(1)
OTHER.ip
(12)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(8)
PIWI.ip
(3)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(51)
TESTES

Sense strand
TGCTAGAAGCTGAAGGGATGTCAAAGTCATACTGCAGTGGGACAGAACGGGTGAGCCTTATGGCTGACGGGAAGATCTTTGTGGGAAGTGGCAGCAGTGGGGGCACTGAAGGGCTGGTCATGAACTCGGATATACTCGGTGCTACCACAGAGGTTCTGATTGAAGATACAGACTCTACTGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACTTTGGGCACTGGGACAGTGCAGACTTTGTATTTAAAAGATAAAAAGGAC
.....................................................((((....))))..(((...(((((((((((....(((((.(((((....)))))..(((...(((.((....)))))...)))..)))))))))))))))))))............................................................................................
.....................................................54......................................................................................................158..........................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
.............................................................................................................................TCGGATATACTCGGTGCTACCACAGAGGT................................................................................................ 29 1 30.00 30.00 - - - 15.00 - 1.00 3.00 - - 4.00 1.00 - - - 2.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TCGGATATACTCGGTGCTACCACAGAGGTT............................................................................................... 30 1 23.00 23.00 - - - - - 2.00 5.00 - - 2.00 1.00 - - - 3.00 3.00 - - 4.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
...........................................................................................................................ACTCGGATATACTCGGTGCTACCA....................................................................................................... 24 1 8.00 8.00 - - - - 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGGCTGACGGGAAGATCTTTGTGGGA.................................................................................................................................................................... 26 1 8.00 8.00 2.00 3.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TAGAAGCTGAAGGGATGTCAAAGTC.............................................................................................................................................................................................................................. 25 2 7.00 7.00 0.50 0.50 0.50 - - - 0.50 - 1.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - 1.00 - 0.50 - 0.50 - - - - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGGTCATGAACTCGGATATACTCGGTGC............................................................................................................ 28 1 6.00 6.00 - 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - -
........................................................................................................................TGAACTCGGATATACTCGGTGCTACCACA..................................................................................................... 29 1 5.00 5.00 2.00 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGAACTCGGATATACTCGGTGCTACC........................................................................................................ 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGGGCTGGTCATGAACTCGGATATACTCGt............................................................................................................... 30 t 4.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GACGGGAAGATCTTTGTGGGAAGTGGC.............................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGAACTCGGATATACTCGGTGCTACCAC...................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TATGGCTGACGGGAAGATCTTTGT........................................................................................................................................................................ 24 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TCGGATATACTCGGTGCTACCACAGAGG................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................CATACTGCAGTGGGACAGAACGGGTG..................................................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TATGGCTGACGGGAAGATCTTTGTG....................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................GAAGATCTTTGTGGGAAGTGGCAGCAGTG....................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TCTGATTGAAGATACAGACTCTACTGG..................................................................... 27 2 3.00 3.00 1.00 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TAGAAGCTGAAGGGATGTCAAAGTCAT............................................................................................................................................................................................................................ 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGAAGGGCTGGTCATGAAC............................................................................................................................. 19 2 2.50 2.50 - - - - 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................CTTTGTGGGAAGTGGCAGCAGTGGGGGCA................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GTCATGAACTCGGATATACTCGGTG............................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGAACTCGGATATACTCGGTGCTACCACAG.................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GGAAGATCTTTGTGGGAAGTGGCAGCAGTGGG..................................................................................................................................................... 32 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................GGAAGACTTTGGGCACTGGGACAGTGt............................. 27 t 2.00 0.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TACTGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACTT............................................... 28 2 2.00 2.00 0.50 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................ACGGGAAGATCTTTGTGGGAAGTGGCA............................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CTCGGATATACTCGGTGCTACCACAGt................................................................................................... 27 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - -
..........TGAAGGGATGTCAAAGTCATACTGCAGT.................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................ACTCGGATATACTCGGTGCTACCACAG.................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................CGGATATACTCGGTGCTACCACAGAGGTT............................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................ATACTGCAGTGGGACAGAACGGGTG..................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGACGGGAAGATCTTTGTGGGAAGTGGC.............................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AAAGTCATACTGCAGTGGGACAGAACGG........................................................................................................................................................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TATACTCGGTGCTACCACAGAGGTTCT............................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGGTCATGAACTCGGATATACTCGGT.............................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................ACGGGAAGATCTTTGTGGGAAGTGGCAGC........................................................................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
............................................................................................................................CTCGGATATACTCGGTGCTACCACAGAGGT................................................................................................ 30 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GACGGGAAGATCTTTGTGGGAAGTGG............................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TCATACTGCAGTGGGACAGAACGGGTG..................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TACTGCAGTGGGACAGAACGGGTGA.................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGGCTGACGGGAAGATCTTTGTGGGAA................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGGTCATGAACTCGGATATACTCGGTG............................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TCGGATATACTCGGTGCTACCACAGAGGgt............................................................................................... 30 gt 2.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................CGGGAAGATCTTTGTGGGAAG.................................................................................................................................................................. 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGAACTCGGATATACTCGGTGCTACCACAGt................................................................................................... 31 t 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TCGGATATACTCGGTGCTACCACAGAG.................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGAACTCGGATATACTCGGTGCTACCA....................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGGTCATGAACTCGGATATACTCGGTGCT........................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGAAGGGCTGGTCATGAACTCGGA........................................................................................................................ 24 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
............................................................................................................................................................................................TGCAAAGGAAGACTTTGGGCACTGGG.................................... 26 2 1.50 1.50 - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAAGATACAGACTCTACTGGACCCTAGTGt........................................................... 31 t 1.50 1.00 - - - - - 1.00 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACTTTGG............................................ 28 2 1.50 1.50 - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGGCTGACGGGAAGATCTTTGTGGaa.................................................................................................................................................................... 26 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............AAGGGATGTCAAAGTCATACTGCAGTG................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TCGGATATACTCGGTGCTACCACAGAGGTTt.............................................................................................. 31 t 1.00 23.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TACCACAGAGGTTCTGATTGAAGATAt................................................................................. 27 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGTCAAAGTCATACTGCAGTGGGACAGt............................................................................................................................................................................................................ 28 t 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AAGCTGAAGGGATGTCAAAGTCATACT......................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................CAGACTCTACTGGACCCTAGTGt........................................................... 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACTTTGa............................................ 28 a 1.00 0.50 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TCATGAACTCGGATATACTCGGTG............................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TCATGAACTCGGATATACTCGGTGC............................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AAGTCATACTGCAGTGGGACAGAACGGG....................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................GAAGATCTTTGTGGGAAGTGGCAGgagt........................................................................................................................................................ 28 gagt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TCGGATATACTCGGTGCTACCACAGAGGa................................................................................................ 29 a 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GTCATACTGCAGTGGGACAGAACGGtt...................................................................................................................................................................................................... 27 tt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TATGGCTGACGGGAAGAT.............................................................................................................................................................................. 18 2 1.00 1.00 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGCAAAGGAAGACTTTGGGCACTGGaa................................... 27 aa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGCAAAGGAAGACTTTGGGCACTGGac................................... 27 ac 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TAGAAGCTGAAGGGATGTCAAAGTCAa............................................................................................................................................................................................................................ 27 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TACCACAGAGGTTCTGATTGAAGATA.................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AAGTCATACTGCAGTGGGACAGAACGGGT...................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGGGCTGGTCATGAACTCGGATATACTCGG............................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................GGCTGACGGGAAGATCTTTGTGGGA.................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TTGAAGATACAGACTCTACTGGACCCTAGT............................................................. 30 2 1.00 1.00 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TATACTCGGTGCTACCACAGAGGTT............................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TACTGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACTTTGGt........................................... 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GAAGCTGAAGGGATGTCAAAGTCATA........................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGAAGGGCTGGTCATGAACTCGGATATt.................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GTCATACTGCAGTGGGACAGA............................................................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GACGGGAAGATCTTTGTGGGAAGTGGCAG............................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................ACTGGACCCTAGTGCAAAGGAAGAC................................................. 25 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TCTACTGGACCCTAGTGCAAAGGAAGAC................................................. 28 2 1.00 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCAAAGTCATACTGCAGTGGGACAGAAC.......................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................GAAGATCTTTGTGGGAAGTGGCAGga.......................................................................................................................................................... 26 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................ATACTGCAGTGGGACAGAACGGGT...................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TCATACTGCAGTGGGACAGAACGGG....................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................ACCACAGAGGTTCTGATTGAAGATACAGAC............................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TTCTGATTGAAGATACAGACTCTACTGGACa.................................................................. 31 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................ATCTTTGTGGGAAGTGGCAGCAGTGG...................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TCGGATATACTCGGTGCTACCACAGA................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................GGGCTGGTCATGAACTCGGATATACTCGG............................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AAAGTCATACTGCAGTGGGACAGAAC.......................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGGAAGTGGCAGCAGTGGGGGC.................................................................................................................................................. 23 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................TAGTGCAAAGGAAGACTTTGGGCACTt...................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
........................................................................AGATCTTTGTGGGAAGTGGCAGCAGT........................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................CACTGAAGGGCTGGTCATGAACTCG.......................................................................................................................... 25 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................TGGGCACTGGGACAGTGCAG........................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TATACTCGGTGCTACCAC...................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................GGGAAGATCTTTGTGGGAAGTGGCAGC........................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................GCAAAGGAAGACTTTGGGCACTGGGACA................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGGGACAGTGCAGACTTTGTATTTAAAAG........... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................ATGAACTCGGATATACTCGGTGCTA.......................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TCGGATATACTCGGTGCTACCA....................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGGCTGACGGGAAGATCTTTGTGGG..................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TACTGGACCCTAGTGCAAAGGAAGAa................................................. 26 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTATGGCTGACGGGAAGATCTTTGT........................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................GCAAAGGAAGACTTTGGGCACTGGGAC.................................. 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TCTTTGTGGGAAGTGGCAGCAGggg...................................................................................................................................................... 25 ggg 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................GAAGACTTTGGGCACTGGGACAGTGt............................. 26 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TGGTCATGAACTCGGATATACTCGGTGt............................................................................................................ 28 t 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................ACGGGAAGATCTTTGTGGGAAGTGG............................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................GTCATGAACTCGGATATACTCGGTGCTACCA....................................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........CTGAAGGGATGTCAAAGTCATACTGCAG..................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................AGTGCAAAGGAAGACTTTGGGCACTGGtat.................................. 30 tat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCAAAGTCATACTGCAGTGGGACAGAACGG........................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................AAGATCTTTGTGGGAAGTGGCAGCAGT........................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........TGAAGGGATGTCAAAGTCATACTGCAG..................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................TACTCGGTGCTACCACAGAGGTTCTGATT......................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGGGACAGTGCAGACTTTGTATTTAAAAGt.......... 30 t 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGGGACAGAACGGGTGAGCCTTATGGCT......................................................................................................................................................................................... 28 2 1.00 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TACTGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACT................................................ 27 2 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................CTACTGGACCCTAGTGCAAAGGA..................................................... 23 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................GAAGACTTTGGGCACTGGGA................................... 20 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GACGGGAAGATCTTTGTGGG..................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TACTGCAGTGGGACAGAACGGGTGAGC.................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................GAAGATCTTTGTGGGAAGTGGCAGC........................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TAGAAGCTGAAGGGATGTCAAAGTCATA........................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TAGAAGCTGAAGGGATGTCAAAG................................................................................................................................................................................................................................ 23 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - -
.....................................TGGGACAGAACGGGTGAGCCTTATGGCTGA....................................................................................................................................................................................... 30 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TACAGACTCTACTGGACC.................................................................. 18 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................TGTCAAAGTCATACTGCAGTGGGACA.............................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................AGCAGTGGGGGCACTGAAGGGCTGGaa................................................................................................................................... 27 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GACGGGAAGATCTTTGTGGGAAGTGGCA............................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................CTGGGACAGTGCAGACTTTGTATTTAAAAGA.......... 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................TACTGCAGTGGGACAGAACGGGTG..................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TATACTCGGTGCTACCACAGAGGTTCTGA........................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................TCGGATATACTCGGTGCTACCAC...................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................TTATGGCTGACGGGAAGATCTTTtt........................................................................................................................................................................ 25 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................TATGGCTGACGGGAAGATCTTTGTGt...................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TACAGACTCTACTGGACCCTAGTGa........................................................... 25 a 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGATTGAAGATACAGACTCTACTGGA.................................................................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGGGACAGAACGGGTGAGCCTTATGG........................................................................................................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAAGATACAGACTCTACTGGACCCTAGTG............................................................ 30 2 1.00 1.00 - - - - - 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................CGGGAAGATCTTTGTGGGAAGTGGCA............................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................TCATACTGCAGTGGGACAGAACGGGT...................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................TGCAAAGGAAGACTTTGGGCACTGGGA................................... 27 2 1.00 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................CGGGAAGATCTTTGTGGGAAGTGGCAGC........................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................GACGGGAAGATCTTTGTGGGAA................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................AGGAAGACTTTGGGCACTGGGACAGTGCAGt.......................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................GGCTGACGGGAAGATCTT........................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................TGAACTCGGATATACTCGGTGCTACCACAtt................................................................................................... 31 tt 1.00 5.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGTCAAAGTCATACTGCAGTGGGACAG............................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................AAGATCTTTGTGGGAAGTGGCA............................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................GGAAGACTTTGGGCACTGGGACAGTGCAGtt......................... 31 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................CACAGAGGTTCTGATTGAAGATACAGACTC........................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................CTTTGTGGGAAGTGGCAGCAGTGG...................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................TACCACAGAGGTTCTGATTGAAGATACAtt.............................................................................. 30 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................CAAAGGAAGACTTTGGGCACTGGGAC.................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................GGATATACTCGGTGCTACCACAGAGGg................................................................................................ 27 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................ACGGGAAGATCTTTGTGGGAAGTGGC.............................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGAAGGGCTGGTCATGAACTCGGATA...................................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AAGGGCTGGTCATGAACTCGGATATACTC................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................GTGGGAAGTGGCAGCAGTGGGGGCACTGAA............................................................................................................................................ 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................TGGCTGACGGGAAGATC............................................................................................................................................................................. 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TAGAAGCTGAAGGGATGTCAAAGT............................................................................................................................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACTTT.............................................. 26 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TCTGATTGAAGATACAGACTCTACTG...................................................................... 26 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TCTACTGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACTTT.............................................. 31 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACTTTGGacat........................................ 32 acat 0.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TCTACTGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACT................................................ 29 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................GACTCTACTGGACCCTAG.............................................................. 18 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TTGAAGATACAGACTCTACTGGACCCT................................................................ 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAAGATACAGACTCTACTGGACCCTAGT............................................................. 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TCTGATTGAAGATACAGACTCTACTGGAC................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................ATGGCTGACGGGAAGAT.............................................................................................................................................................................. 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGAAGGGCTGGTCATGAACTCGGATATA.................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TACAGACTCTACTGGACCCTAGTGCAtt........................................................ 28 tt 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................TCTGATTGAAGATACAGACTCTACTGGt.................................................................... 28 t 0.50 3.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GTGGGACAGAACGGGTGAGC.................................................................................................................................................................................................. 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGGGAAGTGGCAGCAGTGGGGGCACTG.............................................................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................ACAGAACGGGTGAGCCTTATGGCTGACGGG................................................................................................................................................................................... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................TGGGACAGAACGGGTGAGCCTTATGGC.......................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................ACTGAAGGGCTGGTCATGAACTCGGA........................................................................................................................ 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TTGAAGATACAGACTCTACTGGACCC................................................................. 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................AAGGGCTGGTCATGAACTCGGATATACT.................................................................................................................. 28 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAAGATACAGACTCTACTGGACCCTA............................................................... 27 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TACAGACTCTACTGGACCCTAGTGCt.......................................................... 26 t 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TACAGACTCTACTGGACCCTAGTGC........................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAAGATACAGACTCTACTGGACCCT................................................................ 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................TGAAGGGCTGGTCATGAACTCGGAT....................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................ACAGACTCTACTGGACCCTAGTGCA.......................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -
...........................................................................................................GAAGGGCTGGTCATGAACTCGGATATACT.................................................................................................................. 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TACAGACTCTACTGGACCCTAGTGCAAAGG...................................................... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................ATGGCTGACGGGAAGATtt............................................................................................................................................................................ 19 tt 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACTTTGGaca......................................... 31 aca 0.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGGGCTGGTCATGAACTCGGAT....................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGATTGAAGATACAGACTCTACTGGACC.................................................................. 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACTTTG............................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................AGGAAGACTTTGGGCACT....................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................GACAGAACGGGTGAGCCTTATG............................................................................................................................................................................................ 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TTGAAGATACAGACTCTACTGGACCCTA............................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................TACTGGACCCTAGTGCAAAGGAAGAC................................................. 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................CTGCAGTGGGACAGAACGGGTG..................................................................................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TGCAGTGGGACAGAACGGGTGAGCCT................................................................................................................................................................................................ 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - -
............................................................................................................................................................TGATTGAAGATACAGACTCTACTGGACCCT................................................................ 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................GGCTGACGGGAAGATCT............................................................................................................................................................................ 17 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.GCTAGAAGCTGAAGGGATGTCAAAGT............................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................ATACAGACTCTACTGGACCCTAGTGC........................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................TGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACTTTGGaa.......................................... 30 aa 0.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GAAGCTGAAGGGATGTCA................................................................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGATTGAAGATACAGACTCTAC........................................................................ 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................CTTATGGCTGACGGGAAGA............................................................................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................CAGTGGGGGCACTGAAGGGCTGGTCATGAACTCG.......................................................................................................................... 34 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................GATACAGACTCTACTGGACCCTAGT............................................................. 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................ACTGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACTT............................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................CTGAAGGGCTGGTCATGAACTCGG......................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TACAGACTCTACTGGACCCTAGTGCA.......................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TTCTGATTGAAGATACAGACTC........................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50
..................................................................................................................................................................................TGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACTTTGGGC.......................................... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TACAGACTCTACTGGACCCTAGTGCAA......................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................ATGGCTGACGGGAAGATCT............................................................................................................................................................................ 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TGAAGATACAGACTCTACTGGACC.................................................................. 24 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................AGGGCTGGTCATGAAC............................................................................................................................. 16 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGATTGAAGATACAGACTCTACTGGAC................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................ACTGCAGTGGGACAGAACGGGTGAGCCTTA.............................................................................................................................................................................................. 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................ATCTTTGTGGGAAGTG................................................................................................................................................................ 16 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................GAAGATCTTTGTGGG..................................................................................................................................................................... 15 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGAAGCTGAAGGGATGT..................................................................................................................................................................................................................................... 17 5 0.20 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TGCTAGAAGCTGAAGGGATGTCAAAGTCATACTGCAGTGGGACAGAACGGGTGAGCCTTATGGCTGACGGGAAGATCTTTGTGGGAAGTGGCAGCAGTGGGGGCACTGAAGGGCTGGTCATGAACTCGGATATACTCGGTGCTACCACAGAGGTTCTGATTGAAGATACAGACTCTACTGGACCCTAGTGCAAAGGAAGACTTTGGGCACTGGGACAGTGCAGACTTTGTATTTAAAAGATAAAAAGGAC
.....................................................((((....))))..(((...(((((((((((....(((((.(((((....)))))..(((...(((.((....)))))...)))..)))))))))))))))))))............................................................................................
.....................................................54......................................................................................................158..........................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)