| Gene: BC055918 | ID: uc008cjp.1_intron_0_0_chr17_36131506_f.5p | SPECIES: mm9 | 
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  (1)  OTHER.ip  | 
  
  
  (6)  OTHER.mut  | 
  
  
  (1)  OVARY  | 
  
  
  (8)  PIWI.ip  | 
  
  
  (4)  PIWI.mut  | 
  
  
  (31)  TESTES  | 
  
  
| CGTCTAGTCCGGCGTCGCAGACCGGTTTCGCCATGTCTCTTCCTCAAACGGTAAGCCCACGAAAACCTTTTAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTTGGTCAGAAATGTCGGTTATCAAATCTAGAAAAGCGTACAATCGTCAAGCCTTCGCAACTTGAAGCGCCTACTATAGTATTTTTCATTTTAATTTTCTCGGCTCAACTAAGCTTACTTAGTAGATTTATTCATTCATTTCAGGACAGGTTTTCTCTGT .............................................................................((((...(((((..((((.((....))))))....)))))...(((((..((((.((.((...(((((((.....))))).))..)).)).))))))))).............))))........................................................ .............................................................................78........................................................................................................................200................................................  | 
    Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)  | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)  | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)  | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes)  | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes)  | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes)  | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)  | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes)  | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes)  | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes)  | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes)  | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)  | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)  | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes)  | mjTestesWT4() Testes Data. (testes)  | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes)  | SRR014229(GSM319953) 10 dpp MILI. (mili testes)  | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary)  | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes)  | SRR014230(GSM319954) 10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes)  | SRR029039(GSM433291) 25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)  | SRR363957(GSM822759) P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)  | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes)  | SRR363956(GSM822758) P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)  | 
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| .......................................................................................................................................................TTGAAGCGCCTACTATAGTATTTTTCA........................................................................ | 27 | 1 | 11.00 | 11.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................TTGTTTGTTTTGGTCAGAAATGTCGGT............................................................................................................................................. | 27 | 1 | 10.00 | 10.00 | - | 1.00 | 1.00 | 4.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................................................GTAGATTTATTCATTCATTTCAGGACA............ | 27 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | 6.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................TGTTTTGGTCAGAAATGTCGGTTATC......................................................................................................................................... | 26 | 1 | 8.00 | 8.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................TGTCGGTTATCAAATCTAGAAAAGCGTA........................................................................................................................ | 28 | 1 | 7.00 | 7.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................TCTAGAAAAGCGTACAATCGTCAAGCCT.......................................................................................................... | 28 | 1 | 6.00 | 6.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................TTGTTTTGGTCAGAAATGTCGGTTATC......................................................................................................................................... | 27 | 1 | 6.00 | 6.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................TTGTTTGTTTTGGTCAGAAATGTCGGTT............................................................................................................................................ | 28 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................TAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTTGGTC......................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................TGTTTGTTTTGGTCAGAAATGTCGGTT............................................................................................................................................ | 27 | 1 | 5.00 | 5.00 | 2.00 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................TATCAAATCTAGAAAAGCGTACAATCGTCA............................................................................................................... | 30 | 1 | 5.00 | 5.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 
| ....................................................................................................................TCTAGAAAAGCGTACAATCGTCAAGCC........................................................................................................... | 27 | 1 | 5.00 | 5.00 | - | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................TACAATCGTCAAGCCTTCGCAACTTG................................................................................................ | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................TCAAATCTAGAAAAGCGTACAATCGTCA............................................................................................................... | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................AGCTTACTTAGTAGATTTATTCATTCA...................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | 2.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................TTCATTCATTTCAGGACAGGTTTTCT.... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................TAGATTTATTCATTCATTTCAGGACAG........... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................TTCATTCATTTCAGGACAGGTTTTC..... | 25 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................................................GTAGATTTATTCATTCATTTCAGGACAG........... | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................TGAAGCGCCTACTATAGTATTTTTCATTT..................................................................... | 29 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................TGGTCAGAAATGTCGGTTATCAAATCT................................................................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................TTTAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTT............................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................TATTTTTCATTTTAATTTTCTCGGCTC...................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................TACTTAGTAGATTTATTCATTCATTTC.................. | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....TAGTCCGGCGTCGCAGACC................................................................................................................................................................................................................................... | 19 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................GAAATGTCGGTTATCAAATCTAGAAAAGCGT......................................................................................................................... | 31 | 1 | 3.00 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................TAGTATTTTTCATTTTAATTTTCTCGGCTC...................................................... | 30 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................TAGTATTTTTCATTTTAATTTTCTCGGCT....................................................... | 29 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................................................ATTCATTTCAGGACAGGTTTTCTCTGT | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................TCAAATCTAGAAAAGCGTACAATCGTC................................................................................................................ | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................TAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTTGGT.......................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................................................GTAGATTTATTCATTCATTTCAGGACAGG.......... | 29 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................CAGAAATGTCGGTTATCAAATCTAGA................................................................................................................................ | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................TAGAAAAGCGTACAATCGTCAAGCCTT......................................................................................................... | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................TAGAAAAGCGTACAATCGTCAAGCCTTC........................................................................................................ | 28 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................TACTTAGTAGATTTATTCATTCATTTCAGG............... | 30 | 1 | 3.00 | 3.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................................................GTAGATTTATTCATTCATTTCAGGACAGGT......... | 30 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................TAGATTTATTCATTCATTTCAGGACAGG.......... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................TAGATTTATTCATTCATTTCAGGACAGGT......... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................TACAATCGTCAAGCCTTCGCAACTTGAAGC............................................................................................ | 30 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................TATTCATTCATTTCAGGACAGGTTTTC..... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................TTGAAGCGCCTACTATAGTATTTTTCATT...................................................................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................TATCAAATCTAGAAAAGCGTACAATCGT................................................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................TGTTTTGGTCAGAAATGTCGGTTATCA........................................................................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................TTTAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTT.............................................................................................................................................................. | 24 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................TATCAAATCTAGAAAAGCGTACAATCGTC................................................................................................................ | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................................................................................TTAGTAGATTTATTCATTCATTTCAGGAC............. | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................TTGAAGCGCCTACTATAGTATTTTTC......................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................TATTCATTCATTTCAGGACAGGTTTTCT.... | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................TGTTTGTTTTGGTCAGAAATGTCGGT............................................................................................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................TAGTAGATTTATTCATTCATTTCAGGAC............. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................TAGTAGATTTATTCATTCATTTCAGtac............. | 28 | tac | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................TAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTT.............................................................................................................................................................. | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | 
| ......................................................................TAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTTGGTCAG....................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................TTTTAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTTtgtc......................................................................................................................................................... | 30 | tgtc | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................TAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTTttt.......................................................................................................................................................... | 26 | ttt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................TAGTATTTTTCATTTTAATTTTCTCGG......................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................TTCATTCATTTCAGGACAGGTTTTCTaaa. | 29 | aaa | 1.00 | 4.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................TAGAAAAGCGTACAATCGTCAAGC............................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................AAGCGTACAATCGTCAAGCCTTCGCAAC................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................TAAGCCCACGAAAACCTTTTAAAGTCGCT.......................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................................TTTATTCATTCATTTCAGGACAGGTT........ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................TTCTCGGCTCAACTAAGCTTACTTAGT..................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................TACAATCGTCAAGCCTTCGCAACTTGAAGCG........................................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................AAATGTCGGTTATCAAATCTAGAAAAGCGTA........................................................................................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................TTTGTTTGTTTTGGTCAGAAATGTCGGT............................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................TTCCTCAAACGGTAAGCCCACGAAAACC....................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................TGTCGGTTATCAAATCTAGAAAAGCGTAaa...................................................................................................................... | 30 | aa | 1.00 | 7.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................TGAAGCGCCTACTATAGTATTTTTCATTTT.................................................................... | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................TAGTAGATTTATTCATTCATTTCAGGACA............ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................TGTTTGTTTGTTTTGGTCAGAAATGTCGGa............................................................................................................................................. | 30 | a | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................................TTTGTTTTGGTCAGAAATGTCGGTTAT.......................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................TTCATTCATTTCAGGACAGGTTTTCTC... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................TAGAAAAGCGTACAATCGT................................................................................................................. | 19 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................TTTTAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTT............................................................................................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................TATTTTTCATTTTAATTTTCTCGGCTCA..................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................TCAAACGGTAAGCCCACGAAAACCTTTT................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................AAATGTCGGTTATCAAATCTAGAAAAGC........................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................................................................................................................................ATTCATTTCAGGACAGGT......... | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................TACAATCGTCAAGCCTTCGCAACTTaagc............................................................................................. | 29 | aagc | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................TACTTAGTAGATTTATTCATTCATTTCAGta.............. | 31 | ta | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................TGTTTTGGTCAGAAATGTCGGTTATaa........................................................................................................................................ | 27 | aa | 1.00 | 0.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................TAGATTTATTCATTCATTTCAGGACA............ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................TTTAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTTG............................................................................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................TTTTTCATTTTAATTTTCTCGGCTCAAC................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................................................TAGATTTATTCATTCATTTCAGGACAGGTT........ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 
| ............................................................................................TGGTCAGAAATGTCGGTTATCAAATCTA.................................................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................TATCAAATCTAGAAAAGCGTACAATCG.................................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................TCGCCATGTCTCTTCCTCAAACGGTAAGC.................................................................................................................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................................TATTCATTCATTTCAGGACAGGTTTTCTC... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................GAAAAGCGTACAATCGTCAAGCCTTCGC...................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................................................AATCTAGAAAAGCGTACAATCGTCAAG............................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................GCTTACTTAGTAGATTTATTCATTC....................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................TTATTCATTCATTTCAGGACAGGTTTTC..... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................TAGTAGATTTATTCATTCATTTCAGGtc............. | 28 | tc | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................AGTATTTTTCATTTTAATTTTCTCGGCTC...................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................AGCGTACAATCGTCAAGCCTTCGCAAC................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................TAGAAAAGCGTACAATCGTCAAGCCT.......................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................TACAATCGTCAAGCCTTCGCAACTT................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................TCAAATCTAGAAAAGCGTACAATCGTCAAGC............................................................................................................ | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................TCCTCAAACGGTAAGCCCACGAAAACCT...................................................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................................................................................TTAATTTTCTCGGCTCAACTAAGCTTACTTA....................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 
| ..........................TTCGCCATGTCTCTTCCTCAAACGGTAAG................................................................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..................................................................................TTGTTTGTTTTGGTCAGAAATGTCGGgt............................................................................................................................................ | 28 | gt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................TGTTTTGGTCAGAAATGTCGGTTATCAA....................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................TTAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTTG............................................................................................................................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................CGCAACTTGAAGCGCCTACTATAGTATTT............................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................TTTTCTCGGCTCAACTAAGCTTACTTAGT..................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................GTATTTTTCATTTTAATTTTCTCGGCT....................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................TTTTAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTT.............................................................................................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................TCGCCATGTCTCTTCCTCAAACGGTAAGCC................................................................................................................................................................................................. | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................GAAAAGCGTACAATCGTCAAGCCTTC........................................................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................TTTTAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTTGGT.......................................................................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................TGTTTTGGTCAGAAATGTCGGTTATt......................................................................................................................................... | 26 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................TACTTAGTAGATTTATTCATTCATTTCAGGA.............. | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................GAAAAGCGTACAATCGTCAAGCCTTCG....................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................AAGCGCCTACTATAGTATTTTTCATTTT.................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................TCAGAAATGTCGGTTATCAAATCTAGA................................................................................................................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................TAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTTGG........................................................................................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................TTTAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTTGGT.......................................................................................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................................TTCATTCATTTCAGGACAGG.......... | 20 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................ATTTTAATTTTCTCGGCTCAACTAA................................................ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................TTGTTTTGGTCAGAAATGTCGGTT............................................................................................................................................ | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ................................................................................................................................................TCGCAACTTGAAGCGCCTACTATAGTATTT............................................................................ | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................CTTGAAGCGCCTACTATAGTATTTTTC......................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................TGAAGCGCCTACTATAGTATTTTTCA........................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................TTGAAGCGCCTACTATAGTATTTTTCAT....................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ....................................................................................................................TCTAGAAAAGCGTACAATCGTCAAGCCTT......................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................................................................................................................................................GTAGATTTATTCATTCATTTCAGGA.............. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...........................................................................................................................................................................................TCTCGGCTCAACTAAGCTTACTTAGTAGgtt................................ | 31 | gtt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................TGAAGCGCCTACTATAGTATTTTTCAT....................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................TATCAAATCTAGAAAAGCGTACAATCGTCt............................................................................................................... | 30 | t | 1.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................TAAGCTTACTTAGTAGATTTATTCATTC....................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................TTCGCCATGTCTCTTCCTCAAACGGTA..................................................................................................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................TGTTTGTTTTGGTCAGAAATGTCGGg............................................................................................................................................. | 26 | g | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................................................................TCAAATCTAGAAAAGCGTACAATCGTCAA.............................................................................................................. | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................................................................................................................TTATTCATTCATTTCAGGACAGGTT........ | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................TTTTAAAGTCGCTGTTTGTTTGTT............................................................................................................................................................... | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...............................................................AACCTTTTAAAGTCGCTGTTTGTTTtt................................................................................................................................................................ | 27 | tt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | 
| .................................................................................................................................................................................................................TAGTAGATTTATTCATTCATTTCAGG............... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................TAAGCTTACTTAGTAGATTTATTCATTCA...................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .........................................................................................................................AAAAGCGTACAATCGTCAAGCCTTCG....................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................AAAGCGTACAATCGTCAAGCCTTCGCAAC................................................................................................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ..........................................................................................................................................................................................................GCTTACTTAGTAGATTTATTCATTCATTT................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ........................................................................................................................................................................................................................TTTATTCATTCATTTCAGGACAGGTTT....... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................................................................................................................TTACTTAGTAGATTTATTCATTCATTTC.................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................................................................................................................................GATTTATTCATTCATTTCAGGACAGGTT........ | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ...................................................................................TGTTTGTTTTGGTCAGAAATGTCGGgt............................................................................................................................................ | 27 | gt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .....................................................................TTAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTTGG........................................................................................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .............................................................................................................................................................................................................TACTTAGTAGATTTATTCATTCATTTCA................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ......................................................................................................TGTCGGTTATCAAATCTAGAAAAGCGT......................................................................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| ............................................................................................................TTATCAAATCTAGAAAAGCGTACAATCGTt................................................................................................................ | 30 | t | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| .......................................................................................................................................................................................................................................CAGGACAGGTTTTCTCTG. | 18 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 
| CGTCTAGTCCGGCGTCGCAGACCGGTTTCGCCATGTCTCTTCCTCAAACGGTAAGCCCACGAAAACCTTTTAAAGTCGCTGTTTGTTTGTTTTGGTCAGAAATGTCGGTTATCAAATCTAGAAAAGCGTACAATCGTCAAGCCTTCGCAACTTGAAGCGCCTACTATAGTATTTTTCATTTTAATTTTCTCGGCTCAACTAAGCTTACTTAGTAGATTTATTCATTCATTTCAGGACAGGTTTTCTCTGT .............................................................................((((...(((((..((((.((....))))))....)))))...(((((..((((.((.((...(((((((.....))))).))..)).)).))))))))).............))))........................................................ .............................................................................78........................................................................................................................200................................................  | 
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