.......... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................CCTCCTGCCCCCAGATGATCCTGTT............................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................AGGTAGGACTTCCAAGTGAGACTTGAGA........................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................GAGGTAGGACTTCCAAGTGAGACTTGAG............................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................TTCTGAGGTAGGACTTCCAAGTGcgac................................................................................................................................. | 27 | cgac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................CAAGTGAGACTTGAGAGGTGAGGTGGG................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................GACTTGAGAGGTGAGGTGGGACAAGACGC....................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................CCAAGTGAGACTTGAGAGGTGAGGTGGGtt.............................................................................................................. | 30 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................TAAGCCAGTGTCTCTGAGGGGATGT.................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................CAGTGCTTTTCTTCTGAGGTAGGA............................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................GTGAGGTGGGACAAGACGCAGCTGCT................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................CTAAGCCAGTGTCTCTGAGGGGATG................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................ACAAGACGCAGCTGCTTTCTTAGTCCC..................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TGTTGTCTTCCACAGAGTCTCCTAAGt...................................... | 27 | t | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................TGCTTTTCTTCTGAGGTAGGAC.............................................................................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................TGGGACAAGACGCAGCTGCTTTCTT........................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................TTCTGAGGTAGGACTTCCAAGTGAGACTTGA............................................................................................................................. | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................TTCTTCTGAGGTAGGACTTCCAAGTGAGACT................................................................................................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................TTCTGAGGTAGGACTTCCAAGTGAGAaa................................................................................................................................ | 28 | aa | 1.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................TCTTCTGAGGTAGGACTTCCAAGTGAGt.................................................................................................................................. | 28 | t | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................TTCTTCTGAGGTAGGACTTCCAAGTGAGt.................................................................................................................................. | 29 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| ......................................................................TTGAGAGGTGAGGTGGGACAAGACGC....................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................TCTGAGGGGATGTTCTGAGGA.......... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................AGAGGTGAGGTGGGACAAG........................................................................................................... | 19 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................TTGAGAGGTGAGGTGG................................................................................................................. | 16 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ACCGCTAACGCTATCCTGCTGCCACGCCCCCACAGTGCTTTTCTTCTGAGGTAGGACTTCCAAGTGAGACTTGAGAGGTGAGGTGGGACAAGACGCAGCTGCTTTCTTAGTCCCCTCCTGCCCCCAGATGATCCTGTTGTCTTCCACAGAGTCTCCTAAGCCAGTGTCTCTGAGGGGATGTTCTGAGGAGTTCCACTTT ..........................................(((((.((((...(((....)))...)))).)))))....(((........)))....................................................................................................... .........................................42.........................................................101................................................................................................ |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes) |
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| ..................................................................................................................................ATCCTGTTGTCTTCCACAGAGTCTCCTA......................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - |