chr19:8839472 8839721 +
(9)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(2)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(44)
TESTES

Sense strand
GACAGAAACCCCATGTGTGACAACTTCGGAGACCAGTCCAGCTATATCAGGTCAGTTGTAGCCTCTGTCTCCCCTCCTGGGGACATTCACCCCTGGGAGGCTGAGCTCATGCACCCTGACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAACCACCTGTTCTTTGGGAGGAGGATCATGTATTCCTTTCTGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGCTCTGTCCCAGATCTCTTCTTTCTTCTCAC
..................................................(((((.((((..(((.(((((((.....((((.......)))).))))))).)))....))))..)))))..(((.(((.((.((((............)))))).)))...))).....................................................................................
..................................................51.................................................................................................................166..................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
..................................................GTCAGTTGTAGCCTCTGTCTCCCCTCCTGGGGACATTCACCCCTGGGAGGCT.................................................................................................................................................... 52 1 42.00 42.00 42.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAAC........................................................................................ 29 1 40.00 40.00 - 9.00 6.00 - 4.00 6.00 - 2.00 1.00 2.00 - - 2.00 3.00 1.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
....................................................................................................................TGACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACAT.......................................................................................................... 28 1 10.00 10.00 - 1.00 1.00 1.00 - - - 1.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - 1.00
......................................................................................................................................AGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAAC........................................................................................ 28 1 9.00 9.00 - 2.00 3.00 - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACAT.......................................................................................................... 27 1 7.00 7.00 - - - 1.00 4.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACATGC........................................................................................................ 27 1 7.00 7.00 - - - 4.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................GTGCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGC..................................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGA.......................................................................................... 27 1 6.00 6.00 - 2.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAA......................................................................................... 28 1 6.00 6.00 - 1.00 - - 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGG........................................................................................... 26 1 6.00 6.00 - - 1.00 - 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAACC....................................................................................... 30 1 5.00 5.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................GTGCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGCCC................................................................................................... 29 1 5.00 5.00 - - 2.00 - - - 1.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGCCC................................................................................................... 28 1 5.00 5.00 - 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
.................TGACAACTTCGGAGACCAGTCCAGCTA.............................................................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 - 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGCTCTG......................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACA........................................................................................................... 27 1 4.00 4.00 - - 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................ACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGA.......................................................................................... 28 1 4.00 4.00 - 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACATG......................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TTCTGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGC............................. 25 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GCTGGAACCACCTGTTCTTTGGGAGG...................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - - - - - - - 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................CCCTGACCAGTGCCCGTCTACAGGAG............................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................GTGCCCGTCTACAGGAGAACATGCAG...................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACA........................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - 1.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGt.......................................................................................... 27 t 3.00 6.00 - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................GCCCTGAGCTGGAACCACCTGTTCTTT............................................................................ 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGTGTGACAACTTCGGAGACCAGTCCAGC................................................................................................................................................................................................................ 29 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TTCTGCCTGTCTGTTGTCTCCTAG.............................. 24 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGC.............................................................................................. 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGCCCT.................................................................................................. 28 1 3.00 3.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCTACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGG........................................................................................... 30 1 3.00 3.00 - - 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CTGTTGTCTCCTAGCTCTGTCCCAGATC................ 28 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTtt........................................................................................... 26 tt 2.00 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGt........................................................................................... 29 t 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................TGTCTCCTAGCTCTGTCCCAGATCTCT............. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGACAACTTCGGAGACCAGTCCAGCTATt............................................................................................................................................................................................................ 29 t 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTACAGGAGAACATGCAGCCCTGAG............................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGACAACTTCGGAGACCAGTCCAGCT............................................................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACATt......................................................................................................... 28 t 2.00 7.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTCAGTTGTAGCCTCTGTCTCCCCTCC............................................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................CTCCTAGCTCTGTCCCAGATCTCTTCT.......... 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGA................................................................................................ 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACATG......................................................................................................... 29 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................GTGCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGCC.................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................GTGCCCGTCTACAGGAGAACATGaaaa..................................................................................................... 27 aaaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGt.............................................................................................. 26 t 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TTCCTTTCTGCCTGTCTGTTGTCTCC................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGCTGGAACCACCTGTTCTTTGGGAG....................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
.......................................................................................................................................GGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAA......................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTCAGTTGTAGCCTCTGTCTCCCCTC.............................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAAt........................................................................................ 29 t 2.00 6.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGACAACTTCGGAGACCAGTCCAGCTAT............................................................................................................................................................................................................. 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................TTTCTGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGC............................. 26 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGCC.................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................CCCTGACCAGTGCCCGTCTACAGGAGA.............................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................ATGCAGCCCTGAGCTGGAACCACCTGT................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAAtt....................................................................................... 32 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................CTGAGCTCATGCACCCTGACCAGTGCC........................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................ACCCTGACCAGTGCCCGTCTACAGGAGc.............................................................................................................. 28 c 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGCTGGAACCACCTGTTCTTTGGGA........................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACATGCA....................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGtac........................................................................................ 29 tac 1.00 6.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................GAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAAC........................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................GTGCCCGTCTACAGGAGAACATGCA....................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGTTCTTTGGGAGGAGGATCATGTATTt........................................................ 28 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TATCAGGTCAGTTGTAGCCTCTGTCTt................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CCTTTCTGCCTGTCTGTTGTCTCCTA............................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCTACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGC.............................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TTCTGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGa............................. 25 a 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGG........................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGTGTGACAACTTCGGAGACCAGTCCtt................................................................................................................................................................................................................. 28 tt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCTACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGt........................................................................................... 30 t 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TGTTGTCTCCTAGCTCTGTCCCAGATtaa.............. 29 taa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGAGCTCATGCACCCTGACCAGTcccc.......................................................................................................................... 27 cccc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................AGCTGGAACCACCTGTTCTTTGGGAGG...................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTCAGTTGTAGCCTCTGTCT.................................................................................................................................................................................... 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................TTGGGAGGAGGATCATGTATTCCTTTCT.................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGCTCTGTCCt..................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTTGTAGCCTCTGTCTCCCCTCC............................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGG........................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAA......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTATTCCTTTCTGCCTGTCTGTTG...................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................GTGCCCGTCTACAGGAGAACATGC........................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGtatt....................................................................................... 28 tatt 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TCTGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGCTCTGT........................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................GTGCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGCCt................................................................................................... 29 t 1.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CCAGTCCAGCTATATCAG........................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAAC............................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACctgc........................................................................................................ 27 ctgc 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................TCCTTTCTGCCTGTCTGTTGTCTCCT................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................GAGCTGGAACCACCTGTTCTTTGGGAGG...................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................AGTGCCCGTCTACAGGAGAACATGCAG...................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGCC.................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TTCTGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGtta........................... 27 tta 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................CTGTTGTCTCCTAGCTCTGTCCCAGAT................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GCTCTGTCCCAGATCTCTTCTTTCTTCTC.. 29 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................CCTGTCTGTTGTCTCCTAGCTCTGTCC...................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TCCTAGCTCTGTCCCAGATCTCTTCTT......... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AGGAGAACATGCAGCCCTGAGC.............................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGCt.................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACATGCAt...................................................................................................... 29 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAACCA...................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................ACATGCAGCCCTGAGCTGGAACCAC..................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGAGCTCATGCACCCTGACCAGTGC............................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGAGCTCATGCACCCTGACCAGTGCCCGT........................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................ACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACATGC........................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................TGCAGCCCTGAGCTGGAACCACCTGTa................................................................................ 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GTCTACAGGAGAACATGCAGCCC................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGACAACTTCGGAGACCAGTCCAGC................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................AGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGta.......................................................................................... 26 ta 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TTCTGCCTGTCTGTTGTCTCCTA............................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGC..................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................GAACATGCAGCCCTGAGCTGGAACCACC.................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GCCCGTCTACAGGAGAACATGCt....................................................................................................... 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...................................................................................................................................TACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGG........................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TCTGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGCTCa.......................... 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGTTGTAGCCTCTGTCTCCCCTCCTG........................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GCTGGAACCACCTGTTCTTTGGGAGGAG.................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................TGGAACCACCTGTTCTTTGGGAGGAGGt.................................................................. 28 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CCAGTGCCCGTCTACAGGAGAAaatg......................................................................................................... 26 aatg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CCCTGAGCTGGAACCACCTGTTCTTT............................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTATTCCTTTCTGCCTGTCTGTTGTC.................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGcac........................................................................................ 29 cac 1.00 6.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................TGAGCTCATGCACCCTGACCAGTGCCCG......................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGt.......................................................................................... 30 t 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................ATCAGGTCAGTTGTAGCCTCTGTCTCC.................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCTACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTG............................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACATGt........................................................................................................ 27 t 1.00 4.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................CCTGTTCTTTGGGAGGAGGATCATG............................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGCTGGAACCACCTGTTCTTTGGGAGG...................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................TGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGCTCT.......................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGCTGGAACCACCTGTTCTTTGGGAGt...................................................................... 29 t 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GCCCGTCTACAGGAGAACATGCAtt..................................................................................................... 25 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
......................................................................................................................................................................................................CTGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGCTCT.......................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................CTGACCAGTGCCCGTCTACAGGAGgac............................................................................................................ 27 gac 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TCCTAGCTCTGTCCCAGATCTCTTCTTTCT...... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTATTCCTTTCTGCCTGTCTGTTGTCTt.................................. 29 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CCTTTCTGCCTGTCTGTTGTCTCCTAG.............................. 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................CCTTTCTGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGC............................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAACC....................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................CCTGTTCTTTGGGAGGAGGATCATGT............................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTt............................................................................................ 25 t 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTCAGTTGTAGCCTCTGT...................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAA............................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGCTGGAACCACCTGTTCTTTGGGc........................................................................ 27 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.......................................................................................................................................GGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAACCACC.................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGTGTGACAACTTCGGAGACCAGTCCA.................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................GTCTACAGGAGAACATGCAGCCCTGA................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............TGTGTGACAACTTCGGAGACCAG...................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................GCACCCTGACCAGTGCCCGTC....................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGG........................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................CTACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAA......................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................ACATGCAGCCCTGAGCTGGAACCACCTG.................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTCAGTTGTAGCCTCTGTCTCCCCTttt............................................................................................................................................................................ 28 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACATGt........................................................................................................ 29 t 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCT............................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................CTGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGCTC........................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................GGAGGATCATGTATTCCTTTCTG................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACATG......................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TATCAGGTCAGTTGTAGCCTCTGTCT.................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................TATCAGGTCAGTTGTAGCCTCTGTCTC................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................GTGCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGCCCT.................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACAagc........................................................................................................ 29 agc 1.00 3.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................GACCAGTGCCCGTCTACAGGAG............................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TATATCAGGTCAGTTGTAGCCTCTGTC..................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................CCAGTGCCCGTCTACAGGAGAAa............................................................................................................ 23 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGta......................................................................................... 28 ta 1.00 6.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................CTGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGCT............................ 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................CAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAACa....................................................................................... 30 a 1.00 40.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................GCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGCCC................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................TGTCCCAGATCTCTTCTTTCTTCTCA. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTATTCCTTTCTGCCTGTCTGTTGTt.................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGCACCCTGACCAGTGCCCGTCTACAGGAGt.............................................................................................................. 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................TCTACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAAC........................................................................................ 33 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................AGTGCCCGTCTACAGGAGAACATGt........................................................................................................ 25 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................GCCCTGAGCTGGAACCACCTGTTCT.............................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................TACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGA.......................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................GTGACAACTTCGGAGACCAGTCCAGCT............................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGCCCT.................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................TGACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACATGC........................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................GGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAAC........................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................TAGCTCTGTCCCAGATCTCTTCTTTCTTCT... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................TGTTCTTTGGGAGGAGGATCATGTA........................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TGACAACTTCGGAGACCAGTCCAGCTATATt.......................................................................................................................................................................................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CATGTGTGACAACTTCGGAGAC......................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................TGGGAGGAGGATCATGTATTCCTTTCT.................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................ACCTGTTCTTTGGGAGGAGGATCATG............................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................TGTATTCCTTTCTGCC............................................... 16 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GACAGAAACCCCATGTGTGACAACTTCGGAGACCAGTCCAGCTATATCAGGTCAGTTGTAGCCTCTGTCTCCCCTCCTGGGGACATTCACCCCTGGGAGGCTGAGCTCATGCACCCTGACCAGTGCCCGTCTACAGGAGAACATGCAGCCCTGAGCTGGAACCACCTGTTCTTTGGGAGGAGGATCATGTATTCCTTTCTGCCTGTCTGTTGTCTCCTAGCTCTGTCCCAGATCTCTTCTTTCTTCTCAC
..................................................(((((.((((..(((.(((((((.....((((.......)))).))))))).)))....))))..)))))..(((.(((.((.((((............)))))).)))...))).....................................................................................
..................................................51.................................................................................................................166..................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
....................................................................................................AGCTCATGCACCCttc...................................................................................................................................... 16 ttc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -