Gene: Med22

ID: uc008iwd.1_intron_0_0_chr2_26761514_r.3p

SPECIES: mm9

chr2:26761464 26761713 -

(1) OTHER.ip

(9) OTHER.mut

(8) PIWI.ip

(1) PIWI.mut

(1) TDRD1.ip

(35) TESTES

Sense strand

GTCACATGGCCTGTTGACACCACCTTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGCTTAGCAGAGGGGCCAGCACAGAGGAGAAGAAGGGGAGGCAGTCAGGTGATGTTCATTTCTTAACTCTGCATCTGTCTTGCTTTCCCCTCCCTGGCTTTCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTCCTGGGGGTTTCTTGTGGTGGCAAAGCTCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTACTGGA ......................................................................................................(((((...............)))))....(((((..((.......(((........))).((((((.........)))))).......)).))))).................................................... ......................................................................................................103..............................................................................................200................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)	GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)	SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)	SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)	SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)	SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)	mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)
................................................................................................................................................................................................................TCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTG................	26	1	134.00	134.00	49.00	34.00	22.00	23.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................TCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTGT...............	27	1	122.00	122.00	38.00	46.00	18.00	16.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-
.........................TTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAC......................................................................................................................................................................................................	27	1	96.00	96.00	32.00	34.00	10.00	8.00	1.00	-	5.00	-	3.00	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-
..........................TCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACC.....................................................................................................................................................................................................	27	1	78.00	78.00	29.00	27.00	9.00	9.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAC......................................................................................................................................................................................................	28	1	53.00	53.00	16.00	20.00	3.00	4.00	-	2.00	1.00	-	3.00	-	-	-	1.00	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................TTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACC.....................................................................................................................................................................................................	28	1	39.00	39.00	13.00	10.00	5.00	5.00	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............TGACACCACCTTTCTTTGGATGCAAGAG................................................................................................................................................................................................................	28	1	32.00	32.00	-	-	-	-	-	-	12.00	-	9.00	-	5.00	2.00	-	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGC...................................................................................................................................................................................................	27	1	30.00	30.00	12.00	9.00	2.00	3.00	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................TGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGC...................................................................................................................................................................................................	25	1	22.00	22.00	5.00	4.00	1.00	-	-	2.00	4.00	-	2.00	-	-	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................AAGCTCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACC........................	29	1	19.00	19.00	2.00	-	2.00	1.00	-	-	8.00	-	1.00	-	1.00	1.00	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................TCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGC.....................	28	1	15.00	15.00	4.00	6.00	1.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................TCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGC...................................................................................................................................................................................................	29	1	13.00	13.00	6.00	1.00	1.00	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................TAATGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTT......	26	1	13.00	13.00	-	-	-	-	2.00	3.00	1.00	3.00	1.00	1.00	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTGTG..............	26	1	12.00	12.00	1.00	-	-	1.00	2.00	2.00	-	4.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-
.......................................................................................................................................................................TGTCACTCCTGGGGGTTTCTTGTGGT.........................................................	26	1	11.00	11.00	-	-	-	-	8.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGCT..................................................................................................................................................................................................	28	1	9.00	9.00	3.00	3.00	1.00	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................TCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGCCT...................	30	1	9.00	9.00	3.00	4.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................TTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAA.......................................................................................................................................................................................................	26	1	8.00	8.00	5.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................TGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGCT..................................................................................................................................................................................................	26	1	8.00	8.00	1.00	3.00	-	-	1.00	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................TGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTACTG..	27	1	8.00	8.00	-	-	-	-	2.00	-	-	5.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................TGTCACTCCTGGGGGTTTCTTGTGGTG........................................................	27	1	8.00	8.00	-	-	-	-	7.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................TGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGCTT.................................................................................................................................................................................................	27	1	8.00	8.00	3.00	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............TGACACCACCTTTCTTTGGATGCAAGAGT...............................................................................................................................................................................................................	29	1	7.00	7.00	-	-	-	-	2.00	1.00	1.00	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTGTGT.............	27	1	7.00	7.00	2.00	2.00	1.00	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................TTCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTCCTG........................................................................	27	1	7.00	7.00	-	-	-	-	-	4.00	-	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................TCATTTCTTAACTCTGCATCTGTCTTG....................................................................................................................	27	1	7.00	7.00	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	2.00	-	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................TCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCG....................................................................................................................................................................................................	28	1	6.00	6.00	1.00	-	3.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................TCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTCCTG........................................................................	26	1	6.00	6.00	-	-	-	-	-	3.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................TTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGC...................................................................................................................................................................................................	30	1	6.00	6.00	1.00	-	1.00	1.00	-	-	1.00	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................TTGTGGTGGCAAAGCTCAAGTCTCTGC.....................................	27	1	6.00	6.00	-	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	2.00	-	-	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................TCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGCC....................	29	1	6.00	6.00	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................TGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTACTGGA	29	1	5.00	5.00	1.00	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................CAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGCCT...................	29	1	5.00	5.00	2.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................TCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAC......................................................................................................................................................................................................	26	1	5.00	5.00	3.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGA........................................................................................................................................................................................................	26	1	5.00	5.00	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTGTGTG............	28	1	5.00	5.00	-	-	-	-	-	1.00	1.00	2.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAA.......................................................................................................................................................................................................	27	1	5.00	5.00	3.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................TCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTCCTGt.......................................................................	27	t	4.00	6.00	-	-	-	-	-	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................TGGGGGTTTCTTGTGGTGGCAAAGCTC...............................................	27	1	4.00	4.00	-	2.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................TTGTGGTGGCAAAGCTCAAGTCTCTG......................................	26	1	4.00	4.00	-	-	-	-	2.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................CAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGCC....................	28	1	4.00	4.00	3.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................CAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGC.....................	27	1	4.00	4.00	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGC...................................................................................................................................................................................................	31	1	4.00	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	4.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................TCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTG......................	27	1	4.00	4.00	-	3.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................TAACTCTGCATCTGTCTTGCTTTCCCC............................................................................................................	27	1	4.00	4.00	-	1.00	-	-	1.00	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTGT...............	25	1	3.00	3.00	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................CACCTTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCC...........................................................................................................................................................................................................	27	1	3.00	3.00	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACt.....................................................................................................................................................................................................	29	t	3.00	53.00	-	-	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................TGCAAGAGTGGCCAGAACCGCTTAGC..............................................................................................................................................................................................	26	1	3.00	3.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................TTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAacgc...................................................................................................................................................................................................	30	acgc	3.00	8.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACC.....................................................................................................................................................................................................	29	1	3.00	3.00	1.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................TGCATCTGTCTTGCTTTCCCCTCCCTG......................................................................................................	27	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................AAGCTCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCT.......................	30	1	3.00	3.00	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................TTAACTCTGCATCTGTCTTGCTTTCC..............................................................................................................	26	1	3.00	3.00	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................CACCTTTCTTTGGATGCAAGAGTGGC............................................................................................................................................................................................................	26	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................TTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGCT..................................................................................................................................................................................................	27	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................AGCTCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACC........................	28	1	3.00	3.00	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAa......................................................................................................................................................................................................	28	a	3.00	5.00	-	1.00	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................TAGCAGAGGGGCCAGCACAGAGGAGA........................................................................................................................................................................	26	1	3.00	3.00	-	2.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTGTGTGt...........	29	t	3.00	5.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................TTCTTGTGGTGGCAAAGCTCAAGTCTC........................................	27	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................TCTTAACTCTGCATCTGTCTTGCTTTC...............................................................................................................	27	1	3.00	3.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-
..............................TGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGCa..................................................................................................................................................................................................	26	a	3.00	22.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................TAACTCTGCATCTGTCTTGCTTTCCCCT...........................................................................................................	28	1	3.00	3.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................TCCTGTCACTCCTGGGGGTTTCTTGTG...........................................................	27	1	3.00	3.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................TTAACTCTGCATCTGTCTTGCTTTCCCC............................................................................................................	28	1	3.00	3.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............TGACACCACCTTTCTTTGGATGCAAGA.................................................................................................................................................................................................................	27	1	3.00	3.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................TGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTACTGG.	28	1	3.00	3.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................................................TCTCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTC..................	26	1	3.00	3.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............TTGACACCACCTTTCTTTGGATGCAAGA.................................................................................................................................................................................................................	28	1	3.00	3.00	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................AAGCTCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGAC.........................	28	1	3.00	3.00	2.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................TCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAac.....................................................................................................................................................................................................	27	ac	3.00	0.00	-	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................CACTCCTGGGGGTTTCTTGTGGTGGC......................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................TGGATGCAAGAGTGGCCAGAAacgc...................................................................................................................................................................................................	25	acgc	2.00	0.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................TGGCTTTCCTCTGCCTGCTCCTGTCACT............................................................................	28	1	2.00	2.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAt......................................................................................................................................................................................................	28	t	2.00	5.00	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................TAGCAGAGGGGCCAGCACAGAGGAGt........................................................................................................................................................................	26	t	2.00	0.00	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................CTTAGCAGAGGGGCCAGCACAGA.............................................................................................................................................................................	23	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................TGTCACTCCTGGGGGTTTCTTGTGG..........................................................	25	1	2.00	2.00	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGct.......................................................................................................................................................................................................	27	ct	2.00	2.00	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAG.........................................................................................................................................................................................................	25	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................TGGTGGCAAAGCTCAAGTCTCTGCGA...................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................CTCCTGTCACTCCTGGGGGTTTCTTGTG...........................................................	28	1	2.00	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCcct..................................................................................................................................................................................................	28	cct	2.00	0.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................TTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGA........................................................................................................................................................................................................	25	1	2.00	2.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................CTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACC.....................................................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................TAATGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTA.....	27	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................AAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGCCT...................	28	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................TTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGCTT.................................................................................................................................................................................................	28	1	2.00	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................TGTGGTGGCAAAGCTCAAGTCTCTGCGt...................................	28	t	2.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................ACCGCTTAGCAGAGGGGCCAGCACAG..............................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................TCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTGaa..............	28	aa	2.00	134.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................TAACTCTGCATCTGTCTTGCTTTCCC.............................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................TCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTGTG..............	28	1	2.00	2.00	-	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................TGTTCATTTCTTAACTCTGCATCTGTCT......................................................................................................................	28	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................TCATTTCTTAACTCTGCATCTGT........................................................................................................................	23	1	2.00	2.00	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................TCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTCT.................	25	1	2.00	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TGGCCTGTTGACACCACCTTTCTTTGGATGC.....................................................................................................................................................................................................................	31	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................GCTAATGACCTGCCTCTGTGTGAAGCT.......	27	1	2.00	2.00	-	-	-	-	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................AATGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTACT...	28	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................TTCTTAACTCTGCATCTGTCTTGCTTTC...............................................................................................................	28	1	2.00	2.00	-	-	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................CGCTTAGCAGAGGGGCagct..................................................................................................................................................................................	20	agct	2.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............TGACACCACCTTTCTTTGGATGCAAG..................................................................................................................................................................................................................	26	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................CAGTCAGGTGATGTTCATTTCTTAACTC.................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................TGGCTTTCCTCTGCCTGCTCCTGTCACa............................................................................	28	a	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................TGTCACTCCTGGGGGTTTCTTGTGGTGt.......................................................	28	t	1.00	8.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................CTGCCTGCTCCTGTCACTCCTGGGGG....................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................TGCCTGCTCCTGTCACTCCTGGGGGT...................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................TGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTACTGGt	29	t	1.00	3.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................ATTTCTTAACTCTGCATCTGTCTTGCTT.................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................CTCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTG................	27	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................CACCACCTTTCTTTGGATGCAAGAGT...............................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................TCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTt................	26	t	1.00	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................AGCAGAGGGGCCAGCACAGAGGA..........................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACga....................................................................................................................................................................................................	26	ga	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................................................................ATGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTAC....	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................TTCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTCCT.........................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................TCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTC..................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................TGGGGGTTTCTTGTGGTGGCAAAGCT................................................	26	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................AAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGCC....................	27	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................TCTTTGGATGCAAGAGTGGCC...........................................................................................................................................................................................................	21	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGCTT.................................................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................TGGCTTTCCTCTGCCTGCTCCTGTCAC.............................................................................	27	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................TCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTGa...............	27	a	1.00	134.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................TTGTGGTGGCAAAGCTCAAGTCTCTGCca...................................	29	ca	1.00	6.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................TTTCTTAACTCTGCATCTGTCTTGCTTTC...............................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................................TCTGCGAAGCTAATGACCTGCC....................	22	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................TTGTGGTGGCAAAGCTCAAGTCTCTGCt....................................	28	t	1.00	6.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................TTGTGGTGGCAAAGCTCAAGTCTCTtc.....................................	27	tc	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................GTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTCT.................	28	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................CTCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTG......................	28	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................GAAGAAGGGGAGGCAGTCAGGgga..................................................................................................................................................	24	gga	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................TTAGCAGAGGGGCCAGCACAGAGGA..........................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................................TTCTTGTGGTGGCAAAGCTCAAGTCT.........................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................................................................................TCTCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTCT.................	27	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TGGCCTGTTGACACCACCTTTCTTTG..........................................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................................................................CGAAGCTAATGACCTGCCTCTGTGTG............	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................CACCACCTTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCC...........................................................................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................TCTTAACTCTGCATCTGTCTTGCTT.................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................GGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGC...................................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................TCTTAACTCTGCATCTGTCTTGCTTTCC..............................................................................................................	28	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGATGTTCATTTCTTAACTCTGCATCTG.........................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................CTTAACTCTGCATCTGTCTTGCTTTCCC.............................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................CCACCTTTCTTTGGATGCAAGAGTGGC............................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............GACACCACCTTTCTTTGGATGCAAGAG................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................TTGTGGTGGCAAAGCTCAAGTCTCTGCGA...................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......TGGCCTGTTGACACCACCTTTCTT............................................................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................TTCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTC...........................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................GCAAAGCTCAAGTCTCTGCGAAGCTAA.............................	27	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................GCAAGAGTGGCCAGAACCGCTTggt..............................................................................................................................................................................................	25	ggt	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................TCATTTCTTAACTCTGCATCTGTCTTGC...................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................TCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTCCTGGtt.....................................................................	29	tt	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................TGGTGGCAAAGCTCAAGTCTCTGCGAAGC................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................TTGTGGTGGCAAAGCTCAAGTCTCTGg.....................................	27	g	1.00	4.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................TAATGACCTGCCTCTGTGTGAAGCT.......	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................GTCAGGTGATGTTCATTTCTTAACTCT................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................TTGTGGTGGCAAAGCTCAAGTCTCTGCGAAGC................................	32	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................TGGGGGTTTCTTGTGGTGGCAAAG..................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................CAGTCAGGTGATGTTCATTTCTTAACT..................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................TCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTCCTGGt......................................................................	28	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................................................................................................................ACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTACTGGA	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................TGCCTGCTCCTGTCACTCCTGG.......................................................................	22	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAacgc...................................................................................................................................................................................................	31	acgc	1.00	5.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................TCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGCt....................	29	t	1.00	15.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................TGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTACc...	26	c	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAac.....................................................................................................................................................................................................	29	ac	1.00	5.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGCTAATGACCTGCCTCcgtg..............	26	cgtg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................TGTCACTCCTGGGGGTTTCTTGTGtttt.......................................................	28	tttt	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................TCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGCT..................................................................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................TCATTTCTTAACTCTGCATCTGTCTTGCTT.................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................GGGTTTCTTGTGGTGGCAAAGCTCA..............................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................TAGCAGAGGGGCCAGCACAGAGGAGAAGA.....................................................................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................TTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAacgc...................................................................................................................................................................................................	26	acgc	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................TGTCACTCCTGGGGGTTTCTTGTGtt.........................................................	26	tt	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................TCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACaa....................................................................................................................................................................................................	28	aa	1.00	5.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................GATGTTCATTTCTTAACTCT................................................................................................................................	20	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................TCATTTCTTAACTCTGCATCTGTCTT.....................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................CAGCACAGAGGAGAAGAAGGGGAGG.............................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................TGATGTTCATTTCTTAACTCTGCATCTGT........................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................................................................................................TCCCTGGCTTTCCTCTGCCTGCTCCTGT................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................TAGCAGAGGGGCCAGCACAG..............................................................................................................................................................................	20	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................TGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGCg..................................................................................................................................................................................................	26	g	1.00	22.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................GCAGAGGGGCCAGCACAGAGGAGAA.......................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................TAGCAGAGGGGCCAGCACAGAGaaa.........................................................................................................................................................................	25	aaa	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................TGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGg...................................................................................................................................................................................................	25	g	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................TTTCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTCC..........................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
....................................................................................................................................................................TCCTGTCACTCCTGGGGGTTTCTTGTt...........................................................	27	t	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................CCTTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAa......................................................................................................................................................................................................	30	a	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................................TCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGta....................	29	ta	1.00	4.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................TGGCTTTCCTCTGCCTGCTCCTGTCAt.............................................................................	27	t	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................CCTCTGCCTGCTCCTGTCACTCCTGa.......................................................................	26	a	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................TTAGCAGAGGGGCCAGCACAGAGGAG.........................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................................................TGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTGcgtg............	28	cgtg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................CCTTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCC...........................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................TCTGCCTGCTCCTGTCACTCCTGGG......................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACagc...................................................................................................................................................................................................	27	agc	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................................................................TGTCTTGCTTTCCCCTCCCTGGCTTTCC...............................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................TGTCACTCCTGGGGGTTTCTTGTG...........................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAacgc...................................................................................................................................................................................................	27	acgc	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................................................................................................................................................AGCTCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGAC.........................	27	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................AACCGCTTAGCAGAGGGGCCAGCA.................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGt...................................................................................................................................................................................................	27	t	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................TGGGGGTTTCTTGTGGTGGCAAAGttc...............................................	27	ttc	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................................TGTCACTCCTGGGGGTTTCTTGTtgtg........................................................	27	tgtg	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................CCTTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCA..........................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................TTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAaaac......................................................................................................................................................................................................	27	aaac	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................AATGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTcct...	28	cct	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................GAACCGCTTAGCAGAGGGGCCAGC..................................................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................TTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACt.....................................................................................................................................................................................................	28	t	1.00	96.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................TCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAacc.......................................................................................................................................................................................................	25	acc	1.00	0.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........TGTTGACACCACCTTTCTTTGGATGCA....................................................................................................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................TGTTCATTTCTTAACTCTGCATCTGTC.......................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................TAACTCTGCATCTGTCTTGCTTTCCCCTC..........................................................................................................	29	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAgcga...................................................................................................................................................................................................	27	gcga	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................TCCTGGGGGTTTCTTGTGGTGGC......................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................TCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTCCTGa.......................................................................	27	a	1.00	6.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................AAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTC..................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................ACCTTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCC...........................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................TAATGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTACTGt.	31	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................TAGCAGAGGGGCCAGCACAGAGG...........................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................TTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGtacc.....................................................................................................................................................................................................	28	tacc	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................TGGATGCAAGAGTGGCCAGAAC......................................................................................................................................................................................................	22	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................TCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTCCTaaa......................................................................	28	aaa	1.00	0.00	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAA.......................................................................................................................................................................................................	23	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................TTCATTTCTTAACTCTGCATCTGTCTTGC...................................................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................AAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGC.....................	26	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................................................................CTGCCTCTGTGTGAAGCTTACT...	22	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........TGTTGACACCACCTTTCTTTGGATGt.....................................................................................................................................................................................................................	26	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................................................................GCACAGAGGAGAAGAAGGGGAGGCAG..........................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................CACCACCTTTCTTTGGATGCAAGAGTGG.............................................................................................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................CTTTCTTTGGATGCAAGAGT...............................................................................................................................................................................................................	20	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................................TGGCAAAGCTCAAGTCTCTGCGAAGC................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................CATTTCTTAACTCTGCATCTGTCTTGC...................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................ACTCCTGGGGGTTTCTTGTGGTGGC......................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................................................................AGAAGAAGGGGAGGCAGTCAGGTG...................................................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................TTCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTgctg........................................................................	27	gctg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................CAAAGCTCAAGTCTCTcga....................................	19	cga	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................TGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTACT...	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................GAACCGCTTAGCAGAGGGGCCAGCAC................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGCT..................................................................................................................................................................................................	32	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
......................CCTTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAC......................................................................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................................................................................................GGGGGTTTCTTGTGGTGGCAAAGCTC...............................................	26	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................TCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTtctg........................................................................	26	tctg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................................................................................................................................................................CAAAGCTCAAGTCTCTGCG....................................	19	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................................................................................AATGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTACa...	28	a	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................CCTCTGCCTGCTCCTGTCACTCCTG........................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................................................................................................................TGGGGGTTTCTTGTGGTGGCAAAGC.................................................	25	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................TTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGcac......................................................................................................................................................................................................	27	cac	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................TGCCTGCTCCTGTCACTCCTGGGGGTT..................................................................	27	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................TCCCCTCCCTGGCTTTCCTCTGCCTGCTC....................................................................................	29	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................CTCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGC.....................	29	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................GGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGCTTAt...............................................................................................................................................................................................	28	t	1.00	0.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................................................................................................................................................................................TGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTA.....	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................TTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCG....................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................TTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCG....................................................................................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................................................................................................................................................TTCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTCCTGa.......................................................................	28	a	1.00	7.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.......................CTTTCTTTGGATGCAAGAGTGGtcat.........................................................................................................................................................................................................	26	tcat	1.00	0.00	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................................TAATGACCTGCCTCTGTGTGAAGC........	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................TTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCG....................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................TCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAAacgc...................................................................................................................................................................................................	29	acgc	1.00	0.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...............................GGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGCTT.................................................................................................................................................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................................................................................................................................CAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACC........................	24	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................................................................................................................................AGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGCCT...................	27	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................AAGCTCAAGTCTCTGC.....................................	16	5	0.20	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.20	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..................................................................................................................................................................................GGGGTTTCTTGTGGTG........................................................	16	19	0.05	0.05	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.05

Antisense strand

GTCACATGGCCTGTTGACACCACCTTTCTTTGGATGCAAGAGTGGCCAGAACCGCTTAGCAGAGGGGCCAGCACAGAGGAGAAGAAGGGGAGGCAGTCAGGTGATGTTCATTTCTTAACTCTGCATCTGTCTTGCTTTCCCCTCCCTGGCTTTCCTCTGCCTGCTCCTGTCACTCCTGGGGGTTTCTTGTGGTGGCAAAGCTCAAGTCTCTGCGAAGCTAATGACCTGCCTCTGTGTGAAGCTTACTGGA ......................................................................................................(((((...............)))))....(((((..((.......(((........))).((((((.........)))))).......)).))))).................................................... ......................................................................................................103..............................................................................................200................................................	Size	Perfect hit	Total Norm	Perfect Norm	SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)	SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)	SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)	SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)	SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)	SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)	SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)	SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)	SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)	SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)	SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)	SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)	SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)	SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)	GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)	SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)	GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)	SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)	SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)	SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)	mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)	mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)	SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)	SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)	SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)	mjTestesWT2() Testes Data. (testes)	GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)	mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)
.....................................AAGAGTGGCCAGAACCGCTTAGCAGA...........................................................................................................................................................................................	26	1	3.00	3.00	-	2.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................................................................................................CTTGTGGTGGCAAAGCTCAAGTCTC........................................	25	1	2.00	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	2.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...................................................CCGCTTAGCAGAGGGGCCAGCACAGAGGA..........................................................................................................................................................................	29	1	2.00	2.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................GAGGCAGTCAGGTGATGTTCATTTCTTA.....................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..............................................................GCCAGCACAGAGGgacg...........................................................................................................................................................................	17	gacg	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................................GTTCATTTCTTAACTCTGCATCTG.........................................................................................................................	24	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
........................................................................................................................................................................................................................GCTAATGACCTGCCTCTGTGTGAAGC........	26	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........................................................................................................................................................TCTGCCTGCTCCTGTCACTCCTGGGG.....................................................................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.....................................................................................................................................................................................................AAGCTCAAGTCTCTGCGAAGCTAATG...........................	26	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
..........................................................................................AGGCAGTCAGGTGATGTTCATTTCTTA.....................................................................................................................................	27	1	1.00	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
............................................................................................GCAGTCAGGTGATGTTCATTTCTTAACT..................................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.................................................................................................CAGGTGATGTTCATTTCTTAACTCTGCA.............................................................................................................................	28	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.........................................................................................AGGCAGTCAGGTGATGTTCATTTCTTAt.....................................................................................................................................	28	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
...........GTTGACACCACCTTTCTTTGGATGCAt....................................................................................................................................................................................................................	27	t	1.00	0.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-
...................CCACCTTTCTTTGGATGCAAGAGTG..............................................................................................................................................................................................................	25	1	1.00	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
................................................................................GAAGAAGGGGAGGCAGTCAGGTGATGTTCA............................................................................................................................................	30	1	1.00	1.00	-	1.00	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
.............................................................GAGGGGCCAGCACAGAGGA..........................................................................................................................................................................	19	2	0.50	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	0.50	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-