chr19:44368852 44369443 +
(10)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(7)
PIWI.ip 		(5)
PIWI.mut 		(42)
TESTES

Sense strand
ACGTGACCCCAGCATCCGACGCCAAGATGCCGGCCCACATACTGCAAGAGGTGAGCTTACACCCCACCCCCCACCCCCTCCTCAGGTTGGCGGTTGCAGATTGGACTTCTAGGTGGGTGGCTGTTGAGGGTTGGAGAGAGTTCAGAGCAGCTGGGAGCATTTAGCCATCATTTCCGAATTGCTCAACCTTGATAGATTGTTTCTGGACCGGGTGATAACCGGATTTTTACTCAGTACAGTTGATTGTCCCAACTTGTGTTTCTTAAAGTAAAACCTGACCTCTTTTCGATATGCGCAGATTTTCCTTTGTGAGTTGCTAAGGGTGCTGCTAATAAAGCGTCCTTTCCTGCCCCTTCATCATAAGGCTTATTCCCGATGGCCTGCACATTTCCGTGTTCCATTGGTGCGCTCTACAGTCATGCAACCTTGGCACTGGGGTATGGCCGTTATTGCATCTCTCCCGCAGTTATATTAGAGGGAAAGTAACCCCTGCTGCCCCCACGCGTCTGCAGTCCCTAATTCTCCACCCCCTCTCATTGCAGATCTCTGGCGCTTACTCAGCCACCACCACAATCACAGCGCCACCTTCTGG
............................................................................................................................................................................................((((.(((..(((...((.((((.......))))..(((((((.((((((((((.......))))).)))...))...))))))))).))).)))..))))....((((((......))))))....((.((((..(((........)))..))))....))..................................................................................................................................................................................................................................................
........................................................................................................................................................................................185..........................................................................................................................................................................358........................................................................................................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCAGATCTCTGGCGCTTACTCAGC.............................. 26 1 10.00 10.00 - - 8.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCATTGGTGCGCTCTACAGTCATGC.......................................................................................................................................................................... 26 1 9.00 9.00 - - - - 9.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGATAGATTGTTTCTGGACCGGGTG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 9.00 9.00 - - - 5.00 - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................CAAGATGCCGGCCCACATACTGCAAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGAGGGTTGGAGAGAGTTCAGAG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 1 4.00 4.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GCCAAGATGCCGGCCCACATACTGCAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................CAAGATGCCGGCCCACATACTGCAAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................ACCTTGATAGATTGTTTCTGGACCGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACTCAGCCACCACCACAATCACAGCGCC......... 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCAGATCTCTGGCGCTTACTCAGCC............................. 27 1 3.00 3.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTACTCAGCCACCACCACAATCACAGCGC.......... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGCAGATTGGACTTCTAGGTGGGT.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGAGGGTTGGAGAGAGTTCAGAGCAGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GATGCCGGCCCACATACTGCAAGAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCATTGCAGATCTCTGGCGCTTACT.................................. 25 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................TGGCGGTTGCAGATTGGACTTCTAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACTCAGCCACCACCACAATCACAGCGC.......... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCATTGCAGATCTCTGGCGCTTACTC................................. 28 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGCCGGCCCACATACTGCAAGAGatct.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 atct 2.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCATTGCAGATCTCTGGCGCTTA.................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAACCGGATTTTTACTCAGTACAGTTGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CCAAGATGCCGGCCCACATACTGCAAGAGat............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 at 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GAGAGTTCAGAGCAGCTGG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCTCTGGCGCTTACTCAGCCACCACCACAATC................. 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCACCACAATCACAGCGCCA........ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................AGGTTGGCGGTTcgtg............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 16 cgtg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAATAAAGCGTCCTTTCCTGCCCCT.............................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGATGCCGGCCCACATACTGCAAGAGatc........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 atc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TGTTTCTGGACCGGGTGATAACCGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAACCGGATTTTTACTCAGTACAGTTG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................CCGGATTTTTACTCAGTA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TCCGAATTGCTCAACCTTGATAGATTGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TGATAGATTGTTTCTGGACCGGGTGATA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGTTCCATTGGTGCGCTCTACAGTCAT............................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCCACCACCACAATCACAGCGCCACCT..... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACTCAGCCACCACCACAATCACAGCGCCA........ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGCAGATTGGACTTCTAGGTGGGTG......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.............................................................................................TTGCAGATTGGACTTCTAGGTGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TTGAGGGTTGGAGAGAGTTCAGAGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................ATAGATTGTTTCTGGACCGGGTGA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AAGATGCCGGCCCACATACTGCAAGc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCTAATAAAGCGTCCTTTCCTGCCC................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GAGAGTTCAGAGCAGCTGGGAGCATT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TCCGACGCCAAGATGCCGGCCCACATACTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GATGCCGGCCCACATACTGCAAGAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACCTCTTTTCGATATGCGCAGATT................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCACCACAATCACAGCGCCAC....... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGCTGCCCCCACGCGTCTGC.................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................GATTGGACTTCTAGGTGGGTGGCTG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................TACTGCAAGAGGTGAGCTTACACCCCA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............TCCGACGCCAAGATGCCGGCCCACATA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGCCACCACCACAATCACAGCGCCAC....... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TTGTTTCTGGACCGGGTGATAACC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGTTGCTAAGGGTGCTGCTAATAAA................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TACTCAGCCACCACCACAATCACAGCGCCAC....... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TAACCGGATTTTTACTCAGT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTCCCGATGGCCTGCACATTTCCGT...................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATCTCTGGCGCTTACTCAGCCACC.......................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGGCGCTTACTCAGCCACCACCACA.................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............TCCGACGCCAAGATGCCGGCCCAtct........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 tct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTACTCAGCCACCACCACAATCACAGC............ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................TGAGGGTTGGAGAGAGTTCAGAGCAGCa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 a 1.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................CAAGATGCCGGCCCACATACTGCAAGAGa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................AGATGCCGGCCCACATACTGCAAGAGat............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TTTCTGGACCGGGTGATAACCGGATT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................GTTTCTGGACCGGGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 15 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACCTTGGCACTGGGG.......................................................................................................................................................... 16 3 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CCCACATACTGCAAGAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................AGATTGTTTCTGGACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 16 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
ACGTGACCCCAGCATCCGACGCCAAGATGCCGGCCCACATACTGCAAGAGGTGAGCTTACACCCCACCCCCCACCCCCTCCTCAGGTTGGCGGTTGCAGATTGGACTTCTAGGTGGGTGGCTGTTGAGGGTTGGAGAGAGTTCAGAGCAGCTGGGAGCATTTAGCCATCATTTCCGAATTGCTCAACCTTGATAGATTGTTTCTGGACCGGGTGATAACCGGATTTTTACTCAGTACAGTTGATTGTCCCAACTTGTGTTTCTTAAAGTAAAACCTGACCTCTTTTCGATATGCGCAGATTTTCCTTTGTGAGTTGCTAAGGGTGCTGCTAATAAAGCGTCCTTTCCTGCCCCTTCATCATAAGGCTTATTCCCGATGGCCTGCACATTTCCGTGTTCCATTGGTGCGCTCTACAGTCATGCAACCTTGGCACTGGGGTATGGCCGTTATTGCATCTCTCCCGCAGTTATATTAGAGGGAAAGTAACCCCTGCTGCCCCCACGCGTCTGCAGTCCCTAATTCTCCACCCCCTCTCATTGCAGATCTCTGGCGCTTACTCAGCCACCACCACAATCACAGCGCCACCTTCTGG
............................................................................................................................................................................................((((.(((..(((...((.((((.......))))..(((((((.((((((((((.......))))).)))...))...))))))))).))).)))..))))....((((((......))))))....((.((((..(((........)))..))))....))..................................................................................................................................................................................................................................................
........................................................................................................................................................................................185..........................................................................................................................................................................358........................................................................................................................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT1()
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18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
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cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014237(GSM319961)
10 dpp MILI-KO total. (mili testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTACAGTCATGCAAC....................................................................................................................................................................... 18 1 35.00 35.00 10.00 11.00 5.00 - - 2.00 1.00 1.00 - 3.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTCTACAGTCATGCAA........................................................................................................................................................................ 18 1 12.00 12.00 2.00 7.00 - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTACAGTCATGCAACCT..................................................................................................................................................................... 19 1 7.00 7.00 - 1.00 - - - - 3.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGTGTTCCATTGGTGCGCT...................................................................................................................................................................................... 20 1 7.00 7.00 - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTTATTCCCGATGGCCT.................................................................................................................................................................................................................. 18 1 7.00 7.00 - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCTCTACAGTCATGCA......................................................................................................................................................................... 18 1 4.00 4.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTACAGTCATGCAACCT..................................................................................................................................................................... 20 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TCATTTCCGAATTGCTCAACCTTGATA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCTCTACAGTCATGCAA........................................................................................................................................................................ 19 1 3.00 3.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGTGTTCCATTGGTGCGCTCTACAG................................................................................................................................................................................ 26 1 3.00 3.00 - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTACAGTCATGCAACC...................................................................................................................................................................... 19 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTGCGCTCTACAGTCATGC.......................................................................................................................................................................... 20 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................ACCCCCCACCCCCTCCTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 8 2.50 2.50 - - - - - - 0.50 - - - 0.25 - 1.12 - 0.12 - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - 0.25 0.12 - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTACAGTCATGCAACCTTG................................................................................................................................................................... 22 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTCTTTTCGATATGCGCAGATTTTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCTCTACAGTCAT............................................................................................................................................................................ 15 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTACAGTCATGCAACC...................................................................................................................................................................... 18 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTACAGTCATGCAA........................................................................................................................................................................ 17 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGTGTTCCATTGGTGCGCTCTACAGTCA............................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTGCGCTCTACAGTCAT............................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTACAGTCATGCAACCTTG................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCATTGGTGCGCTCTACAGTCATG........................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTCCATTGGTGCGCTCT.................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCTCTACAGTCATGC.......................................................................................................................................................................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................CATTTCCGAATTGCTCAACCTTGATA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACCCCCCACCCCCTCCtta............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 tta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTGCGCTCTACAGTCATGCAAC....................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................CCCCCACCCCCTCCTcca.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 cca 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................ATCATTTCCGAATTGCTCAACCTTGATA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTCCATTGGTGCGCTCTA................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................AAGTAAAACCTGACCTCTTTTCGATA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGTGCGCTCTACAGTCATGCAACCTTGGC................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................GCTGGGAGCATTTAGCCATCATTTCCGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTGCGCTCTACAGTCA............................................................................................................................................................................. 17 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTACAGTCATGCAACCTT.................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTCTACAGTCATGCAACCTTGGCAC............................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCATTGGTGCGCTCTACAGTC.............................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................CAGCTGGGAGCATTTAGCCATCATTTCCGAAT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 32 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCATGCAACCTTGGCACTG............................................................................................................................................................. 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
.......................................................................CACCCCCTCCTCAGGTTGGCGGTTGCA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCCCCACGCGTCTGCAGTCCCTAA......................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTTCCATTGGTGCGCTtgg...................................................................................................................................................................................... 20 tgg 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTACAGTCATGCAAggcg........................................................................................................................................................................ 18 ggcg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTACAGTCATGCAACCTTGGCAC............................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTCTACAGTCATGCAACCT..................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGTGTTCCATTGGTGCGCTCTA................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGCGCTCTACAGTCATGCAAC....................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGATTTTCCTTTGTGAGTTGCTAtgc................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 tgc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTCTACAGTCATGCAACCTTGGCACT.............................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGCGCTCTACAGTCATGCAACCT..................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTACAGTCATGCAACCTTGGCAC............................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................CCCCCCACCCCCTCCTCcca............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 cca 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTGCGCTCTACAGTCATGCAACC...................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCTCTACAGTCATGCAACCTT.................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGTTCCATTGGTGCGCTCTACAGTCA............................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCATTGGTGCGCTCTACAGTCATGCA......................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCAGATTTTCCTTTGTGAGTTGCTA................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTCTACAGTCATGCAACCTTGGC................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCTCTACAGTCATGgc........................................................................................................................................................................... 18 gc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCCCAACTTGTGTTTCTTAAAGTA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGTGTTCCATTGGTGCGCTCTA................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCGCTCTACAGTCATGCAA........................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCGCTCTACAGTCATGCAACCTTGGCA................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................GATATGCGCAGATTTTCCTTTGTGAGTTGCTAA................................................................................................................................................................................................................................................................................ 33 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTGCGCTCTACAGTCATGCAA........................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCACGCGTCTGCAGTCCCTAATTCT..................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCCACGCGTCTGCAGTCCCTAA......................................................................... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................GAATTGCTCAACCTTGATAGATTGTTTC..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................TACTCAGTACAGTTGgct.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 gct 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GCCATCATTTCCGAATTGCTCAACCTTGAT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTCtta............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 tta 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - 0.12 - - 0.12 - - 0.12
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTACAGTCATGCAACCT..................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTCaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 aaa 0.50 0.00 - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - 0.12 -
.................................................................ACCCCCCACCCCCTCCT.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 13 0.38 0.38 - - - 0.15 - - - - - 0.08 0.08 - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTCtaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 taaa 0.38 0.00 - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - 0.12 - -
...............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTCaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 aa 0.38 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - 0.12 - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTACAGTCATGCAAC....................................................................................................................................................................... 16 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTaa.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 aa 0.31 0.00 - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.15 - - - - - - - - 0.08 - - - - - -
..............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTCaca............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 aca 0.25 0.00 - - - - - - - - - - - 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTCtaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 taa 0.25 0.00 - - - - - - 0.12 - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTttga.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 ttga 0.15 0.00 - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTCaaga............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 aaga 0.12 0.00 - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTCacca............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 acca 0.12 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTCttaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 ttaa 0.12 0.00 - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTCaaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 aaaa 0.12 0.00 - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTaca.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 aca 0.08 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTtta.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 tta 0.08 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................ACCCCCCACCCCCTCCTttgt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 ttgt 0.08 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.08 - - - - - - - - - - - - -