| Gene: Rps28 | ID: uc008bzs.1_intron_2_0_chr17_33961292_r | SPECIES: mm9 |
|
|
|
(1) OTHER.ip |
(9) OTHER.mut |
(1) OVARY |
(9) PIWI.ip |
(3) PIWI.mut |
(1) TDRD1.ip |
(46) TESTES |
| TCGCCGCCATCATGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATCAAGCTGGCTAGGGTGAGGCGACTGCGGGTGTTTAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAACATGTCGAGCCTAACTTTCCCTTATTTCCTGTAGGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAGGT ..................................................................(((((((....)))))))..(((((......(((((.....)).)))....)))))................................................................. .................................................................66............................................................128......................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGT.......... | 27 | 7 | 68.43 | 68.43 | 19.43 | 19.29 | 8.14 | 9.57 | 0.14 | 7.14 | 1.00 | 1.14 | - | 0.29 | 0.14 | 0.14 | 0.29 | - | 0.14 | 0.14 | - | 0.71 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | 0.14 | - | - | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................TAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGC........................................................................................ | 29 | 1 | 63.00 | 63.00 | 14.00 | 9.00 | 7.00 | 3.00 | - | 3.00 | 4.00 | 2.00 | 14.00 | 3.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATC..................................................................................................................................................... | 26 | 6 | 23.00 | 23.00 | 3.67 | 4.67 | 0.67 | 1.83 | 8.33 | 1.67 | 0.67 | - | - | - | 0.17 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | 0.50 | - | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATCA.................................................................................................................................................... | 27 | 6 | 19.00 | 19.00 | 3.67 | 4.67 | 1.00 | 1.83 | 6.00 | 1.33 | - | - | - | - | 0.17 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................TAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAA........................................................................................... | 26 | 1 | 17.00 | 17.00 | 9.00 | 4.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................TAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAG......................................................................................... | 28 | 1 | 16.00 | 16.00 | 5.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | - | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................TATTTCCTGTAGGTAACCAAAGTGCTG................................... | 27 | 1 | 15.00 | 15.00 | 2.00 | 3.00 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................TAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGCT....................................................................................... | 30 | 1 | 15.00 | 15.00 | 2.00 | - | 9.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTT...................... | 27 | 9 | 14.78 | 14.78 | 4.56 | 5.11 | 1.89 | 0.56 | 0.78 | 1.00 | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | 0.11 | 0.22 | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | 0.11 |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAG........... | 26 | 7 | 14.43 | 14.43 | 4.00 | 4.00 | 1.86 | 1.43 | - | 1.86 | 0.14 | - | - | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | 0.14 | - | 0.29 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TTAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGA............................................................................................ | 26 | 1 | 13.00 | 13.00 | 5.00 | 5.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGG........................ | 27 | 9 | 13.00 | 13.00 | 4.33 | 2.22 | 2.44 | 2.11 | 0.22 | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................TAAAGAGAGAAGAAAGCTGAACATGTC.............................................................................. | 27 | 1 | 12.00 | 12.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | - | 2.00 | - | - | - | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGT....................... | 28 | 9 | 9.44 | 9.44 | 2.56 | 3.00 | 0.78 | 1.56 | - | 0.89 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.22 | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................TAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGA............................................................................................ | 25 | 1 | 9.00 | 9.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................TAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAA.......................................................................................... | 27 | 1 | 9.00 | 9.00 | 3.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TTAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGC........................................................................................ | 30 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................TATTTCCTGTAGGTAACCAAAGTGC..................................... | 25 | 1 | 6.00 | 6.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | 2.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TTAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAA........................................................................................... | 27 | 1 | 6.00 | 6.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................AACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTT...................... | 26 | 9 | 5.89 | 5.89 | 1.11 | 1.89 | 0.78 | 0.56 | 0.33 | 0.11 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | 0.11 | - | - | - | 0.11 | 0.22 | 0.11 | - | - | - | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTG......... | 28 | 7 | 5.71 | 5.71 | 1.86 | 1.86 | 0.29 | 0.43 | - | 0.57 | - | 0.14 | - | - | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TCATGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCA....................................................................................................................................................... | 27 | 6 | 5.67 | 5.67 | 1.17 | 1.83 | - | 0.50 | 0.83 | 0.33 | - | - | - | - | - | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................TGAATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAAC................................................................................... | 26 | 1 | 5.00 | 5.00 | 1.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................TATTTCCTGTAGGTAACCAAAGTGCT.................................... | 26 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................GTGTTTAGAAACCTGAATAAAGAGAGA............................................................................................... | 27 | 1 | 4.00 | 4.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................TGAACATGTCGAGCCTAACTTTCCC............................................................... | 25 | 1 | 4.00 | 4.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................CCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAG.. | 26 | 6 | 4.00 | 4.00 | 1.50 | 0.67 | 1.50 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................AGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGC........................................................................................ | 28 | 1 | 4.00 | 4.00 | - | - | - | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATa..................................................................................................................................................... | 26 | a | 3.33 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGT....................... | 26 | 9 | 3.11 | 3.11 | 0.44 | 0.89 | 0.56 | 0.33 | - | 0.56 | - | - | - | - | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................GAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGCTG...................................................................................... | 29 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................GAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGC........................................................................................ | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................TGAACATGTCGAGCCTAACTTTCCCTT............................................................. | 27 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGTAGGTAACCAAAGTGCTGGGCAGG............................. | 26 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 3.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................................TTCGCAGGGACAGTGCACGCAGGTt | 25 | t | 3.00 | 0.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCtgt....................... | 28 | tgt | 3.00 | 0.00 | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................TGAACATGTCGAGCCTAACTTTCC................................................................ | 24 | 1 | 3.00 | 3.00 | - | - | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGAC............. | 27 | 7 | 2.43 | 2.43 | 0.43 | 0.86 | 0.29 | - | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTT...................... | 29 | 9 | 2.33 | 2.33 | 0.56 | 0.56 | 0.44 | 0.22 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TCATGGACACGAGTCGCGTGCAGCCC........................................................................................................................................................ | 26 | 7 | 2.14 | 2.14 | 0.43 | 0.57 | 0.14 | 0.43 | 0.14 | - | - | 0.14 | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCA.................. | 25 | 8 | 2.12 | 2.12 | 0.12 | - | 0.88 | 0.12 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | 0.25 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - |
| ...........................................................................ACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGCTGA..................................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................TTTCCTGTAGGTAACCAAAGTGCTGGGC................................ | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................AGAGAGAAGAAAGCTGAACATGTCGAG........................................................................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TAGGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACC.......................... | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................TTTCCTGTAGGTAACCAAAGTGCTGGGCA............................... | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................TGAATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAACAT................................................................................. | 28 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................AAAGAGAGAAGAAAGCTGAACATGTC.............................................................................. | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................TTATTTCCTGTAGGTAACCAAAGTGC..................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................GAGAAGAAAGCTGAACATGTCGAGCC......................................................................... | 26 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................AGGGACAGTGCACGCAG.. | 17 | 8 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | 0.12 | - | - | - | 1.75 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................TTTAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGA............................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................AAACCTGAATAAAGAGAGAAG............................................................................................. | 21 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................TGAATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAACA.................................................................................. | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................TAAAGAGAGAAGAAAGCTGAACATGTCGAGC.......................................................................... | 31 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TAGGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGG........................ | 29 | 1 | 2.00 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................AATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAACATG................................................................................ | 27 | 1 | 2.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTt......... | 28 | t | 1.86 | 68.43 | 0.43 | 0.86 | - | 0.29 | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................CCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAGG. | 27 | 6 | 1.83 | 1.83 | 0.33 | 0.33 | 0.83 | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATCAA................................................................................................................................................... | 28 | 6 | 1.33 | 1.33 | - | - | - | - | 1.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATCt.................................................................................................................................................... | 27 | t | 1.33 | 23.00 | 0.33 | - | - | 0.50 | 0.33 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................AGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCAC...... | 26 | 6 | 1.33 | 1.33 | 0.17 | 0.50 | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................................CAGGGACAGTGCACGCAG.. | 18 | 8 | 1.25 | 1.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................AACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTC..................... | 27 | 9 | 1.22 | 1.22 | 0.22 | 0.11 | 0.22 | 0.11 | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGt........ | 29 | t | 1.14 | 5.71 | - | 0.43 | - | 0.29 | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGT.......... | 25 | 7 | 1.14 | 1.14 | 0.29 | 0.14 | 0.43 | 0.14 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................AACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGG............... | 33 | 7 | 1.14 | 1.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAG................. | 26 | 7 | 1.14 | 1.14 | 0.29 | 0.29 | - | 0.29 | 0.14 | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................ACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTC..................... | 26 | 9 | 1.11 | 1.11 | 0.11 | - | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | 0.22 | 0.22 | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGgg......... | 26 | gg | 1.00 | 0.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................AGAGAGAAGAAAGCTGAACATGTCGAGC.......................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCcg........................ | 27 | cg | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................GAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGCT....................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................TAACTTTCCCTTATTTCCTGTAGGTAA.............................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTagct.................. | 25 | agct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................TAAAGAGAGAAGAAAGCTGAAC................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCA....................................................................................................................................................... | 24 | 6 | 1.00 | 1.00 | - | 0.17 | - | - | 0.67 | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................AATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAACAT................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATCAAGt................................................................................................................................................. | 30 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGAGGCGACTGCGGGTGTTTAGAAAC.............................................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............ACACGAGTCGCGTGCAGCCCtga..................................................................................................................................................... | 23 | tga | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................TAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAA.................................................................................... | 33 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TTAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAt.......................................................................................... | 28 | t | 1.00 | 6.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TTAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAA.......................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................GTTTAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAG............................................................................................. | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................AAGCTGGCTAGGGTGAGGCGAC............................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................TAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGt........................................................................................ | 29 | t | 1.00 | 16.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................CGAGTCGCGTGCAGCCCct...................................................................................................................................................... | 19 | ct | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................AGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGAC............. | 29 | 7 | 1.00 | 1.00 | - | - | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................TGTAGGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGA............................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................GCTGAACATGTCGAGCCTAACTTTCC................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGAGGCGACTGCGGGTGTTTA................................................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................TTATTTCCTGTAGGTAACCAAAGTGCT.................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................ATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAACATGT............................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGggc........ | 27 | ggc | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGAGGCGACTGCGGGTGTTTAGAAt............................................................................................................... | 26 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................CTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGagca....... | 31 | agca | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................TAGGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGAC........................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................GTGAGGCGACTGCGGGTGTTTAGc................................................................................................................. | 24 | c | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................AAGAAAGCTGAACATGTCGAGCCTAAC..................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................ACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAA.................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................TTCCTGTAGGTAACCAAAGTGCTGGGCA............................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................TTCCTGTAGGTAACCAAAGTGCTGGGC................................ | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................GAGAGAAGAAAGCTGAACATGTCGAGCCTAA...................................................................... | 31 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................ATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAACATGTC.............................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................TGGCTAGGGTGAGGCGACTGCGG.......................................................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................AGGGTGAGGCGACTGCG........................................................................................................................... | 17 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................GCGGGTGTTTAGAAACCTGAATAAAGAG.................................................................................................. | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................CCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAAC................................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................TAAAGAGAGAAGAAAGCTGAACAT................................................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................GAATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAAC................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................TTAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAG............................................................................................. | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................TAGAAACCTGAATAAAGAGAGA............................................................................................... | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................AGGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGT....................... | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................TTTAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAG............................................................................................. | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TGTCGAGCCTAACTTTCCCTTATTTCCT...................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................AACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGCT....................................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................CAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGt.... | 29 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................AGAGAAGAAAGCTGAACATGTCGAGCC......................................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................TGTTTAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGA............................................................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................ATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAAC................................................................................... | 23 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................CTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGcctt........... | 27 | cctt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................GAAGAAAGCTGAACATGTCGAGCCTAAC..................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................AGAAGAAAGCTGAACATGTCGAGCCT........................................................................ | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................................AGGGACAGTGCACGCAGGgg | 20 | gg | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................AGAGAAGAAAGCTGAACATGTCGAGC.......................................................................... | 26 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................AGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGG................ | 26 | 7 | 1.00 | 1.00 | 0.43 | 0.29 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................AATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAACATGTCG............................................................................. | 30 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................ACCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAt.. | 27 | t | 1.00 | 0.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................CTAACTTTCCCTTATTTCCTGTAG.................................................. | 24 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................TGTCGAGCCTAACTTTCCCTTATTTCC....................................................... | 27 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................CTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAt........... | 27 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................AGAGAAGAAAGCTGAACATGTCGAGCCaa....................................................................... | 29 | aa | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................TCAAGCTGGCTAGGGTGAGGCGAt............................................................................................................................... | 24 | t | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................ACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTT...................... | 25 | 9 | 1.00 | 1.00 | 0.11 | - | 0.22 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | 0.11 | 0.11 | - | - | - | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................GAGAGAAGAAAGCTGAACATGTCGAGCC......................................................................... | 28 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................CTGAACATGTCGAGCCTAACTTTCCCTTA............................................................ | 29 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................TGAATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAA.................................................................................... | 25 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TAACCAAAGTGCTGGGCAGGACaggt....................... | 26 | aggt | 1.00 | 0.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................AGAAGAAAGCTGAACATG................................................................................ | 18 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................GAGCCTAACTTTCCCTTATTTC........................................................ | 22 | 1 | 1.00 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACA............ | 25 | 7 | 1.00 | 1.00 | 0.29 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | 0.57 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................ACCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAG.. | 27 | 6 | 0.83 | 0.83 | 0.83 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TCATGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATC..................................................................................................................................................... | 29 | 6 | 0.83 | 0.83 | 0.17 | 0.17 | 0.17 | - | - | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTt..................... | 28 | t | 0.78 | 14.78 | 0.22 | 0.33 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................GTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTT...................... | 28 | 9 | 0.78 | 0.78 | 0.11 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................AACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTt..................... | 27 | t | 0.78 | 5.89 | - | 0.44 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTtt........ | 29 | tt | 0.71 | 68.43 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................AGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGA.............. | 28 | 7 | 0.71 | 0.71 | 0.14 | - | - | - | - | 0.29 | - | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTt..................... | 30 | t | 0.67 | 2.33 | 0.11 | - | 0.56 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................GACCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGC.... | 26 | 6 | 0.67 | 0.67 | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................GGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGC.... | 27 | 6 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TCATGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCAT...................................................................................................................................................... | 28 | 6 | 0.67 | 0.67 | - | - | - | 0.17 | 0.17 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................CCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGCA... | 25 | 6 | 0.67 | 0.67 | 0.17 | 0.17 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....CGCCATCATGGACACGAGTCGCGTGCA............................................................................................................................................................ | 27 | 6 | 0.67 | 0.67 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................CAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGC................... | 26 | 8 | 0.62 | 0.62 | 0.25 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGC................... | 24 | 8 | 0.62 | 0.62 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - |
| ..GCCGCCATCATGGACACGAGTCGCGTGC............................................................................................................................................................. | 28 | 5 | 0.60 | 0.60 | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | 0.40 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................GCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTG......... | 25 | 7 | 0.57 | 0.57 | 0.14 | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGA.............. | 26 | 7 | 0.57 | 0.57 | 0.14 | - | - | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......CCATCATGGACACGAGTCGCGTGCAG........................................................................................................................................................... | 26 | 7 | 0.57 | 0.57 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.57 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGC........ | 29 | 7 | 0.57 | 0.57 | - | - | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTC..................... | 28 | 9 | 0.56 | 0.56 | - | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................CGGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAGGT | 27 | 6 | 0.50 | 0.50 | 0.17 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................CCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAGGT | 28 | 6 | 0.50 | 0.50 | 0.17 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................AGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCACG..... | 27 | 6 | 0.50 | 0.50 | - | 0.17 | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAtt................ | 27 | tt | 0.50 | 2.12 | 0.12 | 0.25 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........ATGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATC..................................................................................................................................................... | 27 | 6 | 0.50 | 0.50 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - |
| ........ATCATGGACACGAGTCGCG................................................................................................................................................................ | 19 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TCATGGACACGAGTCGCGT............................................................................................................................................................... | 19 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................AGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAG................. | 25 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | 0.14 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGa.......... | 27 | a | 0.43 | 14.43 | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................GCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGC........ | 26 | 7 | 0.43 | 0.43 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAat.......... | 27 | at | 0.43 | 1.00 | - | 0.29 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........ATCATGGACACGAGTCGCGTGCAGCCC........................................................................................................................................................ | 27 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | - | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCC......................................................................................................................................................... | 22 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | - | - | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................CAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCA....... | 26 | 7 | 0.43 | 0.43 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTaa........ | 29 | aa | 0.43 | 68.43 | 0.14 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................CAGGACCGGTTCGCAGGGA.............. | 19 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................GCAGGACCGGTTCGCAGG................ | 18 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....GCCATCATGGACACGAGTCGCGTGC............................................................................................................................................................. | 25 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGG............... | 25 | 7 | 0.43 | 0.43 | 0.14 | - | - | - | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................GGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGT.......... | 26 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | 0.14 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................GGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAG.. | 24 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................CAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTG......... | 24 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGg.......... | 27 | g | 0.43 | 14.43 | 0.14 | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGA.............. | 27 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................GCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGAC............. | 26 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................CAGGACCGGTTCGCAGGGACAG........... | 22 | 7 | 0.43 | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GCCGCCATCATGGACACGA...................................................................................................................................................................... | 19 | 8 | 0.38 | 0.38 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAt................. | 26 | t | 0.38 | 2.12 | 0.12 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................AAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGC................... | 25 | 8 | 0.38 | 0.38 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCG.................... | 23 | 8 | 0.38 | 0.38 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................ACCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAGt. | 28 | t | 0.33 | 0.83 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............GACACGAGTCGCGTGCAGCCCATCA.................................................................................................................................................... | 25 | 6 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGt........................ | 27 | t | 0.33 | 0.11 | 0.11 | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGT....................... | 20 | 9 | 0.33 | 0.33 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................GACCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAG.. | 28 | 6 | 0.33 | 0.33 | 0.17 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....CGCCATCATGGACACGAGTCGCGTGC............................................................................................................................................................. | 26 | 6 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........ATGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCA....................................................................................................................................................... | 25 | 6 | 0.33 | 0.33 | - | 0.17 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................CGGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAG.. | 25 | 6 | 0.33 | 0.33 | 0.17 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................AACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGT....................... | 25 | 9 | 0.33 | 0.33 | - | - | 0.11 | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGAC............. | 24 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................AGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGG............... | 27 | 7 | 0.29 | 0.29 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................GCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAG........... | 28 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................GCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGT.......... | 24 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTa......... | 28 | a | 0.29 | 68.43 | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........CATGGACACGAGTCGCGTGC............................................................................................................................................................. | 20 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................AGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGt................ | 26 | t | 0.29 | 0.43 | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................CTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCA....... | 31 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................CTGGGCAGGACCGGTTCGCAGG................ | 22 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGAt............. | 27 | t | 0.29 | 0.57 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCA....... | 30 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCCC........................................................................................................................................................ | 23 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAtc.......... | 27 | tc | 0.29 | 1.00 | - | - | - | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................GGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTG......... | 27 | 7 | 0.29 | 0.29 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGt................ | 27 | t | 0.29 | 1.14 | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TCATGGACACGAGTCGCGTGCAG........................................................................................................................................................... | 23 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................GCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCA....... | 27 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.29 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................GGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAGGT | 26 | 7 | 0.29 | 0.29 | 0.14 | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGAC............. | 28 | 7 | 0.29 | 0.29 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGA.............. | 23 | 7 | 0.29 | 0.29 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................CCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGC................... | 27 | 8 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCtt................. | 26 | tt | 0.25 | 0.62 | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGC................... | 18 | 8 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................................CGGTTCGCAGGGACAGTGC........ | 19 | 8 | 0.25 | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.25 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGt................... | 24 | t | 0.25 | 0.38 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGa................... | 24 | a | 0.25 | 0.38 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTa..................... | 28 | a | 0.22 | 14.78 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................AACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGG........................ | 24 | 9 | 0.22 | 0.22 | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................CCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTC..................... | 25 | 9 | 0.22 | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................AACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTaa.................... | 28 | aa | 0.22 | 5.89 | - | - | 0.22 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................AGAGAAGAAAGCTGAAC................................................................................... | 17 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GCCGCCATCATGGACACGAGTCGCGTG.............................................................................................................................................................. | 27 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CGCCGCCATCATGGACACGAGTCGCGT............................................................................................................................................................... | 27 | 5 | 0.20 | 0.20 | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GCCGCCATCATGGACACGAGTCGCGT............................................................................................................................................................... | 26 | 5 | 0.20 | 0.20 | - | - | 0.20 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..GCCGCCATCATGGACACGAGTC................................................................................................................................................................... | 22 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................ACCGGTTCGCAGGGACAGTGCAC...... | 23 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................CAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCAC...... | 27 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................................ACCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGC.... | 25 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................AGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGC.... | 28 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................CGCGTGCAGCCCATCAAGCTGGCTAGG......................................................................................................................................... | 27 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........ATGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCAT...................................................................................................................................................... | 26 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................CCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAttt | 28 | ttt | 0.17 | 0.67 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................CACGAGTCGCGTGCAGCCCATC..................................................................................................................................................... | 22 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............GACACGAGTCGCGTGCAGCCCATC..................................................................................................................................................... | 24 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATCca................................................................................................................................................... | 28 | ca | 0.17 | 23.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCACG..... | 30 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................GCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCAC...... | 28 | 6 | 0.17 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATCAtt.................................................................................................................................................. | 29 | tt | 0.17 | 19.00 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATCAtcg................................................................................................................................................. | 30 | tcg | 0.17 | 19.00 | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................ACGAGTCGCGTGCAGCCCATCA.................................................................................................................................................... | 22 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................GAGTCGCGTGCAGCCCATC..................................................................................................................................................... | 19 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................GGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGCA... | 33 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........CATGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATCA.................................................................................................................................................... | 29 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........ATCATGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCA....................................................................................................................................................... | 28 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............ACACGAGTCGCGTGCAGCCCATCAA................................................................................................................................................... | 25 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCAT...................................................................................................................................................... | 25 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATCAt................................................................................................................................................... | 28 | t | 0.17 | 19.00 | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................................CCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGC.... | 24 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........ATCATGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATC..................................................................................................................................................... | 30 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATt..................................................................................................................................................... | 26 | t | 0.17 | 0.17 | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................ACGAGTCGCGTGCAGCCCATCAAGCTGGCTA........................................................................................................................................... | 31 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................TCGCGTGCAGCCCATCAAGCTGGCTAGG......................................................................................................................................... | 28 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................................GGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCAC...... | 25 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TCATGGACACGAGTCGC................................................................................................................................................................. | 17 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGG................ | 24 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGG................ | 27 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................GGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGt........ | 28 | t | 0.14 | 0.29 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................AGGACCGGTTCGCAGGGACA............ | 20 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........ATGGACACGAGTCGCGTGCAGC.......................................................................................................................................................... | 22 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................AGGACCGGTTCGCAGGGACAG........... | 21 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...............................................................................................................................................AAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGG................ | 28 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........CATGGACACGAGTCGCGTGCA............................................................................................................................................................ | 21 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGC.......................................................................................................................................................... | 21 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......CCATCATGGACACGAGTCGCGTGCAGC.......................................................................................................................................................... | 27 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................AGGACCGGTTCGCAGGGACAGTG......... | 23 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................................GGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAGG. | 25 | 7 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........ATGGACACGAGTCGCGTGCAGCC......................................................................................................................................................... | 23 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................AGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGt............... | 27 | t | 0.14 | 1.00 | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................................GACCGGTTCGCAGGGACA............ | 18 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTt......... | 26 | t | 0.14 | 1.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................................................................................................................................................CTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGT.......... | 28 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................................CAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGC........ | 25 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGggc........ | 29 | ggc | 0.14 | 14.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGAa............. | 27 | a | 0.14 | 0.57 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............GGACACGAGTCGCGTGCAGCCC........................................................................................................................................................ | 22 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGAC............. | 30 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......CCATCATGGACACGAGTCGCGTGCAGCCC........................................................................................................................................................ | 29 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................................GGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTG......... | 26 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGa........ | 29 | a | 0.14 | 5.71 | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........TCATGGACACGAGTCGCGTGCAGCC......................................................................................................................................................... | 25 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....GCCATCATGGACACGAGTCGCGTGCA............................................................................................................................................................ | 26 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....GCCATCATGGACACGAGTCGCG................................................................................................................................................................ | 22 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .........................................................................................................................................................GCAGGACCGGTTCGCAGGGACAG........... | 23 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAG................. | 23 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGC............................................................................................................................................................. | 18 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................AGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGa............... | 27 | a | 0.14 | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGgca............ | 28 | gca | 0.14 | 0.43 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGAaa............ | 28 | aa | 0.14 | 0.57 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGA.............. | 29 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................................AGGACCGGTTCGCAGGG............... | 17 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..................................................................................................................................................GTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGAta............ | 29 | ta | 0.14 | 0.43 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAGCgcat...................................................................................................................................................... | 25 | gcat | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAt........................................................................................................................................................... | 20 | t | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCAG........................................................................................................................................................... | 20 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGAaagt.......... | 27 | aagt | 0.14 | 0.29 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTc......... | 28 | c | 0.14 | 68.43 | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............GGACACGAGTCGCGTGCAG........................................................................................................................................................... | 19 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGaa......... | 28 | aa | 0.14 | 14.43 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................GGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGa........ | 28 | a | 0.14 | 0.29 | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............TGGACACGAGTCGCGTGCA............................................................................................................................................................ | 19 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGaa............... | 28 | aa | 0.14 | 1.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGAaag........... | 26 | aag | 0.14 | 0.29 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................................TCGCAGGGACAGTGCACGC.... | 19 | 7 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................TGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAa........... | 26 | a | 0.14 | 1.00 | - | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACA............ | 28 | 7 | 0.14 | 0.14 | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
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| ............................................................................................................................................ACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCG.................... | 27 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................CAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCG.................... | 25 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .CGCCGCCATCATGGACACGAG..................................................................................................................................................................... | 21 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................AGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAt................. | 25 | t | 0.12 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...................................................................................................................................................TGCTGGGCAGGACCGGTTCGC................... | 21 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGtc.................. | 25 | tc | 0.12 | 0.38 | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGttt................. | 26 | ttt | 0.12 | 0.38 | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ................................................................................................................................................AAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAat................ | 27 | at | 0.12 | 2.12 | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................AGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCA.................. | 24 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................................................................................................................................................GCTGGGCAGGACCGGTTCGCA.................. | 21 | 8 | 0.12 | 0.12 | - | - | - | - | 0.12 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................AACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTa...................... | 26 | a | 0.11 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTc...................... | 27 | c | 0.11 | 3.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGtt....................... | 28 | tt | 0.11 | 0.11 | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .................................................................................................................................................AGTGCTGGGCAGGACCG......................... | 17 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTC..................... | 30 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTtt.................... | 31 | tt | 0.11 | 2.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .............................................................................................................................................CCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTT...................... | 24 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - |
| ...................................................................................................................................................TGCTGGGCAGGACCGGTT...................... | 18 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..............................................................................................................................................CAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTT...................... | 23 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGc....................... | 28 | c | 0.11 | 13.00 | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCG......................... | 26 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ...........................................................................................................................................AACCAAAGTGCTGGGCAGGACCG......................... | 23 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGgt...................... | 29 | gt | 0.11 | 13.00 | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ............................................................................................................................................ACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGT....................... | 24 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | - | - | - | - | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ..........................................................................................................................................TAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGG........................ | 25 | 9 | 0.11 | 0.11 | - | 0.11 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ........................................................................................................................................GGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGA............................ | 23 | 13 | 0.08 | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.08 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| TCGCCGCCATCATGGACACGAGTCGCGTGCAGCCCATCAAGCTGGCTAGGGTGAGGCGACTGCGGGTGTTTAGAAACCTGAATAAAGAGAGAAGAAAGCTGAACATGTCGAGCCTAACTTTCCCTTATTTCCTGTAGGTAACCAAAGTGCTGGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCACGCAGGT ..................................................................(((((((....)))))))..(((((......(((((.....)).)))....)))))................................................................. .................................................................66............................................................128......................................................... |
Size | Perfect hit | Total Norm | Perfect Norm | SRR034119(GSM466729) Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) | SRR034118(GSM466728) Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) | SRR028732(GSM400969) Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) | SRR034121(GSM466731) Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) | SRR069809(GSM610965) small RNA sequencing; sample 1. (testes) | SRR034120(GSM466730) Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) | SRR248524(GSM733812) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | SRR248523(GSM733811) cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT4() Testes Data. (testes) | SRR248526(GSM733814) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | GSM509279(GSM509279) MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) | GSM509277(GSM509277) small RNA cloning by length. (piwi testes) | SRR248525(GSM733813) cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) | mjTestesWT3() Testes Data. (testes) | SRR248527(GSM733815) cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) | SRR014231(GSM319955) 16.5 dpc total. (testes) | SRR014236(GSM319960) 10 dpp total. (testes) | SRR029043(GSM433295) 18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | mjTestesWT1() Testes Data. (testes) | mjTestesKO7() Testes Data. (Zcchc11 testes) | mjTestesKO8() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR014235(GSM319959) 2 dpp total. (testes) | SRR029042(GSM433294) 18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) | SRR069810(GSM610966) small RNA sequencing; sample 2. (testes) | SRR014232(GSM319956) 16.5 dpc MILI. (mili testes) | mjTestesWT2() Testes Data. (testes) | GSM475280(GSM475280) Mili-IP. (mili testes) | GSM509278(GSM509278) small RNA cloning by length. (piwi testes) | GSM475279(GSM475279) Miwi-IP. (miwi testes) | GSM179088(GSM179088) Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) | GSM509280(GSM509280) small RNA cloning by length. (testes) | SRR037901(GSM510437) testes_rep2. (testes) | SRR029037(GSM433289) 18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | mjTestesKO5() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR029036(GSM433288) 18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR028731(GSM400968) Mili-wt-associated. (testes) | GSM509276(GSM509276) small RNA cloning by length. (testes) | SRR014233(GSM319957) 16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) | GSM509275(GSM509275) MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) | SRR029038(GSM433290) 25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) | SRR051939(GSM545783) Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) | SRR051940(GSM545784) 18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes) | SRR028730(GSM400967) Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) | mjTestesKO6() Testes Data. (Zcchc11 testes) | SRR042485(GSM539877) mouse testicular tissue [09-002]. (testes) | SRR014234(GSM319958) Ovary total. (ovary) | SRR037902(GSM510438) testes_rep3. (testes) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ...................CGCGTGCAGCCCAcgct....................................................................................................................................................... | 17 | cgct | 3.00 | 0.00 | - | - | - | - | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ......................................................................................................................................................................AGGGACAGTGCACGCAGaa.. | 19 | aa | 1.00 | 2.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.00 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .......................................................................................................................................................GGGCAGGACCGGTTCGCAGGGACAGTGCA....... | 29 | 7 | 0.43 | 0.43 | 0.14 | - | - | 0.14 | - | 0.14 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| ....................AGTCGCGTGCAGCCCATCAAGCTGGC............................................................................................................................................. | 26 | 6 | 0.33 | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.33 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| .....................GTCGCGTGCAGCCCATCAAGCTGGCTA........................................................................................................................................... | 27 | 6 | 0.17 | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 0.17 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |