(8)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(7)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(35)
TESTES

Sense strand
AATTACAGGCTGTTTTGGAAGATACATTGCTAAAAAATATTACTTTGAAGGTATTTGTGTTTCTTATTTATTTGCCACTCAGTAACCAGGGCAGGATGGCGCCTCTGCCATAGTCTCACCTAGCGTCAGGCTGGTTTTCTTTTTTCTTTTTTTAAAATTTATTTTTTATTTCTATGAATACACTGTCACTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGACGTCAGATCCCATTACAGATGGTTGTGAGCCATCAC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
.............................................................................................................................................................................................................................TCCCATTACAGATGGTTGTGAGCCgaa.. 27 gaa 5.00 0.00 - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TCAGACACACCAGAAGAGGACGTaga.............................. 26 aga 3.00 0.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TTTATTTGCCACTCAGTAACCAGGGC.............................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGTCTCACCTAGCGTCAGGCTGGTTT................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................ACATTGCTAAAAAATATTACTTTGAAGG....................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TCAGACACACCAGAAGAGGACGTtttt............................. 27 tttt 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................CCTCTGCCATAGTCTCACCTAGCGTC........................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................AGACACACCAGAAGAGGACGTCAGATttt......................... 29 ttt 2.00 0.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....CAGGCTGTTTTGGAAGATACATTGCTA.......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TGGAAGATACATTGCTAAAAAATAT.................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....CAGGCTGTTTTGGAAGATACATTGCT........................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TCTGCCATAGTCTCACCTAGCGTCAGGt....................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TATTTATTTGCCACTCAGTAACCAGGGC.............................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TATTTGCCACTCAGTAACCAGGGCAGG........................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................TCTGCCATAGTCTCACCTAGCGTCAGGCT...................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................ACACCAGAAGAGGACGTCAGATCCCATa...................... 28 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TCAGTAACCAGGGCAGGATGGCGCCTCT................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCCCATTACAGATGGTTGTGAGCCAaaaa 29 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCCCATTACAGATGGTTGTGAGCCAagaa 29 agaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................ACACACCAGAAGAGGACGTCAa.............................. 22 a 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................ACTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGtgaa.................................. 29 tgaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................CTCTGCCATAGTCTCACCTAGCGTC........................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTCAGACACACCAGAAGAGGACGTCcga............................. 28 cga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................AGACACACCAGAAGAGGACGTagaa............................. 25 agaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCCCATTACAGATGGTTGTGAGCCAaatc 29 aatc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.......................................TTACTTTGAAGGTATTTGTGTTTCTT......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................AGACACACCAGAAGAGGACGTagta............................. 25 agta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................AGACACACCAGAAGAGGACGTCAaa............................. 25 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TACACTGTCACTGTCTTCAGACACACCta........................................... 29 ta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................AGACACACCAGAAGAGGACGTagt.............................. 24 agt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TATTTCTATGAATACACTGTCACTGTC......................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................TAGTCTCACCTAGCGTCAGGCTGGTTTT................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................CAGTAACCAGGGCAGGATGGCGCCTC................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TTTGGAAGATACATTGCTAAAAAATATT................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TACATTGCTAAAAAATATTACT.............................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................AGTAACCAGGGCAGGATGGCGCCTCTGC.............................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TTCTTATTTATTTGCCACTCAGTAACC................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................TCAGTAACCAGGGCAGGATGGCGCCT.................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.....CAGGCTGTTTTGGAAGATACATTtct........................................................................................................................................................................................................................... 26 tct 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................TGCCATAGTCTCACCTAGCGTCAGGCT...................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................AGACACACCAGAAGAGGACGTCgtt............................. 25 gtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................ATCCCATTACAGATGGTTGTGAGCCAaaaa 30 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CACACCAGAAGAGGACGTCAGATCCCAat...................... 29 at 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CATAGTCTCACCTAGCGTCAGGCTGG.................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................ACTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGcgaa.................................. 29 cgaa 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................TCAGACACACCAGAAGAGGACGTata.............................. 26 ata 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CACACCAGAAGAGGACGTCAGATCCCAT....................... 28 11 0.36 0.36 0.18 - - - - 0.09 - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................TCTCACCTAGCGTCAG......................................................................................................................... 16 3 0.33 0.33 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CACACCAGAAGAGGACGTCAGATCCC......................... 26 11 0.27 0.27 - - 0.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GAGGACGTCAGATCCCATTACAGATGGTT............ 29 9 0.22 0.22 0.11 - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................AGACACACCAGAAGAGGACGTCAGATCCC......................... 29 10 0.10 0.10 - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGAGGACGTCAGATCCCATTACAGATGG.............. 29 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - -
.....................................................................................................................................................................................................GACACACCAGAAGAGGACGTCAGATCC.......................... 27 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GACACACCAGAAGAGGACGTCAGATCCCt........................ 29 t 0.09 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 -
.......................................................................................................................................................................................................CACACCAGAAGAGGACGTCAGATCC.......................... 25 11 0.09 0.09 - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................CACACCAGAAGAGGACGTCAGATCCCctta..................... 30 ctta 0.09 0.27 - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................GACACACCAGAAGAGGACGTCAGATCCC......................... 28 11 0.09 0.09 - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................GAAGAGGACGTCAGATCCCATTACAGA................. 27 12 0.08 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................ACCAGAAGAGGACGTCAGATCC.......................... 22 14 0.07 0.07 - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................CACCAGAAGAGGACGTCAGATCCCA........................ 25 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................ACCAGAAGAGGACGTCAGATCCCA........................ 24 14 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 - - - -

Antisense strand
AATTACAGGCTGTTTTGGAAGATACATTGCTAAAAAATATTACTTTGAAGGTATTTGTGTTTCTTATTTATTTGCCACTCAGTAACCAGGGCAGGATGGCGCCTCTGCCATAGTCTCACCTAGCGTCAGGCTGGTTTTCTTTTTTCTTTTTTTAAAATTTATTTTTTATTTCTATGAATACACTGTCACTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGACGTCAGATCCCATTACAGATGGTTGTGAGCCATCAC


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
......................................................................................................................................................................................TCACTGTCTTCAGACACACCAGAAaaa......................................... 27 aaa 6.00 0.00 - 3.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CTGTCACTGTCTTCAGACACACCAggca............................................ 28 ggca 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................GTCTTCAGACACACCAGAAGAGGACGTCAt............................... 30 t 3.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................ACACCAGAAGAGGACGTCAGAaa............................. 23 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................AGACACACCAGAAGAGGACGttaa.................................. 24 ttaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................CTGTCACTGTCTTCAGACACACCAGAAggc......................................... 30 ggc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TCACTGTCTTCAGACACACCAGAAagtt......................................... 28 agtt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................ACTGTCTTCAGACACACCAGAAcatt......................................... 26 catt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................ACTGTCTTCAGACACACCAGAActtt......................................... 26 cttt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TCAGACACACCAGAAGAGGACGTCAcgac............................... 29 cgac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
...................................................................................................................................................................................CTGTCACTGTCTTCAGACagg.................................................. 21 agg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................GTCTTCAGACACACCAGAAGAGGACcgc................................... 28 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CTGTCACTGTCTTCAGACACACCAccta............................................ 28 ccta 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................ATGAATACACTGTCACTGTCTTCAc..................................................... 25 c 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................ACTGTCACTGTCTTCAGACACACCAGAAtc......................................... 30 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TGGTTGTGAGCCATCACgc 19 gc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................GTCACTGTCTTCAGACACACCAGAAcgtt......................................... 29 cgtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TCACTGTCTTCAGACACACCAGAAaatt......................................... 28 aatt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................ACTGTCTTCAGACACACCAGcca........................................... 23 cca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CTTCAGACACACCAGAAGAGGACGTCAca............................... 29 ca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................CTGTCACTGTCTTCAGACACACCAggg............................................ 27 ggg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................CTGTCACTGTCTTCAGACACACCAgtt............................................ 27 gtt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................ACTGTCACTGTCTTCAGACACACCAtat............................................ 28 tat 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................ACACCAGAAGAGGACGTCAGAttct............................. 25 ttct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................ACTGTCTTCAGACACACCAGAAaga......................................... 25 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CTGTCACTGTCTTCAGACACACCAgtgt............................................ 28 gtgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..................................................................................................................................................................................................GACACACCAGAAGAGGACGTCAGATCatt........................... 29 att 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................TGTCACTGTCTTCAGACACACCAGAActgc......................................... 30 ctgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................ACTGTCTTCAGACACACCAGAAattt......................................... 26 attt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................TCACTGTCTTCAGACACACCAGAAattt......................................... 28 attt 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................TCACTGTCTTCAGACACACCAGAAat......................................... 26 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CTGTCACTGTCTTCAGACACACCActtt............................................ 28 cttt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................CTGTCACTGTCTTCAGACACACCAaaga............................................ 28 aaga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................ACGTCAGATCCCATTACAGATGGTTGTGA........ 29 10 0.50 0.50 0.10 - - - - 0.10 - - - - 0.10 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................ACGTCAGATCCCATTACAGATGGT............. 24 10 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.30 - - - - - - - - - 0.10 - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GACGTCAGATCCCATTACAGATGGTTGTGA........ 30 10 0.40 0.40 0.10 - - - - 0.10 - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - -
..........................................................................................................................................................................................CACTGTCTTCAGACACACCAGAAGAGGACG.................................. 30 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGAGGACGTCAGATCCCATTACAGA................. 26 12 0.17 0.17 - - - 0.08 - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GGACGTCAGATCCCATTACAGATGGTT............ 27 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GGACGTCAGATCCCATTACAGATGGTTG........... 28 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - -
.................................................................................................................................................................................................................GAGGACGTCAGATCCCATTACAGATGG.............. 27 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................CAGAAGAGGACGTCAGATCCCATTACAGAt................. 30 t 0.09 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................CAGAAGAGGACGTCAGATCCCATTACAGA................. 29 11 0.09 0.09 - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................ACACACCAGAAGAGGACGTCAGATCCCAT....................... 29 11 0.09 0.09 - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................AGAAGAGGACGTCAGATCCCATTACA................... 26 12 0.08 0.08 - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GACGTCAGATCCCATTACAGATGG.............. 24 12 0.08 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08
.....................................................................................................................................................................................................................ACGTCAGATCCCATTACAGATGG.............. 23 13 0.08 0.08 - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................AAGAGGACGTCAGATCCCATTACA................... 24 13 0.08 0.08 - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -