chr2:85860838 85861087 +
(10)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(7)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(35)
TESTES

Sense strand
CTCTAAAGTTCCCTCTTCTCAGAAGGTGGCACCACCCTGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGCTCTAAGCTCCAGTGAGGGAGGCATCCGCCCACTTGGGGCTTCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAATCTAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGACTAGAAAGTCCCAACAATCTGACCAAGGTAATAAGAGTCAGACAAGAAAAAGAGTTAAAGAAACATGAGGCTGACAAAGAC
..............................................................................................(((((..(((((........(((((....((.......))......))))))))))..))))).............................................................................................
..............................................................................................95..............................................................159.........................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGtttc........................................................................................................................................................................................... 26 tttc 17.00 0.00 1.00 4.00 4.00 - - 3.00 1.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTa............................................................................................................................ 27 a 15.00 0.00 1.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - 2.00 3.00 5.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGttt............................................................................................................................................................................................ 25 ttt 10.00 0.00 - 3.00 5.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTa............................................................................................... 25 a 7.00 0.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGACa............................................................................... 27 a 7.00 0.00 1.00 2.00 - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGAATCTAACTGCCAGGCTCTGATGGG................................................................................................... 27 3 6.33 6.33 0.67 0.67 - - 0.33 0.33 1.67 - - - 0.33 - 0.33 1.00 - - - - 0.67 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTa............................................................................................................................ 26 a 6.00 0.00 - - - - - - 3.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGgtcc........................................................................................................................................................................................... 26 gtcc 5.00 0.00 - 3.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGa.............................................................................................................................................................................................. 23 a 5.00 0.00 - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGAa................................................................................ 26 a 4.00 0.00 - 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GCCAGGCTCTGATGGGGaag............................................................................................... 20 aag 4.00 0.00 - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGAATCTAACTGCCAGGCTCTGATGG.................................................................................................... 26 3 3.67 3.67 - 0.33 - - - 0.33 0.33 - 1.67 - 0.33 - - - 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TAAAGAAACATGAGGCTGACAAAGAaaga 29 aaga 3.00 0.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGTCCAAGGTAAGGAGCACCTttga........................................................................................................................... 25 ttga 3.00 0.00 - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGaaa........................................................................................................................... 27 aaa 3.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGCTCTA.......................................................................................................................................................................................... 27 2 3.00 3.00 1.00 - 0.50 - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGaa............................................................................................................................ 26 aa 3.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAga......................................................................................................................... 27 ga 3.00 0.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGAATCTAACTGCCAGGCTCTGATGGGG.................................................................................................. 28 3 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.67 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TCCAGTGAGGGAGGCATCCGCCCACTTt........................................................................................................................................................... 28 t 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAga......................................................................................................................... 29 ga 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGc................................................................................................ 24 c 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGAt................................................................................ 26 t 2.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGt........................................................................................................................... 25 t 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGtttt........................................................................................................................................................................................... 26 tttt 2.00 0.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAACTGCCAGGCTCTGATGGGGtct............................................................................................... 25 tct 2.00 0.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTCTCag........................................................................................... 29 ag 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTcca............................................................................................................................ 27 cca 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAga......................................................................................................................... 25 ga 2.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTaa........................................................................................................................... 28 aa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGAa................................................................................ 23 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GAAGGTGGCACCACCCTGAGTTGCTGa.......................................................................................................................................................................................................... 27 a 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGtta............................................................................................................................................................................................ 25 tta 2.00 0.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGaat........................................................................................................................... 27 aat 2.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGAtt............................................................................... 24 tt 2.00 0.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGgtc............................................................................................................................................................................................ 25 gtc 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGttgc........................................................................................................................................................................................... 26 ttgc 2.00 0.00 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAgcc........................................................................................................................ 27 gcc 2.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TGTGAATCTAACTGCCAGGCTCTGATG..................................................................................................... 27 3 2.00 2.00 - 0.33 - - - 0.33 - - - - 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - -
............................................................................................................................TGAATCTAACTGCCAGGCTCTGATGGGGG................................................................................................. 29 3 1.67 1.67 - - - - - - - - 1.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TGTGAATCTAACTGCCAGGCTCTGATGG.................................................................................................... 28 3 1.67 1.67 - - - - - - - - - - 1.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................GTAAGGAGCACCTGTGAATCTAACTGC................................................................................................................. 27 3 1.33 1.33 - 0.33 - - - 0.67 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AGGAGCACCTGTGAATCTAACTGCCAGa............................................................................................................. 28 a 1.33 0.33 - - - - - - - - 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TAAGAGTCAGACAAGAAAAAGAGTa......................... 25 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGttca........................................................................................................................................................................................... 26 ttca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TAAGAGTCAGACAAGAAAAAGAGTTAAAGAAtt................. 33 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TAAGAGTCAGACAAGAAAAAGAGaa......................... 25 aa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTCTCaaa.......................................................................................... 30 aaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AAAAGAGTTAAAGAAACATGAGGCTGAaa..... 29 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCcc................................................................................................................................. 21 cc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TCCAGTGAGGGAGGCATCCGCCCACcac........................................................................................................................................................... 28 cac 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGccta.............................................................................. 28 ccta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGc........................................................................................................................... 25 c 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTCTCaaaa......................................................................................... 31 aaaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGt........................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTCTaa............................................................................................ 28 aa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................AAGAGTTAAAGAAACATGAGGCTacaa..... 27 acaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................CCAAGGTAATAAGAGTCAGACAAGAAAAAGt............................ 31 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................GACCAAGGTAATAAGAGTCAGACAAta.................................. 27 ta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................AGTGAGGGAGGCATCCGCCCACTTt........................................................................................................................................................... 25 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TCTAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTCTCc............................................................................................ 30 c 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................CTGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGttt............................................................................................................................................................................................ 26 ttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CTAACTGCCAGGCTCTGATGGGGccc............................................................................................... 26 ccc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTtgga................................................................................. 25 tgga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGGGGCTTCTGTCCAAGGTAAGGAGta.................................................................................................................................. 28 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CCTGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGttt............................................................................................................................................................................................ 27 ttt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTtttc............................................................................................................................................................................................ 25 tttc 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGACTAGc............................................................................ 27 c 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TCCAGTGAGGGAGGCATCCGCCCACTTa........................................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGc........................................................................................................................... 28 c 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGCTCT........................................................................................................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGa................................................................................................ 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGGGCTTCTGTCCAAGGTAAGGgg.................................................................................................................................... 25 gg 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TCCAGTGAGGGAGGCATCCGCCtt............................................................................................................................................................... 24 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................AAGAAACATGAGGCTGACAAAaacc 25 aacc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TCTAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGgcc.............................................................................................. 28 gcc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTCTCt............................................................................................ 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...................................................................................................................................AACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTtt.............................................................................................. 25 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
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...TAAAGTTCCCTCTTCTCAGAAGGTGtca........................................................................................................................................................................................................................... 28 tca 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CTAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTgt.............................................................................................. 27 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................ACAATCTGACCAAGGTAAcagt.............................................. 22 cagt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTct................................................................................... 23 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTt............................................................................................... 25 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGata................................................................................ 26 ata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
................................................................................................................................................................................................................................TAAAGAAACATGAGGCTGACAAAGAa 26 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCgtct.................................................................................... 22 gtct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TAAGAGTCAGACAAGAAAAAGAGTTAAAGt.................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TCTGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGt................................................................................... 25 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTttcc............................................................................................................................................................................................ 25 ttcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTaa........................................................................................................................... 27 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGCTCTAA......................................................................................................................................................................................... 28 2 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGtgtc........................................................................................................................ 27 tgtc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GTCTCGTCTCTGTGGGACTAGcc........................................................................... 23 cc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGg................................................................................. 25 g 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGcc................................................................................ 26 cc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAgcc........................................................................................................................ 30 gcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................CAGGCTCTGATGGGGGTCTCGTCTCTGaa.................................................................................... 29 aa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGACTc.............................................................................. 28 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................GAAAGTCCCAACAATCTGACCAcggt.................................................... 26 cggt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGgtc.................................................................................................................................................................................................. 19 gtc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TAAGAGTCAGACAAGAAAAAGAGTTAAAGAt................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAATC........................................................................................................................ 28 3 1.00 1.00 - 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGt................................................................................... 23 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................AAGGTAATAAGAGTCAGACAAGAAAcaga............................ 29 caga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TCTAAAGTTCCCTCTTCTCAGAAGGTGcc............................................................................................................................................................................................................................ 29 cc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAtt......................................................................................................................... 30 tt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAACTGCCAGGCTCTGATa..................................................................................................... 19 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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...TAAAGTTCCCTCTTCTCAGAAGGTtgc............................................................................................................................................................................................................................ 27 tgc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TCTGATGGGGGTCTCGTCTCTGTc.................................................................................... 24 c 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TAAAGTTCCCTCTTCTCAGAAGGTGc............................................................................................................................................................................................................................. 26 c 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................ACCCTGAGTTGCTGGCAGTGAGcctg............................................................................................................................................................................................... 26 cctg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GGCTCTGATGGGGGTCTCt............................................................................................ 19 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TAAGGAGCACCTGTGAATCTAACTGaca............................................................................................................... 28 aca 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TAAGAGTCAGACAAGAAAAAGAGTTca....................... 27 ca 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAtg......................................................................................................................... 29 tg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGccta.............................................................................. 25 ccta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TAAAGTTCCCTCTTCTCAGAAGGTGGt............................................................................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGac............................................................................................... 25 ac 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TCTAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGcc............................................................................................... 27 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...TAAAGTTCCCTCTTCTCAGAAGGTGca............................................................................................................................................................................................................................ 27 ca 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................AGTGAGGGAGGCATCCGCCCACTTGGGt........................................................................................................................................................ 28 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTc............................................................................................................................ 24 c 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGgga........................................................................................................................... 25 gga 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGtact............................................................................... 27 tact 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGa..................................................................................... 21 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TAAGGAGCACCTGTGAATCTAACTGC................................................................................................................. 26 3 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TAAGAGTCAGACAAGAAAAAGAGTTcaa...................... 28 caa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTaaa.......................................................................................................................... 29 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTctg............................................................................................................................ 26 ctg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGacat............................................................................... 27 acat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGt........................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTt............................................................................................................................ 26 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................TTGGGGCTTCTGTCCAAGGTAAGGg..................................................................................................................................... 25 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCcgt............................................................................................................................. 25 cgt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................AGAGTTAAAGAAACATGAGGCTt........ 23 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CCTCTTCTCAGAAGGTGGCACCACCCTGAa................................................................................................................................................................................................................. 30 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGgc................................................................................ 26 gc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGgtct........................................................................................................................................................................................... 26 gtct 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CTGCCAGGCTCTGATGGGGGTCTCGTCTt........................................................................................ 29 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGAta............................................................................... 27 ta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TGAGGGAGGCATCCGCCCACTTGGGGta...................................................................................................................................................... 28 ta 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................ACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTCTCGTaa......................................................................................... 29 aa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGTCCAAGGTAAGGAGCACCTccga........................................................................................................................... 25 ccga 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TCTAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTat.............................................................................................. 28 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................CCCTGAGTTGCTGGCAGTGAGTCa................................................................................................................................................................................................ 24 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
..............................................................................................................GTAAGGAGCACCTGTGAATCTAACTGCC................................................................................................................ 28 3 1.00 1.00 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................GTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAgg......................................................................................................................... 26 gg 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTcagt......................................................................................................................... 27 cagt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................AACATGAGGCTGACAAAGACagt 23 agt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................TGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGtct............................................................................... 27 tct 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTtt........................................................................................................................... 27 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................TAAGAGTCAGACAAGAAAAAGAGTTAtt...................... 28 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAgtca....................................................................................................................... 27 gtca 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GCTCTGATGGGGGTCTCGTaa......................................................................................... 21 aa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAATAAGAGTCAGACAAGAAAAAGAGT.......................... 27 13 0.77 0.77 0.08 - 0.15 0.08 0.08 - - 0.08 - - - - - - 0.08 - - - - 0.15 - - - 0.08 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAATCTAA..................................................................................................................... 29 3 0.67 0.67 - - 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAATCTA...................................................................................................................... 28 3 0.67 0.67 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................TAAGGAGCACCTGTGAATCTAACTGCC................................................................................................................ 27 3 0.67 0.67 - 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGAGTCTGCTCTAAGCTCCAGTGAGGG............................................................................................................................................................................ 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGCTCTAAa........................................................................................................................................................................................ 29 a 0.50 1.00 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TGCTCTAAGCTCCAGTGAGGGAGG......................................................................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................AAGGTAATAAGAGTCAGACAAGAAAAAGA............................ 29 13 0.46 0.46 - 0.08 - - - 0.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................TGTGAATCTAACTGCCAGGCTCTGATGGG................................................................................................... 29 3 0.33 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGAATCTAACTGCCAGGCTCTGATGGt................................................................................................... 27 t 0.33 3.67 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAATCT....................................................................................................................... 31 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGAATCTAACTGCCAGGCTCTGATG..................................................................................................... 25 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAATCT....................................................................................................................... 27 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................ACCTGTGAATCTAACTGCCAGGCTCTGA....................................................................................................... 28 3 0.33 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................AAGGTAAGGAGCACCTGTGAA.......................................................................................................................... 21 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................TTCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAA.......................................................................................................................... 29 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33
............................................................................................................................TGAATCTAACTGCCAGGCTCTGATGGGa.................................................................................................. 28 a 0.33 6.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................TCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAAT......................................................................................................................... 29 3 0.33 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................TCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAATCTAAC.................................................................................................................... 30 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AGGTAAGGAGCACCTGTGAATCTAACTG.................................................................................................................. 28 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................AGGAGCACCTGTGAATCTAACTGCCAG.............................................................................................................. 27 3 0.33 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................CACCTGTGAATCTAACTGC................................................................................................................. 19 3 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAAT......................................................................................................................... 27 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................GAGCACCTGTGAATCTAACTGCCAGGC............................................................................................................ 27 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CAAGGTAATAAGAGTCAGACAAGAAAAAG............................. 29 13 0.15 0.15 - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAATAAGAGTCAGACAAGAAAAAGAGTT......................... 28 13 0.15 0.15 - - 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................GACCAAGGTAATAAGAGTCAGACAAGA.................................. 27 14 0.14 0.14 - - - 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CAAGGTAATAAGAGTCAGACAAGAAAA............................... 27 14 0.14 0.14 0.07 - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TAAGCTCCAGTGAGGGAGGCATCCGCCCA............................................................................................................................................................... 29 15 0.13 0.13 - - 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CAAGGTAATAAGAGTCAGACAAGAA................................. 25 15 0.13 0.13 0.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................GAATCTAACTGCCAGGCTCTGATGGGGG................................................................................................. 28 16 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................AGAAAGTCCCAACAATCTGACCAAGGTAATAA............................................... 32 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................AAGTCCCAACAATCTGACCAAGGTAAT................................................. 27 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................GGTAATAAGAGTCAGACAAGAAAAAGA............................ 27 13 0.08 0.08 - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAATAAGAGTCAGACAAGAAAAAGA............................ 25 13 0.08 0.08 - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................GTAATAAGAGTCAGACAAGAAAAAG............................. 25 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - -
.....................................................................................................................................................................................................TAATAAGAGTCAGACAAGAAAAAGAG........................... 26 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................AGGTAATAAGAGTCAGACAAGAAAAAGA............................ 28 13 0.08 0.08 - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAATAAGAGTCAGACAAGAAAAAGAGa.......................... 27 a 0.08 0.08 - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................CAAGGTAATAAGAGTCAGACAAGAAAAAGA............................ 30 13 0.08 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................GACCAAGGTAATAAGAGTCAGACAAGAA................................. 28 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGACCAAGGTAATAAGAGTCAGACAAGAA................................. 29 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCCCAACAATCTGACCAAGGTAATAAGAGT........................................... 30 14 0.07 0.07 - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGACCAAGGTAATAAGAGTCAGACAAGA.................................. 28 14 0.07 0.07 - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................GGTAATAAGAGTCAGACAAGAA................................. 22 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAATAAGAGTCAGACAAGA.................................. 19 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TAAGCTCCAGTGAGGGAGGCATCCGCCC................................................................................................................................................................ 28 15 0.07 0.07 - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TAAGCTCCAGTGAGGGAGGCATCCGCC................................................................................................................................................................. 27 15 0.07 0.07 - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................CCAAGGTAATAAGAGTCAGACAAGAA................................. 26 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................GTCCCAACAATCTGACCAAGGTAATAAGA............................................. 29 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TAAGCTCCAGTGAGGGAGGCATCCGC.................................................................................................................................................................. 26 15 0.07 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAATAAGAGTCAGACAAGAA................................. 20 15 0.07 0.07 - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................TAAGCTCCAGTGAGGGAGGCATCCGCCCt............................................................................................................................................................... 29 t 0.07 0.07 - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................AATCTAACTGCCAGGCTCTGATG..................................................................................................... 23 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................AATCTAACTGCCAGGCTCTGATGGGG.................................................................................................. 26 16 0.06 0.06 - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................AATCTAACTGCCAGGCTCTGATGGGGG................................................................................................. 27 16 0.06 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CAATCTGACCAAGGTAATAAGA............................................. 22 18 0.06 0.06 - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTCTAAAGTTCCCTCTTCTCAGAAGGTGGCACCACCCTGAGTTGCTGGCAGTGAGTCTGCTCTAAGCTCCAGTGAGGGAGGCATCCGCCCACTTGGGGCTTCTGTCCAAGGTAAGGAGCACCTGTGAATCTAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGACTAGAAAGTCCCAACAATCTGACCAAGGTAATAAGAGTCAGACAAGAAAAAGAGTTAAAGAAACATGAGGCTGACAAAGAC
..............................................................................................(((((..(((((........(((((....((.......))......))))))))))..))))).............................................................................................
..............................................................................................95..............................................................159.........................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
................................................................................ATCCGCCCACTTGGGGCTTCTGTCCAAGGTaa.......................................................................................................................................... 32 aa 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GAGTTAAAGAAACATGAGGCTGACAAAGAa. 30 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAGGTGGCACCACCCTGAGTTGCTGGCAa........................................................................................................................................................................................................ 29 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................TGGGGCTTCTGTCCAAGGTAAGGAcgt..................................................................................................................................... 27 cgt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CATCCGCCCACTTGGGGCTTCTGTCCAAGGTa.......................................................................................................................................... 32 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................AGAAGGTGGCACCACCCTGAGTTGCTGaaaa........................................................................................................................................................................................................... 31 aaaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TCCGCCCACTTGGGGCTTCTGTCCAAGGTAAa........................................................................................................................................ 32 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................CCCACTTGGGGCTTCTGTCCAAGGTAAtgt........................................................................................................................................ 30 tgt 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................CGCCCACTTGGGGCTTCTGTCCAAGGTAAca........................................................................................................................................ 31 ca 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TCTAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTCTCGTCca.......................................................................................... 34 ca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................CGCCCACTTGGGGCTTCTGTCCAAGGTAAct........................................................................................................................................ 31 ct 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TCCGCCCACTTGGGGCTTCTGTCCAAGGTAAag........................................................................................................................................ 33 ag 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................GACTAGAAAGTCCCAACAATCTGACCAAttt....................................................... 31 ttt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAGGTGGCACCACCCTGAGTTGCTGGCAGTa...................................................................................................................................................................................................... 31 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCTAACTGCCAGGCTCTGAa....................................................................................................... 20 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................CCCACTTGGGGCTTCTGTCCAAGGTAAagga........................................................................................................................................ 31 agga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................CCCACTTGGGGCTTCTGTCCAAGGTtggg.......................................................................................................................................... 29 tggg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AGGTGGCACCACCCTGAGTTGCTGcc........................................................................................................................................................................................................... 26 cc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................AAGAAACATGAGGCTGACAAAGACa 25 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................CTGATGGGGGTCTCGTCTCTGTGGGAtgt................................................................................. 29 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................GACTAGAAAGTCCCAACAATCTGAaa........................................................... 26 aa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................CTCGTCTCTGTGGGACTAGAAAGTCCCAAt................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TCTAACTGCCAGGCTCTGATGGGGGTCga............................................................................................... 29 ga 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................GGGGCTTCTGTCCAAGGTAAGGAcagt..................................................................................................................................... 27 cagt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGGTGGCACCACCCTGAGTTGCTGcctg........................................................................................................................................................................................................... 28 cctg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGGTGGCACCACCCTGAGTTGCTcctg............................................................................................................................................................................................................ 27 cctg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................AAGGTGGCACCACCCTGAGTTGCTGaa........................................................................................................................................................................................................... 27 aa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................CCCACTTGGGGCTTCTGTCCAAGGTAAtggt........................................................................................................................................ 31 tggt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................GGCAGTGAGTCTGCTCTAAGCTCCAGTGA............................................................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................CAGTGAGTCTGCTCTAAGCTCCAGTGA............................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................CAGTGAGTCTGCTCTAAGCTCCAGT................................................................................................................................................................................. 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
............................................CTGGCAGTGAGTCTGCTCTAAGCTCCA................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GCTGGCAGTGAGTCTGCTCTAAGCTCCA................................................................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCCCAACAATCTGACCAAGGTAATAA............................................... 26 15 0.13 0.13 - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................AGTCCCAACAATCTGACCAAGGTAATAA............................................... 28 12 0.08 0.08 - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................CAATCTGACCAAGGTAATAAGAGTCA......................................... 26 14 0.07 0.07 - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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................................................................................................................................................................................GTCCCAACAATCTGACCAAGGTAATA................................................ 26 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................TCCCAACAATCTGACCAAGGTAATA................................................ 25 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - -