chr2:26768272 26768557 +
(1)
OTHER.ip 		(13)
OTHER.mut 		(6)
OVARY 		(10)
PIWI.ip 		(5)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(58)
TESTES

Sense strand
CTGGTCCACAGGAAGACATGCACCACCGTTGCCTTCACACAGGTTAACTCGTGAGTATTTATGCGCCCACACCTTACCCTCACAGCTTTGGACCATTTGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCACCTGAATCAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAAAAAGGCAGGGAGGGAAGGGTTTATTACTCCTGCTTCTTAAACAGTAACGAGACCTTCCTCATTGCCTTTCCAGGGAAGACAAGGGTGCTCTGGCTAAGCTGGTGGAAGCTATTAGGACCAATT
...............................................................................................((((((........(((((..........)))))..((((...(((....))).)))).....))))))..........................................................................................................................
............................................................................................93......................................................................165.......................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR037898(GSM510434)
ovary_rep3. (ovary) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR037896(GSM510432)
ovary_rep1. (ovary) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCACCTGAATCAACTATGTGGTCACACT......................................................................................................................................... 52 1 1684.00 1684.00 984.00 - - 700.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 31 1 543.00 543.00 - 50.00 186.00 - 49.00 48.00 59.00 24.00 10.00 14.00 11.00 7.00 24.00 22.00 1.00 - 4.00 4.00 - - 1.00 1.00 1.00 - - - 9.00 1.00 4.00 6.00 - 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
................................................................................................................................................ACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 19 1 448.00 448.00 - 196.00 41.00 - 83.00 34.00 25.00 1.00 28.00 7.00 11.00 1.00 2.00 1.00 - 5.00 - - 3.00 - - - - 5.00 - - - - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 30 1 274.00 274.00 - 44.00 12.00 - 25.00 63.00 26.00 33.00 - 8.00 14.00 10.00 3.00 10.00 1.00 2.00 5.00 3.00 - - 1.00 2.00 1.00 - - 1.00 2.00 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
................................................................................................TTGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCACCTGAATCAACTATGTGGTCACAC.......................................................................................................................................... 52 1 223.00 223.00 132.00 - - 91.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TCACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 21 1 208.00 208.00 - 75.00 22.00 - 64.00 21.00 - - 15.00 - 6.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 18 1 186.00 186.00 - 82.00 16.00 - 18.00 31.00 7.00 - 23.00 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GTCACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 22 1 177.00 177.00 - 77.00 20.00 - 39.00 19.00 3.00 - 7.00 2.00 1.00 4.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGGTCACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 23 1 167.00 167.00 - 67.00 13.00 - 18.00 22.00 24.00 - 1.00 4.00 17.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 29 1 132.00 132.00 - - 22.00 - - - 3.00 61.00 1.00 9.00 - 3.00 5.00 8.00 - 2.00 5.00 8.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 25 1 129.00 129.00 - 39.00 23.00 - 36.00 2.00 - - 13.00 1.00 2.00 - 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 24 1 127.00 127.00 - 44.00 38.00 - 13.00 7.00 15.00 - 6.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 19 1 126.00 126.00 - 42.00 24.00 - 18.00 15.00 - - - 10.00 12.00 1.00 - - - - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 30 1 80.00 80.00 - 7.00 34.00 - 16.00 - - 1.00 2.00 3.00 5.00 - 1.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGA........................................................................................................................................................................... 18 1 75.00 75.00 - 9.00 - - 1.00 - - - 9.00 - - 1.00 - 1.00 - 11.00 - - 8.00 - - 3.00 - 2.00 13.00 4.00 - - - - 8.00 - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 26 1 75.00 75.00 - 6.00 31.00 - - 21.00 6.00 2.00 1.00 5.00 - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 27 1 74.00 74.00 - 17.00 2.00 - 27.00 - - 2.00 5.00 2.00 - 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - 1.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - -
..............................................................................................................................................TCACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 20 1 72.00 72.00 - 47.00 5.00 - 4.00 - - - - 1.00 13.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 31 1 69.00 69.00 - 20.00 5.00 - 5.00 18.00 - 2.00 - 1.00 4.00 3.00 3.00 3.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 20 1 67.00 67.00 - 13.00 10.00 - 22.00 - - - 10.00 - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - -
........................................................................................................................................ATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 25 1 65.00 65.00 - 4.00 13.00 - - - - 33.00 - 5.00 1.00 - 4.00 1.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GGTCACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 23 1 64.00 64.00 - 7.00 46.00 - 7.00 - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................ACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 17 1 63.00 63.00 - 8.00 19.00 - - - 6.00 24.00 - 3.00 - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GTGGTCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 23 1 59.00 59.00 - 11.00 20.00 - - - 12.00 1.00 1.00 8.00 2.00 - - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 18 1 56.00 56.00 - 10.00 28.00 - 1.00 6.00 - - - 8.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 30 1 56.00 56.00 - - 6.00 - - 17.00 8.00 10.00 - 5.00 - - 5.00 4.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GTCACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 21 1 50.00 50.00 - 16.00 2.00 - 3.00 - 15.00 - - 1.00 7.00 4.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGGTCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 22 1 49.00 49.00 - - 36.00 - 2.00 - 3.00 2.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GTCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 20 1 48.00 48.00 - 3.00 25.00 - - - 7.00 2.00 - 9.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 32 1 43.00 43.00 - 2.00 21.00 - 3.00 2.00 - 3.00 - - - 3.00 2.00 2.00 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 19 1 34.00 34.00 - 1.00 26.00 - 1.00 - - - 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................ACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 18 1 33.00 33.00 - 7.00 4.00 - 2.00 7.00 5.00 - - 1.00 1.00 3.00 - - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 28 1 32.00 32.00 - 1.00 7.00 - 2.00 - - 8.00 - 3.00 - 1.00 6.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 26 1 29.00 29.00 - 3.00 2.00 - 10.00 5.00 - - 4.00 - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGG.............................................................................................................................. 28 1 29.00 29.00 - 3.00 - - - 11.00 - 7.00 - - 1.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 27 1 25.00 25.00 - - 10.00 - - - 2.00 2.00 - 7.00 - - 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 27 1 24.00 24.00 - 6.00 - - - 5.00 - - 1.00 1.00 2.00 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................ACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 17 1 24.00 24.00 - 3.00 15.00 - 1.00 - - - - 2.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 25 1 23.00 23.00 - 12.00 - - 3.00 - - - - 1.00 4.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TCAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 32 1 23.00 23.00 - - 5.00 - 3.00 6.00 7.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 26 1 20.00 20.00 - 3.00 - - 2.00 - - 1.00 - - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
................................................................................................TTGCCAGTGATGCTTAGGA........................................................................................................................................................................... 19 1 18.00 18.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - 4.00 2.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 24 1 17.00 17.00 - 5.00 5.00 - - - - 1.00 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 17 1 17.00 17.00 - 7.00 - - 6.00 - - - - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTT....................................................................................................................................................................... 22 1 16.00 16.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 2.00 - - - 8.00 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 28 1 16.00 16.00 - 2.00 - - - - - 2.00 - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - 1.00 2.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAAT......................................................................................................................................................................... 20 1 16.00 16.00 - - - - - - - - - - - 6.00 - - 1.00 1.00 - - 2.00 - 1.00 - 1.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAA.......................................................................................................................................................................... 19 1 16.00 16.00 - - - - - - - - - - - 5.00 - - - 2.00 1.00 - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 -
......................................................................................................................................CTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 28 1 14.00 14.00 - 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - 4.00 1.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TCAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 33 1 13.00 13.00 - - 10.00 - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................ATCAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 33 1 12.00 12.00 - 5.00 6.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCACCTGAA............................................................................................................................................................ 33 1 12.00 12.00 - - - - 7.00 - - - 2.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GGTCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 21 1 11.00 11.00 - - 5.00 - 1.00 4.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGGTCACACTGTTGTCTGAGG.............................................................................................................................. 21 1 10.00 10.00 - - - - 4.00 - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 24 1 10.00 10.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 29 1 9.00 9.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGG.............................................................................................................................. 24 1 9.00 9.00 - - - - 2.00 - 5.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................ATCAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 32 1 9.00 9.00 - - - - - - 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATT........................................................................................................................................................................ 21 1 9.00 9.00 - - - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - 2.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTC...................................................................................................................................................................... 23 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCACCTGAATC.......................................................................................................................................................... 35 1 7.00 7.00 - - - - - 5.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GGTCACACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 22 1 6.00 6.00 - 2.00 - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTC................................................................................................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 29 1 6.00 6.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..................................................................................................................................................ACTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 16 2 6.00 6.00 - - 4.00 - - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGG.............................................................................................................................. 25 1 5.00 5.00 - - 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGG............................................................................................................................................................................ 17 1 5.00 5.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGTGGTCACACTGTTGTCTGAGG.............................................................................................................................. 23 1 5.00 5.00 - - - - 2.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TCACACTGTTGTCTGAGG.............................................................................................................................. 18 1 5.00 5.00 - - 3.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TTGCCAGTGATGCTTAGG............................................................................................................................................................................ 18 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCAC................................................................................................................................................................. 27 1 5.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCACCTGAATCAACTATGTGGTC.............................................................................................................................................. 23 1 5.00 5.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTT.................................................................................................................................................................... 25 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGTGGTCACACTGTTGTCTGA................................................................................................................................ 21 1 4.00 4.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................AGACAAGGGTGCTCTGGCTAAGCTGGTt................... 28 t 4.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCAC................................................................................................................................................................. 28 1 4.00 4.00 - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCACC................................................................................................................................................................ 29 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 16 6 3.33 3.33 - 0.50 2.17 - - - - 0.33 - 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCT..................................................................................................................................................................... 24 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................ACCTGAATCAACTATGTGGT............................................................................................................................................... 20 1 3.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCA.................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGG.............................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................ACCTGAATCAACTATGTG................................................................................................................................................. 18 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................ATCAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 34 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ACTATGTGGTCACACTGTTGT.................................................................................................................................... 21 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGaaa........................................................................................................................... 31 aaa 3.00 29.00 - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TTGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTC................................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................TGGCTAAGCTGGTGGAAGCTATTAGGt...... 27 t 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
..................................................................................................GCCAGTGATGCTTAGGAATTT....................................................................................................................................................................... 21 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GTGGTCACACTGTTGTCTGAGG.............................................................................................................................. 22 1 3.00 3.00 - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TCAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 31 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCACCTGAAT........................................................................................................................................................... 34 1 3.00 3.00 - - - - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................CTGAATCAACTATGTGG................................................................................................................................................ 17 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGtcaa........................................................................................................................... 31 tcaa 3.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CACACTGTTGTCTGAGG.............................................................................................................................. 17 2 2.50 2.50 - - 0.50 - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGGTCCACAGGAAGACATGCACCACCGT................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 6 2.50 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - 0.67 - - - - - - - 0.17 0.33 - 0.67 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAAaaa....................................................................................................................................................................... 22 aaa 2.00 16.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................GGTCACACTGTTGTCTGAGGCAAAAAGG...................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAAA.......................................................................................................................... 32 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................AGGGTGCTCTGGCTAAGCTGGTGGAAt............... 27 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TTGCCAGTGATGCTTAGGAA.......................................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CACCTGAATCAACTATGTGGa............................................................................................................................................... 21 a 2.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TTCACCTGAATCAACTATGTGGT............................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAAAA......................................................................................................................... 33 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAAAA......................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTa...................................................................................................................................................................... 23 a 2.00 16.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GCCAGTGATGCTTAGGAAT......................................................................................................................................................................... 19 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TCACACTGTTGTCTGAGGCAAA.......................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................GACAAGGGTGCTCTGGCTAAGCTGGTGt.................. 28 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................ACAAGGGTGCTCTGGCa............................ 17 a 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGG.............................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCTGAATCAACTATGTGG................................................................................................................................................ 18 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CAACTATGTGGTCACACTGTTG..................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GTCACACTGTTGTCTGAGG.............................................................................................................................. 19 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................ATTTCTTCACCTGAATCAAC....................................................................................................................................................... 20 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TGATGCTTAGGAATTTCTTCACCTGAAT........................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................ACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGG.............................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................CACACTGTTGTCTGAGGCAAAAAGGCAGG.................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGT.................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCCACAGGAAGACATGCACCACCGTT................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 6 1.83 1.83 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - 0.17 - 0.17 - - 0.33 - - - - - - - - 0.17 - - - 0.33 0.17 - - - - - - - - - -
....TCCACAGGAAGACATGCACCACCGTTG............................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 1.83 1.83 - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - 0.33 - - - - - 0.17 - - - - - - - - 0.33 - 0.33 - - - - - - - 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - -
.TGGTCCACAGGAAGACATGCACCACCG.................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 6 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - -
........CAGGAAGACATGCACCACCGTTGCCTTC.......................................................................................................................................................................................................................................................... 28 6 1.17 1.17 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 0.17 - - - - - - - - - 0.17 - 0.17 - - - - - - 0.33 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TTGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCACCTGAA............................................................................................................................................................ 34 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................GTTGTCTGAGGCAAcg......................................................................................................................... 16 cg 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................AAAAAGGCAGGGAGGGAAGGGTTTATTACT............................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................ATGCTTAGGAATTTCTTCACCTcaa............................................................................................................................................................ 25 caa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCACCTGAATC.......................................................................................................................................................... 34 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CACTGTTGTCTGAGGCAAAA......................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................AGGGTGCTCTGGCTAAGCTGGTGt.................. 24 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................AGACAAGGGTGCTCTGGCTAAGCTGGg.................... 27 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ATGTGGTCACACTGTTGTCTG................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGGAATTTCTTCACCTGAATCAACTATG................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CAACTATGTGGTCACACTGTTGT.................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAG............................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGaaa........................................................................................................................... 27 aaa 1.00 9.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ATGTGGTCACACTGTTGTCT.................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCga........................................................................................................................... 31 ga 1.00 132.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGcggc............................................................................................................................. 29 cggc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........AGGAAGACATGCACCAtc................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................AGACAAGGGTGCTCTGGCTAtaa........................ 23 taa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTac.................................................................................................................................................................. 27 ac 1.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCAtc................................................................................................................................................................ 29 tc 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCACCTGg............................................................................................................................................................. 32 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TTCTTCACCTGAATCAACTATGTGGTCAC............................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCc............................................................................................................................ 30 c 1.00 132.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGa............................................................................................................................. 30 a 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TCACACTGTTGTCTGAGtcaa........................................................................................................................... 21 tcaa 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................AGTGATGCTTAGGAATTTCTTCACCTGAAT........................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................AAGGCAGGGAGGGAAGGGT....................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
........................................................................................................................TTCACCTGAATCAACTATGTGGTC.............................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................AGGGTGCTCTGGCTAAGCTGGTGGAAtt.............. 28 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.............AGACATGCACCACCGTTGCCTTCAaa....................................................................................................................................................................................................................................................... 26 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGGTCACACTGTTGTCTGAG............................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGGTCACACTGTTGTCTGA................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................GACAAGGGTGCTCTGGCTAAGCaagt.................... 26 aagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................AGGGTGCTCTGGCTAAGCTGGTGGAt................ 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAt.......................................................................................................................................................................... 19 t 1.00 75.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCTGAATCAACTATGTGGTCA............................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GTCACACTGTTGTCTGAGGa............................................................................................................................. 20 a 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................ACCTGAATCAACTATGTGa................................................................................................................................................ 19 a 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGT....................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CACCTGAATCAACTATGTGGTCACA........................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TTGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTT.................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................TCTGGCTAAGCTGGTGGAAGCTATTtttt...... 29 tttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AATTTCTTCACCTGAATCAACTATGTGGTCA............................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GTCACACTGTTGTCTGAGGCAAAA......................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAa............................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAAAA......................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAAA.......................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................AGACAAGGGTGCTCTGGCTt........................... 20 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................ACACTGTTGTCTGAGGCAt........................................................................................................................... 19 t 1.00 33.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGac............................................................................................................................. 29 ac 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAAA.......................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................CTGAATCAACTATGTGGT............................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................TGGTCACACTGTTGTCTGAGGta............................................................................................................................ 23 ta 1.00 10.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCACCTtaat........................................................................................................................................................... 33 taat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTgaaa................................................................................................................................................................. 28 gaaa 1.00 3.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................TGGCTAAGCTGGTGGAAGCTATTAGt....... 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TCTGAGGCAAAAAGGCAGGGAGGGAA........................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................GACAAGGGTGCTCTGGCTAAGCTGGTt................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CACCTGAATCAACTATGTGGTCACACTGTTG..................................................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTC................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTG..................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCTGAATCAACTATGTGGTCACACTGatg..................................................................................................................................... 29 atg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................TCTTCACCTGAATCAACTATGTGG................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................TCTGGCTAAGCTGGTGGAAGCTATTtt........ 27 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................TATGTGGTCACACTGTTGTCTGAG............................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AATTTCTTCACCTGAATCAACTATGTGG................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCTGAATCAACTATGTGGTC.............................................................................................................................................. 20 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...GTCCACAGGAAGACATGCACCACta.................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 ta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TTGCCAGTGATGCTTAGGAAT......................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................AGGAATTTCTTCACCTGA............................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTgtct........................................................................................................................................................................... 18 gtct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CACCTGAATCAACTATGTGG................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................TCACCTGAATCAACTATG................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCACCTGA............................................................................................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CACTGTTGTCTGAGGCAAAAAGGCAG................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CTTAGGAATTTCTTCACCTGAAT........................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GTCACACTGTTGTCTGAGGCAAAAAGGCAa................................................................................................................... 30 a 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................TGTGGTCACACTGTTGTCTGAG............................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................ACCTGAATCAACTATGTGG................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGta............................................................................................................................ 30 ta 1.00 29.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................AGACAAGGGTGCTCTGGCTAAGCTGGggt.................. 29 ggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TCACACTGTTGTCTGAGGCc............................................................................................................................ 20 c 1.00 34.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGGAATTTCTTCACCTGAATCAACTATGTGGT............................................................................................................................................... 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................CAAGGGTGCTCTGGCTAAGCTGGTGt.................. 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TGAATCAACTATGTGGTCACACT......................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................GATGCTTAGGAATTTCTTCACCTGt............................................................................................................................................................. 25 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................GTCACACTGTTGTCTGAGGCAg........................................................................................................................... 22 g 1.00 50.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................ATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCta........................................................................................................................... 27 ta 1.00 65.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................TGCCAGTGATGCTTAGGt........................................................................................................................................................................... 18 t 1.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GCCAGTGATGCTTAGGAATT........................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GTGGTCACACTGTTGTCTGA................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................AAGGGTGCTCTGGCTAAGatgt..................... 22 atgt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................CAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGaa............................................................................................................................ 31 aa 1.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................AGGCAAAAAGGCAGGGAGGGAAGGGT....................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................TTGCCAGTGATGCTTAGGAATT........................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CACCACCGTTGCCTTCACACAGGTTAAatc............................................................................................................................................................................................................................................ 30 atc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
....................................................................................................................................AACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGcgg.............................................................................................................................. 28 cgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TGAATCAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 35 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCCACAGGAAGACATGCACCACCGTTGCC............................................................................................................................................................................................................................................................. 29 6 1.00 1.00 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 15 9 0.89 0.89 - - 0.11 - - - - 0.22 - - - - 0.33 - - - - 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCCACAGGAAGACATGCACCACCGTTGC.............................................................................................................................................................................................................................................................. 28 6 0.83 0.83 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCCACAGGAAGACATGCACCACCGTTGCCTT........................................................................................................................................................................................................................................................... 31 6 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CAGGAAGACATGCACCACCGTTGCCTT........................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - -
..................TGCACCACCGTTGCCTTCACACAGGTT................................................................................................................................................................................................................................................. 27 6 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................CTGTTGTCTGAGGCA............................................................................................................................ 15 15 0.33 0.33 - - 0.20 - - - - - - - - - 0.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GCCAGTGATGCTTAGG............................................................................................................................................................................ 16 3 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............AGACATGCACCACCGTTGCCTTCACACAGGT.................................................................................................................................................................................................................................................. 31 6 0.33 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GCCAGTGATGCTTAGGcaa......................................................................................................................................................................... 19 caa 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GACATGCACCACCGTTGCC............................................................................................................................................................................................................................................................. 19 6 0.33 0.33 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCCACAGGAAGACATGCACCACCGTTGCCT............................................................................................................................................................................................................................................................ 30 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - -
....TCCACAGGAAGACATGCACCACCG.................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................ACTGTTGTCTGAGGC............................................................................................................................. 15 15 0.33 0.33 - - 0.07 - - - - 0.07 - 0.13 - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................CTGTTGTCTGAGGCAA........................................................................................................................... 16 4 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................ACACTGTTGTCTGAGG.............................................................................................................................. 16 5 0.20 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................ATTTCTTCACCTGAAT........................................................................................................................................................... 16 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...GTCCACAGGAAGACATGCACCACCGT................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGGTCCACAGGAAGACATGCACCACC................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGCACCACCGTTGCCTTCACACAGGTTAACTCG........................................................................................................................................................................................................................................... 33 6 0.17 0.17 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............ACATGCACCACCGTTGCCTTCACACA..................................................................................................................................................................................................................................................... 26 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - -
..................TGCACCACCGTTGCCTTCACACAGGTTA................................................................................................................................................................................................................................................ 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...GTCCACAGGAAGACATGCACCACC................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCCACAGGAAGACATGCACCACCGTTGt.............................................................................................................................................................................................................................................................. 28 t 0.17 1.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........CAGGAAGACATGCACCACCGTTGCCTTCAC........................................................................................................................................................................................................................................................ 30 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - -
.......ACAGGAAGACATGCACCACCGTTGCCTT........................................................................................................................................................................................................................................................... 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCCACAGGAAGACATGCACCACCcccg............................................................................................................................................................................................................................................................... 27 cccg 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - -
..............GACATGCACCACCGTTGCCTTCACACAGGTT................................................................................................................................................................................................................................................. 31 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - -
........CAGGAAGACATGCACCACCGTTGCCT............................................................................................................................................................................................................................................................ 26 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGCACCACCGTTGCCTTCACACAGG................................................................................................................................................................................................................................................... 25 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........GAAGACATGCACCACCGTTGCCTTC.......................................................................................................................................................................................................................................................... 25 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - -
.TGGTCCACAGGAAGACATGCACCACCGa................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 a 0.17 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GGAAGACATGCACCACCGTTGCCTTCAC........................................................................................................................................................................................................................................................ 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCCACAGGAAGACATGCACCACC................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCCACAGGAAGACATGCACCACCttt................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 ttt 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GGAAGACATGCACCACCGTTGCCT............................................................................................................................................................................................................................................................ 24 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCCACAGGAAGACATGCACCACCGTTa............................................................................................................................................................................................................................................................... 27 a 0.17 1.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - -
......CACAGGAAGACATGCACCACCGTTGC.............................................................................................................................................................................................................................................................. 26 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTGGTCCACAGGAAGACATGCACCACCGTTGCCTTCACACAGGTTAACTCGTGAGTATTTATGCGCCCACACCTTACCCTCACAGCTTTGGACCATTTGCCAGTGATGCTTAGGAATTTCTTCACCTGAATCAACTATGTGGTCACACTGTTGTCTGAGGCAAAAAGGCAGGGAGGGAAGGGTTTATTACTCCTGCTTCTTAAACAGTAACGAGACCTTCCTCATTGCCTTTCCAGGGAAGACAAGGGTGCTCTGGCTAAGCTGGTGGAAGCTATTAGGACCAATT
...............................................................................................((((((........(((((..........)))))..((((...(((....))).)))).....))))))..........................................................................................................................
............................................................................................93......................................................................165.......................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
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Testes Data. (testes) 		SRR363963(GSM822765)
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cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesKO8()
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small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
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16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR037898(GSM510434)
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Mili-IP. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR034119(GSM466729)
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25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR037899(GSM510435)
ovary_rep4. (ovary) 		SRR029040(GSM433292)
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small RNA cloning by length. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR037896(GSM510432)
ovary_rep1. (ovary) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
................CATGCACCACCGTTGCCTTCACACAGGTT................................................................................................................................................................................................................................................. 29 6 1.17 1.17 - - - - - 1.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................AGGGTTTATTACTCCTgtat............................................................................................ 20 gtat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ACATGCACCACCGTTGCCTTCACACAt..................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................GGAAGACAAGGGTGCTCTGGCTAAgaga.......................... 28 gaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................ATGCACCACCGTTGCCTTCACACAGGTa.................................................................................................................................................................................................................................................. 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................GGAAGACAAGGGTGCTCTGGCTAgagc........................... 27 gagc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.........................................................................TTACCCTCACAGCTTTGGACCATTTGC.......................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................ATGCACCACCGTTGCCTTCACACAG.................................................................................................................................................................................................................................................... 25 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CACCACCGTTGCCTTCACACAGGTTA................................................................................................................................................................................................................................................ 26 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGCACCACCGTTGCCTTCACACAGGT.................................................................................................................................................................................................................................................. 26 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CATGCACCACCGTTGCCTTCACACAGGT.................................................................................................................................................................................................................................................. 28 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GACATGCACCACCGTTGCCTTCACA....................................................................................................................................................................................................................................................... 25 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CATGCACCACCGTTGCCTTCACACAGGTTA................................................................................................................................................................................................................................................ 30 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................GCACCACCGTTGCCTTCACACAGGTTA................................................................................................................................................................................................................................................ 27 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CACCGTTGCCTTCACACAGGTTAACTC............................................................................................................................................................................................................................................ 27 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............ACATGCACCACCGTTGCCTTCACACAGG................................................................................................................................................................................................................................................... 28 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............GACATGCACCACCGTTGCCTTCACACA..................................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ACCGTTGCCTTCACACAGGTTAACTCG........................................................................................................................................................................................................................................... 27 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............CATGCACCACCGTTGCCTTCACACAGGTa.................................................................................................................................................................................................................................................. 29 a 0.17 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGCACCACCGTTGCCTTCACACAGGTa.................................................................................................................................................................................................................................................. 27 a 0.17 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -