(7)
OTHER.mut
(4)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(28)
TESTES

Sense strand
TCCTCATTCAGGAGGATCTCTGTGAGTTTGAGGATGGCCTGGTTTACAAAGTGAGTTCCAGACCAGCCAGGGCTACACAATGAACAGAGAATATGGTTGTGGTGTCAAACGTAGGAAACACTATGAAACTTGTTATTCTGAAAACAGAAGTTGTGGATTGTGGGGAAAAAATGGAAGTAGGCACATAGCAGCAAATTTTAAAAATAATTATAATTATGAAAAGAAGACTTAAGGTGACCAATGCCTAGTA
.......................................................................................................................................(((((....)))))(((((....((((...................))))..)))))..........................................................
......................................................................................................................119..............................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
...........................................................................................................................TGAAACTTGTTATTCTGAAAACAGAAGTTGTG............................................................................................... 32 1 16.00 16.00 6.00 3.00 5.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGAAACTTGTTATTCTGAAAACAGAAGTTGT................................................................................................ 31 1 14.00 14.00 2.00 3.00 5.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................AGGAAACACTATGAAACTTGTTATTCTGAA............................................................................................................ 30 1 5.00 5.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGAAACTTGTTATTCTGAAAACAGAAGTTG................................................................................................. 30 1 3.00 3.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TGAACAGAGAATATGGTTGTGGTGTC................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TATGAAACTTGTTATTCTGAAAACAGAAGT................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGtgta......................................................................................................................................................................................... 21 tgta 2.00 0.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGAAAACAGAAGTTGTGGATTGTGGG...................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGAAACTTGTTATTCTGAAAACAGAAG.................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GGGCTACACAATGAACAGAGAATATGGTTt....................................................................................................................................................... 30 t 2.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TATGAAACTTGTTATTCTGAAAACAGAAG.................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GGGCTACACAATGAACAGAGAATATGGTT........................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGACCAGCCcggg.................................................................................................................................................................................. 28 cggg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGGAAGTAGGCACATAGCAGCAAATT..................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TGGAAGTAGGCACATAGCAGCAAATTTTA.................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.....................................................................GGGCTACACAATGAACAGAGAATATGGTTtt...................................................................................................................................................... 31 tt 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGTTGTGGTGTCAAACGTAGGAAACACT................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGAAAAGAAGACTTAAGGTGACCAATGCC..... 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................AAAACAGAAGTTGTGGATTGTGGGGAA................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGtttc......................................................................................................................................................................................... 21 tttc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................AGGGCTACACAATGAACAGAGAATATGGTT........................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGAGTTTGAGGATGGCCTGGTTTACAAA........................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TACACAATGAACAGAGAATATGGTTGT...................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
............................TGAGGATGGCCTGGTTTACAAAGTGAGT.................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................TGAAAAGAAGACTTAAGGTGACCAATGCCTAt.. 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
...........................................................................................................................................................................TGGAAGTAGGCACATAGCAGCAAATTT.................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................CAGGGCTACACAATGAACAGAGAATATGGTT........................................................................................................................................................ 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGAAACTTGTTATTCTGAAAACAGAAGTTGTt............................................................................................... 32 t 1.00 14.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGAAACTTGTTATTCTGAAAACAGAAGTT.................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGAAACTTGTTATTCTGAAAACAGAAGTTGTGGA............................................................................................. 34 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...................................................TGAGTTCCAGACCAGCCAtatc................................................................................................................................................................................. 22 tatc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TGGTTGTGGTGTCAAACGTAGGAAA.................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TAGCAGCAAATTTTAAAAATAATTATAATTA.................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................GGGAAAAAATGGAAGTAGGCACATAGC............................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGtgct......................................................................................................................................................................................... 21 tgct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TGTTATTCTGAAAACAGAAGTTGTGG.............................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGAAAACAGAAGTTGTGGATTGTG........................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AGGAGGATCTCTGTGAGTTTGAac......................................................................................................................................................................................................................... 24 ac 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................AGGGCTACACAATGAACAGAGAATATGGTTt....................................................................................................................................................... 31 t 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GTGAGTTTGAGGATGGCCTGGTT.............................................................................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................TCTCTGTGAGTTTGAGGATGGCCTG................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GAAAACAGAAGTTGTGGATTGTGGGGt.................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................AAAAATGGAAGTAGGCACATAGCAGCA......................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................AAAAATAATTATAATTATGAAAAGAAGACTTt................... 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......TTCAGGAGGATCTCTGTGAGTTTGAGGAT....................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TAATTATGAAAAGAAGACTTAAGGTGACCAA......... 31 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TGTGAGTTTGAGGATGGCCTGG................................................................................................................................................................................................................ 22 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TACAAAGTGAGTTCCAGACCAGCCAGGG.................................................................................................................................................................................. 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17

Antisense strand
TCCTCATTCAGGAGGATCTCTGTGAGTTTGAGGATGGCCTGGTTTACAAAGTGAGTTCCAGACCAGCCAGGGCTACACAATGAACAGAGAATATGGTTGTGGTGTCAAACGTAGGAAACACTATGAAACTTGTTATTCTGAAAACAGAAGTTGTGGATTGTGGGGAAAAAATGGAAGTAGGCACATAGCAGCAAATTTTAAAAATAATTATAATTATGAAAAGAAGACTTAAGGTGACCAATGCCTAGTA
.......................................................................................................................................(((((....)))))(((((....((((...................))))..)))))..........................................................
......................................................................................................................119..............................................................................200................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
................................GCCTGGTTTACAAAGTGAGTTCCAagaa.............................................................................................................................................................................................. 28 agaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TACAAAGTGAGTTCCAGACCgt.......................................................................................................................................................................................... 22 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
................................GGCCTGGTTTACAAAGTGAGggc................................................................................................................................................................................................... 23 ggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...................................CCTGGTTTACAAAGTGAgc.................................................................................................................................................................................................... 19 gc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -