chr17:35565488 35565994 +
(9)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(6)
PIWI.ip 		(3)
PIWI.mut 		(33)
TESTES

Sense strand
AGCTTTCCTTCTCACAGGTGGACAAGGAGGGGACTATGCTCTGGCTCCAGGTTAGTGTGGGGGACAGAGTTGTCCTGAGGTCATTGGAGTGAAGCTGGAGTTGTTGGGTGCTCTGGGAACCCATAATAGCTTCTCCGTTGTAATCCTCTGGTGGCCTGTGTCAGATCTTGCTATAGATATATCTTTGTATATATTTTTCCCTAGGCAGGGACAGCTCCCAGAGCTCTGATATGTTTCTCTCAAGATTGTAAAGGTGACATTCTATGGCCTGATTGCAGAGGGGCACTGTGGACATGGTTGTGTTTCAGGGACTCCCACAATCCCCTGTGAGTGGTGGGTTGTTGGGATATTGTCTTCATTGTGGTGGTTCCTGACCCTCGTTCTCTATCATGAAGACAGCTGCCTGGAGTGGACTCAGTGACAGCCAGTGTGACCTTGGGTCTTCATTTTTCTTTAGAGAACAGTGTCTGATGTTCCCTGTGAGCCTATGGGCTCAATGTGAAGAAT
...............................................................................................................................................................................................................................((((((..(((..(((((((....((..(((......)))...))....))).))))..))).....(((((....)))))))))))..(((((((((((((.......)).))))))).))))..((((((((((.((((.((..............)).)))).))))))))))............................................................................................................
.............................................................................................................................................................................................................................222.................................................................................................................................................................................402.......................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACCCTCGTTCTCTATCATGAAGACAGC........................................................................................................... 29 1 7.00 7.00 1.00 - - - - - - - 4.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TGATATGTTTCTCTCAAGATTGTAAAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................ 29 2 6.00 6.00 1.00 1.50 - - - 0.50 - 0.50 - 0.50 - - - 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - -
.................GTGGACAAGGAGGGGACTATGCTCTGGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 2 4.00 4.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGTCTGATGTTCCCTGTGAGCCTATG................. 27 2 4.00 4.00 - - - - 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACCCTCGTTCTCTATCATGAAGACA............................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 1.00 1.00 - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGAGTGGTGGGTTGTTGGGATATT............................................................................................................................................................ 26 2 3.50 3.50 1.50 0.50 - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGAGTGGTGGGTTGTTGGGATAT............................................................................................................................................................. 25 2 3.50 3.50 0.50 - - 0.50 - - - 2.00 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................TATGTTTCTCTCAAGATTGTAAAGGTG........................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 3.00 3.00 1.50 1.00 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGACAGCTGCCTGGAGTGGACTCA.......................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - 2.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACCCTCGTTCTCTATCATGAAGACAGCT.......................................................................................................... 30 1 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TGTTTCTCTCAAGATTGTAAAGGTGA.......................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 3.00 3.00 - 1.00 - - - - 0.50 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTATCATGAAGACAGCTGCCTGGAG.................................................................................................. 26 2 3.00 3.00 0.50 2.00 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................TTCTCTCAAGATTGTAAAGGTGACATT...................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 2.50 2.50 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTATCATGAAGACAGCTGCCTGGAGT................................................................................................. 27 2 2.00 2.00 0.50 1.00 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TAATAGCTTCTCCGTTGTAATCCTC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTTCTTTAGAGAACAGTGTCTGATG.................................. 27 1 2.00 2.00 - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAAGACAGCTGCCTGGAGTGGACTC........................................................................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
...........................................................................TGAGGTCATTGGAGTGAAGCTGGAG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 2.00 2.00 - - - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATCATGAAGACAGCTGCCTGGAGTG................................................................................................ 26 2 2.00 2.00 0.50 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCCTGATTGCAGAGGGGCACTGTGG........................................................................................................................................................................................................................ 27 2 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGACTCAGTGACAGCCAGTGTGACC........................................................................ 28 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTTCTTTAGAGAACAGTGTCTGAT................................... 26 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TCTCACAGGTGGACAAGGAGGGGACT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 4 1.75 1.75 0.75 0.75 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTGATGTTCCCTGTGAGC...................... 19 4 1.50 1.50 - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TGTTTCTCTCAAGATTGTAAAGGTGAC......................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 1.50 1.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCCTGATTGCAGAGGGGCACTGTGGAC...................................................................................................................................................................................................................... 29 2 1.50 1.50 - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGATTGCAGAGGGGCACTGTGGAC...................................................................................................................................................................................................................... 26 2 1.50 1.50 - 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TGATATGTTTCTCTCAAGATTGTAAAGGTG........................................................................................................................................................................................................................................................... 30 2 1.50 1.50 - - - - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................AAGGAGGGGACTATGCTCTGGC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 4 1.25 1.25 - - - - 1.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................TATGGCCTGATTGCAGAGGGGtact............................................................................................................................................................................................................................ 25 tact 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TAATAGCTTCTCCGTTGTAATCCTCTG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGATATTGTCTTCATTGTGGTGGTT.......................................................................................................................................... 27 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGAGTGGACTCAGTGACAGCCAGTGTGt.......................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTCTATCATGAAGACAGCTGCCTGc.................................................................................................... 27 c 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................GTCATTGGAGTGAAGCTGGAGTTGTTGGGTG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTATGGCCTGATggtt...................................................................................................................................................................................................................................... 18 ggtt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTTCTTTAGAGAACAGTGTCTGATGT................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTTCTCTATCATGAAGACAGCTGCCTGG.................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TCACAGGTGGACAAGGAGGGGACTATt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTTCTCTATCATGAAGACAGCTGCC....................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................TTCTCTCAAGATTGTAAAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................ 21 2 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................TATTTTTCCCTAGGCAGGGACAGCTCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 2 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGTTCTCTATCATGAAGACAGCTtt........................................................................................................ 26 tt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TCACAGGTGGACAAGGAGGGGACTA....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 1.00 1.00 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TAGCTTCTCCGTTGTAATCCTCTGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCTGGAGTGGACTCAGTGACAGC.................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TCTCACAGGTGGACAAGGAGGGGACTATa..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TGATATGTTTCTCTCAAGATTGTAAAt.............................................................................................................................................................................................................................................................. 27 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GATCTTGCTATAGATATATCTTgtat.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 gtat 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTCTATCATGAAGACAGCTGCCTGG.................................................................................................... 27 2 1.00 1.00 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTGTTTCAGGGACTCCCACAATCCCCTa.................................................................................................................................................................................... 30 a 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................ACCCATAATAGCTTCTCCGTTGTAATCC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAGGGGCACTGTGGACATGGTTGTG............................................................................................................................................................................................................. 26 2 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTATCATGAAGACAGCTGCCTcg.................................................................................................... 24 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TGTTTCTCTCAAGATTGTAAAGGTG........................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................GTTTCTCTCAAGATTGTAAAGGTGAC......................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGAGAACAGTGTCTGATGTTCCtgt........................... 26 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTTCTTTAGAGAACAGTGTCTGATGTT................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................TAGCTTCTCCGTTGTAATCCTCTtg.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 tg 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTAGAGAACAGTGTCTGATGTTCCCTG........................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGAGAACAGTGTCTGATGTTCCCTG........................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................TTCTCTCAAGATTGTAAcggt............................................................................................................................................................................................................................................................ 21 cggt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TTCTCACAGGTGGACAAGGAGGGGACTt....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGGACTCAGTGACAGCCAGTGTGAC......................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTCTATCATGAAGACAGCTGtct...................................................................................................... 25 tct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TCTCACAGGTGGACAAGGAGGGa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGACATGGTTGTGTTTCAGGGACTC................................................................................................................................................................................................. 26 2 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATCATGAAGACAGCTGCCTGGAGTGGACTC........................................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGTGACAGCCAGTGTGACCTTGGGTCTT............................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TGATATGTTTCTCTCAAGATTGTAAAGG............................................................................................................................................................................................................................................................. 28 2 1.00 1.00 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
.......................................................TGTGGGGGACAGAGTTGTCCTGAGGTCt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TCTATGGCCTGATTGCAGAGGGGCACT............................................................................................................................................................................................................................ 27 2 1.00 1.00 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCCTGATTGCAGAGGGGCACTGTGt........................................................................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................TATGGCCTGATTGCAGAGGGGCAC............................................................................................................................................................................................................................. 24 2 1.00 1.00 - - - - - 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TAGTGTGGGGGACAGAGTTGTCCTGAGGTCt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTATGGCCTGATTGtt...................................................................................................................................................................................................................................... 18 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACAGCCAGTGTGACCTTGGGTCTT............................................................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TAATAGCTTCTCCGTTGTAATCCTCT...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTGTTTCAGGGACTCCCACAATCCCCca.................................................................................................................................................................................... 30 ca 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGAGAACAGTGTCTGATGTTCCCT............................ 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGACCCTCGTTCTCTATCATGAAGACAG............................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................TATGGCCTGATTGCAGAGGGGCACTGT.......................................................................................................................................................................................................................... 27 2 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCTATCATGAAGACAGCTGCCTGG.................................................................................................... 26 2 1.00 1.00 - 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TCCTTCTCACAGGTGGACAAGGAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 4 0.75 0.75 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - -
.............................................................................................................................................................................................................................................TCTCAAGATTGTAAAGGTGACATTCTt................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TGTTTCTCTCAAGATTGTAAAGGTGACA........................................................................................................................................................................................................................................................ 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTTGGGATATTGTCTTCATTGTGGTG............................................................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGTCTTCATTGTGGTGGTTCCTGACC................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTTTTCCCTAGGCAGGGACAGCTCCCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................TCTCTCAAGATTGTAAAGGTGACATTC..................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TCTGGTGGCCTGTGTCAGATCTTGCT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGAGGTCATTGGAGTGAAGCTGGAGaa..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 aa 0.50 2.00 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGTCTTCATTTTTCTTTAGAGAACAG........................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................TGATATGTTTCTCTCAAGATTGTAAAGGTt........................................................................................................................................................................................................................................................... 30 t 0.50 6.00 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................TCAGATCTTGCTATAGATATATCTTTGT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TTGGAGTGAAGCTGGAGTTGTTGGGTGCTCT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATCATGAAGACAGCTGCCTGGAGT................................................................................................. 25 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................TGTTTCTCTCAAGATTGTAAAGGTGACAT....................................................................................................................................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATCATGAAGACAGCTGC........................................................................................................ 18 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGACATGGTTGTGTTTCAGGGAC................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCATGAAGACAGCTGCCTGGAGTGGAC............................................................................................. 27 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TGGTGGCCTGTGTCAGATCTTGCTATA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................TGGACAAGGAGGGGACTATGCTCTGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................TTTTTCCCTAGGCAGGGACAGCTCCCAGAGC........................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................TGAAGCTGGAGTTGTTGGGTGCTCT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........TCACAGGTGGACAAGGAGGGGACTATG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................TGACATTCTATGGCCTGATTGCAGAGG.................................................................................................................................................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................TATATTTTTCCCTAGGCAGGGACAGCTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................TGTAATCCTCTGGTGGCCTGTG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTATGGCCTGATTGCAGAGGGGCA.............................................................................................................................................................................................................................. 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................TATGGCCTGATTGCAGAGGGGCACTG........................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GACAAGGAGGGGACTATGCTCTGGCT............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGATTGCAGAGGGGCACTGTGGACATGG.................................................................................................................................................................................................................. 28 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................CACTGTGGACATGGTTGTGTTTCAGG...................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................TATGTTTCTCTCAAGATTGTAAAGGT............................................................................................................................................................................................................................................................ 26 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGAGTGGTGGGTTGTTGGGATATa............................................................................................................................................................ 26 a 0.50 3.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................TATGGCCTGATTGCAGAGGGGCACT............................................................................................................................................................................................................................ 25 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCTATCATGAAGACAGCTGCCTGGAG.................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................CTGATTGCAGAGGGGCACTGTGGAC...................................................................................................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TTCTCACAGGTGGACAAGGAGGGGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 4 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................TCTCAAGATTGTAAAGGTGACATTCT.................................................................................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATCATGAAGACAGCTGCCTGGAGTGt............................................................................................... 27 t 0.50 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTGTGTTTCAGGGACTCCCACAATC......................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGACATGGTTGTGTTTCAGG...................................................................................................................................................................................................... 23 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCAGAGGGGCACTGTGGACATGG.................................................................................................................................................................................................................. 25 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTATGGCCTGATTGCAGAGGGGCACT............................................................................................................................................................................................................................ 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................TGATTGCAGAGGGGCACTGTGGAC...................................................................................................................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................TGACATTCTATGGCCTGATTGCAGAGGG................................................................................................................................................................................................................................. 28 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCAGAGGGGCACTGTGGACATGGTT................................................................................................................................................................................................................ 26 2 0.50 0.50 - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCAGGGACTCCCACAA........................................................................................................................................................................................... 18 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................TTGGAGTGAAGCTGGAGTTGTTGGGTGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................TCTATGGCCTGATTGCAGAGGGGCAC............................................................................................................................................................................................................................. 26 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTTGTGTTTCAGGGACTCCCACAA........................................................................................................................................................................................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................TGGAGTTGTTGGGTGCTCTGGGAA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGATTGCAGAGGGGCACTGTGG........................................................................................................................................................................................................................ 24 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................TCTCAAGATTGTAAAGGTGACATTCTAT.................................................................................................................................................................................................................................................. 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................TATGGCCTGATTGCAGAGGGGCACTGa.......................................................................................................................................................................................................................... 27 a 0.50 0.50 - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................TCAAGATTGTAAAGGTGACATTCTATG................................................................................................................................................................................................................................................. 27 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGAGTGGTGGGTTGTTGGGATATaaaa......................................................................................................................................................... 29 aaaa 0.50 3.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCTATCATGAAGACAGCTGCCTGGt................................................................................................... 27 t 0.50 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGAGGGGCACTGTGGACATGGTTGT.............................................................................................................................................................................................................. 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATTGTCTTCATTGTGGTGGTTCCT....................................................................................................................................... 25 2 0.50 0.50 - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................TGAGGTCATTGGAGTGAAGCTGGAGTT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 2 0.50 0.50 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........CTCACAGGTGGACAAGGAGGGGACTATGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TATCATGAAGACAGCTGCCTGGAGTGGA.............................................................................................. 28 2 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGGCCTGATTGCAGAGGGGCACTGTGGA....................................................................................................................................................................................................................... 28 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCCTGTGAGTGGTGGGTTGTTGGG................................................................................................................................................................. 26 3 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGTTCCCTGTGAGCCTATGGG............... 22 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCCCCTGTGAGTGGTGGGTTGTTGG.................................................................................................................................................................. 25 3 0.33 0.33 - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCCTGTGAGTGGTGGGTTGTTGGG................................................................................................................................................................. 25 3 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................TGCTCTGGCTCCAGGTTAGTGTGGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................GAGGGGACTATGCTCTGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - -
......CCTTCTCACAGGTGGACAAGGAGGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - -
....TTCCTTCTCACAGGTGGACAAGGAGGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 4 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................TATGCTCTGGCTCCAGGTTAGTGTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TTTCCTTCTCACAGGTGGACAAGGAG.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TTCTCACAGGTGGACAAGGAGG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 4 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....TCCTTCTCACAGGTGGACAAGGAGGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TCTCACAGGTGGACAAGGAGGGGAC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TTCTCACAGGTGGACAAGGAGGGG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........TTCTCACAGGTGGACAAGGAGGGGAC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TCTCACAGGTGGACAAGGAGGGGA.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................CACTGTGGACATGGT................................................................................................................................................................................................................. 15 19 0.05 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.05 - - -

Antisense strand
AGCTTTCCTTCTCACAGGTGGACAAGGAGGGGACTATGCTCTGGCTCCAGGTTAGTGTGGGGGACAGAGTTGTCCTGAGGTCATTGGAGTGAAGCTGGAGTTGTTGGGTGCTCTGGGAACCCATAATAGCTTCTCCGTTGTAATCCTCTGGTGGCCTGTGTCAGATCTTGCTATAGATATATCTTTGTATATATTTTTCCCTAGGCAGGGACAGCTCCCAGAGCTCTGATATGTTTCTCTCAAGATTGTAAAGGTGACATTCTATGGCCTGATTGCAGAGGGGCACTGTGGACATGGTTGTGTTTCAGGGACTCCCACAATCCCCTGTGAGTGGTGGGTTGTTGGGATATTGTCTTCATTGTGGTGGTTCCTGACCCTCGTTCTCTATCATGAAGACAGCTGCCTGGAGTGGACTCAGTGACAGCCAGTGTGACCTTGGGTCTTCATTTTTCTTTAGAGAACAGTGTCTGATGTTCCCTGTGAGCCTATGGGCTCAATGTGAAGAAT
...............................................................................................................................................................................................................................((((((..(((..(((((((....((..(((......)))...))....))).))))..))).....(((((....)))))))))))..(((((((((((((.......)).))))))).))))..((((((((((.((((.((..............)).)))).))))))))))............................................................................................................
.............................................................................................................................................................................................................................222.................................................................................................................................................................................402.......................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGGTGGTTCCTGACCCTCGTTCTCTA........................................................................................................................ 27 1 2.00 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TAATAGCTTCTCCGTTGTAATCCTC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 2.00 2.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTGGTTCCTGACCCTCGTTCTCTA........................................................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GTCATTGGAGTGAAaaga.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 aaga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCTGGAGTGGACTCAGTGACAGCCA................................................................................ 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................CGTTGTAATCCTCTGGTGGCCTGTGTCA........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCCACAATCCCCTaaag..................................................................................................................................................................................... 19 aaag 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................AACCCATAATAGCTTCTCCGTTGTAtct............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 tct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................AATAGCTTCTCCGTTGTAATCCTC....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTGTCTGATGTTCCCTGTGAGCCTA................... 26 2 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGTCTTCATTTTTCTTTAGAGAACAGTGTC....................................... 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGTGAGCCTATGGGCTCAATGTGAAGAAT 30 2 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................CTTCTCCGTTGTAATCCTCTGGTGGg................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCTGGAGTGGACTCAGTGACAGCC................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................CTGGTGGCCTGTGTCAGATCTTGCTA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................CAGCTCCCAGAGCTCTGATATGTTTCTC............................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - -
.....................................................................................................................................................GGTGGCCTGTGTCAGATCTTGCTATAGAT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 2 0.50 0.50 - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCTGATGTTCCCTGTGAGCCTA................... 24 2 0.50 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................GGTGGCCTGTGTCAGATCTTGCTATA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 2 0.50 0.50 - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGGGTCTTCATTTTTCTTTAGAGAACA............................................ 28 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................GGGGACTATGCTCTGGCTCCAGGTTA..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -