| Gene: Slmo1 | ID: uc008fmk.1_intron_4_0_chr18_67636721_f.3p | SPECIES: mm9 |
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(10) OTHER.mut |
(6) PIWI.ip |
(1) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(34) TESTES |
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Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) |
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| .........................................................................................................................................................................................................................GTGGATAATTGAACATTCCGAGAGCGCCAT... | 30 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................TGGCAAGAACTGAAGTCCTTCTGTGTT......................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................AGTGGATAATTGAACATTCCGAGAGC........ | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................................................................................ATTGAACATTCCGAGAGCGCCATAAG | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................................................................................ATAATTGAACATTCCGAGAGCGCCAT... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .....................................................................................................................................................................................................................TTGAGTGGATAATTGAACATTCCGAGAGCGC...... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ......................................................................................................CTCATAGTCCATGGCTCAGGGAGATT.......................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..........................................................................................................................................................................................................................TGGATAATTGAACATTCCGAGAGCGCCATt.. | 30 | t | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ..............................................................................................................................................................................................................................TAATTGAACATTCCGAGAGCGCCATAA. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ....................TTCTTCCAACAAGGTCATACTCCAA............................................................................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .........................................................................................................................................................................................TCTGTGTTGTTGCAGGGGTGGGCTGCCA..................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| .................................................................................................................TGGCTCAGGGAGATTATTGCTACC................................................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................GTGGATAATTGAACATTCCGAGAGCGCC..... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ................................................................................................................................................................TGCATGTGGCAAGAACTGAAGTCCTTC............................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................TCCTGCATGTGGCAAGAACTGAAGTCC.................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................ATGTGGCAAGAACTGAAGTCCTTCTG............................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................GTGGATAATTGAACATTCCGAGAGCGC...... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TTATTCAGACCACCTCATAGTC........................................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................................................................GATAATTGAACATTCCGAGAGCGCCA.... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................AGTGGATAATTGAACATTCCGAGAGCGCCA.... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................GACCACCTCATAGTCCATGGCTCAGGGA.............................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - |
| .........................................................................................................................................................................................................................GTGGATAATTGAACATTCCGAGAGCG....... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................................................................AGTGGATAATTGAACATTCCGAGAGCGCCt.... | 30 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................TTATTCAGACCACCTCATAGTCCATGGC..................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................................................................TGAGTGGATAATTGAACATTCCGAGA.......... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| GCCCACCCCTAACAACCCACTTCTTCCAACAAGGTCATACTCCAACAGGGTTACACCTCCCAGTAGTAGCACTCCCTATGGGGCCCTGTTTATTCAGACCACCTCATAGTCCATGGCTCAGGGAGATTATTGCTACCTCTTTGCCACAGCAGTTCCCTCCTGCATGTGGCAAGAACTGAAGTCCTTCTGTGTTGTTGCAGGGGTGGGCTGCCATTGAGTGGATAATTGAACATTCCGAGAGCGCCATAAG |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR363959(GSM822761) AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR363958(GSM822760) Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475281(GSM475281) total RNA. (testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR029041(GSM433293) 6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR029040(GSM433292) 6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) |
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| ..............................................................................................CAGACCACCTCATAGTCCATGGCTCA.................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................................................................GCCATTGAGTGGATAATTGAACATTCCGA............ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................TCTTTGCCACAGCAGTTCCCTCCTG........................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................................GAACTGAAGTCCTTCTGTGTTGTTGCA................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |