| Gene: Phpt1 | ID: uc008isp.1_intron_1_0_chr2_25429833_r | SPECIES: mm9 | 
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| 
  (8)  OTHER.mut  | 
  
  
  (1)  OVARY  | 
  
  
  (7)  PIWI.ip  | 
  
  
  (4)  PIWI.mut  | 
  
  
  (1)  TDRD1.ip  | 
  
  
  (40)  TESTES  | 
  
  
| GAAGGAGTGCAAGGAAATCGTGCGTGGCTACAAATGGGCTGAGTACCACGGTGAGGGCGGGGCCTCTGTGCCCTTGGAGGCGGGACGAAGGTTAGGGGCGGGGCCTTACAGTTGCTGGTAGCGGAGTAGTGACTGCTAATATATCATGACTTGTACTAACACATAGCTAGGCTGACCTAGAAACGTCGGGATTTGGGCAGAAAGGAGTGCCATGACTGGGATCTTCTTAATCCCGTCTCTCACTTCGAAAGTGTCTTCTTCCTCCCGTTCATCTTTTTGCCAGCGGGGGAAGGGCTCATCTTCTCTGGGAAAAAGACCACCAAGAGCTGGAGCTTCTGACCCCATATCCAGCCCTAGAGTTCAGTGTGGGGCCAACAAGGGCGGCTAGGGCATATCCTGAGGCCACTCTCCCCACCCCAGCGGACATCTATGACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAAGGAATGGCTATGAC ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((.((((((...............)))))).))..........((((((......((((.((((.(((.....)))..)))).))))))))))....................................................... ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................321................................................................................................420................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)  | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)  | SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary)  | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)  | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)  | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)  | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)  | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)  | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)  | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAAG............. | 27 | 1 | 38.00 | 38.00 | 14.00 | 8.00 | 3.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | 4.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 
| ............................TACAAATGGGCTGAGTACCACGcgga................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | cgga | 29.00 | 0.00 | 14.00 | 6.00 | 1.00 | - | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................TACAAATGGGCTGAGTACCACGGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 19.00 | 19.00 | 4.00 | 3.00 | 1.00 | 4.00 | 5.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................TACAAATGGGCTGAGTACCACGcgg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | cgg | 15.00 | 0.00 | 1.00 | 2.00 | 4.00 | 4.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAA.............. | 26 | 1 | 12.00 | 12.00 | 5.00 | 4.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................CCCTTGGAGGCGtggg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 16 | tggg | 7.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAAGG............ | 28 | 1 | 7.00 | 7.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................AAATGGGCTGAGTACCACGcgga................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 23 | cgga | 6.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................TAGAAACGTCGGGATTTGGGCAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................TAGAAACGTCGGGATTTGGGCAGAA............................................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 6.00 | 6.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................GAAACGTCGGGATTTGGGCAGAAAG.......................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAAGt............ | 28 | t | 3.00 | 38.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................AGAAACGTCGGGATTTGGGCAGAAAG.......................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .AAGGAGTGCAAGGAAATCGTGCGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................TACAAATGGGCTGAGTACCACGGgt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | gt | 2.00 | 0.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAAG............. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......TGCAAGGAAATCGTGCGTGGCTACAAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 
| ........................................................................................................................................TAATATATCATGACTTGTACTAACACA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................TGACCTAGAAACGTCGGGATTTGGGCA............................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......TGCAAGGAAATCGTGCGTGGCTACAA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................TGGGCTGAGTACCACGGTGAGGGCGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................AGAAACGTCGGGATTTGGGCAGAAAGGA........................................................................................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................TAGCTAGGCTGACCTAGAAACGTCGGGA....................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............GGAAATCGTGCGTGGCTACAAATGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................TACAGTTGCTGGTAGCGGAGTAGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................TACAAATGGGCTGAGTACCACGGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGGCGAGCTGCAAAGGAATGGCTAT... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................TACAGTTGCTGGTAGCGGA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATGACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCA................ | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAAGG............ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................AGGCTGACCTAGAAACGTCGG......................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...GGAGTGCAAGGAAATCGTGCGTGGCTA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................TACAAATGGGCTGAGTACCACGGgtt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | gtt | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTTTTGCCAGCGGGGGAAGGGCTC............................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................TACAAATGGGCTGAGTACCACGcggt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | cggt | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATGACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAA.............. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCGAGCTGCAAAGGAATGGCTt.... | 24 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCACCAAGAGCTGGAGCTTCTGAC.................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATGACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAAGt............ | 30 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 
| .....................................................................................................................................................................................AACGTCGGGATTTGGGCAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................................................................TCATCTTTTTGCCAGCGGGGGAAGGGCTC............................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................GCTACAAATGGGCTGAGTACCAC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAAAAAGACCACCAAGAGCTGGAGC......................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................TACAAATGGGCTGAGTACCACGGgtta............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | gtta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........AGGAAATCGTGCGTGGCTACAAATGGGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................................................................................................................................CAGAAAGGAGTGCCATGACTGGGAT........................................................................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................TGCGTGGCTACAAATGGGCTGAGTACC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 
| ............................TACAAATGGGCTGAGTACCACGGTc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | c | 1.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAAtt............ | 28 | tt | 1.00 | 12.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................TGCTGGTAGCGGAGTAGTGACTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......TGCAAGGAAATCGTGCGTGGCTACA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACATCTATGACAAAGTGTCAGGCGAGCT................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................TAGAAACGTCGGGATTTGGGCAGAAt........................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | t | 1.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACAAAGTGTCAGGCGAGCT................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................TACAAATGGGCTGAGTACCACacgg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 25 | acgg | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAACAAGGGCGGCTAGGGCATATC.......................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......TGCAAGGAAATCGTGCGTGGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCCAACAAGGGCGGtgg................................................................................... | 18 | tgg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................AGGCTGACCTAGAAACGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAAGGA........... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGAGTTCAGTGTGGGGCCAACAAa........................................................................................... | 25 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTATGACAAAGTGTCAGGCGAGCTG.................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAAGAGCTGGAGCTTCTGACCCCATATCC......................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................GGCTACAAATGGGCTGAGTACCACGcgg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | cgg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCCTAGAGTTCAGTGTGGGGCCAAC.............................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................AATGGGCTGAGTACCACGGTGAGGGa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................ACGAAGGTTAGGGGatcg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 18 | atcg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................GCGTGGCTACAAATGGGCTGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAAGta........... | 29 | ta | 1.00 | 38.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............GGAAATCGTGCGTGGCTACAAATG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................GGCTACAAATGGGCTGAGTACCACGc................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | c | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...GGAGTGCAAGGAAATCGTGCGTGGCT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................TACAAATGGGCTGAGTACCACGGTGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........AGGAAATCGTGCGTGGC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCcaag............. | 26 | caag | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................AGTGCCATGACTGGGATCTTCTTA................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......TGCAAGGAAATCGTGCGTGGCTACAAAT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....AGTGCAAGGAAATCGTGCGTGGCTACA...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......TGCAAGGAAATCGTGCGTGGCTAtaaa.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | taaa | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................TACAAATGGGCTGAGTACCACGGg.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 24 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................TGGCTACAAATGGGCTGAGTACCACGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................TAGCTAGGCTGACCTAGAAACGTCGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................GAAACGTCGGGATTTGGGCAGAAAGGt........................................................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | t | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................................................................TAATCCCGTCTCTCACTTCGAAAGTGTC....................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................................GACTGCTAATATcgg..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 15 | cgg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................GTGCGTGGCTACAAATGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 18 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................AAACGTCGGGATTTGGGCAGAAAGGA........................................................................................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCAGTGTGGGGCCAACAAGGGCGGCT.................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAAt............. | 27 | t | 1.00 | 12.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAgt............. | 27 | gt | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................TATATCATGACTTGTACTAACACATAGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................GAAACGTCGGGATTTGGGCAGAAAGG......................................................................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................ATGGGCTGAGTACCACGGTGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................GTGCGTGGCTACAAATGGGCTGAGTAC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......GTGCAAGGAAATCGTGCGTGGCTAC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| GAAGGAGTGCAAGGAAATCGTGCGTGGCTACAAATGGGCTGAGTACCACGGTGAGGGCGGGGCCTCTGTGCCCTTGGAGGCGGGACGAAGGTTAGGGGCGGGGCCTTACAGTTGCTGGTAGCGGAGTAGTGACTGCTAATATATCATGACTTGTACTAACACATAGCTAGGCTGACCTAGAAACGTCGGGATTTGGGCAGAAAGGAGTGCCATGACTGGGATCTTCTTAATCCCGTCTCTCACTTCGAAAGTGTCTTCTTCCTCCCGTTCATCTTTTTGCCAGCGGGGGAAGGGCTCATCTTCTCTGGGAAAAAGACCACCAAGAGCTGGAGCTTCTGACCCCATATCCAGCCCTAGAGTTCAGTGTGGGGCCAACAAGGGCGGCTAGGGCATATCCTGAGGCCACTCTCCCCACCCCAGCGGACATCTATGACAAAGTGTCAGGCGAGCTGCAAAGGAATGGCTATGAC ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................((.((((((...............)))))).))..........((((((......((((.((((.(((.....)))..)))).))))))))))....................................................... ................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................321................................................................................................420................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes)  | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | mjTestesWT1() Testes Data. (testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes)  | mjTestesWT3() Testes Data. (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)  | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes)  | SRR037897(GSM510433) ovary_rep2. (ovary)  | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)  | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes)  | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)  | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes)  | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)  | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes)  | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)  | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ........................TGGCTACAAATGGGCTGAGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCCCTAGAGTTCAGa.......................................................................................................... | 17 | a | 2.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................................................GTCTTCTTCCTCCCGTTCATCTTTTTGC.............................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCAGGCGAgcga...................... | 15 | gcga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCGGCTAGGGCATtgga............................................................................. | 18 | tgga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............GGAAATCGTGCGTGGCTACAAATGGGCT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..............................................................................................................................................................................................................................................................CTTCTTCCTCCCGTTCAT...................................................................................................................................................................................................... | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |