| Gene: Ndufb8 | ID: uc008hpv.1_intron_0_0_chr19_44624711_r.3p | SPECIES: mm9 |
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(1) OTHER.ip |
(9) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(9) PIWI.ip |
(4) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(47) TESTES |
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Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) |
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| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATGG........................................................................................................................................ | 25 | 2 | 99.50 | 99.50 | 25.00 | 19.50 | 13.00 | 2.00 | 2.00 | 3.00 | - | 3.00 | 0.50 | 5.50 | 3.00 | 1.00 | - | 2.50 | 1.00 | - | 0.50 | 2.50 | 0.50 | 0.50 | 5.00 | 0.50 | 2.50 | - | - | 0.50 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...........................................................................................TGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGC...................................................................................................................................... | 25 | 2 | 30.50 | 30.50 | 2.50 | 5.00 | 3.00 | 1.00 | 3.50 | 1.00 | - | 5.50 | 4.00 | 0.50 | - | 1.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGT.................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 29.00 | 29.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | 5.00 | 6.00 | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - |
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| ..........................TACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTG.................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 12.00 | 12.00 | 3.00 | 1.00 | 1.00 | - | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGt................................................................................................................................................................................................ | 27 | t | 10.00 | 61.00 | 1.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGAT............................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 10.00 | 10.00 | 2.00 | 2.00 | - | 4.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................TTACAATAATCTGTACCTGGAGCGG........................................................................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | 3.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTACAATAATCTGTACCTGGAGCGGG....................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 8.00 | 8.00 | 1.00 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................TCTGTACCTGGAGCGGGGT..................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 8.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGt....................................................................................................................................... | 26 | t | 7.50 | 99.50 | 1.50 | 3.00 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................CCTTACAATAATCTGTACCTGGAGCGG........................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 7.00 | 7.00 | 2.00 | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................ACTATGATATCTGAGGAGGCTTGATGG........................................................................................................................................ | 27 | 2 | 6.50 | 6.50 | 0.50 | 2.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................CAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGT..................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 6.00 | 6.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................CAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTG.................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGA................................................................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | 1.00 | - | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGG...................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................CGTGGTTCACTATGATATCTGAGGAG................................................................................................................................................. | 26 | 2 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................TCACTATGATATCTGAGGAGGCTTGAT.......................................................................................................................................... | 27 | 2 | 5.00 | 5.00 | 0.50 | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................TCACTATGATATCTGAGGAGGCTTGA........................................................................................................................................... | 26 | 2 | 5.00 | 5.00 | 2.00 | 1.50 | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................ATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGT.................................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGG...................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGATC.............................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TCTGAGGAGGCTTGATGGGCTTTTTGCCCTt........................................................................................................................... | 31 | t | 5.00 | 0.00 | 3.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................CAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGG................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................TGGTTCACTATGATATCTGAGGAGG................................................................................................................................................ | 25 | 2 | 4.50 | 4.50 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | 2.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................TACCAAAGAGCCTGAGCCCGTGGTT.................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGt................................................................................................................................................................................................... | 30 | t | 4.00 | 12.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGATATCTGAGGAGGCTTGATGGG....................................................................................................................................... | 24 | 2 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................TCCTACCAAAGAGCCTGAGCCCGTGGT..................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................CAATAATCTGTACCTGGAGCGGG....................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................TACCAAAGAGCCTGAGCCCGTGGT..................................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGgg................................................................................................................................................................................................. | 26 | gg | 4.00 | 10.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................CGTGGTTCACTATGATATCTGAGGAGGC............................................................................................................................................... | 28 | 2 | 3.50 | 3.50 | 1.50 | 0.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................CACTATGATATCTGAGGAGGCTTGATGG........................................................................................................................................ | 28 | 2 | 3.50 | 3.50 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................GTGGTTCACTATGATATCTGAGGAGGC............................................................................................................................................... | 27 | 2 | 3.50 | 3.50 | 0.50 | 1.00 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................CGTGGTTCACTATGATATCTGAGGAGGCT.............................................................................................................................................. | 29 | 2 | 3.50 | 3.50 | 1.00 | 1.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................GTGGTTCACTATGATATCTGAGGAGGCT.............................................................................................................................................. | 28 | 2 | 3.50 | 3.50 | 0.50 | 0.50 | 2.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................TCCTACCAAAGAGCCTGAGCCCGTGGTT.................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................GTGGTTCACTATGATATCTGAGGAGG................................................................................................................................................ | 26 | 2 | 3.00 | 3.00 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACAATAATCTGTACCTGGAGCGG........................................................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACAATAATCTGTACCTGGAGCGGG....................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGt................................................................................................................................................................................................... | 29 | t | 3.00 | 12.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCTa.................................................................................................................................... | 27 | a | 3.00 | 34.50 | 0.50 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................TCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGATC.............................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCTTT................................................................................................................................... | 28 | 2 | 3.00 | 3.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GGTTCACTATGATATCTGAGGAGGCTT............................................................................................................................................. | 27 | 2 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................CTATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGG....................................................................................................................................... | 27 | 2 | 2.50 | 2.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGATATCTGAGGAGGCTTGATGG........................................................................................................................................ | 23 | 2 | 2.50 | 2.50 | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................CACTATGATATCTGAGGAGGCTTGATG......................................................................................................................................... | 27 | 2 | 2.50 | 2.50 | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................TCACTATGATATCTGAGGAGGCTTGATGG........................................................................................................................................ | 29 | 2 | 2.50 | 2.50 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................TGAGCCCGTGGTTCACTATGATATCTGA..................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................TCCTACCAAAGAGCCTGAGCCCGTGG...................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TGTACCTGGAGCGGGGTGGTGATCCT............................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................ATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGG................................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................ATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGC...................................................................................................................................... | 26 | 2 | 2.00 | 2.00 | 0.50 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................CAGTACCCTTACAATAATCTGTACCTGGA............................................................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................TCCTACCAAAGAGCCTGAGCCCGTG....................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TAATAAAATCCCTAATAAAGCTCAGTGC............................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................CCCTTACAATAATCTGTACCTGGAGCGG........................................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................ACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGT..................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................AATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGG................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TCTGAGGAGGCTTGATGGGCTTTTTGCCCTa........................................................................................................................... | 31 | a | 2.00 | 0.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................CACTATGATATCTGAGGAGGCTTGAT.......................................................................................................................................... | 26 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................GTTCACTATGATATCTGAGGAGGCTT............................................................................................................................................. | 26 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TGTACCTGGAGCGGGGTGGTGATCCTA........................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................GTGGTTCACTATGATATCTGAGGAGGt............................................................................................................................................... | 27 | t | 2.00 | 3.00 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................TCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGAT............................................................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................TCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGA................................................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................TCTGTACCTGGAGCGGGGTGG................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................TCCTAGAGGCTTAACCATAATAAAATCCC............................................................................................ | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................CGTGGTTCACTATGATATCTGAGGAGG................................................................................................................................................ | 27 | 2 | 2.00 | 2.00 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 |
| ..........................................................................................ATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGG....................................................................................................................................... | 25 | 2 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................ACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTG.................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................TGGTTCACTATGATATCTGAGGAGGCTTG............................................................................................................................................ | 29 | 2 | 1.50 | 1.50 | 0.50 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TCTGAGGAGGCTTGATGG........................................................................................................................................ | 18 | 2 | 1.50 | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................TGGTTCACTATGATATCTGAGGAGGCTTt............................................................................................................................................ | 29 | t | 1.50 | 39.50 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................CTATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGt....................................................................................................................................... | 27 | t | 1.50 | 15.00 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................CTATGATATCTGAGGAGGCTTGATGcg....................................................................................................................................... | 27 | cg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCaa.................................................................................................................................... | 29 | aa | 1.00 | 73.50 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGaa..................................................................................................................................... | 28 | aa | 1.00 | 137.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................TACCAAAGAGCCTGAGCCCGTGGTTCACTA............................................................................................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................TACCAAAGAGCCTGAGCCCGTGGTTCACT................................................................................................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................TAATAAAATCCCTAATAAAGCTCAGTG............................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............CGAAGCAGTACCCTTACAATAATCTGTA.................................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................CAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGg.................................................................................................................................................................................................. | 28 | g | 1.00 | 5.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TCTGAGGAGGCTTGATGGGCTTTgtg................................................................................................................................ | 26 | gtg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTt.................................................................................................................................................................................................... | 28 | t | 1.00 | 37.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................TAAAATCCCTAATAAAGCTCAaaaa............................................................................ | 25 | aaaa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGATATCTGAGGAGGCTTGATGt........................................................................................................................................ | 23 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................AATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGA................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................GATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCTTTTTGCCC............................................................................................................................. | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................CTGGAGCGGGGTGGTGATCCTA........................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................TCTGTACCTGGAGCGGGG...................................................................................................................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGG...................................................................................................................................................................................................... | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................GTACCCTTACAATAATCTGTACCTGGAG........................................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................CCCTTACAATAATCTGTACCTGGAGCG......................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................CTGGAGCGGGGTGGTGATCCTACCAA....................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................TGGTGATCCTACCAAAGAGCCTGAGCCCGT........................................................................................................................................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................TTCCTAGAGGCTTAACCATAATAAAAT............................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TCTGAGGAGGCTTGATGGGCTTTTTG................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................AATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGT.................................................................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................GAATAGTCACTGCTGTGAGGATCCAG........................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................AGGAGGCTTGATGGGCTT.................................................................................................................................... | 18 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGtt..................................................................................................................................... | 26 | tt | 1.00 | 4.00 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................CAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGt................................................................................................................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 6.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............CGAAGCAGTACCCTTACAATAATCTGTACC................................................................................................................................................................................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TAGAGGCTTAACCATAAT.................................................................................................... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................TCCTACCAAAGAGCCTGAGCCCGT........................................................................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TAGAGGCTTAACCATAATAAAATCCC............................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TGTACCTGGAGCGGGGTGGTGA................................................................................................................................................................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGg.................................................................................................................................................................................................. | 25 | g | 1.00 | 10.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................ATAATCTGTACCTGGAGCGGGG...................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGt...................................................................................................................................... | 25 | t | 1.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................AATAATCTGTACCTGGAGCGG........................................................................................................................................................................................................ | 21 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................TCACTATGATATCTGAGGAGGCTTG............................................................................................................................................ | 25 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................CCTGAGCCCGTGGTTCACTATGATATCT....................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................CGTGGTTCACTATGATATCTGAGGAGGt............................................................................................................................................... | 28 | t | 1.00 | 2.00 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGG................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TGTACCTGGAGCGGGGTGGTGATCC............................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................GCCCGTGGTTCACTATGATATCTGAGG................................................................................................................................................... | 27 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTt.................................................................................................................................................................................................... | 29 | t | 1.00 | 22.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TAGAGGCTTAACCATAATAAAATCCCT........................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................ATCTGAGGAGGCTTGATGGaa...................................................................................................................................... | 21 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - |
| ....................................................................................................AGGAGGCTTGATGGGCTTTTTGCCC............................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................CCCTTACAATAATCTGTACCTGGAGCGGt....................................................................................................................................................................................................... | 29 | t | 1.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................AATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGATC.............................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................TATCTGAGGAGGCTTGATGGGCTTTTTGCCCTC........................................................................................................................... | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGGTG.................................................................................................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................CCTACCAAAGAGCCTGAGCCCGTGGT..................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACAATAATCTGTACCTGGAGC.......................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTaa................................................................................................................................................................................................ | 27 | aa | 1.00 | 29.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATcgg....................................................................................................................................... | 26 | cgg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................TGGAGCGGGGTGGTGATCCT............................................................................................................................................................................................ | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGt...................................................................................................................................................................................................... | 27 | t | 1.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGtt............................................................................................................................................................................................... | 28 | tt | 1.00 | 61.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................TACCCTTACAATAATCTGTACCTGGAGCGG........................................................................................................................................................................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGATATCTGAGGAGGCTTGATtgg....................................................................................................................................... | 24 | tgg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGGT..................................................................................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGta.................................................................................................................................................................................................. | 30 | ta | 1.00 | 12.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................TCCTAGAGGCTTAACCATAATAAAATCC............................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTG................................................................................................................................................................................................. | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGt................................................................................................................................................................................................... | 24 | t | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................TCTGAGGAGGCTTGATGGGCTTTTTGCCCTta.......................................................................................................................... | 32 | ta | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............CGAAGCAGTACCCTTACAATAATCTGTAC................................................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................CTATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCT..................................................................................................................................... | 29 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................TGGTTCACTATGATATCTGAGGAGGCa.............................................................................................................................................. | 27 | a | 1.00 | 61.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................TGGAGCGGGGTGGTGATCCTACCAAA...................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................TTACAATAATCTGTACCTGGAGCGGt....................................................................................................................................................................................................... | 26 | t | 1.00 | 8.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................GATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCT..................................................................................................................................... | 25 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGATCC............................................................................................................................................................................................. | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCaa.................................................................................................................................... | 27 | aa | 1.00 | 30.50 | - | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................ACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGt................................................................................................................................................................................................... | 28 | t | 1.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................CTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGATCC............................................................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................CTTACAATAATCTGTACCTGGAGCGG........................................................................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................GCCCGTGGTTCACTATGATATCTGAGGAGG................................................................................................................................................ | 30 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................ATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTG................................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................TACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGa...................................................................................................................................................................................................... | 26 | a | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................ATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGt...................................................................................................................................... | 26 | t | 1.00 | 2.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........CCGAAGCAGTACCCTTACAATAATCTGTAt................................................................................................................................................................................................................. | 30 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGtt...................................................................................................................................... | 27 | tt | 1.00 | 99.50 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................TAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTt................................................................................................................................................................................................. | 26 | t | 1.00 | 29.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................TACCTGGAGCGGGGTGGTGATCCTACCA........................................................................................................................................................................................ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................CAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGT.................................................................................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................TCGTTCCTAGAGGCTTAACCATAATAAAAT............................................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................ACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTG................................................................................................................................................................................................. | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................TACCAAAGAGCCTGAGCCCG......................................................................................................................................................................... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................AATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGAT............................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................CCTGAGCCCGTGGTTCACTATGATATC........................................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................TCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGATCC............................................................................................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................CCTGGAGCGGGGTGGTGATCCTACCAA....................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTaatg......................................................................................................................................... | 24 | aatg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................TCCTACCAAAGAGCCTGAGCCCGTGGc..................................................................................................................................................................... | 27 | c | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................GTACCCTTACAATAATCTGTACCTGGAGC.......................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............CGAAGCAGTACCCTTACAATAATCTG.................................................................................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................GCAGTACCCTTACAATAATCTGTACCT............................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................TTCACTATGATATCTGAGGAGGCTTG............................................................................................................................................ | 26 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGC............................................................................................................................................... | 18 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................TTCACTATGATATCTGAGGAGGCTTGA........................................................................................................................................... | 27 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................TCACTATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGG....................................................................................................................................... | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................GTTCACTATGATATCTGAGG................................................................................................................................................... | 20 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCag.................................................................................................................................... | 27 | ag | 0.50 | 30.50 | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGA........................................................................................................................................... | 22 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGa...................................................................................................................................... | 27 | a | 0.50 | 137.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GGTTCACTATGATATCTGAGG................................................................................................................................................... | 21 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................CCGTGGTTCACTATGATATCTGAGGAGGCT.............................................................................................................................................. | 30 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................GATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCTT.................................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GGTTCACTATGATATCTGAGGAGGC............................................................................................................................................... | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................ATCTGAGGAGGCTTGATGGGCTTTT.................................................................................................................................. | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - |
| ..............................................................................CCGTGGTTCACTATGATATCTGAGGAGGC............................................................................................................................................... | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATGc........................................................................................................................................ | 25 | c | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................TCCTACCAAAGAGCCTGAG............................................................................................................................................................................. | 19 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATGatcg..................................................................................................................................... | 28 | atcg | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATGtgc...................................................................................................................................... | 27 | tgc | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGa....................................................................................................................................... | 26 | a | 0.50 | 99.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................TCACTATGATATCTGAGGAGGCTTGATG......................................................................................................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................TATCTGAGGAGGCTTGATGGGCTTT................................................................................................................................... | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................TTCACTATGATATCTGAGGAGGCTT............................................................................................................................................. | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................CACTATGATATCTGAGGAGGCTTGATGat....................................................................................................................................... | 29 | at | 0.50 | 2.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGAaggg....................................................................................................................................... | 26 | aggg | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGtt..................................................................................................................................... | 28 | tt | 0.50 | 137.00 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................TCACTATGATATCTGAGGAGGCTTGt........................................................................................................................................... | 26 | t | 0.50 | 1.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................CGTGGTTCACTATGATATCTGAGGAGt................................................................................................................................................ | 27 | t | 0.50 | 5.00 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATG......................................................................................................................................... | 24 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGAggg........................................................................................................................................ | 25 | ggg | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGgttt................................................................................................................................... | 28 | gttt | 0.50 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GGTTCACTATGATATCTGAGGAGGCT.............................................................................................................................................. | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................TCACTATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGt....................................................................................................................................... | 30 | t | 0.50 | 2.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCTa.................................................................................................................................... | 29 | a | 0.50 | 16.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCa..................................................................................................................................... | 28 | a | 0.50 | 73.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................ATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCTT.................................................................................................................................... | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................CACTATGATATCTGAGGAGGCTTGA........................................................................................................................................... | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................TGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCatt................................................................................................................................... | 28 | att | 0.50 | 30.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................CTATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCTTT................................................................................................................................... | 31 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................TCACTATGATATCTGAGGAGGCTTGAaa......................................................................................................................................... | 28 | aa | 0.50 | 5.00 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGAcggg....................................................................................................................................... | 26 | cggg | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAGGCTTGATGtgt...................................................................................................................................... | 27 | tgt | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................ACTATGATATCTGAGGAGGCTTGATG......................................................................................................................................... | 26 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................GTTCACTATGATATCTGAGGAGGCT.............................................................................................................................................. | 25 | 2 | 0.50 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TGTACCTGGAGCGGGG...................................................................................................................................................................................................... | 16 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................GTGGTTCACTATGATATCTGAGGAGGCTT............................................................................................................................................. | 29 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TATGATATCTGAGGAG................................................................................................................................................. | 16 | 3 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................ACCAAAGAGCCTGAGCC........................................................................................................................................................................... | 17 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................AGGAGGCTTGATGGG....................................................................................................................................... | 15 | 17 | 0.06 | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.06 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TTCCTTAGGGTCCGAAGCAGTACCCTTACAATAATCTGTACCTGGAGCGGGGTGGTGATCCTACCAAAGAGCCTGAGCCCGTGGTTCACTATGATATCTGAGGAGGCTTGATGGGCTTTTTGCCCTCGTTCCTAGAGGCTTAACCATAATAAAATCCCTAATAAAGCTCAGTGCTCTGGTTTCTGTGTCTCTTTCTCCAGGAATAGTCACTGCTGTGAGGATCCAGGTCCTTGTCCTTCCCTCTACGTGC .....................................................((((....))))..(((((((((((((((((....)))))...........)))))...)))))))................................................................................................................................... .....................................................54...............................................................119................................................................................................................................. |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR363963(GSM822765) AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR069811(GSM610967) small RNA sequencing; sample 3. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes) | SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...........................................................................................................................................................................................................................CAGGTCCTTGTCCTTagga............ | 19 | agga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................GGTTCACTATGATATCTGAGGAGGCTTGA........................................................................................................................................... | 29 | 2 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................GCCCGTGGTTCACTATGATATCTGAGGA.................................................................................................................................................. | 28 | 2 | 0.50 | 0.50 | - | 0.50 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |