(1)
OTHER.ip
(11)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(2)
PIWI.ip
(33)
TESTES

Sense strand
GGGGCTGGCCCAGGGAGGGACACCCCCAACCCCCATTTCATTTGCCCTGGGTAGGAAAGACCACTTTATACACTCCAGAGTGACGGGTCTAGGGCCCAGGGCCCAGGTTACCCGTGCCCACCCCCACCCCCACCCCCACGCCCGACTCTGCTGAGAAGGAAAGGCCTGACAACCTCAACTTCTTTTTTCCAGAGTTTCCAGGTCTCACCACCTATTGCAGGTCCCACCCCTCCGTATTTATT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
.....................................................................................................................................................................................CTTTTTTCCAGAGTTTCCAGGTCTC.................................... 25 1 6.00 6.00 - - - - - - - - - - - 5.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................GGAAAGACCACTTTATACACTCCAGA................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TACACTCCAGAGTGACGGGTCTAGG..................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
....................................................................TACACTCCAGAGTGACGGGTCTAGGGC................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TATACACTCCAGAGTGACGGGTCTAG...................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGAAGGAAAGGCCTGACAACCattt................................................................ 27 attt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TAGGAAAGACCACTTTATACACTCCAGAGT................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...................................TTTCATTTGCCCTGGGTAGGAAAGACCAC.................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTAGGAAAGACCACTTTATACACTCCAGAG.................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
........................................................................CTCCAGAGTGACGGGTCTAa...................................................................................................................................................... 20 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGCTGAGAAGGAAAGGCCcgac........................................................................ 22 cgac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGCTGAGAAGGAAAGGCCTGA......................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................TATACACTCCAGAGTGACGGGTCTAGGa.................................................................................................................................................... 28 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TGGGTAGGAAAGACCACTTTATACACTC....................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................AGACCACTTTATACACTCCAGAGTGACGGG........................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGCTGAGAAGGAAAGGCCTGACAACCTCAAt............................................................... 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGCTGAGAAGGAAAGGCCTGACAACCT................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TCCCACCCCTCCGTcgc.... 17 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CCCCAACCCCCATTTCATTTGCCCTGG................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................CTTTATACACTCCAGAGTGACGGGTCT........................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AGGAAAGACCACTTTATACACTCCAGAGT................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AGGAAAGACCACTTTATACACTCCAGA................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TTGCCCTGGGTAGGAAAGACCACTT................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................CTCCAGAGTGACGGGTCTAGGGCC.................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
...............................................................................................................................................................................CAACTTCTTTTTTCCAGAGTTTCCAGGTC...................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CTGGCCCAGGGAGGtcgg............................................................................................................................................................................................................................ 18 tcgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................AGGAAAGACCACTTTATACACTCCAGAG.................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TGAGAAGGAAAGGCCTGACAACCTC.................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................TTTCATTTGCCCTGGGTAGGAAAGACCACT................................................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
GGGGCTGGCCCAGGGAGGGACACCCCCAACCCCCATTTCATTTGCCCTGGGTAGGAAAGACCACTTTATACACTCCAGAGTGACGGGTCTAGGGCCCAGGGCCCAGGTTACCCGTGCCCACCCCCACCCCCACCCCCACGCCCGACTCTGCTGAGAAGGAAAGGCCTGACAACCTCAACTTCTTTTTTCCAGAGTTTCCAGGTCTCACCACCTATTGCAGGTCCCACCCCTCCGTATTTATT


Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
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testes_rep3. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR248527(GSM733815)
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SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363959(GSM822761)
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SRR363958(GSM822760)
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cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR363957(GSM822759)
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SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
GSM475279(GSM475279)
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.............................................................................................................................CCCCCACCCCCACGCCCGc.................................................................................................. 19 c 46.14 0.00 7.43 21.29 0.71 0.29 3.14 2.14 4.43 2.14 - - 0.86 - 0.14 0.71 0.71 - - - 0.43 - 0.14 0.14 0.86 - - - - - - 0.14 0.14 0.29 - -
...............................................................................................................................CCCCACCCCCACGCCCG.................................................................................................. 17 10 29.30 29.30 9.30 2.90 5.50 5.70 2.20 0.90 0.30 2.30 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - 0.10 - - -
................................................................................................................................CCCACCCCCACGCCCG.................................................................................................. 16 10 28.20 28.20 9.00 3.80 6.40 1.00 3.30 1.30 0.80 2.30 - - - - - - - - - - - - - 0.30 - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCCCCACCCCCACGCCCGcc.................................................................................................. 20 cc 20.29 0.00 0.71 1.57 0.57 1.29 5.14 0.29 2.71 - 0.14 1.29 2.57 - 1.43 0.43 0.86 - - - 0.14 0.14 - 0.14 0.14 - - - - - - 0.57 - - - 0.14
..............................................................................................................................CCCCCACCCCCACGCCCG.................................................................................................. 18 7 19.14 19.14 3.71 4.43 1.43 4.43 2.43 0.14 - 0.71 0.29 - 0.43 - 0.14 0.14 0.57 - - - - - - - - - - - - - - - 0.29 - - -
.................................................................................................................................CCACCCCCACGCCCG.................................................................................................. 15 11 17.91 17.91 12.64 0.09 0.91 0.18 - 1.36 - 2.36 - - - - - - - - - - - - - 0.27 0.09 - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCCCCACCCCCACGCCCGccgg.................................................................................................. 22 ccgg 13.00 0.00 0.29 0.29 4.00 5.29 1.57 0.71 0.71 - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................CCCCCACCCCCACGCCCccgg................................................................................................... 21 ccgg 12.00 0.00 3.00 - 3.00 4.00 - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CCCCCACCCCCACGCCCGccg.................................................................................................. 21 ccg 4.86 0.00 0.43 - 1.86 - 0.43 0.86 0.57 - 0.14 - 0.14 - 0.14 0.14 - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................CCCCCACCCCCACGCCCGACc................................................................................................ 21 c 2.00 0.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCCCACCCCCACGCCCtcc................................................................................................... 19 tcc 2.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................ACCCCCACGCCCGAC................................................................................................ 15 2 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCCACCCCCACGCCCtgcc................................................................................................... 19 tgcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................CCCCCACCCCCACGCCCGAC................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CCCACCCCCACGCCCGAC................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCCCCACCCCCACGCCCGACcc................................................................................................ 22 cc 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................ACCCCCATTTCATTgtct........................................................................................................................................................................................................ 18 gtct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................CCCCCACCCCCACGCCCGA................................................................................................. 19 2 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................CACCCCCACGCCCGtggg.................................................................................................. 18 tggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCCACCCCCACGCCtgcc.................................................................................................... 18 tgcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................CCCCACCCCCACGCCCGAC................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................GAGTTTCCAGGTCTcgc..................................... 17 cgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................CCCACCCCCACGCCCtgc................................................................................................... 18 tgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCCCCACCCCCACGCCCGca.................................................................................................. 20 ca 0.57 0.00 - 0.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCCCCACCCCCACGCCCGAcc................................................................................................. 21 cc 0.50 0.00 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CCCACCCCCACGCCCGA................................................................................................. 17 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................ACCCCCACCCCCACGCCCGcgg.................................................................................................. 22 cgg 0.33 0.00 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCCACCCCCACGCCCGtgcc.................................................................................................. 20 tgcc 0.20 0.00 - - - - - - - - - 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................ACCCCCACCCCCACGCCCG.................................................................................................. 19 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................ACCCCCACCCCCACGCCCGcg.................................................................................................. 21 cg 0.17 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 -
............................................................................................................................CCCCACCCCCACGCCCGtcc.................................................................................................. 20 tcc 0.10 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.10 -
...............................................................................................................................CCCACCCCCACGCCCGa.................................................................................................. 17 a 0.10 0.00 - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................CCCCACCCCCACGCCCGtc.................................................................................................. 19 tc 0.10 0.00 - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................CCCACCCCCACGCCCGt.................................................................................................. 17 t 0.10 0.00 - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................CCCCACCCCCACGCCCGccgg.................................................................................................. 21 ccgg 0.10 0.00 - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................CCACCCCCACGCCCGaggc.................................................................................................. 19 aggc 0.09 0.00 - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CCACCCCCACGCCCGa.................................................................................................. 16 a 0.09 0.00 - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -