(4)
OTHER.mut
(5)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(31)
TESTES

Sense strand
CAGGCAAGATGAAGACTGAGCGGCGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGGTGGGTCTTGGGAGGGAGGTGGGGGCTCTGCATTTTTGGGTGATGTGTGATATGCTGGGCCTGCTCCCCCTGTTCTGACCTCCTGTGGCCCCACAGCTCCTGAAGAAAATGAGCTCCAGTGACACGCCCCTGGGCACCGTGGCACT
..................................................(((((((.(((((((..((.((((((((.((((.((............)).)))).)))))......)))....))..))))))).))))).))....................................................
..................................................51.............................................................................................146................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
......................................................................................................................................................TGAAGAAAATGAGCTCCAGTGACACGCC.................. 28 1 44.00 44.00 10.00 11.00 11.00 - 3.00 - 1.00 1.00 1.00 - 3.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - -
.......................CGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGC................................................................................................................................................... 26 1 34.00 34.00 5.00 5.00 1.00 - 1.00 6.00 3.00 - - 4.00 1.00 - 2.00 - 1.00 2.00 1.00 - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - -
..................................................GTGGGTCTTGGGAGGGAGGTGGGGGCTCTGCATTTTTGGGTGATGTGTGATA.............................................................................................. 52 1 30.00 30.00 - - - 30.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGAAGAAAATGAGCTCCAGTGACACGCCC................. 29 1 20.00 20.00 5.00 2.00 7.00 - 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGAAGAAAATGAGCTCCAGTGACACGC................... 27 1 16.00 16.00 3.00 1.00 2.00 - 4.00 - - 2.00 - 1.00 - - - 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCG.................................................................................................................................................. 27 1 14.00 14.00 2.00 2.00 - - 1.00 - 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 1.00 -
.......................CGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGG.................................................................................................................................................... 25 1 11.00 11.00 3.00 - 3.00 - 1.00 - - 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.......................CGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGc................................................................................................................................................. 28 c 11.00 14.00 4.00 2.00 - - 1.00 - 2.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGAAGACTGAGCGGCGGATGAAGAA.................................................................................................................................................................. 25 1 10.00 10.00 1.00 - 1.00 - 1.00 - - 1.00 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
......................GCGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCG.................................................................................................................................................. 28 1 8.00 8.00 - - - - - 5.00 1.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - -
......................GCGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGC................................................................................................................................................... 27 1 8.00 8.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGt................................................................................................................................................. 28 t 6.00 14.00 1.00 2.00 - - 1.00 - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGct................................................................................................................................................ 29 ct 5.00 14.00 - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GCGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGG.................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GGCGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGG.................................................................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...........................TGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGctcc.............................................................................................................................................. 27 ctcc 3.00 1.00 1.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................AGCTGGATGAGGAGGCG.................................................................................................................................................. 17 1 3.00 3.00 - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGAAGAAAATGAGCTCCAGTGACACGCt.................. 28 t 3.00 16.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGctcc.............................................................................................................................................. 26 ctcc 3.00 0.00 - - 2.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGAAGAAAATGAGCTCCAGTGACACGCCt................. 29 t 2.00 44.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.....AAGATGAAGACTGAGCGGCGGATG....................................................................................................................................................................... 24 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GGCGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGC................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GCGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAG..................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGAAGACTGAGCGGCGGATGAAGAAG................................................................................................................................................................. 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GCGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGc................................................................................................................................................. 29 c 2.00 8.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................TGGGTCTTGGGAGGGAGGTGGGGGC........................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CAAGATGAAGACTGAGCGGCGGATGA...................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AGATGAAGACTGAGCGGCGGATGAAG.................................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGc................................................................................................................................................. 26 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............AGACTGAGCGGCGGATGAAGAAGCT............................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............ACTGAGCGGCGGATGAAGAAGCTGGATGA......................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GCGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCtt................................................................................................................................................. 29 tt 1.00 8.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGAAGACTGAGCGGCGGATGAAGAAGCT............................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................TGAGCTCCAGTGACACG.................... 17 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........GAAGACTGAGCGGCGGATGAAGAAGCT............................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGa................................................................................................................................................. 24 a 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................TCCTGAAGAAAATGAGCTCCAGTGACA...................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....CAAGATGAAGACTGAGCGGCGGATGAAG.................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.........TGAAGACTGAGCGGCGGATGAAG.................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGctat.............................................................................................................................................. 27 ctat 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TGAAGACTGAGCGGCGGATGAAGA................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGGATGAAGAAGCTGGATGAG........................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...GCAAGATGAAGACTGAGCGGC............................................................................................................................................................................ 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGAAGAAAATGAGCTCCAGTGAC....................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GATGAAGACTGAGCGGCGGATGA...................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GAAGAAAATGAGCTCCAGTGACACGCC.................. 27 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................TGGGGGCTCTGCATactt............................................................................................................. 18 actt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
...................................CTGGATGAGGAGGCGGgc............................................................................................................................................... 18 gc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCG.................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGGATGAGGAGGCGctcc.............................................................................................................................................. 18 ctcc 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCt.................................................................................................................................................. 27 t 1.00 34.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCtt................................................................................................................................................. 28 tt 1.00 34.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGAAGAAGCTGGATGAGGAGGC................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGtg.................................................................................................................................................. 27 tg 1.00 11.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................GGCGGATGAAGAAGCTGGATGAG........................................................................................................................................................ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGctc............................................................................................................................................... 26 ctc 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...........AAGACTGAGCGGCGGATGAAGAAGC................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................AAGAAAATGAGCTCCAGTGACACGCC.................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................ATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGc................................................................................................................................................. 25 c 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGcta............................................................................................................................................... 26 cta 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................CGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGttt................................................................................................................................................. 28 ttt 1.00 11.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AGGCAAGATGAAGACTGAGCGGCGGA......................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................CCTGAAGAAAATGAGCTCCAGTGACACGCC.................. 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGAAGAAAATGAGCTCCAGTGACAC..................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........AAGACTGAGCGGCGGATGAAGAAGCTG.............................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................GAAGAAAATGAGCTCCAGTGACACGCCCC................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................ATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGct................................................................................................................................................ 26 ct 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................TGAAGAAAATGAGCTCCAGTGACACG.................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGctct.............................................................................................................................................. 27 ctct 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................GCGGATGAAGAAGCTGGATGAGGtggt................................................................................................................................................... 27 tggt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................TGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGct................................................................................................................................................ 25 ct 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.AGGCAAGATGAAGACTGAGCGGCGGATGAA..................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
........ATGAAGACTGAGCGGCGGATGAAGA................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCG.................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................ATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGctcc.............................................................................................................................................. 28 ctcc 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CTGAAGAAAATGAGCTCCAGTGACACGCC.................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................CGGCGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGC................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................CTGAAGAAAATGAGCTCCAGTGACA...................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CAGGCAAGATGAAGACTGAGCGGCGGATGAAGAAGCTGGATGAGGAGGCGGTGGGTCTTGGGAGGGAGGTGGGGGCTCTGCATTTTTGGGTGATGTGTGATATGCTGGGCCTGCTCCCCCTGTTCTGACCTCCTGTGGCCCCACAGCTCCTGAAGAAAATGAGCTCCAGTGACACGCCCCTGGGCACCGTGGCACT
..................................................(((((((.(((((((..((.((((((((.((((.((............)).)))).)))))......)))....))..))))))).))))).))....................................................
..................................................51.............................................................................................146................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR363963(GSM822765)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)