chr2:119422029 119422278 +
(1)
OTHER.ip 		(12)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(8)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(55)
TESTES

Sense strand
CTTAGGTGCTTTTATATTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCATCCCAAGTCCTGTTGTAGCGGCTTGAAAGGCTCCATAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAAATGAGTACAAGCCAGCTACCATGGCTCACCTTTATGCCCAGCTCTTGGGACCTGGGGAACTGAGGTGAGGATTGAGAGTTTGAAGCTAATCTGGG
...................................................................................................................(((.((...(((((......))))).)))))............(((........)))..............................................................................
................................................................................................................113...........................................................175.........................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGT.................................................................................................................................................................................................. 27 1 281.00 281.00 71.00 74.00 25.00 53.00 38.00 - - 4.00 5.00 - - 7.00 - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTA................................................................................................................................................................................................. 26 1 202.00 202.00 48.00 51.00 32.00 16.00 26.00 - - 1.00 6.00 2.00 - 7.00 - - - - - - - 1.00 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - 4.00 - - - 1.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGT.................................................................................................................................................................................................. 28 1 160.00 160.00 41.00 55.00 16.00 17.00 16.00 1.00 - - 4.00 - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - 3.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCATC................................................................................................................................................................................. 29 1 143.00 143.00 46.00 30.00 39.00 8.00 2.00 1.00 4.00 - - 4.00 1.00 - 2.00 - 1.00 - 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAA.................................................................................................................................................................................................... 26 1 136.00 136.00 39.00 33.00 22.00 14.00 12.00 - - 3.00 5.00 1.00 - 3.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGaat.................................................................................................................................................................................................... 26 aat 120.00 2.00 29.00 30.00 17.00 26.00 12.00 - - 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAG................................................................................................................................................................................................... 26 1 119.00 119.00 34.00 38.00 12.00 15.00 9.00 - - 2.00 2.00 - - 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAG................................................................................................................................................................................................... 27 1 103.00 103.00 29.00 22.00 17.00 16.00 13.00 - - 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGA.......................................................................................................... 27 1 89.00 89.00 6.00 9.00 5.00 4.00 2.00 - 11.00 21.00 6.00 6.00 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - 3.00 4.00 5.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................TCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCAC........................................................................................................................................................................................................ 28 1 71.00 71.00 25.00 26.00 2.00 7.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 -
......................TCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCA......................................................................................................................................................................................................... 27 1 70.00 70.00 24.00 19.00 7.00 7.00 9.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATG........................................................................................................ 29 1 60.00 60.00 8.00 10.00 3.00 2.00 - 4.00 2.00 1.00 - 3.00 7.00 - 2.00 2.00 7.00 - 5.00 - - - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGaatt................................................................................................................................................................................................... 27 aatt 58.00 2.00 14.00 20.00 - 8.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGC................................................................................................................... 29 1 55.00 55.00 10.00 7.00 10.00 1.00 2.00 - 15.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - 3.00 - - 1.00 - - - 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCATCC................................................................................................................................................................................ 30 1 54.00 54.00 10.00 14.00 18.00 - 5.00 2.00 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAt................................................................................................................................................................................................ 27 t 50.00 202.00 11.00 13.00 8.00 6.00 7.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCATCCC............................................................................................................................................................................... 31 1 48.00 48.00 - - 28.00 - 1.00 7.00 - - - 1.00 - - 1.00 2.00 1.00 2.00 - 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGT.................................................................................................................................................................................................. 25 1 47.00 47.00 3.00 6.00 9.00 3.00 4.00 - 1.00 1.00 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - 2.00 - - 5.00 1.00 - - - - 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCA.................................................................................................................. 30 1 46.00 46.00 - - 1.00 1.00 1.00 13.00 1.00 - - - - - 7.00 8.00 - 4.00 1.00 5.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGAT......................................................................................................... 28 1 44.00 44.00 7.00 5.00 7.00 2.00 3.00 - 3.00 4.00 - 1.00 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTA................................................................................................................................................................................................. 28 1 40.00 40.00 7.00 9.00 7.00 4.00 7.00 2.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCAA................................................................................................................. 31 1 30.00 30.00 - - 2.00 - - 10.00 1.00 - - - - - 4.00 6.00 - 2.00 - 3.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAG................................................................................................................................................................................................ 27 1 30.00 30.00 9.00 8.00 3.00 4.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGA....................................................................................................... 30 1 29.00 29.00 - - 2.00 - - 2.00 - - - 2.00 1.00 - 1.00 - 2.00 3.00 5.00 1.00 4.00 - - - 1.00 - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCAT.................................................................................................................................................................................. 28 1 28.00 28.00 9.00 10.00 7.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAG........................................................................................................... 26 1 27.00 27.00 6.00 2.00 1.00 - - - 1.00 2.00 1.00 5.00 2.00 - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
............................................TGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCA................................................................................................................................................................................... 27 1 26.00 26.00 5.00 4.00 7.00 2.00 2.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGC.......................................................................................................................................................................................................... 31 2 24.50 24.50 - - - - - 8.50 0.50 - - 1.00 0.50 - 2.00 1.50 0.50 1.50 2.00 2.50 - - - - - - - 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - 0.50 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGA............................................................................................................................................................................................... 28 1 23.00 23.00 10.00 4.00 6.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTA..................................................................................................................................................................................................... 25 1 21.00 21.00 - 1.00 3.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 5.00 2.00 - - - 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGaatt................................................................................................................................................................................................... 26 aatt 14.00 0.00 4.00 6.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGA..................................................................................................................... 27 1 14.00 14.00 4.00 1.00 3.00 - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGAT.............................................................................................................................................................................................. 29 1 14.00 14.00 4.00 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGAAGATAAAAATGAGTACAAGCCAGC............................................................................... 27 1 12.00 12.00 - 1.00 1.00 - - - 3.00 - 1.00 - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGAC............................................................................................................................................................................................................... 27 2 12.00 12.00 2.50 3.00 1.50 0.50 0.50 - 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - 1.00 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAAATG............................................................................................ 30 1 12.00 12.00 - - 8.00 - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAG..................................................................................................... 29 1 12.00 12.00 - - 1.00 - - - 2.00 - - 4.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGt.......................................................................................................................................................................................................... 31 t 12.00 8.50 - - - - - 4.50 - - - - - - 2.50 2.50 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAA............................................................................................... 27 1 11.00 11.00 1.00 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGaa..................................................................................................................................................................................................... 25 aa 11.00 2.00 1.00 - 2.00 - 2.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAA...................................................................................................... 31 1 11.00 11.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 2.00 2.00 3.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAA...................................................................................................... 28 1 11.00 11.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - 4.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAt................................................................................................................................................................................................ 29 t 11.00 40.00 4.00 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAG...................................................................................................................... 26 1 11.00 11.00 2.00 4.00 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATG........................................................................................................ 26 1 10.00 10.00 2.00 - 2.00 - - - 1.00 - - 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGT.................................................................................................................................................................................................. 26 1 10.00 10.00 2.00 4.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTt................................................................................................................................................................................................. 28 t 10.00 281.00 4.00 - 4.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TAGGTGCTTTTATATTCAGCTCAACAT............................................................................................................................................................................................................................. 27 2 9.50 9.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 6.50 - - - - 2.00 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - -
..TAGGTGCTTTTATATTCAGCTCAACATT............................................................................................................................................................................................................................ 28 2 9.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.00 - - - - 3.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTA................................................................................................................................................................................................. 29 1 9.00 9.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGATA.................................................................................................. 27 1 9.00 9.00 1.00 - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TTGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCATC................................................................................................................................................................................. 30 1 9.00 9.00 1.00 - 6.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATC.................................................................................................................................................................................... 26 1 9.00 9.00 - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGA....................................................................................................... 27 1 9.00 9.00 - 2.00 1.00 - - - - 2.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGG........................................................................................................................................................................................................... 30 2 8.50 8.50 - - - - - 2.00 - - - 0.50 - - 2.00 1.00 - 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGC.......................................................................................................................................................................................................... 29 2 8.00 8.00 - 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - 4.50 - - - - 0.50 - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAt................................................................................................................................................................................................... 27 t 8.00 136.00 2.00 4.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAAA.............................................................................................. 28 1 8.00 8.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..............TATTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGAC............................................................................................................................................................................................................... 29 2 8.00 8.00 0.50 1.00 - 0.50 - - 1.50 - - - - - - - - - 0.50 - - 0.50 0.50 0.50 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - -
...........................................................TAGAGATAATCATCCCAAGTCCTGTTG.................................................................................................................................................................... 27 1 8.00 8.00 - - - - - - - - - 4.00 - - - - 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAt.................................................................................................................................................................................................... 26 t 7.00 21.00 3.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCA......................................................................................................................................................................................................... 30 1 7.00 7.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAATCATCCCAAGTCCTGTTGTAGCGGC............................................................................................................................................................. 28 1 7.00 7.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAAAT............................................................................................. 29 1 7.00 7.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGA.................................................................................................... 30 1 7.00 7.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - 3.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAA................................................................................................. 28 1 7.00 7.00 3.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGt....................................................................................................... 30 t 6.00 60.00 - 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAG.................................................................................................................... 28 1 6.00 6.00 1.00 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACATTCTGAACTCAGGACTTGGCA......................................................................................................................................................................................................... 24 1 6.00 6.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - -
.........................ACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGT...................................................................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCAC........................................................................................................................................................................................................ 27 1 6.00 6.00 1.00 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAG................................................................................................................................................................................................ 29 1 6.00 6.00 - 2.00 - 2.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGC.......................................................................................................................................................................................................... 26 2 5.50 5.50 1.50 0.50 0.50 1.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGA............................................................................................................................................................................................... 30 1 5.00 5.00 - - 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................CAGAAGATGAAGATAAAAATGAGTACA...................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAA................................................................................................ 29 1 5.00 5.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGAT................................................................................................... 26 1 5.00 5.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGaat.................................................................................................................................................................................................... 25 aat 5.00 0.00 1.00 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAA.................................................................................................................................................................................................... 25 1 5.00 5.00 - - 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCAt................................................................................................................. 31 t 5.00 46.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAA................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - -
........................AACATTCTGAACTCAGGACTTGGCAC........................................................................................................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCA.................................................................................................................. 28 1 4.00 4.00 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTA..................................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAG................................................................................................................................................................................................... 24 1 4.00 4.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTt................................................................................................................................................................................................. 26 t 4.00 47.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGaaa.................................................................................................................................................................................................... 26 aaa 4.00 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAAATGA........................................................................................... 31 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TCAGGACTTGGCACGTAAGTAGATAGA........................................................................................................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGA.................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
........................AACATTCTGAACTCAGGACTTGGCA......................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TAGAGATAATCATCCCAAGTCCTGTTGTA.................................................................................................................................................................. 29 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................ACTAAACTGTTAAGAGCAA................................................................................................................. 19 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
....................GCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCA......................................................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAATCATCCCAAGTCCTGTTGTAGCGGCT............................................................................................................................................................ 29 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TGGCTCACCTTTATGCCCAGCTCTTGGGACC........................................... 31 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TACCATGGCTCACCTTTATGCCCAGCTC................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGTAGATAGAGATAATCATCCCAAGTC.......................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTtt................................................................................................................................................................................................ 29 tt 3.00 281.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAA.................................................................................................................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CGACATACTAAACTGTTAAGAGCAA................................................................................................................. 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGT...................................................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGT...................................................................................................................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GAAGATGAAGATAAAAATGAGTACAAGCC.................................................................................. 29 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCCATAGAAGCGACATACTAAACTGTT......................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TACCATGGCTCACCTTTATGCCCAGCTCT.................................................. 29 1 3.00 3.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGAAAGGCTCCATAGAAGCGACATACTAAA.............................................................................................................................. 30 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CATACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAG........................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGaat.................................................................................................................................................................................................... 23 aat 3.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCAAC................................................................................................................ 32 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTA................................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAa................................................................................................................................................................................................ 27 a 3.00 202.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTt................................................................................................................................................................................................. 29 t 3.00 160.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGaat.................................................................................................................................................................................................... 29 aat 3.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGA............................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAa................................................................................................................................................................................................... 26 a 3.00 5.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAAAAATGAGTACAAGCCAGCTACCAT......................................................................... 27 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................CAGAAGATGAAGATAAAAATGAGTAC....................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGAT................................................................................................... 31 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGA.................................................................................................... 33 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACG....................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAttt.............................................................................................................................................................................................. 29 ttt 3.00 202.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGt............................................................................................................................................................................................... 28 t 3.00 30.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TAGGTGCTTTTATATTCAGCTCAACA.............................................................................................................................................................................................................................. 26 2 2.50 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGC................................................................................................................... 18 2 2.50 2.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 0.50 - - - -
..............................CTGAACTCAGGACTTGGC.......................................................................................................................................................................................................... 18 3 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAAAAATGAGTACAAGCCAGCTACCATGG....................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACG....................................................................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGT...................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GATGAAGATAAAAATGAGTACAAGCCAGC............................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGT...................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCA......................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................AGGACTTGGCACGTAAGTAGATAGAGATA....................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................ATAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGC................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTA..................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGtt......................................................................................................................................................................................................... 32 tt 2.00 8.50 - - - - - 1.00 - - - - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................AGATGAAGATAAAAATGAGTACAAGCC.................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCt......................................................................................................................................................................................................... 32 t 2.00 24.50 - - - - - 1.00 - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GTAGATAGAGATAATCATCCCAAGTC.......................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCA.................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGT...................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTtt................................................................................................................................................................................................ 30 tt 2.00 160.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAatc................................................................................................................................................................................................. 26 atc 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACG....................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AACTCAGGACTTGGCAC........................................................................................................................................................................................................ 17 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................AGGACTTGGCACGTAAGTAGATAGAG.......................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAA................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGAAGATAAAAATGAGTACAAGCCAGCT.............................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCAC........................................................................................................................................................................................................ 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................ATCATCCCAAGTCCTGTTGTAGCGGCT............................................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................ACTTGGCACGTAAGTAG................................................................................................................................................................................................ 17 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGAAAGGCTCCATAGAAGCGACATACTA................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGaat.................................................................................................................................................................................................... 28 aat 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................CCATAGAAGCGACATACTAAACTGTT......................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGT.................................................................................................................................................................................................. 31 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TTGAAAGGCTCCATAGAAGCGACATACTA................................................................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGAAAGGCTCCATAGAAGCGACATACTAAt.............................................................................................................................. 30 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TAGCGGCTTGAAAGGCTCCATAGAAGCGA....................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGaatt................................................................................................................................................................................................... 24 aatt 2.00 2.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGAa......................................................................................................... 28 a 2.00 89.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGaa..................................................................................................................................................................................................... 27 aa 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACt....................................................................................................................................................................................................... 29 t 2.00 71.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAtt............................................................................................................................................................................................... 28 tt 2.00 202.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACG....................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................AAGGCTCCATAGAAGCGACAT.................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGAT.............................................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGAAAGGCTCCATAGAAGCGACATACTAAAC............................................................................................................................. 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAA.................................................................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAAA.............................................................................................. 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTTAAGAGCAACAGAAGATGA....................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGATA.................................................................................................. 32 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAAATGt........................................................................................... 31 t 2.00 12.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AGCAACAGAAGATGAAGATAAAAAT............................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CACGTAAGTAGATAGAGATAATCATCCCAt............................................................................................................................................................................. 30 t 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACG....................................................................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................GCACGTAAGTAGATAGAGATAATCATCCC............................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TCCCAAGTCCTGTTGTAGCGGCT............................................................................................................................................................ 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - -
...........................................................TAGAGATAATCATCCCAAGTCCTGTT..................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAtt.................................................................................................................................................................................................. 28 tt 2.00 136.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TATTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACT.............................................................................................................................................................................................................. 30 2 2.00 2.00 - - 0.50 - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAG................................................................................................................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TAGGTGCTTTTATATTCAGCTCAAC............................................................................................................................................................................................................................... 25 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCA......................................................................................................................................................................................................... 21 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGC.......................................................................................................................................................................................................... 28 2 1.50 1.50 - 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTG............................................................................................................................................................................................................ 29 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGC.......................................................................................................................................................................................................... 27 2 1.50 1.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................GCAACAGAAGATGAAGAT................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................AGATGAAGATAAAAATGAGTACAAGCCAGC............................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCAtc....................................................................................................................................................................................................... 32 tc 1.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................AAACTGTTAAGAGCAACAGA............................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.........................................................................................................................................CAGAAGATGAAGATAAAAATGAGTACAAGCC.................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGtt.................................................................................................................. 30 tt 1.00 6.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAt............................................................................................... 30 t 1.00 5.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TTGAAAGGCTCCATAGAAGCGACATt................................................................................................................................... 26 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACT............................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................AAGATAAAAATGAGTACAAGCCAGCTA............................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAA.................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAtt................................................................................................................................................................................................... 27 tt 1.00 21.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAt..................................................................................................... 29 t 1.00 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TCCATAGAAGCGACATACTAAACTGTTA........................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CAACAGAAGATGAAGATAAAAATGAGT......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CGACATACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAA............................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCAACA............................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGa...................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAa................................................................................................................................................................................................ 29 a 1.00 40.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAt................................................................................................ 29 t 1.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCA......................................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CAGCTCTTGGGACCTGGGGAACTGAa............................... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAcgt.................................................................................................... 28 cgt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CTGAACTCAGGACTTGGCACGaat.................................................................................................................................................................................................... 24 aat 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TGGCTCACCTTTATGCCCAGCTCTTGGGAC............................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GCGGCTTGAAAGGCTCCATAGAAGCGACA..................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATaaaa..................................................................................................... 21 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCATt................................................................................................................................................................................. 29 t 1.00 28.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TAGATAGAGATAATCATCCCAAGTCCTG....................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTTAAGAGCAACAGAAGATGAA...................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAAAAATGAGTACAAGCCAGCTACCATGGt...................................................................... 30 t 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GAAGCGACATACTAAACTGTTAAGA..................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TATATTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGG................................................................................................................................................................................................................. 29 2 1.00 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAt............................................................................................... 27 t 1.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAAATt............................................................................................ 30 t 1.00 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ACAGAAGATGAAGATAAAAATGAGTACAAG.................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TAGATAGAGATAATCATCCCAAGTCCT........................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................GAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAG................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGA.................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TATGCCCAGCTCTTGGGACCTGGGGAAC................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................ACGTAAGTAGATAGAGATAATCATCCCA.............................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................AAAATGAGTACAAGCCAGCTACga.......................................................................... 24 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................ATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTA..................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TAGAGATAATCATCCCAAGTCCTGTTGTAG................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................AGCTCTTGGGACCTGGGGAACTGA................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGA................................................................................................................................................................................................................ 26 2 1.00 1.00 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................TGGCTCACCTTTATGCCCAGCTCTTGGGAt............................................ 30 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TACCATGGCTCACCTTTATGCCCAGCT.................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CACGTAAGTAGATAGAGATAATCATCCCAA............................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCATCt................................................................................................................................................................................ 30 t 1.00 143.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGATt.................................................................................................. 32 t 1.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................ACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGATA............................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAtaat............................................................................................. 29 taat 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGt........................................................................................................................................................................................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAAtt............................................................................................. 29 tt 1.00 11.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGAAGATAAAAATGAGTACAAGCCAGCTAC............................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACttaa.................................................................................................................................................................................................... 26 ttaa 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TCAGGACTTGGCACGTAAGTAGATAGAG.......................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTcg................................................................................................................................................................................................ 29 cg 1.00 281.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TGGGACCTGGGGAACTGAGGTGAGGAT....................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................ATGGCTCACCTTTATGCCCAGCTCTTGGGAC............................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TCAGGACTTGGCACGTAAGTAGATAG............................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GACTTGGCACGTAAGTAGATAGAGATA....................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TCATCCCAAGTCCTGTTGTAGCGGCT............................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCA......................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................ACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAA...................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCAt........................................................................................................................................................................................................ 31 t 1.00 7.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACaaat.................................................................................................................................................................................................... 26 aaat 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................AGCGGCTTGAAAGGCTCCATAGAAGCGA....................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GGACTTGGCACGTAAGTAGATAGAGATA....................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................CTACCATGGCTCACCTTTATGCCCAGCT.................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GAAGATGAAGATAAAAATGAGTACAAGCCA................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CGACATACTAAACTGTTAAGA..................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGaaa.................................................................................................................................................................................................... 25 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTTGTAGCGGCTTGAAAGGCTCCATAGA............................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAATCATCCCAAGTCCTGTTGTAGCGGCTTt.......................................................................................................................................................... 31 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................ACATACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAG........................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................CCATAGAAGCGACATACTAAACTGTTA........................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGAAGATAAAAATGAGTACAAGCCAGCTACC........................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCAtt....................................................................................................................................................................................................... 29 tt 1.00 70.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................GAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCAA................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................CTCTTGGGACCTGGGGAACTGA................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCAA................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTgtt............................................................................................................................................................................................... 28 gtt 1.00 47.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATaatc................................................................................................................................................................................. 29 aatc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGtt.............................................................................................................................................................................................. 31 tt 1.00 6.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTA..................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACG....................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................TAGCGGCTTGAAAGGCTCCATAGAAGt......................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CGACATACTAAACTGTTAAGAGCAACAG.............................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................GCGGCTTGAAAGGCTCCATAGAAGCGAC...................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TAGATAGAGATAATCATCCCAAGTCCTGTT..................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTca.................................................................................................................................................................................................... 26 ca 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCAAa................................................................................................................ 32 a 1.00 30.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGAT.............................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGA.................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GAAGATGAAGATAAAAATGAGTACAAGC................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................CTTGGCACGTAAGTAGATAGAGATAAT..................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTtt.................................................................................................................................................................................................... 29 tt 1.00 6.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GAAGATGAAGATAAAAATGAGTACAAGCCt................................................................................. 30 t 1.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCATCCtt.............................................................................................................................................................................. 32 tt 1.00 54.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGcag..................................................................................................... 29 cag 1.00 10.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAATCATCCCAAGTCCTGTTGTAGCG............................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGt.................................................................................................... 28 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAATCATCCCAAGTCCTGTTGTAGCGG.............................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................AGCGGCTTGAAAGGCTCCATAGAAGCGAC...................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACATTCTGAACTCAGGACTTGGCAC........................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................ATACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAG..................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGAa.............................................................................................................................................................................................. 27 a 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGt.......................................................................................................................................................................................................... 32 t 1.00 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAt................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCAa........................................................................................................................................................................................................ 31 a 1.00 7.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGATAGA........................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAG................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CCAGCTCTTGGGACCTGGGGAAaa.................................. 24 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCAC........................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................AAACTGTTAAGAGCAACAGAAGAT......................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGtt...................................................................................................... 31 tt 1.00 60.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGa.......................................................................................................................................................................................................... 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................AGGACTTGGCACGTAAGTAGATAGAGA......................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGAAAGGCTCCATAGAAGCGACATACT................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................ATAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCAt................................................................................................................. 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGTTGTAGCGGCTTGAAAGGCTCCATt.............................................................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TCTTGGGACCTGGGGAACTGAGGTGA........................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGC.......................................................................................................................................................................................................... 30 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................ACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGAT.............................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGat................................................................................................................................................................................................. 26 at 1.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TCATCCCAAGTCCTGTTGTAGCGGCTT........................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................GCGACATACTAAACTGTTAAGAGCAACA............................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTttt................................................................................................................................................................................................... 27 ttt 1.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCAcc................................................................................................................................................................................. 29 cc 1.00 26.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TAGATAGAGATAATCATCCCAAGTCC......................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAAATGc........................................................................................... 31 c 1.00 12.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAt.................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................ATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGaatt................................................................................................................................................................................................... 28 aatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CTGTTAAGAGCAACAGAAGATG........................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TCCCAAGTCCTGTTGTAGCGGCTTGAAAGGC.................................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCATCCCt.............................................................................................................................................................................. 32 t 1.00 48.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CACGTAAGTAGATAGAGATAATCATCCCA.............................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................CGGCTTGAAAGGCTCCATAGAAGCGACAT.................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................ATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAA.................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAttcc................................................................................................................................................................................................. 29 ttcc 1.00 21.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TTGAAAGGCTCCATAGAAGCGACATACTAA............................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAtagc................................................................................................................... 29 tagc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAtc.................................................................................................................................................................................................. 28 tc 1.00 136.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAG................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................GAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAa................................................................................................................................................................................................ 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGaat................................................................................................................. 31 aat 1.00 6.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................CACGTAAGTAGATAGAGATAATCATCCCAtt............................................................................................................................................................................ 31 tt 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................CAGAAGATGAAGATAAAAATGAGTACAA..................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGAAGATAAAAATGAGTACAAGCCAGCTA............................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................ATACTAAACTGTTAAGAGCAACA............................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGAT......................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................ACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATG........................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................AAGATGAAGATAAAAATGAGTACAAGCC.................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................ATAATCATCCCAAGTCCTGTTGTAGCGGC............................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGTAGATAGAGATAATCATCCCAAGTCCT........................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................CTCTTGGGACCTGGGGAACTGAGGaa............................ 26 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGA....................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAAt.............................................................................................. 28 t 1.00 11.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TAGAGATAATCATCCCAAGTCCTGTTGT................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCAta....................................................................................................................................................................................................... 32 ta 1.00 7.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCt.................................................................................................................. 30 t 1.00 55.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGAGTACAAGCCAGCTACCATGGCgcac.................................................................. 28 gcac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TTGAAAGGCTCCATAGAAGCGACATACTAAt.............................................................................................................................. 31 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAAAAATGAGTACAAGCCAGCTACCATGGCT..................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAAGTAGATAGAGATAATCATCCCAAGTCC......................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGC................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAG..................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................CAGGACTTGGCACGaat.................................................................................................................................................................................................... 17 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................ACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGATAGA........................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGt..................................................................................................................... 27 t 1.00 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAG................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................ATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAG................................................................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAttt.............................................................................................................................................................................................. 31 ttt 1.00 40.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................ACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGA.......................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................GAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGt............................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................ATGAGTACAAGCCAGCTACCATG........................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TTGAAAGGCTCCATAGAAGCGACAT.................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TTGAAAGGCTCCATAGAAGCGACATACT................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGat..................................................................................................................................................................................................... 28 at 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TCAGGACTTGGCACGTAAGTAGATA............................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGa...................................................................................................................................................................................................... 28 a 1.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCA.................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGATA............................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACt....................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 6.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCATac................................................................................................................................................................................ 30 ac 1.00 28.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCAAt................................................................................................................ 32 t 1.00 30.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................TTGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCA................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................CGTAAGTAGATAGAGATAATCATCCC............................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAAATGA........................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTaa........................................................................................................................................................................................................... 31 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GGACTTGGCACGTAAGTAGATAGAGAT........................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAa..................................................................................................... 32 a 1.00 11.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAA............................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................CAGGACTTGGCACGTAAGTAGATA............................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................GAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGA............................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCt................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 9.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAttt.................................................................................................................................................................................................. 28 ttt 1.00 21.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTA..................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGt.......................................................................................................... 27 t 1.00 27.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAATCATCCCAAGTCCTGTTGTAGCGGCTT........................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAAAAATGAGTACAAGCCAGCTACCA.......................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCA.................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCAtt................................................................................................................ 32 tt 1.00 46.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TATATTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGA................................................................................................................................................................................................................ 30 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TTGAAAGGCTCCATAGAAGCGACA..................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGAGTACAAGCCAGCTACCATGGCTCACC................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATa........................................................................................................ 29 a 1.00 44.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................GATGAAGATAAAAATGAGTACAAGCCAG................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGAGTACAAGCCAGCTACCATGGCTCA................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGC................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................GTCCTGTTGTAGCGGCTT........................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAatag................................................................................................................................................................................................ 27 atag 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AACTCAGGACTTGGCACGTAAG................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AAGTAGATAGAGATAATCATCCCAAG............................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................AACAGAAGATGAAGATAAAAATGAGTACAAGCC.................................................................................. 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TAAAAATGAGTACAAGCCAGCTACCATG........................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TAAGAGCAACAGAAGATGAAGATA.................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TATATTCAGCTCAACATTCTGAACTCcgg................................................................................................................................................................................................................. 29 cgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGAAAGGCTCCATAGAAGCGACATAC.................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTAGGTGCTTTTATATTCAGCTCAACA.............................................................................................................................................................................................................................. 27 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCAC........................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TTGAAAGGCTCCATAGAAGCGACATA................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGA............................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAG..................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................AGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAAATG............................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TGAACTCAGGACTTGGCACGTAAata................................................................................................................................................................................................. 26 ata 1.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AAGTAGATAGAGATAATCATCCCAAGT........................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCAt........................................................................................................................................................................................................ 28 t 1.00 70.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAt................................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AACATTCTGAACTCAGGACTTGGt.......................................................................................................................................................................................................... 24 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTA..................................................................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................TGTAGCGGCTTGAAAGGCTCCATAG............................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGa.................................................................................................................................................................................................. 27 a 1.00 119.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGc....................................................................................................... 30 c 1.00 60.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GTGAGGATTGAGAGTTTGAAGCTAATC.... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGg.................................................................................................................................................................................................. 27 g 1.00 119.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGt............................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 6.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................GGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCATCCC............................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAttt.............................................................................................................................................................................................. 32 ttt 1.00 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAt................................................................................................. 28 t 1.00 9.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................ATTCTGAACTCAGGACTTGGC.......................................................................................................................................................................................................... 21 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - -
.................TCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGttt........................................................................................................................................................................................................ 33 ttt 0.50 8.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TAGGTGCTTTTATATTCAGCTCAACATTCT.......................................................................................................................................................................................................................... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TATATTCAGCTCAACATTCTGAACTCA................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TCTGAACTCAGGACTTGGCA......................................................................................................................................................................................................... 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGCTCAACATTCTGAA....................................................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGA................................................................................................................................................................................................................ 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGt........................................................................................................................................................................................................... 30 t 0.50 1.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TTAGGTGCTTTTATATTCAGCTCAAC............................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGG........................................................................................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TATATTCAGCTCAACATTCTGAACTCAtgat............................................................................................................................................................................................................... 31 tgat 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TATTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTG............................................................................................................................................................................................................ 32 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TATATTCAGCTCAACATTCTGAACTCAG.................................................................................................................................................................................................................. 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGa.......................................................................................................................................................................................................... 31 a 0.50 8.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TATTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGG................................................................................................................................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACT.............................................................................................................................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GCTTTTATATTCAGCTCAACATT............................................................................................................................................................................................................................ 23 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGG........................................................................................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................ACTAAACTGTTAAGAGCA.................................................................................................................. 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............ATATTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGA................................................................................................................................................................................................................ 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGttt........................................................................................................................................................................................................ 32 ttt 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................ATTCTGAACTCAGGACTTGGCA......................................................................................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................TTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGG........................................................................................................................................................................................................... 31 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TTCTGAACTCAGGACTTGGC.......................................................................................................................................................................................................... 20 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................ATTCTGAACTCAGGACTTGG........................................................................................................................................................................................................... 20 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................ACTAAACTGTTAAGAGC................................................................................................................... 17 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTTAGGTGCTTTTATATTCAGCTCAACATTCTGAACTCAGGACTTGGCACGTAAGTAGATAGAGATAATCATCCCAAGTCCTGTTGTAGCGGCTTGAAAGGCTCCATAGAAGCGACATACTAAACTGTTAAGAGCAACAGAAGATGAAGATAAAAATGAGTACAAGCCAGCTACCATGGCTCACCTTTATGCCCAGCTCTTGGGACCTGGGGAACTGAGGTGAGGATTGAGAGTTTGAAGCTAATCTGGG
...................................................................................................................(((.((...(((((......))))).)))))............(((........)))..............................................................................
................................................................................................................113...........................................................175.........................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
..............TATTCAGCTCAACATTCTGAACTCA................................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -