(8)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(33)
TESTES

Sense strand
AAGTCAGTTCTCTCCTTTTAGCCATTTGGGTCCCAGGGATTCAAGTCAAGTGGCCAGGCTTTGATGGCTAGTGCCTTTCCACTTGTGGGAAAGTGTCATCTGCTTTGTGGGGGCAGTATGCAGTTGGTAGCTTCCCGAGGCCCAGGCAGCACCCCCACTCCATCCTCTGGAACATCCTCTGAGCTGCCTCTCTCTTTGAGGTTGGTCCAGGACCAGCTCCAGAAGTGGATCCGAGGCAATGTGAGTGCGT
........................................................(((...((((((....((.((((((....)))))).)))))))).)))....(((((((((...(((..((....((((.((((....((.((........))))..)))).))))...)).))).)))))))))...........................................................
........................................................57.......................................................................................................................................194......................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
.........................................................................................................................................................................................................................TCCAGAAGTGGATCCGAGGCAATGTG....... 26 1 16.00 16.00 7.00 - 3.00 - 3.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
................................................................................................................................................................................................................................GTGGATCCGAGGCAATGTGAGTGCGT 26 1 12.00 12.00 2.00 - 4.00 1.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGATGGCTAGTGCCTTTCCACTTGTG................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - 3.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................CAGAAGTGGATCCGAGGCAATGTGAGT.... 27 1 5.00 5.00 - - 1.00 - - - 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TCCTCTGGAACATCCTCTGAGCTGCCTC............................................................ 28 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TGCAGTTGGTAGCTTCCCGAGGCCCAGGC....................................................................................................... 29 1 4.00 4.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
......................................................................................................................TGCAGTTGGTAGCTTCCCGAGGCCC........................................................................................................... 25 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TCTGGAACATCCTCTGAGCTGC............................................................... 22 1 3.00 3.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGAACATCCTCTGAGCTGCCTCTCTC........................................................ 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.........................TTGGGTCCCAGGGATTCAAGTCAAGTGGtt................................................................................................................................................................................................... 30 tt 3.00 0.00 - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TCCAGAAGTGGATCCGAGGCAATGT........ 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TCTCCTTTTAGCCATTTGGGTCCCAGG..................................................................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TGCAGTTGGTAGCTTCCCGAGGCCCA.......................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGGGAAAGTGTCATCTGCTTTGTGG............................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TCCTCTGGAACATCCTCTGAGCTGCC.............................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................TGCCTCTCTCTTTGAGGTTGGTCCAGGA...................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AAGTGGATCCGAGGCAATGTGAGTGC.. 26 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGTAGCTTCCCGAGGCCCAGGCAGC.................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.......................................................................................................................................................................TGGAACATCCTCTGAGCTGCCTCTCTCT....................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GGGATTCAAGTCAAGTGGCCAGGC............................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TCCTCTGGAACATCCTCTGAGCTGCCTCT........................................................... 29 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CATCCTCTGGAACATCCTCTGAGCTGC............................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TCTGGAACATCCTCTGAGCTGCCTCT........................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TGTGGGAAAGTGTCATCTGCTTTGTGG............................................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AAGTGGATCCGAGGCAATGTGAGTG... 25 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................AGTGGATCCGAGGCAATGTGAGTG... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTCAAGTCAAGTGGCCAGGCTTTGA.......................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCCAGGACCAGCTCCAGAAGTGGATC................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................TAGCCATTTGGGTCCCAGGGATTCAAGTC........................................................................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................GTGGATCCGAGGCAATGTGAGTGCG. 25 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................GCTCCAGAAGTGGATCCGAGGCAATGT........ 27 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTTTAGCCATTTGGGTCCCAGGGATT................................................................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TTGTGGGAAAGTGTCATCTGCTTTGT.............................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
...............TTTTAGCCATTTGGGTCCCAcca.................................................................................................................................................................................................................... 23 cca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................CTCTGGAACATCCTCTGAGCTGCCTCTC.......................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................AAGTGTCATCTGCTTTGTGGGGGC........................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TGCAGTTGGTAGCTTCCCGAG............................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................GTGGATCCGAGGCAATGTGAGTGCGTa 27 a 1.00 12.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TGAGGTTGGTCCAGGACCAGCTCCAGt........................... 27 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................GGGAAAGTGTCATCTGCTTTGTG............................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..........TCTCCTTTTAGCCATTTGGGTCCCAGGG.................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGAACATCCTCTGAGCTGCCTCTCTCTT...................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGGGAAAGTGTCATCTGCTTTGTGGa........................................................................................................................................... 26 a 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................GAAGTGGATCCGAGGCAATGTGAGT.... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................AGTGGATCCGAGGCAATGTGAGTGC.. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................TCAAGTCAAGTGGCCAGGCTTTGATGGC...................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TTTGATGGCTAGTGCCTTTCCACTT...................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................CAAGTCAAGTGGCCAGGCTTTGATGGCT..................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGAGCTGCCTCTCTCTTTGAGGTTGGTC........................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TCTGGAACATCCTCTGAGCTGCCTCTC.......................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................ATCCTCTGAGCTGCCTCTCTCTTTGA................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................TCCTCTGAGCTGCCTCTCTCTTTGAGGTT............................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAGCCATTTGGGTCCCAGGGATTCAAGT............................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
......................................................................................................................TGCAGTTGGTAGCTTCCCGAGGCCCAG......................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TGGGTCCCAGGGATTCAAGTCAAGTG...................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................CCTCTGGAACATCCTCTGAGCcgc............................................................... 24 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGTAGCTTCCCGAGGCCCAGGCAGt.................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................TGGGAAAGTGTCATCTGCTTTGTGGG........................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................ATCCTCTGGAACATCCTCTGAGCTGCCTC............................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................TCCTCTGGAACATCCTCTGAGCTGCCTCTCT......................................................... 31 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CAGGGATTCAAGTCAAGTGGCCAGGCT.............................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
...............TTTTAGCCATTTGGGTCCCAGGGATTC................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TCCAGAAGTGGATCCGAGGCAATGTGt...... 27 t 1.00 16.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TGCAGTTGGTAGCTTCCCGAGG.............................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
....................................................................................................................................................................................................................CCAGCTCCAGAAGTGGATCCGAGG.............. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................TCCCAGGGATTCAAGTCAAGTGGCCA.................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AAAGTGTCATCTGCTTTGTGGGGGCA....................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................................................TTTGATGGCTAGTGCCTTTCCACTTGTGt.................................................................................................................................................................. 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................AGAAGTGGATCCGAGGCAATGTGAGT.... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TAGCCATTTGGGTCCCAGGGATTCAAG............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................TCCAGGACCAGCTCCAGAAGTGGA..................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.................................................................................................................................................................................TCTGAGCTGCCTCTCTCTTTGAGGTTG.............................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTTTAGCCATTTGGGTCCCAGGGggt................................................................................................................................................................................................................. 26 ggt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................AGTGGATCCGAGGCAATGTGAGTGCGT 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGGAACATCCTCTGAGCTGCCTCTCT......................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................CTCCAGAAGTGGATCCGAGGCAATGTG....... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TGATGGCTAGTGCCTTTCCACTTGT.................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGGTAGCTTCCCGAGGCCCAGG........................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CCCAGGGATTCAAGTCAAGTGGCCAGGC............................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................CCAGAAGTGGATCCGAGGCAATGTGA...... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TTCCACTTGTGGGAAAGTGTCATCTGC................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GGGATTCAAGTCAAGTGGCCAGGCT.............................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AAGTGGATCCGAGGCAATGTGAGTGCGT 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................TCCACTTGTGGGAAAGTGTCATCTGC................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TTTTAGCCATTTGGGTCCCAGGGAT.................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................GTCCAGGACCAGCTCCAGAAGTGGATCCGA................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................TCTGGAACATCCTCTGAGCTGCCTCTCT......................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TTCAAGTCAAGTGGCCAGGCTTTGATGGCTt.................................................................................................................................................................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CATCCTCTGGAACATCCTCTGAGCT................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AAGTGGATCCGAGGCAATGTGAGT.... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -

Antisense strand
AAGTCAGTTCTCTCCTTTTAGCCATTTGGGTCCCAGGGATTCAAGTCAAGTGGCCAGGCTTTGATGGCTAGTGCCTTTCCACTTGTGGGAAAGTGTCATCTGCTTTGTGGGGGCAGTATGCAGTTGGTAGCTTCCCGAGGCCCAGGCAGCACCCCCACTCCATCCTCTGGAACATCCTCTGAGCTGCCTCTCTCTTTGAGGTTGGTCCAGGACCAGCTCCAGAAGTGGATCCGAGGCAATGTGAGTGCGT
........................................................(((...((((((....((.((((((....)))))).)))))))).)))....(((((((((...(((..((....((((.((((....((.((........))))..)))).))))...)).))).)))))))))...........................................................
........................................................57.......................................................................................................................................194......................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
....................................................................................................................................................................................GAGCTGCCTCTCTCTTTGAGGTTGGTCCA......................................... 29 1 5.00 5.00 1.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................CTGCCTCTCTCTTTGAGGTTGGTCCAgtc......................................... 29 gtc 4.00 0.00 1.00 - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................CTTTGTGGGGGCAGTATGCAGTTGGTA......................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................ATGCAGTTGGTAGCTTCCCGAGGCCCA.......................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GCTTTGTGGGGGCAGTATGCAGTTGGT.......................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................CCAGCTCCAGAAGTGGATCCGAGGCAA........... 27 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GCCATTTGGGTCCCAGGGATTCAAGT............................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................ATCCTCTGAGCTGCCTCa............................................................ 18 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GGGGCAGTATGCAGTTGGTAGCTTCCCGA................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TCTCTCCTTTTAGCCATTTGGGTCCCA....................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................GCTTTGTGGGGGCAGTATGCAGTTGGTA......................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................ACCAGCTCCAGAAGTGGATCCGAGGCAAt........... 29 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................CAGCTCCAGAAGTGGATCCGAGGCAA........... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGAGCTGCCTCTCTCTTTGAGGTTGGTCCA......................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................CCACTCCATCCTCTGGAACATCCTC....................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................ACCAGCTCCAGAAGTGGATCCGAGGCAA........... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CCTTTTAGCCATTTGGGTCCCAGGGATT................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................CAGAAGTGGATCCGAGGCAATGTGA...... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................GCCTCTCTCTTTGAGGTTGGTCCAGGAt...................................... 28 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CACCCCCACTCCATCCTCTGGAACAg............................................................................ 26 g 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GCCTTTCCACTTGtcg..................................................................................................................................................................... 16 tcg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TCATCTGCTTTGTGGG........................................................................................................................................... 16 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -