| Gene: Tor1b | ID: uc008jdb.1_intron_1_0_chr2_30809529_f.5p | SPECIES: mm9 | 
![]()  | 
    
    ![]()  | 
  
| 
  (10)  OTHER.mut  | 
  
  
  (1)  OVARY  | 
  
  
  (8)  PIWI.ip  | 
  
  
  (3)  PIWI.mut  | 
  
  
  (39)  TESTES  | 
  
  
| TCCACCTGTTCGTCTCTACTTTGCACTTCCCTCATGAGCAGAAGATAAAGGTGTACCAGGCAAGAAAACCTACCGATTTTTGATCATATGCCTGGGGTACTTTACTCAGTAGCTCTGGCCTCTGCTTTTCTTTCTCTGCCTTGAAGTGCTCCATCTGGCCTCTGCTTTGCTTTCTGCTATTTATTTGACTGAGTTTTACTGTGTAGGTCTGGCAGGCCTGGAACTCACAGAGATCTACCTACCTCTGCCC ..........................................................................((((...))))....(((((((((((((((..(((.((....(((....)))...))....)))...))))))))))))...)))........................................................................................... .................................................................66...................................................................................................167.................................................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)  | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)  | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes)  | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)  | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)  | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ................TACTTTGCACTTCCCTCATGAGCAGAA............................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 13.00 | 13.00 | - | 5.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................TACCGATTTTTGATCATATGCCTGGGG......................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 7.00 | 7.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................TCATGAGCAGAAGATAAAGGTGTACC................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 7.00 | 7.00 | 5.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACAGAGATCTACCTACCTC..... | 27 | 3 | 6.33 | 6.33 | - | 1.67 | 1.33 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................TGAGCAGAAGATAAAGGTGTACCAGGac............................................................................................................................................................................................ | 28 | ac | 6.00 | 0.00 | 2.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................TGCACTTCCCTCATGAGCAGAAGATAA.......................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................TGAGCAGAAGATAAAGGTGTACCAGGtt............................................................................................................................................................................................ | 28 | tt | 6.00 | 0.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........TCGTCTCTACTTTGCACTTCCCTCATG...................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 5.00 | 5.00 | 3.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................TTTTTGATCATATGCCTGGGGTACT..................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................TACTGTGTAGGTCTGGCAGGCCTGGA............................ | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................TGGCAGGCCTGGAACTCACAGAGAa................ | 25 | a | 5.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................TACTTTGCACTTCCCTCATGAGCAGA................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................................................CTGTGTAGGTCTGGCAGGC................................. | 19 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................TGCCTTGAAGTGCTCCATCTGGCCTCT....................................................................................... | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........TTCGTCTCTACTTTGCACTTCCCTCA........................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................CTGGAACTCACAGAGATCTACCTACCTC..... | 28 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................TGAGTTTTACTGTGTAGGTCTGGCAG................................... | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................TTTGACTGAGTTTTACTGTGTAGGT.......................................... | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................TGAGCAGAAGATAAAGGTGTACCAGGCA............................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................TGAGCAGAAGATAAAGGTGTACCAGGaa............................................................................................................................................................................................ | 28 | aa | 3.00 | 0.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................GAAAACCTACCGATTTTTGATCATATG................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................TATTTGACTGAGTTTTACTGTGTAGG........................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................TACTTTGCACTTCCCTCATGAGCAGAAG.............................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................TTTATTTGACTGAGTTTTACTGTGTAG............................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................TCATGAGCAGAAGATAAAGGTGTACCAGG.............................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................TTTTTGATCATATGCCTGGGGTACTT.................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................TAAAGGTGTACCAGGCAAGAAAACCTAC................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........TCGTCTCTACTTTGCACTTCCCTCAT....................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................TTCCCTCATGAGCAGAAGATAAAGGTG..................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................TTGCACTTCCCTCATGAGCAGAAGATA........................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................TGTAGGTCTGGCAGGCCTGGAACTCACAGA................... | 30 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................CTGAGTTTTACTGTGTAGGTCTGGCAGGC................................. | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................TAGGTCTGGCAGGCCTGGAACTCACAGA................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................TTTTCTTTCTCTGCCTTGAAGTGCTCC.................................................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................TGGCAGGCCTGGAACTCACAGAGATCT.............. | 27 | 3 | 1.33 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................TGGCAGGCCTGGAACTCACAGAGATC............... | 26 | 5 | 1.20 | 1.20 | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | 0.80 | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................TATTTGACTGAGTTTTACTGTGTAGGT.......................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................CTTCCCTCATGAGCAGAAGATAAAGGTG..................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................TACTGTGTAGGTCTGGCAGGCCTGG............................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................TGTAGGTCTGGCAGGCCTGGAACTC........................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................CTGGAACTCACAGAGATCTACCTAta....... | 26 | ta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................TTTCTCTGCCTTGAAGTGCTCCATCTGt............................................................................................ | 28 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................TATTTATTTGACTGAGTTTTACTGTGTAG............................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................TTGACTGAGTTTTACTGTGTAG............................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................CTGGAACTCACAGAGATCTACCTgcat...... | 27 | gcat | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................TCTCTGCCTTGAAGTGCTCCATCTGGC........................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................GTAGGTCTGGCAGGCCTGGAACTCACAG.................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................GCAGAAGATAAAGGTGTACCAGGacc........................................................................................................................................................................................... | 26 | acc | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................TACTTTGCACTTCCCTCATGAGCAGAAGAT............................................................................................................................................................................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................TGCACTTCCCTCATGAGCAGAAGATAAAGG....................................................................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 
| ..................................TGAGCAGAAGATAAAGGTGTACCAGcca............................................................................................................................................................................................ | 28 | cca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................TGCACTTCCCTCATGAGCAGAAGATAAAGGT...................................................................................................................................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................TACTGTGTAGGTCTGGCAGGCCTaaga........................... | 27 | aaga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................TGCTTTGCTTTCTGCTATTTATTTGACT............................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................TGCACTTCCCTCATGAGCAGAAGATA........................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................TACTTTGCACTTCCCTCATGAGCAGAAGA............................................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................TGAGCAGAAGATAAAGGTGTACCAGGt............................................................................................................................................................................................. | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACAGAGATCTACCTACCTCT.... | 28 | 3 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | 0.33 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................TACTGTGTAGGTCTGGCAGGC................................. | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................TATTTATTTGACTGAGTTTTACTGTGTA............................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................TGAGCAGAAGATAAAGGTGTACCAGGtc............................................................................................................................................................................................ | 28 | tc | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................TACCAGGCAAGAAAACCTACCGATTTT.......................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................TGAAGTGCTCCATCTGGCCTCTGCTTa.................................................................................. | 27 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................TGATCATATGCCTGGGGTACTTTACTC............................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................TGCTTTTCTTTCTCTGCCTTGAAGTGCT.................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................TAAAGGTGTACCAGGCAAGAAAACCTccc................................................................................................................................................................................ | 29 | ccc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................TACCAGGCAAGAAAACataa................................................................................................................................................................................. | 20 | ataa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 
| ......................................CAGAAGATAAAGGTGTACCAGGacca.......................................................................................................................................................................................... | 26 | acca | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................................TTTACTGTGTAGGTCTGGC..................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................TGCACTTCCCTCATGAGCAGAAGAT............................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................CTCATGAGCAGAAGATAAAGGTGTACa................................................................................................................................................................................................. | 27 | a | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................TGCTTTCTGCTATTTATTTGACTGAGT........................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................CTGGAACTCACAGAGATCTACCTACCT...... | 27 | 4 | 1.00 | 1.00 | - | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................TGCACTTCCCTCATGAGCAGAAGATAAAGGTtt.................................................................................................................................................................................................... | 33 | tt | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 
| ...........................................GATAAAGGTGTACCAGGCAAGAAAACCTA.................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................CTCATGAGCAGAAGATAAA......................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................TACTCAGTAGCTCTGGCCTCTGC............................................................................................................................. | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................TGAGTTTTACTGTGTAGGTCTGGCA.................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................TTGAAGTGCTCCATCTGGCCTCTGC..................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................TTTGACTGAGTTTTACTGTGTA............................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................ATTTATTTGACTGAGTTTTACTGTGTAG............................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................TACTTTACTCAGTAGCTCTGGCCTCT............................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................CCCTCATGAGCAGAAGATAAAGGTGT.................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................TCCCTCATGAGCAGAAGATAAAGGTGT.................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................TGCTTTCTGCTATTTATTTGACTGAG......................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................CCCTCATGAGCAGAAGATAAAGGTGTACC................................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................TATTTGACTGAGTTTTACTGTGTAGtt.......................................... | 27 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................TTCCCTCATGAGCAGAAGATAAAGGT...................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................TTCTCTGCCTTGAAGTGCTCCATCTGGCCTC........................................................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................TACCGATTTTTGATCATATGCCTGGG.......................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................TTCTCTGCCTTGAAGTGCTCCATCTG............................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................TTTGATCATATGCCTGGGGTACTTTA.................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................................GTTTTACTGTGTAGGTCTGGCAGGCC................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........TCGTCTCTACTTTGCACTTCCCTCATGAGt................................................................................................................................................................................................................... | 30 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................TGAGTTTTACTGTGTAGGTCTGGCAGG.................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................TCATGAGCAGAAGATAAAGGTGTACCA................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................AAAACCTACCGATTTTTGATCATATGCC.............................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................GCTTTCTGCTATTTATTTGACTGAGTTTT..................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................TGAGCAGAAGATAAAGGTGTACCAGGact........................................................................................................................................................................................... | 29 | act | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................TAAAGGTGTACCAGGCAAGAAAACCTA.................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................TTCTCTGCCTTGAAGTGCTCCAT................................................................................................ | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................TTTGCACTTCCCTCATGAGCAGAAGA............................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................................TTACTGTGTAGGTCTGGCAGGCCTGGA............................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................AACCTACCGATTTTTGATCATATGCCT............................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................GCAGAAGATAAAGGTGTACCAGGCAAG.......................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................TGGCAGGCCTGGAACTCACAGAGATCTA............. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACAGAGATCTACCTACCTCa.... | 28 | a | 0.67 | 6.33 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACAGAGATCTACCTAC........ | 24 | 6 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACAGAGATCTACCTACCTCTGC.. | 30 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................TGGCAGGCCTGGAACTCACAGA................... | 22 | 10 | 0.30 | 0.30 | - | - | - | - | - | - | - | 0.30 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................CTGGAACTCACAGAGATCTACCTACC....... | 26 | 4 | 0.25 | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACAGAGATCTACCTACC....... | 25 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACAGAGATCTACCTACCTa..... | 27 | a | 0.20 | 0.20 | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................TGGAACTCACAGAGATCTACCTACCT...... | 26 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................TGGCAGGCCTGGAACTCACAGAGAT................ | 25 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | 
| ......................................................................TACCGATTTTTGA....................................................................................................................................................................... | 13 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | 
| TCCACCTGTTCGTCTCTACTTTGCACTTCCCTCATGAGCAGAAGATAAAGGTGTACCAGGCAAGAAAACCTACCGATTTTTGATCATATGCCTGGGGTACTTTACTCAGTAGCTCTGGCCTCTGCTTTTCTTTCTCTGCCTTGAAGTGCTCCATCTGGCCTCTGCTTTGCTTTCTGCTATTTATTTGACTGAGTTTTACTGTGTAGGTCTGGCAGGCCTGGAACTCACAGAGATCTACCTACCTCTGCCC ..........................................................................((((...))))....(((((((((((((((..(((.((....(((....)))...))....)))...))))))))))))...)))........................................................................................... .................................................................66...................................................................................................167.................................................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | mjTestesWT2() Testes Data. (testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)  | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)  | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes)  | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)  | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)  | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR363960(GSM822762) Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ......TGTTCGTCTCTACTTTGCACTTCCCTCA........................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....CCTGTTCGTCTCTACTTTGCACTTCCC........................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......GTTCGTCTCTACTTTGCACTTCCCTCA........................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........CGTCTCTACTTTGCACTTCCCTCATGA..................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...ACCTGTTCGTCTCTACTTTGCACTTCCC........................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................TAGGTCTGGCAGGCCTGGAACTCAat....................... | 26 | at | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................TTTCTTTCTCTGCCTTGAAGTGCTCCA................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................GCAGGCCTGGAACTCACtc...................... | 19 | tc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................GTCTGGCAGGCCTGGAACTCACAa..................... | 24 | a | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................GCTTTCTGCTATTTATTTGACTGAGTTTTA.................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............CTACTTTGCACTTCCCTCATGAGCAGAAGt.............................................................................................................................................................................................................. | 30 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................AAACCTACCGATTTTTGATCATATGCC.............................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................TGCTTTCTGCTATTTATTTGACTGAGTTTTA.................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................CCTCTGCTTTTCTTTCTCTGCCTTGAA......................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................CTGCTATTTATTTGACTGAGTTTTACTGTG............................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................GTCTGGCAGGCCTGGAACTCACAGAGAa................. | 28 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................CTTTCTGCTATTTATTTGACTGAGTTTTA.................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................CTACCGATTTTTGATCATATGCCTGGGGTA....................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........TTCGTCTCTACTTTGCACTTCCCTCA........................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................CCATCTGGCCTCTGCTTTGCTTTCTGCTAtt....................................................................... | 31 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................GCACTTCCCTCATGAGCAGAAGATAAA......................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................TGGCAGGCCTGGAACTCACAGAGATCTA............. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................CAGTAGCTCTGGCCTC................................................................................................................................ | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |