Gene: Tor1b

ID: uc008jda.1_intron_3_0_chr2_30812096_f

SPECIES: mm9

chr2:30812046 30812381 +

(9) OTHER.mut

(1) OVARY

(7) PIWI.ip

(3) PIWI.mut

(40) TESTES

Sense strand

GAAGGACCTGGAGCCTGTGCTGTCTGTGGGCGTCTTCAACAACAAGCACAGTGAGTCCACTATGGAGCGGGGAACCCAGTGCTCGGCTGGCATTGAGTAGATTCTCAGCAGTGTGTCTTTTCGAAGCCAGCGATACCCTTGTTTGTGGCTTTGCTGCCACAGGGAGATTTCTTAGGGTATTTTGAGGGCACATGTCACTTGACAGAGTCTCTGGAAGGGTGAAGGCATGAAGGATGGGATATGGCTAGGTGGCAGTGACAGGAGACCCGCTTGTCTTGTTCTGCAGGTGGCCTGTGGCACAGTGGGCTAATAGACAAAAACCTCATCGACTATTTT .........................................................................................((..((((......))))))...((((((((......((((.(((((((....(((((((......))))))).(((....))).)))))))....((((...((((....))))..))))))))......))))))))............................................................................................................ ........................................................................................89...........................................................................................................................................230........................................................................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)	mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)	SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)	SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)	SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)	mjTestesWT1() Testes Data. (testes)	SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)	SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)	SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
....................TGTCTGTGGGCGTCTTCAACAACAAGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	67.00	67.00	15.00	16.00	15.00	15.00	1.00	1.00	-	-	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................TGTCTGTGGGCGTCTTCAACAACAAGCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	12.00	12.00	6.00	4.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................TGACAGAGTCTCTGGAAGGGTGAAGGC..............................................................................................................	27	1	9.00	9.00	2.00	-	-	-	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	3.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................TCTGGAAGGGTGAAGGCATGAAGG.......................................................................................................	24	1	8.00	8.00	-	-	-	-	-	1.00	7.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................CAGAGTCTCTGGAAGGGTGAAGGCAT............................................................................................................	26	1	7.00	7.00	1.00	1.00	-	-	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................TGAGTAGATTCTCAGCAGTGTGTCTTT........................................................................................................................................................................................................................	27	1	6.00	6.00	2.00	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................TGGAAGGGTGAAGGCATGAAGGATG....................................................................................................	25	1	6.00	6.00	-	-	-	-	1.00	1.00	-	1.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................................................GTCTCTGGAAGGGTGAAGGCATGAAG........................................................................................................	26	1	6.00	6.00	2.00	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................CAGAGTCTCTGGAAGGGTGAAGGC..............................................................................................................	24	1	5.00	5.00	-	-	-	-	-	-	5.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................TTGACAGAGTCTCTGGAAGGGTGAAGG...............................................................................................................	27	1	5.00	5.00	-	-	-	-	1.00	-	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................TGTCACTTGACAGAGTCTCTGGAAGGG.....................................................................................................................	27	1	4.00	4.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................TAGGGTATTTTGAGGGCACATGTCACT.........................................................................................................................................	27	1	4.00	4.00	3.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................GTCTGTGGGCGTCTTCAACAACAAGCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	4.00	4.00	1.00	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCACAGTGGGCTAATAGACAAAAAC...............	27	1	4.00	4.00	1.00	-	-	-	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................TGCTGTCTGTGGGCGTCTTCAACAAC.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	4.00	4.00	3.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCACAGTGGGCTAATAGACAAAAACC..............	28	1	3.00	3.00	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-
......................TCTGTGGGCGTCTTCAACAACAAGCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	3.00	3.00	1.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................TGGAAGGGTGAAGGCATGAAGGATGG...................................................................................................	26	1	3.00	3.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................TAGGTGGCAGTGACAGGAGACCCGCTT................................................................	27	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................TGAAGGATGGGATATGGCTAGGTGGC...................................................................................	26	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTGGCCTGTGGCACAGTGGG..............................	21	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................................CATGAAGGATGGGATATGGCTAGGTGGa...................................................................................	28	a	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................TTGACAGAGTCTCTGGAAGGGTGAAGGC..............................................................................................................	28	1	2.00	2.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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...........................................................................................................................................................................TTAGGGTATTTTGAGGGCACATGTCACT.........................................................................................................................................	28	1	2.00	2.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................GTGAGTCCACTATGGAGCGGGGAAC.....................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGGTGGCCTGTGGCACAGTGGG..............................	25	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................GTCTGTGGGCGTCTTCAACAACAAGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................TAGGGTATTTTGAGGGCACATGTCAC..........................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................TCTTAGGGTATTTTGAGGGCACATGTCACTT........................................................................................................................................	31	1	2.00	2.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00
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........TGGAGCCTGTGCTGTCTGTGGGCGTC..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................TGAAGGATGGGATATGGCTAGGTGG....................................................................................	25	1	2.00	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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.............CCTGTGCTGTCTGTGGGCGTCTTtaac........................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	taac	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TTCTCAGCAGTGTGTCTTTTCGAcgcc................................................................................................................................................................................................................	27	cgcc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................ACAGAGTCTCTGGAAGGGTGAAGG...............................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................GAGGGCACATGTCACTTG.......................................................................................................................................	18	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
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........................TGTGGGCGTCTTCAACAACAAGCACAGTG...........................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TGTGGGCGTCTTCAACAACAAGCACAGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................TGAAGGATGGGATATGGCTAGGTGGa...................................................................................	26	a	1.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TGTGGGCGTCTTCAACAACAAGCACAGTGg..........................................................................................................................................................................................................................................................................................	30	g	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGCACAGTGGGCTAATAGACAAAAAC...............	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................GTGGGCGTCTTCAACAACAAGCACAGTGgc.........................................................................................................................................................................................................................................................................................	30	gc	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................TGGCATTGAGTAGATTCTCAGCAGTG...............................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................TGGAAGGGTGAAGGCATGAAGGATGGG..................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................TGAAGGATGGGATATGGCTAGGgggc...................................................................................	26	gggc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................TCTGGAAGGGTGAAGGCATGAAGGAT.....................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................TGGGCGTCTTCAACAACAAGCACAGTGgcc........................................................................................................................................................................................................................................................................................	30	gcc	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCACAGTGGGCTAATAGACAAAA.................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-
.......................................................................................................................................................................................................TGACAGAGTCTCTGGAAGGGT....................................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................................CATGAAGGATGGGATATGGCTAag.......................................................................................	24	ag	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................TTTTGAGGGCACATGTCACTTGACAGAGTC...............................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCACAGTGGGCTAATAGACAAAAAC...............	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TGTGGGCGTCTTCAACAACAAGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................................................GTCTCTGGAAGGGTGAAGGCATGAAGt.......................................................................................................	27	t	1.00	6.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TGTGGGCGTCTTCAACAACAAGCACAGTGgt.........................................................................................................................................................................................................................................................................................	31	gt	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................TATTTTGAGGGCACATGTCACTTGACAGA..................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAATAGACAAAAACCTCATCGACTATT..	27	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................TGAGTAGATTCTCAGCAGTGTGTCTT.........................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................TGGAGCGGGGAACCCAGTGCTCGGCTG.......................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................TTCGAAGCCAGCGATACCCTTGTTT................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................TATGGAGCGGGGAACCCAGTGCTCGGta........................................................................................................................................................................................................................................................	28	ta	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................TGACAGAGTCTCTGGAAGGGTGAAa................................................................................................................	25	a	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................CGAAGCCAGCGATACCCTTGTTTGT..............................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGCTAATAGACAAAAACCTCATCGACTA....	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................TGGGCGTCTTCAACAACAAGCACAGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................TGTCACTTGACAGAGTCTCTGGAAGGGT....................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................AGTCTCTGGAAGGGTGAAGGCATGA..........................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAAAACCTCATCGACTATTTTt	23	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................GAAGGGTGAAGGCATGAAGGATGGGA.................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................TAGATTCTCAGCAGTGTGTCTTTTCGAAGC.................................................................................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................TGTCTGTGGGCGTCTTCAACAACAAGt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	t	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................TGACAGAGTCTCTGGAAGGGTGAAGGCA.............................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGGTGGCCTGTGGCACAGTGGa..............................	25	a	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................CTGTCTGTGGGCGTCTTCAACAACAAGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................TTGAGTAGATTCTCAGCAGTGTGTC...........................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................TAGGGTATTTTGAGGGCACATGTCAa..........................................................................................................................................	26	a	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAATAGACAAAAACCTCATCGACTATTT.	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................TCTGTGGGCGTCTTCAACAACAAGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................TGGAAGGGTGAAGGCATGAAGGATGt...................................................................................................	26	t	1.00	6.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................GTTTGTGGCTTTGCTGCCtg................................................................................................................................................................................	20	tg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................AGATTTCTTAGGGTATTTTGAGGGCA..................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................TCTTAGGGTATTTTGAGGGCACATGTCA...........................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................GAGCGGGGAACCCAGTGCTCGGCTGGCAT...................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................TGTCTGTGGGCGTCTTCAACAACAAGCAC...............................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................................................TGGCTAGGTGGCAGTGACAGGAGAa......................................................................	25	a	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................................AGGGTGAAGGCATGAAGGATGGGATA...............................................................................................	26	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................TGACAGAGTCTCTGGAAGGGTGAAGa...............................................................................................................	26	a	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................GACAGAGTCTCTGGAAGGGTGAAGGg..............................................................................................................	26	g	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............TGTGCTGTCTGTGGGCGTCTTCAACA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................AAGGATGGGATATGGCTAGGTGGCAGT................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................AGTCTCTGGAAGGGTGAAGGC..............................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................TCTTAGGGTATTTTGAGGGCACATGT.............................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................GGAGATTTCTTAGGGTATTTTGAGGGC...................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTGGGCTAATAGACAAAAACCTCATC.........	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................TGAGTCCACTATGGAGCGGGGAAC.....................................................................................................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................TGTCTGTGGGCGTCTTCAACAACAAG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................................................GTCTCTGGAAGGGTGAAGGCATGAA.........................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................TTGAGTAGATTCTCAGCAGTGTGTCTTT........................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................TCTGGAAGGGTGAAGGCATGAAGGA......................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................CAGAGTCTCTGGAAGGGTGAAGGCA.............................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................................................GTCTCTGGAAGGGTGAAGGCATGAAGG.......................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................AGAGTCTCTGGAAGGGTGAAGGCAT............................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTGTTCTGCAGGTGGCCTGTGGCAC....................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................TGACAGAGTCTCTGGAAGGGTGAA.................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................TCTTCAACAACAAGCACA..............................................................................................................................................................................................................................................................................................	18	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................ACAGAGTCTCTGGAAG.......................................................................................................................	16	10	0.10	0.10	-	-	-	-	-	0.10	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-

Antisense strand

GAAGGACCTGGAGCCTGTGCTGTCTGTGGGCGTCTTCAACAACAAGCACAGTGAGTCCACTATGGAGCGGGGAACCCAGTGCTCGGCTGGCATTGAGTAGATTCTCAGCAGTGTGTCTTTTCGAAGCCAGCGATACCCTTGTTTGTGGCTTTGCTGCCACAGGGAGATTTCTTAGGGTATTTTGAGGGCACATGTCACTTGACAGAGTCTCTGGAAGGGTGAAGGCATGAAGGATGGGATATGGCTAGGTGGCAGTGACAGGAGACCCGCTTGTCTTGTTCTGCAGGTGGCCTGTGGCACAGTGGGCTAATAGACAAAAACCTCATCGACTATTTT .........................................................................................((..((((......))))))...((((((((......((((.(((((((....(((((((......))))))).(((....))).)))))))....((((...((((....))))..))))))))......))))))))............................................................................................................ ........................................................................................89...........................................................................................................................................230........................................................................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	mjTestesWT4() Testes Data. (testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	mjTestesWT3() Testes Data. (testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)	mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)	SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)	SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)	SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)	mjTestesWT1() Testes Data. (testes)	SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)	SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)	SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
..................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGAGACCCGCTTGTCTTGTTCTGCA...................................................	27	1	27.00	27.00	6.00	7.00	5.00	8.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAGACCCGCTTGTCTTGTTCTGCA...................................................	26	1	13.00	13.00	3.00	6.00	1.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............TGTGCTGTCTGTGGGCGTCTTCAACAA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	4.00	4.00	2.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................TTTTCGAAGCCAGCGATACCCTTGTT.................................................................................................................................................................................................	26	1	4.00	4.00	-	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTTGTCTTGTTCTGCAGGTGGCCTG..........................................	28	1	4.00	4.00	2.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TTCTCAGCAGTGTGTCTTTTCGAAGCCA...............................................................................................................................................................................................................	28	1	4.00	4.00	3.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................GCTCGGCTGGCATTGAGTAGATTCTCA.....................................................................................................................................................................................................................................	27	1	3.00	3.00	2.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................TCTTCAACAACAAGCACAGTGAGTCCA.....................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	3.00	3.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................GTCTTCAACAACAAGCACAGTGAGTCCA.....................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	3.00	3.00	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................ACAAGCACAGTGAGTCCACTA..................................................................................................................................................................................................................................................................................	21	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................GCTTTGCTGCCACAGGGAGATTTCTTA..................................................................................................................................................................	27	1	2.00	2.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................GCTGTCTGTGGGCGTCTTCAACAACA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................AGTGCTCGGCTGGCATTGAGTAGATTCTCA.....................................................................................................................................................................................................................................	30	1	2.00	2.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................................................................ACAGGAGACCCGCTTGTCTTGTTCTGCA...................................................	28	1	2.00	2.00	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........AGCCTGTGCTGTCTGTGGGCGTCTTCA..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTAATAGACAAAAACCTCATCGACTA....	27	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................................................................GACAGGAGACCCGCTTGTCTTGTTCTG.....................................................	27	1	2.00	2.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........GAGCCTGTGCTGTCTGTGGGCGTCTTCAA.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	2.00	2.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................TGTCTGTGGGCGTCTTCAACAACAAGCA................................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	2.00	2.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................GGGCACATGTCACTTGACAGAGTCTCTGGA.........................................................................................................................	30	1	2.00	2.00	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................................................................ACAGGAGACCCGCTTGTCTTGTTCTG.....................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGACCCGCTTGTCTTGTTCTGCA...................................................	25	1	2.00	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................AACAACAAGCACAGTGAGTCCACTA..................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................GGGCGTCTTCAACAACAAGCACAGTGA..........................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................................TGACAGAGTCTCTGGAAGGGTGAAGGCA.............................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................GCGGGGAACCCAGTGCTCGGCTGGCA....................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................AAGGCATGAAGGATGGGATATGGCTA.........................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................TGGGCGTCTTCAACAACAAGCACAGTGAGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTTGTCTTGTTCTGCAGGTGGCCT...........................................	27	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................GAAGGGTGAAGGCATGAAGGATGGGATA...............................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................GGGCACATGTCACTTGACAGAGTCTCTG...........................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCTGTGGCACAGTGGGCTAATAGACAA...................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................................................GAGTCTCTGGAAGGGTGAAGGCATGAA.........................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................CTCAGCAGTGTGTCTTTTCGAAGCCAt...............................................................................................................................................................................................................	27	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................TCTTCAACAACAAGCACAGTGAGTCCAC....................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGCTAATAGACAAAAACCTCATCGACTA....	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................................GATATGGCTAGGTGGCAGTGACAGGA.........................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............CTGTGCTGTCTGTGGGCGTCTTCAACA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................ATTTTGAGGGCACATGTCACTTGACAGA..................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................................................................................................................GCTTGTCTTGTTCTGCAGGTGGCCTG..........................................	26	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........GGAGCCTGTGCTGTCTGTGGGCGTCTTCA..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................TGAGTCCACTATGGAGCGGGGAACCCA..................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................................GAAGGATGGGATATGGCTAGGTGGCA..................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................TGACAGGAGACCCGCTTGTCTTGTTCTGCA...................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........GAGCCTGTGCTGTCTGTGGGCGTCTTCAt..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................	29	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-
.............................................................................................TGAGTAGATTCTCAGCAGTGTG.............................................................................................................................................................................................................................	22	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGACCCGCTTGTCTTGTTCTGCAa...................................................	26	a	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................TTCTCAGCAGTGTGTcag............................................................................................................................................................................................................................	18	cag	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................ACATGTCACTTGACAGAGTCTCTGGAA........................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCCTGTGGCACAGTGGGCTAATAGACAA...................	30	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................GCTCGGCTGGCATTGAGTAGATTCTCAt.....................................................................................................................................................................................................................................	28	t	1.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................GCTGGCATTGAGTAGATTCTCAGCAGTG...............................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................................................................................GAGACCCGCTTGTCTTGTTCTGCA...................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....GACCTGGAGCCTGTGCTGTCTGTGGGCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................................................................................................GTGACAGGAGACCCGCTTGTCTTGTTCT......................................................	28	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................TCTTAGGGTATTTTGAGGGCACATGTCA...........................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................CAACAACAAGCACAGTGAGTCCACT...................................................................................................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................CTCGGCTGGCATTGAGTAGATTCTCA.....................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................CAGTGCTCGGCTGGCATTGAGTAGATT.........................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................AGGGCACATGTCACTTGACAGAGTCTC.............................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTTGTCTTGTTCTGCAGGTGGCC............................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................GGCTTTGCTGCCACAGGGAGATTTCTTA..................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................GAGGGCACATGTCACTTGACAGAGTCT..............................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTGTTCTGCAGGTGGCCTGTGGCA.....................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................TTCTTAGGGTATTTTGAGGGCACATGTCA...........................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................GATTCTCAGCAGTGTGTCTTTTCGAAGCC................................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGGTGGCCTGTGGCACAGTGGGCTA...........................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................................................................AGGAGACCCGCTTGTCTTGTTCTGCAc...................................................	27	c	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................CAACAAGCACAGTGAGTCCA.....................................................................................................................................................................................................................................................................................	20	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGTGGCCTGTGGCACAGTGGGCTAa...........................	27	a	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................GCTGTCTGTGGGCGTCTTCAACAACAA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................CACTTGACAGAGTCTCTGGAAGGGTGAA.................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............CCTGTGCTGTCTGTGGGCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................CAACAACAAGCACAGTGAGTCCACTA..................................................................................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................................GATGGGATATGGCTAGGTGGCAGTGACA............................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................CTGCCACAGGGAGATTTCTTAGGGTA.............................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................CTCAGCAGTGTGTCTTTTCGAAGCCA...............................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-