(12)
OTHER.mut
(3)
OVARY
(8)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(49)
TESTES

Sense strand
ATACCTAGCAAACAAATGCAGTATTGCCTCAAGAATTGATTGCTTCTCTGGTATGGATGGGGAAGTTGGCATTTGAGTTGAAGGGGTTACAGTGGGGGGGAAACAACCTACCTTGGCAGCTTCTACAATGATGGTAATATTTTTCGTCAACAGAGTTCACCTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGAAGCTGAGGGGAGAGCAGCTGGGGAGTAGTTTGTCATTTCAAGGGTTGTAATTGACTTTGTTTACACACGCACACACATCTAGAGGTCCCCACAAGTGTATTTGGGGAAAAACTCCGAGAACAAGTTGAGGAA
.......................................................................................................................((((.((..((((((.........)))))).((((.....(((((...(((....))).))))))))).))))))..................................................................................................................................
.....................................................................................................................118.........................................................................194................................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
..........................................................................................................................CTACAATGATGGTAATATTTTTCGTCAACAGAGTTCACCTAGTGAGTGTTGA...................................................................................................................................................... 52 1 775.00 775.00 506.00 269.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TACAATGATGGTAATATTTTTCGTCAACAGAGTTCACCTAGTGAGTGTTGAC..................................................................................................................................................... 52 1 335.00 335.00 151.00 184.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 28 1 270.00 270.00 - - 26.00 1.00 16.00 31.00 13.00 56.00 14.00 18.00 6.00 22.00 11.00 9.00 10.00 3.00 5.00 1.00 10.00 2.00 1.00 - 1.00 2.00 - 1.00 1.00 - 2.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 29 1 76.00 76.00 - - 1.00 2.00 9.00 9.00 2.00 5.00 7.00 8.00 - 7.00 1.00 3.00 1.00 2.00 7.00 1.00 2.00 4.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................GTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 21 1 75.00 75.00 - - 42.00 12.00 - 5.00 - - - - - - 6.00 3.00 2.00 2.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................ACAATGATGGTAATATTTTTCGTCAACAGAGTTCACCTAGTGAGTGTTGACA.................................................................................................................................................... 52 1 51.00 51.00 51.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 29 1 50.00 50.00 - - 2.00 - 3.00 7.00 9.00 5.00 5.00 - - 2.00 5.00 2.00 - - 4.00 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 27 1 38.00 38.00 - - 5.00 - 3.00 8.00 - - - 4.00 - 1.00 2.00 3.00 3.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................GTTGACACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 22 1 35.00 35.00 - - 10.00 10.00 - - 1.00 - 2.00 - - - 3.00 3.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 30 1 31.00 31.00 - - 2.00 - 12.00 1.00 1.00 - 1.00 2.00 6.00 1.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................AGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 24 1 30.00 30.00 - - 1.00 16.00 1.00 2.00 1.00 - 2.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GTGTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 23 1 28.00 28.00 - - 1.00 10.00 - 9.00 1.00 - - - - - - 3.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 30 1 24.00 24.00 - - 3.00 - 2.00 1.00 5.00 - 4.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAa....................................................................................................................................... 26 a 22.00 1.00 - - - - 2.00 5.00 - 8.00 - 2.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TCAACAGAGTTCACCTAGTGAGTGTTGACA.................................................................................................................................................... 30 1 21.00 21.00 - - - - - - - - - 10.00 - 7.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 29 1 20.00 20.00 - - 1.00 - 5.00 2.00 3.00 - - 2.00 6.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 28 1 17.00 17.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - 4.00 - 1.00 1.00 - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 22 1 16.00 16.00 - - - 15.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 31 1 16.00 16.00 - - - - 4.00 - 4.00 - 3.00 - - - - - - - - 1.00 - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 26 1 15.00 15.00 - - - 2.00 5.00 - 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 25 1 14.00 14.00 - - 1.00 - 2.00 - 1.00 - 5.00 - - - 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GACACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 19 1 13.00 13.00 - - 1.00 1.00 - - 2.00 - 1.00 - 2.00 - - - 2.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................AGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 26 1 12.00 12.00 - - - 3.00 3.00 - 1.00 - - - 2.00 - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................GTTGACACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 23 1 12.00 12.00 - - - 5.00 2.00 - - - - - 2.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 31 1 12.00 12.00 - - - - 4.00 - 2.00 - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................CACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 17 2 11.00 11.00 - - - - - 0.50 6.00 - 0.50 - 0.50 - - 0.50 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 28 1 11.00 11.00 - - - 1.00 3.00 - 3.00 - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..........................................................................................................................CTACAATGATGGTAATATT....................................................................................................................................................................................... 19 1 10.00 10.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 24 1 10.00 10.00 - - 2.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 32 1 10.00 10.00 - - - - 1.00 1.00 2.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGACACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 21 1 10.00 10.00 - - - 1.00 2.00 - 1.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGACACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 20 1 9.00 9.00 - - - - 2.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 30 1 9.00 9.00 - - - - 4.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 27 1 8.00 8.00 - - 1.00 - 2.00 - - - 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 31 1 8.00 8.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................GTTGACACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 24 1 8.00 8.00 - - - 5.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 24 1 7.00 7.00 - - - - 2.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................AGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 25 1 7.00 7.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................ACACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 18 1 6.00 6.00 - - 1.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CCTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 31 1 6.00 6.00 - - - - 4.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................AGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CTACAATGATGGTAATAT........................................................................................................................................................................................ 18 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGTTGACACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 23 1 5.00 5.00 - - - 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAG....................................................................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GACACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 20 1 4.00 4.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................GTTGACACCTTGGGTCTGAG....................................................................................................................................... 20 1 4.00 4.00 - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................ACACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 19 1 4.00 4.00 - - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGACACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 22 1 4.00 4.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CTACAATGATGGTAATATTTTTCGTCAACAGA.......................................................................................................................................................................... 32 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 19 2 3.50 3.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 1.00 - - - - - - 1.00 - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................CACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 18 2 3.50 3.50 - - - - 1.00 - 0.50 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CTACAATGATGGTAATATTTTTCGTC................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTGGGTCT.......................................................................................................................................... 23 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TTGACACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 22 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TTCACCTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 35 1 3.00 3.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................ACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 17 2 3.00 3.00 - - 0.50 - 0.50 0.50 - - - - 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CTACAATGATGGTAATATTTTTC................................................................................................................................................................................... 23 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 18 2 3.00 3.00 - - 1.00 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................CACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 19 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................CACCTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 33 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 20 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAa....................................................................................................................................... 27 a 3.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 17 2 2.50 2.50 - - - - - - 0.50 - 0.50 - 1.00 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................CACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 16 3 2.33 2.33 - - - 0.33 0.33 - - - - - - - 0.67 0.33 - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 33 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GGTAATATTTTTCGTCAACAG........................................................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAaa...................................................................................................................................... 27 aa 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GACACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTG......................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CTACAATGATGGTAATATTTTTCGT................................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TACAATGATGGTAATATT....................................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CTACAATGATGGTAATATTT...................................................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TTTCGTCAACAGAGTTCACCT.................................................................................................................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................AGTGTTGACACCTTGGGTCTGA........................................................................................................................................ 22 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TATTTTTCGTCAACAGAGTTCACCTAGTGA............................................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTG......................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TATTTTTCGTCAACAGAGTTCACCTAGTGAGT........................................................................................................................................................... 32 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................ATTTTTCGTCAACAGAGT........................................................................................................................................................................ 18 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CCTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 32 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGTGAGTGTTGACACCTTGGG............................................................................................................................................. 22 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TCACCTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 34 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................CACCTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 36 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TACAATGATGGTAATATTTTTCGTCAACAGA.......................................................................................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGA........................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAG....................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................ATTTTTCGTCAACAGAGTTCACC................................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTtagt...................................................................................................................................... 29 tagt 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................CAACAGAGTTCACCTAGTGAGTGTTGACAC................................................................................................................................................... 30 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................TTGCCTCAAGAATTGATTGCTTCTCTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............CAAATGCAGTATTGCCTCAAGAATT............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CTACAATGATGGTAATATTTTTCGTCAACAGAGT........................................................................................................................................................................ 34 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................ATGGTAATATTTTTCGTCAACAGAG......................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ATATTTTTCGTCAACAGAa......................................................................................................................................................................... 19 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TCACCTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 36 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGGT............................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGTGAGTGTTGACAC................................................................................................................................................... 16 4 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CTACAATGATGGTAATATTTTTCGTCAACAcaa......................................................................................................................................................................... 33 caa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................GTTGACACCTTGGGTCTG......................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ATATTTTTCGTCAACAGAGTTCAC.................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AATATTTTTCGTCAACAGAGT........................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CTACAATGATGGTAATATTTTTCGTCA............................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................ACCTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGa...................................................................................................................................... 32 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................CAGAGTTCACCTAGTGAGTGgaca...................................................................................................................................................... 24 gaca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGaga.................................................................................................................................... 30 aga 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TTTTTCGTCAACAGAGTTC...................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................AACAGAGTTCACCTAGTGAGTGTTtaca.................................................................................................................................................... 28 taca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TTGACACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................ATTGCCTCAAGAATTGATTGCTTCTCTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................CAACAGAGTTCACCTAGTGAGTGTTGACA.................................................................................................................................................... 29 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ATATTTTTCGTCAACAGAGTTCACCT.................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGTATTGCCTCAAGAATTGATTGCTactc.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 actc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGcg..................................................................................................................................... 29 cg 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................GGTAATATTTTTCGTCAAC............................................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TACAATGATGGTAATATTTT..................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TAATATTTTTCGTCAACAGA.......................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TTTCGTCAACAGAGTTCACCTAGTGA............................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGTGAGTGTTGACACCTTGGGa............................................................................................................................................ 23 a 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ATATTTTTCGTCAACAGAGTTCACCTAGTGAGTGTT........................................................................................................................................................ 36 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ACCTTGGGTCTGAGTGAAGC................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGtgt...................................................................................................................................... 28 tgt 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................GTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TTCGTCAACAGAGTTCACC................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGACACCTTGGGTCTagt....................................................................................................................................... 18 agt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TACAATGATGGTAATATTTTTCGTCA............................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AATATTTTTCGTCAACAGA.......................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTaaa................................................................................................................................... 30 aaa 1.00 38.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTG............................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGCAGTATTGCCTCAAGAATTGAatgc......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 atgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTGGGTCcgaa....................................................................................................................................... 26 cgaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTt..................................................................................................................................... 30 t 1.00 50.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TCAACAGAGTTCACCTAGTGAGTGTTtaca.................................................................................................................................................... 30 taca 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGA........................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................ATTGCCTCAAGAATTGATTGCTTCTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TACAATGATGGTAATATTT...................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................GGTCTGAGTGAAGCTGAGGG........................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................TGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................ACCTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAtt...................................................................................................................................... 29 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GAGTTCACCTAGTGAGTGTTGACACCT................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAatg..................................................................................................................................... 30 atg 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TTTCGTCAACAGAGTTCACCTAct............................................................................................................................................................... 24 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAaaa..................................................................................................................................... 28 aaa 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................CCTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCagt........................................................................................................................................ 29 agt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TTTCGTCAACAGAGTTCACCTAGT............................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTa..................................................................................................................................... 29 a 1.00 270.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TATTGCCTCAAGAATTGATTGCTTCTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TTGACACCTTGGGTCTGAGTGAAGCTGAGG............................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................ATTTTTCGTCAACAGAGTTCACCT.................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CTACAATGATGGTAATATTTT..................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................ATTTTTCGTCAACAGAGTTCACCTA................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TACAATGATGGTAATATTTTTCGTCAACAGAG......................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAG....................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.........................................................................................................................................TATTTTTCGTCAACAGAGTTCACCTAGTG.............................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTGGGa............................................................................................................................................ 21 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................ACCTAGTGAGTGTTGACAC................................................................................................................................................... 19 2 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGACACCTTGGGTCTGcgtg..................................................................................................................................... 20 cgtg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGG............................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CTAGTGAGTGTTGACACC.................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................AGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTt..................................................................................................................................... 29 t 1.00 270.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TATTTTTCGTCAACAGAGTTCACCT.................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................ATGATGGTAATATTTTTCGTCAACAGAGTTCACC................................................................................................................................................................... 34 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TACAATGATGGTAATATTTTTCGTC................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTtg.................................................................................................................................... 29 tg 1.00 38.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................CTTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 16 3 0.67 0.67 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CTACAATGATGGTAATA......................................................................................................................................................................................... 17 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGCCTCAAGAATTGATTGCTTCTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AAACAAATGCAGTATTGCCTCAAGAAT................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
........CAAACAAATGCAGTATTGCCTCAAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TATTGCCTCAAGAATTGATTGCTTCTCT................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGCAGTATTGCCTCAAGAATTGATTG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................TATTGCCTCAAGAATTGATTGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................AACAGAGTTCACCTAGTGAGTGTTGACA.................................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AAACAAATGCAGTATTGCCTCAAGAATT............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GTTCACCTAGTGAGTGTTGA...................................................................................................................................................... 20 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................ACCTAGTGAGTGTTGA...................................................................................................................................................... 16 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TGCCTCAAGAATTGATTGCTTCTCT................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ACCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 16 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................ATTGCCTCAAGAATTGATTGCTTCTCTGt................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 t 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GTATTGCCTCAAGAATTGATTGCTTC...................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GTTCACCTAGTGAGTGTTGAC..................................................................................................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ACCTTGGGTCTGAGT...................................................................................................................................... 15 8 0.50 0.50 - - 0.12 - - 0.12 - - - - - - 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................ACAGAGTTCACCTAGTGAGTGTTGACA.................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................CACCTTGGGTCTGAGTGAg................................................................................................................................... 19 g 0.50 3.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TGCAGTATTGCCTCAAGAATTGATTGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - -
........CAAACAAATGCAGTATTGCCTCAAGAAT................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GACACCTTGGGTCTGAG....................................................................................................................................... 17 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CAAGAATTGATTGCTTCT..................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGGAAAAACTCCGAGAACAAGTTGAG... 27 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGAAAAACTCCGAGAACAAGTTGAGG.. 27 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTGTATTTGGGGAAAAACTCCGAGA............. 27 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGGGAAAAACTCCGAGAACAAGTTGA.... 28 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGTGTATTTGGGGAAAAACTCCGA............... 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................CCTTGGGTCTGAGTG..................................................................................................................................... 15 16 0.25 0.25 - - 0.06 - - - - - - - - - 0.12 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................CACAAGTGTATTTGGGGAAAAACTCCGA............... 28 4 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGGGGAAAAACTCCG................ 17 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................CTTGGGTCTGAGTGA.................................................................................................................................... 15 13 0.23 0.23 - - - - 0.15 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TACCTAGCAAACAAATGCAGTATTGCC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20
..................................................................................................................................................................................TTGGGTCTGAGTGAA................................................................................................................................... 15 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
ATACCTAGCAAACAAATGCAGTATTGCCTCAAGAATTGATTGCTTCTCTGGTATGGATGGGGAAGTTGGCATTTGAGTTGAAGGGGTTACAGTGGGGGGGAAACAACCTACCTTGGCAGCTTCTACAATGATGGTAATATTTTTCGTCAACAGAGTTCACCTAGTGAGTGTTGACACCTTGGGTCTGAGTGAAGCTGAGGGGAGAGCAGCTGGGGAGTAGTTTGTCATTTCAAGGGTTGTAATTGACTTTGTTTACACACGCACACACATCTAGAGGTCCCCACAAGTGTATTTGGGGAAAAACTCCGAGAACAAGTTGAGGAA
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.....................................................................................................................118.........................................................................194................................................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
........................................................................................................................................................................................................AGCAGCTGGGGAGTAGattt........................................................................................................ 20 attt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -