chr19:6057952 6058295 +
(1)
OTHER.ip 		(12)
OTHER.mut 		(3)
OVARY 		(9)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(46)
TESTES

Sense strand
TCTTTCTTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGCGTCCGCGGGCTAGGTGAGACACGGGGGACTGCTGGGCCAGGAGCGCTCGGTAGCCAGCGGTCTACGGGCTCAGAGGGTGCGGGGAAGGCAAAGTACAAGGGCGGTTCTGCGGCCTTCGCTCCGTCTCCATCCGGGTCCCCGGCGAGCCTGGCCTTCCGCATGGGAGACCGCGCAATCCCCCGCCTTGATTACCGTACCGCGACCTTTCTCCTGGGCTGCTCCCTATCATCACTCACAAGCCTTTCTTCCTTCAGTAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCCTCGAGGTG
......................................................................................................................................................................................................((((((..(((........)))..((((.........(((.(((.......))).)))........))))............))))))..........................................................
..................................................................................................................................................................................................195................................................................................................294................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCC........................ 29 2 100.00 100.00 4.50 30.50 24.50 0.50 14.50 - 12.00 10.50 - - - - - 2.00 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGC......................... 28 2 59.50 59.50 4.00 10.00 7.00 0.50 6.50 5.00 1.00 5.00 4.00 2.00 3.00 0.50 - 0.50 - 1.00 0.50 - - 1.00 - 1.50 0.50 - 1.50 - 0.50 1.00 - - 0.50 - - - 0.50 - - - 0.50 - - - - 0.50 0.50 - - - 0.50
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACC......... 27 2 26.00 26.00 9.50 - - 8.00 - 1.50 - - 0.50 3.00 - 0.50 0.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCCTC...... 29 2 15.00 15.00 10.50 - - 2.00 - 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCC........................ 28 2 14.50 14.50 - 2.50 2.50 - 2.00 - 4.50 1.00 - - - - 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAAC................. 27 2 12.00 12.00 1.50 - - 0.50 0.50 3.50 0.50 - 1.50 1.00 - 0.50 0.50 0.50 - 0.50 - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACAC.......... 28 2 12.00 12.00 6.00 - - 3.00 - 0.50 - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGC........................... 26 2 11.00 11.00 - - - 0.50 0.50 1.00 0.50 0.50 5.00 - - 1.50 - - - - - - - - - - 0.50 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTCCTTCAGTAGCCAACATGCAGCTCT................................... 29 1 10.00 10.00 - 1.00 2.00 - 4.00 - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 9.00 9.00 - 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - 4.00 1.00 - 0.50 - - - 0.50 - 0.50 - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTTGTCCGCGCCCAGGAACTACAC............ 26 2 8.50 8.50 3.00 - - 3.00 - - - - - - - 0.50 - - - 1.00 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACAC.......... 26 2 7.50 7.50 3.00 - - 1.00 - 0.50 - - - - - - - 0.50 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GGGCTAGGTGAGACACGGGGGACTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCC........ 28 2 7.00 7.00 4.00 - - 1.50 - - - - - 0.50 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCTTCCTTCAGTAGCCAACATGCAGC...................................... 28 1 7.00 7.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCC....................... 30 2 6.50 6.50 - 2.00 2.00 - 0.50 - 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGA................... 25 2 5.50 5.50 0.50 - - - - 2.00 - - - 0.50 - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCt........................ 29 t 5.50 59.50 - 1.00 0.50 - 1.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCCT....... 28 2 5.00 5.00 0.50 - - 1.00 - 1.50 - - - - - - 0.50 - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCG.......................... 27 2 5.00 5.00 0.50 - - 0.50 - 1.00 - - 0.50 0.50 - 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCCTC...... 30 2 5.00 5.00 2.00 - 0.50 1.00 - - - - 0.50 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 2 4.50 4.50 - 0.50 0.50 - - - - - 1.50 0.50 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAA.................. 26 2 4.50 4.50 - 0.50 - - - 1.00 - - - - - - 0.50 - - - - 0.50 0.50 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCC........ 27 2 4.50 4.50 0.50 - - 1.50 - 0.50 - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGCAGCAGCGGCGTCCGCGGGCTA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 4.00 4.00 - 0.50 0.50 - - 0.50 - 0.50 - 1.00 - - - - - - 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CGGCGTCCGCGGGCTAGGT.................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACC......... 29 2 4.00 4.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TATCATCACTCACAAGCCTTTCTTCCT......................................................... 27 1 4.00 4.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGACACGGGGGACTGCTGGGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 4.00 4.00 - - - - - - - - 1.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGCGTCC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 4.00 4.00 - - 1.00 - - 0.50 - 1.00 - 0.50 - 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGC......................... 27 2 3.50 3.50 0.50 2.00 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TTTCTTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 2 3.50 3.50 - 0.50 0.50 - - 1.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCC....................... 26 2 3.00 3.00 - - 0.50 - 0.50 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCC....................... 28 2 3.00 3.00 - - 0.50 - 0.50 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTCCTTCAGTAGCCAACATGCAGCTC.................................... 28 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCGCCCAGGAACTACACACCCTCG..... 27 2 3.00 3.00 1.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACAC.......... 27 2 3.00 3.00 - - - 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCC........ 26 2 3.00 3.00 - - - 0.50 - 0.50 - - - 1.00 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTCCTTCAGTAGCCAACATGCAGCTCTT.................................. 30 1 3.00 3.00 - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCCTC...... 28 2 2.50 2.50 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGCAGCAGCGGCGTCCGCGGGCTAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 2.50 2.50 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGCGTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 2 2.50 2.50 - 1.00 0.50 - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 2.50 2.50 - - - 0.50 - - - - 1.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAAC................. 25 2 2.50 2.50 - - - 0.50 - - - - 1.00 - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGCGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 2 2.50 2.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGACACGGGGGACTGCTGGGCC............................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 2.00 2.00 - 0.50 - - - - 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCC........................ 27 2 2.00 2.00 - - - 0.50 - 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCTATCATCACTCACAAGCCTTTCT............................................................. 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCC....................... 27 2 2.00 2.00 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACA........... 27 2 2.00 2.00 1.00 - - - - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCTTCCTTCAGTAGCCAACATGCAG....................................... 27 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCCT....... 29 2 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTTCCTTCAGTAGCCAACATGCAGCTCT................................... 30 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCt...................... 26 t 2.00 0.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGt......................... 28 t 2.00 5.00 - 0.50 - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTTCAGTAGCCAACATGCAGCTCTT.................................. 28 1 2.00 2.00 - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GCGGGCTAGGTGAGACACGGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TACCGTACCGCGACCTTTCTCCTGGGC........................................................................................... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 2 1.50 1.50 - - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCA...................... 27 2 1.50 1.50 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTCTTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 2 1.50 1.50 - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCC........................ 30 2 1.50 1.50 - - - - 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCGCCCAGGAACTACACACCCTC...... 26 2 1.50 1.50 1.00 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............TCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGCGTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 2 1.50 1.50 - - - - - - - - 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........ACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 1.50 1.50 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CGGCGTCCGCGGGCTAGGTGAG................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACa......... 26 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................GACACGGGGGACTGCTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CATCTTCGCGGTAGCAG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCt........ 28 t 1.00 26.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGACACGGGGGACTGCTGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTCTTGACTCCATCTTCGCGGTAGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGCAGCAGCGGCGTCCGCGGGCTggt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 ggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTTCCTTCAGTAGCCAACATGCAGCTC.................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................CGTCCGCGGGCTAGGTGAGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................GGTCTACGGGCTgga.......................................................................................................................................................................................................................................... 15 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................GAGGGTGCGGGGAAGGt.......................................................................................................................................................................................................................... 17 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TCCCCCGCCTTGATTACCGTACCGCGAC........................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCTTCCTTCAGTAGCCAACATGCA........................................ 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CTCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGCG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACccc......... 27 ccc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................GGGCTAGGTGAGACACGGGGGACTGCTGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................AGGCAAAGTACAAGGGCGGTTCTGCGG................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCCTCG..... 30 2 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGCAGCTCTTTGTCCGCcca........................ 21 cca 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGt........................... 26 t 1.00 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGCTCTTTGTCCtcg.......................... 18 tcg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGCAGCAGCGGCGTCCGCGGGCT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 2 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............CCATCTTCGCGGTAGCAGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAt.................. 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TCGCGGTAGCAGCAGCGGCGgcca.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 gcca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................CACTCACAAGCCTTTCTTCCTTCAGT.................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCTTCAGTAGCCAACATGCAGCTCTTT................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................TTGATTACCGTACCGCGACCTTTCT.................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGcac................. 27 cac 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGCAGCAGCGGCGTCCGCGGGCTAGGag................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGACACGGGGGACTGCTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTCCTTCAGTAGCCAACATGCAGCTC.................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGCAGCTCTTTGTCagc........................... 18 agc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGACACGGGGGACTGCTGGGCCAGGAG........................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
....TCTTGACTCCATCTTCGCGGTAGaagc......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 aagc 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................CGGGGGACTGCTGGGCCA............................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........TCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGCGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 2 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGCAGCTCTTTGTCCGCGCC........................ 21 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCC............................. 24 2 1.00 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTTGTCCGCGCCCAGGAACTACAaaa.......... 28 aaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTcgt.............................. 23 cgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................AGGTGAGACACGGGGGACTGCTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCTTTCTTCCTTCAGTAGCCAACATGC......................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCAG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCCTTCAGTAGCCAACATGCAGCTCT................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................TAGGTGAGACACGGGGGACTGCTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................GGTGAGACACGGGGGACTGCTGGGa.............................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACATGCAGCTCTTTGTCCGCGC......................... 23 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACactc...... 29 actc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACa......... 27 a 1.00 7.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCG.......................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GCGGGCTAGGTGAGACAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGcaac................. 27 caac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGC......................... 26 2 1.00 1.00 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAAC................. 26 2 1.00 1.00 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TATCATCACTCACAAGCCTTTCTTC........................................................... 25 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TATCATCACTCACAAGCCTTTCTTCC.......................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGCAGCAGCGGCGTCCGCGGGCTt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGC........................... 25 2 1.00 1.00 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................ACACGGGGGACTGCTGGGCCAGGAGCG...................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGCAGCAGCGGCGTCCGCGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................AGCAGCAGCGGCGTCCGCGGGCTAGtaga.................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 taga 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGCAGCAGCGGCGTCCGCGGGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 2 1.00 1.00 - - - - - 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGC......................... 29 2 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................GCGGGCTAGGTGAGACACGGGG......................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACtc.......... 26 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................AGACACGGGGGACTGCTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTGAGACACGGGGGACTGCTGGGCCAG........................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGTCCGCGCCCAGGAACT................ 20 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TATCATCACTCACAAGCCTTTCTTCCTTC....................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACact....... 28 act 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCaa....................... 30 aa 0.50 59.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 0.50 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAACT................ 31 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CTTCGCGGTAGCAGCAGCGGCGTCCGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GACTCCATCTTCGCGGTAGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCC........ 30 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCGCGCCCAGGAACTACACACCCTCGA.... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTCTTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACC......... 28 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCCT....... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACt......... 29 t 0.50 12.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......TGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCAG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGCGTCC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAACTACAC............ 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAACTA............... 27 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGC........................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............CCATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGCGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............CCATCTTCGCGGTAGCAG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGCTCTTTGTCCGCGCC........................ 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAAC................. 29 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGG.................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGCAGCAGCGGCGTCCGCGGGCTAt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 0.50 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAACTACA............. 28 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTCTTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCAtt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 tt 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCCcc...... 28 cc 0.50 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
.....CTTGACTCCATCTTCGCGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACt......... 27 t 0.50 7.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACATGCAGCTCTTTGTCC............................. 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGCAGCAGCGGCGTCCGCGGG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGa......................... 28 a 0.50 5.00 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................TAGCAGCAGCGGCGTCCGCGGGCTt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 t 0.50 1.00 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAG..................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGag.......................... 27 ag 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CTTCGCGGTAGCAGCAGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCG............................ 25 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCA...................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCaa......................... 28 aa 0.50 11.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGCGTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TTCGCGGTAGCAGCAGCGGCGTCCGCGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACC......... 26 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCatc...... 29 atc 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ATCTTCGCGGTAGCAGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTTGTCCGCGCCCAGGAACTACAC............ 25 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GCGGTAGCAGCAGCGGCGTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TTTCTTGACTCCATCTTCGCGGTAGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAG..................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCC........................ 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCCgc...... 29 gc 0.50 4.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCtt....................... 30 tt 0.50 59.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCacc........................ 29 acc 0.50 11.00 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGCG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................AACATGCAGCTCTTTGTCCGC........................... 21 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAACT................ 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGCTCTTTGTCCGCGCC........................ 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAACT................ 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCCGCGCCCAGGAACTACACA........... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCGCCCAGGAACTACACACCCTCG..... 26 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.CTTTCTTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCCTCGA.... 31 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................AGCGGCGTCCGCGGGCTAG...................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCaa....... 29 aa 0.50 26.00 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CTCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCC....................... 29 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....CTTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGac........................ 29 ac 0.50 5.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGA................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGtt.......................... 27 tt 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTGTCCGCGCCCAGGAACTACA............. 23 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TCGCGGTAGCAGCAGCGGCGTCCGCGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAG..................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGCTCTTTGTCCGCGC......................... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAA.................. 24 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CTCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGCGTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....TCTTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........GACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGCG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCAACATGCAGCTCTTTGTC.............................. 21 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........ACTCCATCTTCGCGGTAGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............CATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGCGTC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAACT................ 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAA.................. 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCGCCCAGGAACTACACA........... 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCt....................... 30 t 0.50 100.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ATCTTCGCGGTAGCAGCAGC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAA.................. 23 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TCTTTCTTGACTCCATCTTCGCGGTAGCAGCAGCGGCGTCCGCGGGCTAGGTGAGACACGGGGGACTGCTGGGCCAGGAGCGCTCGGTAGCCAGCGGTCTACGGGCTCAGAGGGTGCGGGGAAGGCAAAGTACAAGGGCGGTTCTGCGGCCTTCGCTCCGTCTCCATCCGGGTCCCCGGCGAGCCTGGCCTTCCGCATGGGAGACCGCGCAATCCCCCGCCTTGATTACCGTACCGCGACCTTTCTCCTGGGCTGCTCCCTATCATCACTCACAAGCCTTTCTTCCTTCAGTAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCCTCGAGGTG
......................................................................................................................................................................................................((((((..(((........)))..((((.........(((.(((.......))).)))........))))............))))))..........................................................
..................................................................................................................................................................................................195................................................................................................294................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR042486(GSM539878)
mouse ovaries [09-002]. (ovary) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
...........................................................................................................................................................................................................................................................................ACTCACAAGCCTTTCTTCCTTCAGTA................................................... 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGCCTTTCTTCCTTCAGTAGCCAA.............................................. 26 1 2.00 2.00 - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCCGCGCCCAGGAACTACACACCCT....... 27 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................CTGGGCTGCTCCCTATCATCACTCA........................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTTCAGTAGCCAACATGCAGCTCTT.................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................CTCACAAGCCTTTCTTCCTTCAGTA................................................... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................CCTTTCTCCTGGGCTGCTCCCTATCA............................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGTAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCG............................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................CTTGATTACCGTACCGCGACCTTTCT.................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGAACTACACACtgtg.......... 19 tgtg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................ATCACTCACAAGCCTTTCTTCCTTCAGT.................................................... 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................GCGACCTTTCTCCTGGGCTGCTCCCTA.................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................CACTCACAAGCCTTTCTTCCTTCAGTAt................................................... 28 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................CTTTCTTCCTTCAGTAGCCAACATcctt........................................... 28 cctt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGTAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGC........................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................ACCGCGACCTTTCtc................................................................................................... 15 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCG.......................... 27 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGCCCA...................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCGC......................... 30 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTAGCCAACATGCAGCTCTTTGTCCGCG.......................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -