chr17:35400807 35401022 +
(1)
OTHER.ip 		(9)
OTHER.mut 		(8)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(45)
TESTES

Sense strand
TCTGGCTGTGACTTGGGGTCGGACTGGCGCCTCCTCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCTATGAAGGCCGCGATTACATCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGCGGACATGGCGGCGCAGATCACCCGACGCAAGTGGGAGCAGAGTGGTGCTGCAGAGCATTACAAGGCCTACCTGGAGGGCGAGTGCGTGGAGTGGCTCCACAGA
..................................................((.((((.....(((..(((((...)))))))).........((.........))..)))))).......................................................................................................
..................................................51.............................................................114....................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGC.......................................................................................................... 28 6 58.50 58.50 11.50 3.17 9.17 12.33 6.17 0.17 6.00 1.83 1.33 0.83 1.00 - 2.67 0.17 0.17 - 0.50 - - - 0.17 - 0.33 - - - - 0.17 0.17 0.17 0.17 - - - - - 0.17 - - - - 0.17 - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGG........................................................................................................... 27 6 24.17 24.17 6.00 - 0.67 5.83 1.83 - 1.00 1.33 1.33 1.00 0.67 0.50 0.33 1.17 0.83 - - - - - - 0.17 - - - - 0.17 0.33 0.50 0.17 - - - 0.17 - - - - 0.17 - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCG......................................................................................................... 29 5 9.80 9.80 0.80 2.40 4.00 0.20 - - - 0.20 0.40 0.20 0.40 - 0.40 0.60 - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACG............................................................................................................ 26 7 8.71 8.71 1.86 - - 2.29 1.00 - 1.14 0.71 0.29 - - 0.71 - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - 0.14 - - - - - 0.14 - - - - - -
............TTGGGGTCGGACTGGCGC.......................................................................................................................................................................................... 18 1 7.00 7.00 - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGC....................................................................................................... 29 4 6.25 6.25 1.25 - 2.00 0.75 0.25 1.00 0.25 0.25 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GTGACTTGGGGTCGGACTGGCGCCTCCTCCGC................................................................................................................................................................................. 32 1 6.00 6.00 - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGAC............................................................................................................. 25 7 5.57 5.57 0.14 0.86 1.14 0.57 0.57 - - - 0.43 0.29 0.14 0.29 - - 0.71 - - 0.14 - - - - - - - - - - - 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - -
..............GGGGTCGGACTGGCGCCTCCTCCGC................................................................................................................................................................................. 25 1 4.00 4.00 - - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TGGCTGTGACTTGGGGaca................................................................................................................................................................................................... 19 aca 4.00 0.00 - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGt.......................................................................................................... 28 t 3.83 24.17 1.00 - - 1.17 0.17 - 0.33 0.67 - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGC....................................................................................................... 26 4 3.50 3.50 - - 1.75 0.25 0.25 1.00 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGG........................................................................................................ 28 5 3.40 3.40 1.40 0.20 - 1.00 - - 0.20 0.40 - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TGACTTGGGGTCGGACTGGCGCCTC....................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CTTGGGGTCGGACTGGC............................................................................................................................................................................................ 17 1 3.00 3.00 - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCt......................................................................................................... 29 t 3.00 58.50 1.33 - - 0.83 0.17 - 0.33 0.17 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................CTGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGC....................................................................................................... 32 4 2.75 2.75 - 2.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................CGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGC....................................................................................................... 27 4 2.50 2.50 0.25 - 1.25 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TGCAGTTCGCCTATGAAGGCCGCGAT................................................................................................................................................ 26 4 2.50 2.50 - - - - - - - - - - - - - - - 1.75 - - - - - 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGG........................................................................................................ 30 5 2.20 2.20 - 1.60 0.40 - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AGACCTGAAAACGTGGACGGCGGtga..................................................................................................... 26 tga 2.00 0.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CTTGGGGTCGGACTGGCGCCTCCTCCGCGG............................................................................................................................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................AAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGCGG..................................................................................................... 27 5 1.80 1.80 0.20 - 1.00 - - - 0.20 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGCG...................................................................................................... 32 4 1.75 1.75 - 1.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACa............................................................................................................ 26 a 1.71 5.57 0.43 - - 0.86 - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................GAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGC.......................................................................................................... 27 6 1.67 1.67 0.50 - - 0.33 0.33 - 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGC....................................................................................................... 28 4 1.50 1.50 0.50 - - 0.25 - - 0.50 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGAAAACGTGGACGGCGGCGGACAT................................................................................................. 25 4 1.50 1.50 0.75 - - - 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................CCCTGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGG........................................................................................................ 33 5 1.40 1.40 - 1.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCG......................................................................................................... 27 5 1.40 1.40 0.60 - - 0.40 - - 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGCGG..................................................................................................... 28 4 1.25 1.25 - - 1.00 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCG......................................................................................................... 26 5 1.20 1.20 0.40 - - - 0.20 - - - 0.40 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGACGGCGGCGGACATGGCGGggca........................................................................................ 26 ggca 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......TGTGACTTGGGGTCGGACTGGC............................................................................................................................................................................................ 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TACAAGGCCTACCTGGAGGGCGAGTGC.................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............TTGGGGTCGGACTGGCGCCTCCTCCGCGGGT............................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....GCTGTGACTTGGGGTCGGACTGGCGC.......................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ACGAAGACCTGAAAACGTGGACagca......................................................................................................... 26 agca 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGaggc....................................................................................................... 29 aggc 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CTTGGGGTCGGACTGGCGCCTCC...................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................GGGAGCAGAGTGGTGCTGCAGAGC............................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGccgt........................................................................................................... 27 ccgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TTACAAGGCCTACCTGGAGGGCGAGTG................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TGGCTGTGACTTGGGGTCGGACTGGCGC.......................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................AAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGgggg.................................................................................................... 28 gggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................ACCTGGAGGGCGAGTGCG................. 18 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TACATCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAAa................................................................................................................... 29 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAACGTGt............................................................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGA.............................................................................................................. 24 8 1.00 1.00 - - - - - - - - 0.25 0.12 - - 0.12 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - 0.12 - - - - - - -
..............................................................................................TGAAAACGTGGACGGCGGCGGgcat................................................................................................. 25 gcat 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TTACAAGGCCTACCTGGAGGGCGAGTGC.................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CCGCGATTACATCGCCCTGAACGAAGACCTGt....................................................................................................................... 32 t 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGacgg............................................................................................................ 26 acgg 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................AGGCCGCGATTACATCGCCCTGt................................................................................................................................... 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................TTACAAGGCCTACCTGGAGGGCGAGT.................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CGGACATGGCGGCGCAGATCACCCGACGCA.......................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................TGAAGGCCGCGATTACATCGCCCTGAt.................................................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TACAAGGCCTACCTGGAGGGCGAtgc................... 26 tgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TACAAGGCCTACCTGGAGGGCGAGTG................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................CGGACATGGCGGCGCAGATCACCCGAC............................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TGGCTGTGACTTGGGGTCGGACTGGCGt.......................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................ACAAGGCCTACCTGGAGGGCGAGTGC.................. 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................TACAAGGCCTACCTGGAGGGCGAGT.................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......GTGACTTGGGGTCGGACTGGCGC.......................................................................................................................................................................................... 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..TGGCTGTGACTTGGGGTtac.................................................................................................................................................................................................. 20 tac 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........ACTTGGGGTCGGACTGGCGCCTCC...................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAccgt................................................................................................................. 28 ccgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................GACCTGAAAACGTGGACGGCGGggt..................................................................................................... 25 ggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................AAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGagga.................................................................................................... 28 agga 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACagc.......................................................................................................... 28 agc 0.86 5.57 0.29 - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CCTGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGC.......................................................................................................... 30 6 0.83 0.83 - 0.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................CTGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGG........................................................................................................... 28 6 0.83 0.83 0.17 - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................CCCTGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCG......................................................................................................... 32 5 0.80 0.80 - 0.80 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGG........................................................................................................ 27 5 0.80 0.80 0.60 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TGCAGTTCGCCTATGAAGGCCGCGATTA.............................................................................................................................................. 28 4 0.75 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGCG...................................................................................................... 27 4 0.75 0.75 - - - - - 0.50 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................CGGCGGCGGACATGGCGGC........................................................................................... 19 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGtt......................................................................................................... 29 tt 0.67 24.17 0.17 - - 0.17 0.17 - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................AACGTGGACGGCGGCGGACATGGCG............................................................................................. 25 3 0.67 0.67 0.33 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................CCCTGAACGAAGACCTGAAAACGTGG............................................................................................................... 26 8 0.62 0.62 0.25 - - - - - - - - - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................AAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGCGGA.................................................................................................... 28 5 0.60 0.60 - - 0.40 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................AAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGCG...................................................................................................... 26 5 0.60 0.60 - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................CGCGATTACATCGCCCTGAACGAAGACC.......................................................................................................................... 28 5 0.60 0.60 - - - - 0.20 - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AGACCTGAAAACGTGGACGGCGGCGGA.................................................................................................... 27 5 0.60 0.60 0.40 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................GAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGt........................................................................................................ 29 t 0.60 0.20 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CCTGAACGAAGACCTGAAAACGTGGAC............................................................................................................. 27 7 0.57 0.57 0.14 - - 0.14 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGt........................................................................................................... 27 t 0.57 8.71 0.43 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TTACATCGCCCTGAACGAAGACCTGA....................................................................................................................... 26 7 0.57 0.57 - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TACATCGCCCTGAACGAAGACCTGAAA..................................................................................................................... 27 7 0.57 0.57 - - - 0.14 - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGGTGCTGCAGAGCATTACAAGGC..................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................CGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGCt...................................................................................................... 28 t 0.50 2.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGC....................................................................................................... 31 4 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................CGATTACATCGCCCTGAACGAAGACC.......................................................................................................................... 26 6 0.50 0.50 0.17 - - 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TGCAGTTCGCCTATGAAGGCCGCGATT............................................................................................................................................... 27 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - -
...............................................................................CCCTGAACGAAGACCTGAAAACGTGGA.............................................................................................................. 27 8 0.50 0.50 0.12 - - 0.12 - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACag........................................................................................................... 27 ag 0.43 5.57 0.14 - - 0.14 - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................ATTACATCGCCCTGAACGAAGACC.......................................................................................................................... 24 7 0.43 0.43 - - 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TACATCGCCCTGAACGAAGACCTGAA...................................................................................................................... 26 7 0.43 0.43 0.14 - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................GACCTGAAAACGTGGACGGCGGCGGA.................................................................................................... 26 5 0.40 0.40 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - -
.................................................................CCGCGATTACATCGCCCTGAACGAAGAC........................................................................................................................... 28 5 0.40 0.40 - - - - - - 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGC.......................................................................................................... 34 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................AAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGC....................................................................................................... 25 5 0.40 0.40 - - - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................AGACCTGAAAACGTGGACGGCGGCGG..................................................................................................... 26 5 0.40 0.40 - - - - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGt........................................................................................................ 30 t 0.40 9.80 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 0.20 - - - - - - - -
...........................................................................................ACCTGAAAACGTGGACGGCGGCGGA.................................................................................................... 25 5 0.40 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................AAAACGTGGACGGCGGCGGACATGGCc............................................................................................. 27 c 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAACG.................................................................................................................. 26 6 0.33 0.33 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAACGT................................................................................................................. 27 6 0.33 0.33 - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGC.......................................................................................................... 26 6 0.33 0.33 - - - 0.17 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GAAGACCTGAAAACGTGGACGGC.......................................................................................................... 23 6 0.33 0.33 - - - - 0.17 - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGAAAACGTGGACGGCGGCGGACATGGC.............................................................................................. 28 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................GAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGt.......................................................................................................... 27 t 0.33 0.17 0.17 - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGa.......................................................................................................... 28 a 0.33 24.17 - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAACGTG................................................................................................................ 28 6 0.33 0.33 - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................AAAACGTGGACGGCGGCGGACATGGC.............................................................................................. 26 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................AAACGTGGACGGCGGCGGACATGGCG............................................................................................. 26 3 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................CCCTGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGC.......................................................................................................... 31 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TACATCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAACca................................................................................................................. 31 ca 0.29 0.14 - - - - - - - - - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAAC................................................................................................................... 26 7 0.29 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - -
................................CCTCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCT.............................................................................................................................................................. 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCCTCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCT.............................................................................................................................................................. 27 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGT................................................................................................................. 21 8 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - 0.12 - - - - - - - - - - -
......................................CGGGTACCTGCAGTTCGCCTATGAAGGC...................................................................................................................................................... 28 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGCG...................................................................................................... 30 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCTA............................................................................................................................................................. 25 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGAAAACGTGGACGGCGGCGGACA.................................................................................................. 24 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCCTCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCTA............................................................................................................................................................. 28 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - -
..............................................................................................TGAAAACGTGGACGGCGGCGGACATG................................................................................................ 26 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................CAGATCACCCGACGCAAGTGGGAGC................................................................. 25 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................TGCAGTTCGCCTATGAAGGCCGCGATTAa............................................................................................................................................. 29 a 0.25 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGAaa............................................................................................................ 26 aa 0.25 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GCCCTGAACGAAGACCTGAA...................................................................................................................... 20 9 0.22 0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - - - - - 0.11 - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGG........................................................................................................ 25 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................GAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCG......................................................................................................... 28 5 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................GACCTGAAAACGTGGACGGCGGCGG..................................................................................................... 25 5 0.20 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCCGCGATTACATCGCCCTGAACGAAGACCT......................................................................................................................... 31 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................CGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGG........................................................................................................ 26 5 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................TGGACGGCGGCGGACATG................................................................................................ 18 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAAC................................................................................................................... 19 10 0.20 0.20 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................AAAACGTGGACGGCGGCGGAC................................................................................................... 21 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................AAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGCGGAC................................................................................................... 29 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGC.......................................................................................................... 25 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GAAGACCTGAAAACGTGGACGG........................................................................................................... 22 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................GAAGACCTGAAAACGTGGACGGgggg....................................................................................................... 26 gggg 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TACATCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAACGT................................................................................................................. 31 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - -
............................................................................TCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAACGTGGAC............................................................................................................. 31 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................CGCCCTGAACGAAGACCTGAAAACGTG................................................................................................................ 27 6 0.17 0.17 - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................CGCCCTGAACGAAGACCTGAAAACGTGG............................................................................................................... 28 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................CGATTACATCGCCCTGAACGAAGA............................................................................................................................ 24 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - -
...................................................................................GAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGG........................................................................................................... 26 6 0.17 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGccgc........................................................................................................ 30 ccgc 0.14 8.71 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................CTGAACGAAGACCTGAAAACGTGGAC............................................................................................................. 26 7 0.14 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TACATCGCCCTGAACGAAGACCTGA....................................................................................................................... 25 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CCTGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACG............................................................................................................ 28 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................AAGACCTGAAAACGTGGACGGC.......................................................................................................... 22 7 0.14 0.14 - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................TCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAAC................................................................................................................... 25 7 0.14 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................GCCCTGAACGAAGACCTGAAAACGTG................................................................................................................ 26 7 0.14 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................GATTACATCGCCCTGAACGAAGACCTG........................................................................................................................ 27 7 0.14 0.14 - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATCGCCCTGAACGAAGACC.......................................................................................................................... 19 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................ATCGCCCTGAACGAAGACCTGA....................................................................................................................... 22 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACagt.......................................................................................................... 28 agt 0.14 5.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................ACATCGCCCTGAACGAAGACCTG........................................................................................................................ 23 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TACATCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAAC................................................................................................................... 29 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................AACGAAGACCTGAAAACGTGGAC............................................................................................................. 23 7 0.14 0.14 - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGc........................................................................................................... 27 c 0.14 8.71 - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................TTACATCGCCCTGAACGAAGACCTGAA...................................................................................................................... 27 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................TACATCGCCCTGAACGAAGAC........................................................................................................................... 21 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGAtga........................................................................................................... 27 tga 0.12 1.00 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................CTGAACGAAGACCTGAAAACG.................................................................................................................. 21 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................ACGAAGACCTGAAAACGT................................................................................................................. 18 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACG.................................................................................................................. 20 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................CCTGAACGAAGACCTGAAAACGTG................................................................................................................ 24 8 0.12 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................TGAACGAAGACCTGAAAACGTGGAagg........................................................................................................... 27 agg 0.12 1.00 - - - - - - - - - - - 0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................CCCTGAACGAAGACCTGA....................................................................................................................... 18 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................CCCTGAACGAAGACCTGAAAA.................................................................................................................... 21 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................CTGAACGAAGACCTGAAAA.................................................................................................................... 19 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................CTGAACGAAGACCTGAAA..................................................................................................................... 18 10 0.10 0.10 - - - - - - - - - - - - - - 0.10 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TCTGGCTGTGACTTGGGGTCGGACTGGCGCCTCCTCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCTATGAAGGCCGCGATTACATCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAACGTGGACGGCGGCGGACATGGCGGCGCAGATCACCCGACGCAAGTGGGAGCAGAGTGGTGCTGCAGAGCATTACAAGGCCTACCTGGAGGGCGAGTGCGTGGAGTGGCTCCACAGA
..................................................((.((((.....(((..(((((...)))))))).........((.........))..)))))).......................................................................................................
..................................................51.............................................................114....................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
................................................................GCCGCGATTACATCGCCCTGAACGAAGA............................................................................................................................ 28 5 5.40 5.40 0.20 - - 0.60 0.40 1.60 0.20 - 0.80 - 0.80 - - - 0.60 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................TCCTCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCTA............................................................................................................................................................. 28 4 3.75 3.75 - - 3.50 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCTATGA.......................................................................................................................................................... 27 4 2.50 2.50 - - 1.50 - - - - - - 0.25 - - - 0.50 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CCTCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCTA............................................................................................................................................................. 27 4 2.25 2.25 0.25 1.75 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CCTCCTCCGCGGGTACCTGCAGTTCGC................................................................................................................................................................ 27 5 1.40 1.40 - - 1.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................CGCGATTACATCGCCCTGAACGAAGAtc............................................................................................................................ 28 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCTA............................................................................................................................................................. 25 4 1.00 1.00 0.25 - - - - - - - - - 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................GTGGTGCTGCAGAGCATTACAAGGCCTA.................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CCTCCTCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCTA............................................................................................................................................................. 30 4 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................GCCTCCTCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCaaa................................................................................................................................................................ 31 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................AGTGGTGCTGCAGAGCATTACAAGGCCTA.................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................CTCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCTA............................................................................................................................................................. 26 4 1.00 1.00 0.25 - - 0.25 - - 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................CTCCTCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCTAt............................................................................................................................................................. 30 t 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................GGCCGCGATTACATCGCCCTGAACGAAGA............................................................................................................................ 29 5 0.60 0.60 - - - - - - 0.20 - - - - 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................GCCGCGATTACATCGCCCTGAACGAA.............................................................................................................................. 26 5 0.40 0.40 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GCGCCTCCTCCGCGGGTACCTGCAGTTCG................................................................................................................................................................. 29 5 0.40 0.40 - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................ACATCGCCCTGAACGAAGACCTGAAA..................................................................................................................... 26 7 0.29 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 -
.................................CTCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCC............................................................................................................................................................... 24 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................CCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCTA............................................................................................................................................................. 24 4 0.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................CTCCGCGGGTACCTGCAGTTCGCCTAc............................................................................................................................................................. 27 c 0.25 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................CCGCGATTACATCGCCCTGAACGAAGA............................................................................................................................ 27 5 0.20 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................CATCGCCCTGAACGAAGACCTGAAAA.................................................................................................................... 26 7 0.14 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -