(1)
OTHER.ip
(10)
OTHER.mut
(8)
PIWI.ip
(2)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(36)
TESTES

Sense strand
CTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTGTAGACCAGGCTTCCCTTGAACTCACAGAGATCCTCCTGCCTCTGCTTCCTGAGTGCTGGGAGTAAAAGTACACGCCAGCACCTCCAGGCAGTTTTCCATAGGAAAGATTCACACATAGCGTATTTTGTTAGGATAAAAAATATTGCCTGTTTTCATCCTTCTGCAGGTTTTATGGGAGCTAGAAACCTTACGCCTCGTAAGTCACTTTGAGAAGTC
............................................................((.(((.(((((.....(((.((((.(((((((..((........)).)))))))...)))).)))......)))))..)))))..........................................................................................................
..................................................51...................................................................................................152................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
..............................................................................................................AGCACCTCCAGGCAGTTTTCCATAGGAAAGATTCACACATAGCGTATTTTGT........................................................................................ 52 1 58.00 58.00 58.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGGGAGCTAGAAACCTTACGCCTCGTA................. 27 1 12.00 12.00 - 4.00 1.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGGGAGCTAGAAACCTTACGCCTCGTAA................ 28 1 8.00 8.00 - 2.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGGGAGCTAGAAACCTTACGCCTCGTAAGT.............. 30 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
..............................................................................................................................................................................................................TGGGAGCTAGAAACCTTACGCCTCGTAt................ 28 t 3.00 12.00 - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGGGAGCTAGAAACCTTACGCCTCGTAAt............... 29 t 3.00 8.00 - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGGGAGCTAGAAACCTTACGCCTCGT.................. 26 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................AAACCTTACGCCTCGTAAGTCACTTT........ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGGAACTCACTGTAGACCAGGCTTta.......................................................................................................................................................................................................... 26 ta 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGGAACTCACTGTAGACCAGGCTTtt.......................................................................................................................................................................................................... 26 tt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TCACTGTAGACCAGGCTatc.......................................................................................................................................................................................................... 20 atc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........CCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTGTAGAag.................................................................................................................................................................................................................. 30 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GGAACTCACTGTAGACCgggc.............................................................................................................................................................................................................. 21 gggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TTGAACTCACAGAGATCCTatgc.................................................................................................................................................................................. 23 atgc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CTGGAACTCACTGTAGACCAGGCTTtaa......................................................................................................................................................................................................... 28 taa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGGAACTCACTGTAGACCAGGCTTaa.......................................................................................................................................................................................................... 26 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TAGAAACCTTACGCCTCGTAAGTCACT.......... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................TATGGGAGCTAGAAACCTTACGCCTC.................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGGGAGCTAGAAACCTTACGCCTC.................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGGAACTCACTGTAGACCAGGCTTC........................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................TTGAACTCACAGAGATCCTCCTGCCTaaa............................................................................................................................................................................ 29 aaa 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GGAACTCACTGTAGACCAGGCTTt........................................................................................................................................................................................................... 24 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
......................TGGAACTCACTGTAGACCggg............................................................................................................................................................................................................... 21 ggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................TCACTGTAGACCAGGgc............................................................................................................................................................................................................. 17 gc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTGTAGta................................................................................................................................................................................................................... 29 ta 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................TGAACTCACAGAGATCCTCCTGCCTaa............................................................................................................................................................................. 27 aa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGGAACTCACTGTAGACCAGGCTTgt.......................................................................................................................................................................................................... 26 gt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TGGGAGCTAGAAACCTTACGCCTCGTAAG............... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGGAACTCACTGTAGACCAGGgc............................................................................................................................................................................................................. 23 gc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................CTTGAACTCACAGAGATCCTCCTaaa................................................................................................................................................................................ 26 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
..............................................................................................................................................................................................................TGGGAGCTAGAAACCTTACGCCTCGTAAGTt............. 31 t 1.00 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGGCTGTCCTGGAACTCACTGTAGga................................................................................................................................................................................................................... 26 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................CTGGAACTCACTGTAGACCcggc.............................................................................................................................................................................................................. 23 cggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
......................TGGAACTCACTGTAGACCAGGCTaaa.......................................................................................................................................................................................................... 26 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TTATGGGAGCTAGAAACCTTACGCCTCGT.................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................TGAACTCACAGAGATCCTCCTGCCTaaa............................................................................................................................................................................ 28 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TTATGGGAGCTAGAAACCTTACGCCTC.................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................TTTATGGGAGCTAGAAACCTTACGCCT..................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GGGAGCTAGAAACCTTACGCCTCGTAAGTC............. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
................................................CTTGAACTCACAGAGATCCTCCga.................................................................................................................................................................................. 24 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTGTAGACCAGGCTTCCCTTGAACTCACAGAGATCCTCCTGCCTCTGCTTCCTGAGTGCTGGGAGTAAAAGTACACGCCAGCACCTCCAGGCAGTTTTCCATAGGAAAGATTCACACATAGCGTATTTTGTTAGGATAAAAAATATTGCCTGTTTTCATCCTTCTGCAGGTTTTATGGGAGCTAGAAACCTTACGCCTCGTAAGTCACTTTGAGAAGTC
............................................................((.(((.(((((.....(((.((((.(((((((..((........)).)))))))...)))).)))......)))))..)))))..........................................................................................................
..................................................51...................................................................................................152................................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR034119(GSM466729)
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SRR028732(GSM400969)
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Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR248524(GSM733812)
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SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
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18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
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mjTestesKO6()
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Testes Data. (Zcchc11 testes)
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small RNA cloning by length. (testes)
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Testes Data. (Zcchc11 testes)
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SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
.........TGGCTGTCCTGGAACTCACTGTAatgc...................................................................................................................................................................................................................... 27 atgc 5.00 0.00 - - - - - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGCTGTCCTGGAACTCACTGTAagaa...................................................................................................................................................................................................................... 27 agaa 3.00 0.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGGCTGTCCTGGAACTCACTGTAaaa...................................................................................................................................................................................................................... 26 aaa 2.00 0.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AGATCCTCCTGCCTCTGCTTCCTGAaggc.................................................................................................................................................................... 29 aggc 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGGCTGTCCTGGAACTCACTGTAagta...................................................................................................................................................................................................................... 27 agta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................CACAGAGATCCTCCTGCCTCtttt.............................................................................................................................................................................. 24 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..........TGGCTGTCCTGGAACTCACTGTAtta...................................................................................................................................................................................................................... 26 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
....TAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTGTaaa....................................................................................................................................................................................................................... 31 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GGCTGTCCTGGAACTCACTGTggt....................................................................................................................................................................................................................... 24 ggt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GGCTGTCCTGGAACTCACTGTAcgg...................................................................................................................................................................................................................... 25 cgg 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CTGTCCTGGAACTCACTGTAGACCAaa................................................................................................................................................................................................................. 27 aa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CTGGCTGTCCTGGAACTCACTGTAtgt...................................................................................................................................................................................................................... 27 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GGCTGTCCTGGAACTCACTGTAcat...................................................................................................................................................................................................................... 25 cat 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................CCTCCTGCCTCTGCTTCCTGAggtt.................................................................................................................................................................... 25 ggtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGGCTGTCCTGGAACTCACTGTAatt...................................................................................................................................................................................................................... 26 att 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CTGGCTGTCCTGGAACTCACTGTAtag...................................................................................................................................................................................................................... 27 tag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
TGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAAtttt............................................................................................................................................................................................................................... 28 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.............CTGTCCTGGAACTCACTGTAGACCAgct................................................................................................................................................................................................................. 28 gct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
CTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTcgt................................................................................................................................................................................................................................... 24 cgt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GTGTAGCCCTGGCTGTCCTGcgt.................................................................................................................................................................................................................................. 23 cgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CCTGGCTGTCCTGGAACTCACTGcca........................................................................................................................................................................................................................ 26 cca 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................TGCCTCTGCTTCCTGAGTGCTGGtaa............................................................................................................................................................. 26 taa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
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