chr2:152655152 152655401 -
(1)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(7)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(47)
TESTES

Sense strand
CATCCCAGCTTCACATAACCCCAGGGACCGCGTATCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAATGAACTCTTTCGGGATGGAGTAAACTGGGGTCGCATCGTGGCCTTTTTCTCCTTTGGCGGGGCACTGTGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGCAGGTATTGGTGAGTCGGATTGCAAGTTGGATGGCCACCTATCTGAATGACCACCTAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGGCTGGGTAAGAACCAC
.............................................................(((((........)))))...(((.((((((...))))))....(((((((..((((....))))((((.....))))....)))))))..)))...............................................................................................
.....................................................54.........................................................................................................161.......................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
.................................................................................................................................TGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGCAGGT............................................................................................. 28 1 50.00 50.00 14.00 11.00 9.00 5.00 9.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TGAACTCTTTCGGGATGGAGTAAACT...................................................................................................................................................................... 26 1 37.00 37.00 3.00 7.00 4.00 2.00 2.00 5.00 - - 5.00 - 1.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................................................................................................................TGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGCAGG.............................................................................................. 27 1 33.00 33.00 6.00 2.00 1.00 3.00 1.00 1.00 14.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAATG.............................................................................................................................................................................................. 26 1 29.00 29.00 5.00 10.00 4.00 4.00 1.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAATGt............................................................................................................................................................................................. 27 t 21.00 29.00 5.00 4.00 3.00 3.00 2.00 - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................TCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAATGA............................................................................................................................................................................................. 27 1 17.00 17.00 1.00 3.00 6.00 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGC................. 26 1 13.00 13.00 3.00 1.00 1.00 - 2.00 - - - 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGG.................. 25 1 10.00 10.00 - 1.00 1.00 - - 1.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCTGAATGACCACCTAGAGCCTTGGATC............................. 28 1 9.00 9.00 - - 1.00 - 1.00 3.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TGAACTCTTTCGGGATGGAGTAAAC....................................................................................................................................................................... 25 1 8.00 8.00 - - - - - 4.00 - - 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TGAGTCGGATTGCAAGTTGGATGGCCAC............................................................ 28 1 8.00 8.00 1.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGC................................................................................................. 28 1 8.00 8.00 3.00 - - 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGGC.............. 27 1 7.00 7.00 1.00 1.00 2.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TAGACAAGGAGATGCAGGTATTGGTG...................................................................................... 26 1 7.00 7.00 2.00 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TATCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAATG.............................................................................................................................................................................................. 28 1 6.00 6.00 3.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGTGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGC................................................................................................. 30 1 6.00 6.00 - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TGAGTCGGATTGCAAGTTGGATGGCCA............................................................. 27 1 5.00 5.00 3.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGTGAATGAACTCTTTCGGGATGGA............................................................................................................................................................................. 26 1 5.00 5.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TGAGCAGGTAGTGAATGAACTCTTTCGG................................................................................................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATG.................................................................................................. 27 1 5.00 5.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
....................................AGAGCTTTGAGCAGGTAGTG.................................................................................................................................................................................................. 20 1 4.00 4.00 - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAGAT................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGCAGGTA............................................................................................ 29 1 4.00 4.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TTGGATCCAGGAGAACGGCGGCTGGG.......... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TGCAAGTTGGATGGCCACCTATCTG..................................................... 25 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TAACCCCAGGGACCGCGTATCAGAGCTT............................................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGTGAATGAACTCTTTCGGGATGGAG............................................................................................................................................................................ 27 1 3.00 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AAAGCGTAGACAAGGAGATGCAGGTA............................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTGCAAGTTGGATGGCCACCTATCTG..................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TATCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAAT............................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TGAGCAGGTAGTGAATGAACTCTTTCG.................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGTGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAG..................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TTCACATAACCCCAGGGACCGCGTATC...................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCTGAATGACCACCTAGAGCCTTGGATCt............................ 29 t 3.00 9.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGC................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TGAGTCGGATTGCAAGTTGGATGGCC.............................................................. 26 1 3.00 3.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TATCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAA................................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TGAGTCGGATTGCAAGTTGGATGGCCACC........................................................... 29 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAAT............................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................GGAAAGCGTAGACAAGGAGATGCAGG.............................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TGAATGAACTCTTTCGGGATGGAGTAt......................................................................................................................................................................... 27 t 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCG................ 27 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGCAG............................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TGAACTCTTTCGGGATGGAGTAAACTG..................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGGGACCGCGTATCAGAGCTTTGAGC.......................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGGAGTAAACTGGGGTCGCATCGTGGC...................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGCAG............................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TATCTGAATGACCACCTAGAGCCTTG................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CTAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGG.................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GACAAGGAGATGCAGGTATTGGTGAG.................................................................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................ATGCAGGTATTGGTGAGTCGGATTG............................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.................................ATCAGAGCTTTGAGCAGG....................................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TGAATGAACTCTTTCGGGATGGAGTAA......................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................TGAATGAACTCTTTCGGGATGGAGTA.......................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TTGGATCCAGGAGAACGGCGGCTGG........... 25 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GCAAGTTGGATGGCCACCT.......................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TAACCCCAGGGACCGCGTATCAGAGCT................................................................................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................ATGAACTCTTTCGGGATGGAGTAAACT...................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TGAGTCGGATTGCAAGTTGGATGGC............................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TCACATAACCCCAGGGACCGCGTATCA..................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGCAGGT............................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................GAATGAACTCTTTCGGGATGGAGTAAt........................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................GGCACTGTGCGTGGAAAGCGTAGA............................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGGGACCGCGTATCAGAGCTTTGAG........................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGt................................................................................................. 28 t 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAA................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TATCTGAATGACCACCTAGAGCCTTGGA............................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGATCCAGGAGAACGGCGGCTGGGg......... 26 g 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AGATGCAGGTATTGGTGAGTCGG................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGA................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGTGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGA...................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GCGTAGACAAGGAGATGCAGGTATTGG........................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGGTGAGTCGGATTGCAAGTTGGA................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................GCAAGTTGGATGGCCACCTATCTGA.................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................CCTTGGATCCAGGAGAACGGCGGCT............. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................ACCTAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGC................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GGGACCGCGTATCAGAGCTTTGAGCAG........................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TCGGATTGCAAGTTGGATGGCCACCTA......................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TGAGCAGGTAGTGAATGAACTCTTTCGGG.................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGGGACCGCGTATCAGAGCTTTGAGCA......................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.........................................................ATGAACTCTTTCGGGATGGAGTAAAC....................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GAGTCGGATTGCAAGTTGGATGGCCAC............................................................ 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TTGGATCCAGGAGAACGGCGGCTG............ 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGGCT............. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................CGGATTGCAAGTTGGATGGCCACCTA......................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAGTGAATGAACTCTTTCGGGATGG.............................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TAACCCCAGGGACCGCGTATCAGAGCTTT.............................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TAACCCCAGGGACCGCGTATCAGAGC................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TGAGCAGGTAGTGAATGAA............................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TTGCAAGTTGGATGGCCACCTATCT...................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GCTTTGAGCAGGTAGTGAATGAACTCTTTCGG................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTAGTGAATGAACTCTTTCGGGATtg.............................................................................................................................................................................. 27 tg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGa............... 26 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CTAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGC................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................CGGCTGGGTAAGAAgcc. 17 gcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CCTAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACG................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGGCTG............ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.............................................................................................................................TGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGa................................................................................................. 28 a 1.00 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TCGTGGCCTTTTTCTCCTTTGGCGG.................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGGCTG............ 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGTGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATG.................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAATGtc............................................................................................................................................................................................ 28 tc 1.00 29.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TGAGCAGGTAGTGAATGAACTCTTTC..................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.........................................................ATGAACTCTTTCGGGATGGAGTAAA........................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TCGGGATGGAGTAAt........................................................................................................................................................................ 15 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GTATCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGA................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGAATGACCACCTAGAGCCTTGGATC............................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TTTTTCTCCTTTGGCGGGGCACTGTGC.......................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................AACTCTTTCGGGATGGAGTAAACTGGGGTC................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................GCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGCAGG.............................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGATCCAGGAGAACGGCGGCTGGt.......... 25 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................AGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAA................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCTGAATGACCACCTAGAGCCTTGta............................... 26 ta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TTTCGGGATGGAGTAAACTGGGGgc................................................................................................................................................................ 25 gc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................ACCGCGTATCAGAGCTTTGAGCAGGTA..................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TTGGATGGCCACCTATCTGAATGACC.............................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TTTGGCGGGGCACTGTGCGTGGAAAG.................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TTCACATAACCCCAGGGACCGCGTATCA..................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TTTGAGCAGGTAGTGAATGAACTC......................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TAGACAAGGAGATGCAGGTATTGGTGA..................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCTGAATGACCACCTAGAGCCTTGGATCCA........................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................TGGCGGGGCACTGTGCGTGGAAAGCGT............................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGGCTGG........... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................CGCGTATCAGAGCTTTGAGCAGG....................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GTGAGTCGGATTGCAAGTTGGATGGCC.............................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................AGATGCAGGTATTGGTGAGTCGGAT.............................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................CCTAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGG.................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CTAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCtt............... 29 tt 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CAGGGACCGCGTATCAGAGCTTTGAGCAG........................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TATCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAATGt............................................................................................................................................................................................. 29 t 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGATCCAGGAGAACGGCGGCTGGGgaa....... 28 gaa 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ATAACCCCAGGGACCGCGTATCAGAGCT................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGATCCAGGAGAACGGCGGCTtgga......... 26 tgga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AGTGAATGAACTCTTTCGGGATGGAGTAA......................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGATCCAGGAGAACGGCGGCTGGG.......... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGGCTG............ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................ACCTAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACG................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GGACCGCGTATCAGAGCTTTGAGCAGGT...................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TGAATGACCACCTAGAGCCTTGGAT.............................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................AACCCCAGGGACCGCGTATCAGAGCTT............................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TATCAGAGCTTTGAGCAGG....................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GACAAGGAGATGCAGGTATTGGTGA..................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GGGACCGCGTATCAGAGCTTTGAGCAGG....................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................CTTGGATCCAGGAGAACGGCGGCTGG........... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GGGACCGCGTATCAGAGCTT............................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGG............... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGa............... 28 a 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTCGGGATGGAGTAAACTGGGGTCGC.............................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TTTGAGCAGGTAGTGAATGAACTCT........................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..........................................TTGAGCAGGTAGTGAATGAACTCT........................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGCAGGTATTGGTGAGTCGGATTGCA.......................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCTGAATGACCACCTAGAGCCTTGGATCC............................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TGAACTCTTTCGGGATGGAGTAAACTGt.................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................AGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGGC.............. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TATTGGTGAGTCGGATTGCAAG........................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TTTTCTCCTTTGGCGGGGCACTGTG........................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TTTGAGCAGGTAGTGAATGAACTCTT....................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGGATCCAGGAGAACGGCGGCTGGGgc........ 27 gc 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GTCGGATTGCAAGTTGGATGGCCAC............................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TTGGTGAGTCGGATTGCAAGTTGGATGGC............................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TCTGAATGACCACCTAGAGCCTTGGgtct............................ 29 gtct 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CAGGTAGTGAATGAACTC......................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAATGAA............................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AGCGTAGACAAGGAGATGCAGGTATTGGT....................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TTCTCCTTTGGCGGGGCACTGTGCGTG....................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TTGAGCAGGTAGTGAATGAACTCTT....................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TGGAGTAAACTGGGGTCGCATCGTGG....................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................GAGCAGGTAGTGAATGAACTCTTTCGGGAT................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAATGAACT.......................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GGGATGGAGTAAACTGGGGTCGCATCGT......................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................TCCTTTGGCGGGGCACTGTGCGTGGA..................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGTGAATGAACTCTTTCGGGATGGAGT........................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTAGTGAATGAACTCTTTCGGGATGG.............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TTGGCGGGGCACTGTGCGTGGAAAGCGTA.............................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAATGAAC........................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GAAAGCGTAGACAAGGAG..................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........TCACATAACCCCAGGGACCGCGTATC...................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TGGCCACCTATCTGAATGACCACCTAGt....................................... 28 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................GAATGAACTCTTTCGGGATGGAGTA.......................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................GAATGAACTCTTTCGGGATG............................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................GGAAAGCGTAGACAAGGAGATGCAG............................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................GGAGTAAACTGGGGTC................................................................................................................................................................ 16 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CATCCCAGCTTCACATAACCCCAGGGACCGCGTATCAGAGCTTTGAGCAGGTAGTGAATGAACTCTTTCGGGATGGAGTAAACTGGGGTCGCATCGTGGCCTTTTTCTCCTTTGGCGGGGCACTGTGCGTGGAAAGCGTAGACAAGGAGATGCAGGTATTGGTGAGTCGGATTGCAAGTTGGATGGCCACCTATCTGAATGACCACCTAGAGCCTTGGATCCAGGAGAACGGCGGCTGGGTAAGAACCAC
.............................................................(((((........)))))...(((.((((((...))))))....(((((((..((((....))))((((.....))))....)))))))..)))...............................................................................................
.....................................................54.........................................................................................................161.......................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
............................................................................................................................................................................................................................GAGAACGGCGGCtccc.............. 16 tccc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -