(6)
OTHER.mut
(1)
OVARY
(6)
PIWI.ip
(4)
PIWI.mut
(34)
TESTES

Sense strand
CGGGCGGCGGAGGTGGTGCCTCTGGGAGCGACGAGGACGAGGTGTCCGAGGTATAGCTCCAGGACCCTTGTCTCTTAAGGTTGCGTGCGACGGGAATTCTTTGGACCCGCACCCGGCTGGTTCACCCTCCCGCTTCCCCGGTGCAGTGTTCTCTGACAGCAGTCGCTTGCAAGGCGACGGTGGCAAGCGGTTGCGGGCCTAGGGAGCGCTGGGTTTGCTCTTCGGCGCGCGTCAGGAGCGGGTAGGGTTC
....................................................................((((.....(((..(((((((..(((((.....((((((.((.....)).)))))).........)))))...)))).)))..)))))))............................................................................................
....................................................................69.............................................................................................164....................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
............................................................................................................................................................................................................................................AGCGGGTAGGGTTCcaaa 18 caaa 28.00 0.00 19.00 8.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.....................................................................................................................................TTCCCCGGTGCAGTGTTCTCTGACAGC.......................................................................................... 27 1 5.00 5.00 - - - 1.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TTCCCCGGTGCAGTGTTCTCTGACAGCAG........................................................................................ 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TAGCTCCAGGACCCTTGTCTCTTAAG........................................................................................................................................................................... 26 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................AGCGGGTAGGGTTCcata 18 cata 3.00 0.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GACGAGGTGTCCGAGtgg..................................................................................................................................................................................................... 18 tgg 3.00 2.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................AGCGGGTAGGGTTCcaat 18 caat 2.00 0.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGCAGTGTTCTCTGACAGCAGTCGCTT.................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TCTCTTAAGGTTGCGTGCGACGGG............................................................................................................................................................ 24 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TCTTCGGCGCGCGTCAGGAGCGGGTA...... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GACGAGGTGTCCGAG........................................................................................................................................................................................................ 15 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGCAGTGTTCTCTGACAGCAGTCGCTTGC................................................................................ 29 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................CTTAAGGTTGCGTGCGACGGGAATTC....................................................................................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................TGCTCTTCGGCGCGCGTCAGGAGCGGG........ 27 1 2.00 2.00 - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................TGGGAGCGACGAGGACGAGGTGTCC........................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGCAGTGTTCTCTGACAGCAGTCGCT................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - -
.......................................................................................................................................................................TGCAAGGCGACGGTGGCAAGCGGTTG......................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................AGCGGGTAGGGTTCcgaa 18 cgaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................AGCGGGTAGGGTTCctcg 18 ctcg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................CGTCAGGAGCGGGTAGGGTT. 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............GTGGTGCCTCTGGGAGCGACGA........................................................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 -
.....................................................................................................................................................TCTCTGACAGCAGTCGCTTGCAAGGCGt......................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GGGAGCGACGAGGACGAGGTG.............................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGCGTGCGACGGGAATTCTTTGGAC................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................TGCGTGCGACGGGAATTCTTTGG.................................................................................................................................................. 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................AGCGACGAGGACGAGGTGTCCGAGGT...................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................GACGAGGTGTCCGAGtggt.................................................................................................................................................................................................... 19 tggt 1.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TTCCCCGGTGCAGTGTTCTCTGACAGg.......................................................................................... 27 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - -
............................................................................................................................................................................................................................................AGCGGGTAGGGTTCgaag 18 gaag 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................TGTCTCTTAAGGTTGCGTGCGACGGG............................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TTCCCCGGTGCAGTGTTCTCTGACAGCAGTa...................................................................................... 31 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGCAGTGTTCTCTGACAGCAGTCGCTTG................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................GTCGCTTGCAAGGCGACGGTGGCAAGCGGT........................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................TCTCTTAAGGTTGCGTGCGACGGGA........................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................CTGGGAGCGACGAGGACGAGGTGTC............................................................................................................................................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGTGTTCTCTGACAGCAGTCGCTTGC................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................TTCCCCGGTGCAGTGTTCTCTGACA............................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................AGCGGGTAGGGTTCctaa 18 ctaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
....................TCTGGGAGCGACGAGGACGAGGTGT............................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................AGCGGGTAGGGTTCtgaa 18 tgaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................TCTGACAGCAGTCGCTTGCAAGGCGACGGTG.................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................AGCGGGTAGGGTTCtaaa 18 taaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................AGCGGGTAGGGTTCgaca 18 gaca 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................TTCGGCGCGCGTCAGGAGCGGGTA...... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................TTGCGTGCGACGGGAATTCTTTGGACC............................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................TCTCTTAAGGTTGCGTGCGACGGGAAT......................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CTCTTCGGCGCGCGTCAGGAGCGGGTAGGG... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
......................................................................................................................................TCCCCGGTGCAGTGTTCTCTGACAGCAGTCGC.................................................................................... 32 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................AGCGGGTAGGGTTCaaaa 18 aaaa 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CCTCTGGGAGCGACGAGGACGAGGT............................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................CCGGTGCAGTGTTCTCTGACAGCAG........................................................................................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................TGCAAGGCGACGGTGGCAAGCGGTT.......................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................AGCGGGTAGGGTTCaaac 18 aaac 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................TCTGGGAGCGACGAGGACGAGGTGTC............................................................................................................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................AGCGGGTAGGGTTCcaac 18 caac 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CGGGCGGCGGAGGTGGTGCCTCTGGGAGCGACGAGGACGAGGTGTCCGAGGTATAGCTCCAGGACCCTTGTCTCTTAAGGTTGCGTGCGACGGGAATTCTTTGGACCCGCACCCGGCTGGTTCACCCTCCCGCTTCCCCGGTGCAGTGTTCTCTGACAGCAGTCGCTTGCAAGGCGACGGTGGCAAGCGGTTGCGGGCCTAGGGAGCGCTGGGTTTGCTCTTCGGCGCGCGTCAGGAGCGGGTAGGGTTC
....................................................................((((.....(((..(((((((..(((((.....((((((.((.....)).)))))).........)))))...)))).)))..)))))))............................................................................................
....................................................................69.............................................................................................164....................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
mjTestesWT3()
Testes Data. (testes)
SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT4()
Testes Data. (testes)
mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
mjTestesWT2()
Testes Data. (testes)
SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)
GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)
SRR037900(GSM510436)
testes_rep1. (testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary)
GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
..................................................................................................................................................................................................................GGGTTTGCTCTTCGGCGCGCGTCAGGA............. 27 1 12.00 12.00 - - 3.00 - 5.00 1.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GCTTCCCCGGTGCAGTGTTCTCTGACA............................................................................................ 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
........GGAGGTGGTGCCTCTGGGAGCGACGAGGA..................................................................................................................................................................................................................... 29 1 3.00 3.00 - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................TGCAGTGTTCTCTGACAGCAGTCGCTT.................................................................................. 27 1 3.00 3.00 - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................CCGCTTCCCCGGTGCAGTGTTCTCTGACA............................................................................................ 29 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GGTTGCGTGCGACGGGAATTCTTTGGA................................................................................................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................CCCCGGTGCAGTGTTCTCTGACAGCA......................................................................................... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................GCAGTCGCTTGCAAGGCGACGGTGGCA................................................................. 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GCGACGAGGACGAGGTGTCCGAGGTA..................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................TATAGCTCCAGGACCCTTGTCTCTTA............................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................GGGTTTGCTCTTCGGCGCGCGTCAG............... 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................CTGGGTTTGCTCTTCGGCGCGCGTCA................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TCCCCGGTGCAGTGTTCTCTGACAGCA......................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GTGTTCTCTGACAGCAGTCGCTTGCA............................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGTGTTCTCTGACAGCAGTCGCTTGCAA.............................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CCCGCTTCCCCGGTGCAGTGTTCTCTGA.............................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................AGTGTTCTCTGACAGCAGTCGCTTGCA............................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................CCGGTGCAGTGTTCTCTGACAGCA......................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................GTTTGCTCTTCGGCGCGCGTCAGGA............. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCCCGCTTCCCCGGTGCAGTGTTCTC................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................TAGCTCCAGGACCCTTGTCTCTTA............................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................CTCTTCGGCGCGCGTCAGGAGCGGGTA...... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
..............................................................................................................................................GCAGTGTTCTCTGACAGCAGTCG..................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................CTTAAGGTTGCGTGCGACGGGAATTC....................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................TGGGTTTGCTCTTCGGCGCGCGTCAGGA............. 28 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................GGTGCAGTGTTCTCTGACAGCAGTCGCTT.................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GCGTGCGACGGGAActgc.......................................................................................................................................................... 18 ctgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................GCTTCCCCGGTGCAGTGTTCTCTGA.............................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................CCCTCCCGCTTCCCCGGTG........................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................CCCGGTGCAGTGTTCTCTGACA............................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
......................................................AGCTCCAGGACCCTTGTCTCTTAAGG.......................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CCGGTGCAGTGTTCTCTGACAGCAttt......................................................................................... 27 ttt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................GCGACGAGGACGAGGTGTCCGAGGTATA................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................GCTGGGTTTGCTCTTCGGCGCGCG................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................CTTAAGGTTGCGTGCGACGGGAATTCT...................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................GCGGGCCTAGGGAGCGCTGGGTTTGCTC.............................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........AGGTGGTGCCTCTGGGAGCGACGAGGA..................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CCCGCTTCCCCGGTGCAG........................................................................................................ 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................CCCGGTGCAGTGTTCTCTGACAGCAtt......................................................................................... 27 tt 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................TCCAGGACCCTTGTCTCTTAat............................................................................................................................................................................. 22 at 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................GGTTTGCTCTTCGGCGCGCGTCAGGA............. 26 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TAGCTCCAGGACCCTTGTCTCTTAa............................................................................................................................................................................. 25 a 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -