(1)
OTHER.ip
(6)
OTHER.mut
(4)
PIWI.ip
(1)
PIWI.mut
(1)
TDRD1.ip
(35)
TESTES

Sense strand
TCTTGAGGTCAGCAAGTGAGGATTTGAGGGATTACTGGGGGTTCAATCTAGGGCTGTCCACACACTAGGCAAATCACTGTATACCCCATAAGCTGCACTCCAGCCCAAGTGCCTTCAAGTCATATTCTCGTATCTAGTAGAATGTTTGTACATTAAGACTTTGTTGTATCACAGATTAGTCTGCCTCTTTTTTTCCTCAGCTCCCATTTGATTTTACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCAATGAATG
...................................................................((((((((..((((((...........(((((........))))).........(((((((..........))))))).))))))....)).)))))).....................................................................................
............................................................61.........................................................................................................168................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)
.................................................................TAGGCAAATCACTGTATACCCCATAAGCTG........................................................................................................................................................... 30 1 36.00 36.00 10.00 19.00 - - - 1.00 - - - - - 6.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGATTTTACATGGAAGATGCTAAAGGAC.............. 28 1 21.00 21.00 - - 5.00 6.00 1.00 - 2.00 - 2.00 - - - 2.00 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAGGCAAATCACTGTATACCCCATAAGCTGC.......................................................................................................................................................... 31 1 18.00 18.00 8.00 8.00 - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGATTTTACATGGAAGATGCTAAAGGACA............. 29 1 14.00 14.00 - 2.00 4.00 3.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCA....... 29 1 10.00 10.00 2.00 2.00 1.00 - - 2.00 - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TAGTAGAATGTTTGTACATTAAGACTTTGT...................................................................................... 30 1 9.00 9.00 5.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCAA...... 30 1 8.00 8.00 - 3.00 3.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAGGCAAATCACTGTATACCCCATAAGCTGt.......................................................................................................................................................... 31 t 8.00 36.00 3.00 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAGGCAAATCACTGTATACCCCATAAGCT............................................................................................................................................................ 29 1 7.00 7.00 5.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAGGCAAATCACTGTATACCCCATAcgct............................................................................................................................................................ 29 cgct 6.00 0.00 - - - 1.00 4.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCAAT..... 31 1 6.00 6.00 3.00 - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTC........ 28 1 6.00 6.00 - 1.00 - - - 1.00 - - 2.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - -
.........................................................................................................................................TAGAATGTTTGTACATTAAGACTTTGTTGT................................................................................... 30 1 5.00 5.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................TTTGATTTTACATGGAAGATGCTAAAGGAC.............. 30 1 5.00 5.00 - - 3.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAGGCAAATCACTGTATACCCCATAAGC............................................................................................................................................................. 28 1 4.00 4.00 - - - - - - - 1.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGATTTTACATGGAAGATGCTAAAGGACAA............ 30 1 4.00 4.00 - 1.00 2.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGATTTTACATGGAAGATGCTAAAGGACt............. 29 t 4.00 21.00 - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TATCTAGTAGAATGTTTGTACATTAAGAC........................................................................................... 29 1 3.00 3.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................AGGGCTGTCCACACACTAGGCAAATCACTGT.......................................................................................................................................................................... 31 1 3.00 3.00 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGATTTTACATGGAAGATGCTAAAGGA............... 27 1 3.00 3.00 - - - 1.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAGGCAAATCACTGTATACCCCATAc............................................................................................................................................................... 26 c 3.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TTTTACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTT......... 30 1 3.00 3.00 - 1.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TAGTAGAATGTTTGTACATTAAGACTTTGTT..................................................................................... 31 1 3.00 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TATCTAGTAGAATGTTTGTACATTAAGACT.......................................................................................... 30 1 2.00 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCAAT..... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCAA...... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGATTTTACATGGAAGATGCTAAAGGACAt............ 30 t 2.00 14.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TCAATCTAGGGCTGTCCACACACTAGGCAA.................................................................................................................................................................................. 30 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TAGTAGAATGTTTGTACATTAAGACTTT........................................................................................ 28 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................ATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCA....... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAGGCAAATCACTGTATACCC.................................................................................................................................................................... 21 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................ACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCAAT..... 30 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................TCAAGTCATATTCTCGTATCTAGTAGAATGT......................................................................................................... 31 1 2.00 2.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TACATGGAAGATGCTAAAGGACA............. 23 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCAAT..... 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 -
......................................................................................................................................................................................................................TACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTT......... 27 1 2.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGATTTTACATGGAAGATGCTAAAGG................ 26 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................TTGTACATTAAGACTTTGTTGTATCACAGA........................................................................... 30 1 2.00 2.00 - - 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................TTTTACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTC........ 31 1 2.00 2.00 - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................TTGATTTTACATGGAAGATGCTAAAGGAC.............. 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCAt...... 30 t 1.00 10.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TGTACATTAAGACTTTGTTGTATCACAGATT......................................................................... 31 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TAGTAGAATGTTTGTACATTAAGACTTTG....................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TTACATGGAAGATGCTAAAGGACA............. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................ACTAGGCAAATCACTGTATACCCCATAAGC............................................................................................................................................................. 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TGCTAAAGGACAAGTTCAATGA... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................ACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTT......... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TTTACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTT......... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................AAGGACAAGTTCAATGAATG 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.................................................AGGGCTGTCCACACACTAGGCAAATCACT............................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AGATGCTAAAGGACAAGTTCAATGAATG 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGCCTTCAAGTCATATTCTCGTATCTAGT................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TCAATCTAGGGCTGTCCACACACTAGGCAAA................................................................................................................................................................................. 31 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................TTACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCA....... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................TGCCTTCAAGTCATATTC........................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCAc...... 30 c 1.00 10.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................TTAAGACTTTGTTGTATCACAGATTAGTCT.................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCAATGAAT. 31 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................AATCTAGGGCTGTCCACACACTAGGC.................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCAATGA... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAGGCAAATCACTGTATACCCCATAAGCTt........................................................................................................................................................... 30 t 1.00 7.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGGAAGATGCTAAAGGACAAGTT......... 23 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................ATTTTACATGGAAGATGCTA.................... 20 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................TAGTAGAATGTTTGTACATTAAGACT.......................................................................................... 26 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................TGTATCACAGATTAGTCTGCCTCTTTTT.......................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGatc........ 28 atc 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................TGATTTTACATGGAAGATGCTAAAGGACAAG........... 31 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................TTCAATCTAGGGCTGTCCACACACTAGGCA................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................GGGGGTTCAATCTAGGGCTGT................................................................................................................................................................................................. 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00
.................................................AGGGCTGTCCACACACTAGGCAAATCACa............................................................................................................................................................................ 29 a 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGAGGTCAGCAAGTGAGGATTTGAGGGA........................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TACATGGAAGATGCTAAAGGACAAG........... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCA....... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................TGCTAAAGGACAAGTTCAATGAATG 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................ACATGGAAGATGCTAAAGG................ 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGTTGTATCACAGATTAGTCTGCCTttt............................................................. 28 ttt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................AGATGCTAAAGGACAAGTTCAA...... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TTTACATGGAAGATGCTAAAGt................ 22 t 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................TGTTGTATCACAGATTAGTCTGCCTCTTT............................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
.................................................................TAGGCAAATCACTGTATACCCCATAAGCTGCA......................................................................................................................................................... 32 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................TAAGACTTTGTTGTATCACAGATTAGTCTGt.................................................................. 31 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGctc........ 28 ctc 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...TGAGGTCAGCAAGTGAGGATTTGAGGG............................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GGAAGATGCTAAAGGACAAGTTC........ 23 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................TCGTATCTAGTAGAATGTTTGTACATTAAGAa........................................................................................... 32 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................TGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCAATGAAa. 31 a 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TATCTAGTAGAATGTTTGTACATTAAGACa.......................................................................................... 30 a 1.00 3.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................ATGCTAAAGGACAAGTTCAATGAA.. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TATCTAGTAGAATGTTTGTACATTAAGACaa......................................................................................... 31 aa 1.00 3.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAGGCAAATCACTGTATACCCCctac............................................................................................................................................................... 26 ctac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................GGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCA....... 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................TACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGT.......... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
........TCAGCAAGTGAGGATTTGAGGGATTACTt..................................................................................................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
........TCAGCAAGTGAGGATTTGAGGGt........................................................................................................................................................................................................................... 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................TCCCATTTGATTTTACATGGAAGATGCTA.................... 29 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................ATTTGATTTTACATGGAAGATGCTA.................... 25 1 1.00 1.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................TTTACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTC........ 30 1 1.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................TCAATCTAGGGCTGTCCACACACTAGGCA................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - -
..................................................................................................................................................TGTACATTAAGACTTTGTTGTATCACAGAT.......................................................................... 30 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................TATCTAGTAGAATGTTTGTACATTAAGA............................................................................................ 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................TACATTAAGACTTTGTTGTATCACAGATTA........................................................................ 30 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................TAGGCAAATCACTGTATACCCCATAAGCTGtt......................................................................................................................................................... 32 tt 1.00 36.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
TCTTGAGGTCAGCAAGTGAGGATTTGAGGGATTACTGGGGGTTCAATCTAGGGCTGTCCACACACTAGGCAAATCACTGTATACCCCATAAGCTGCACTCCAGCCCAAGTGCCTTCAAGTCATATTCTCGTATCTAGTAGAATGTTTGTACATTAAGACTTTGTTGTATCACAGATTAGTCTGCCTCTTTTTTTCCTCAGCTCCCATTTGATTTTACATGGAAGATGCTAAAGGACAAGTTCAATGAATG
...................................................................((((((((..((((((...........(((((........))))).........(((((((..........))))))).))))))....)).)))))).....................................................................................
............................................................61.........................................................................................................168................................................................................
Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363960(GSM822762)
Adult Library#1Small RNA Miwi IPDuplexed run:. (testes)
SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes)
GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes)
SRR363957(GSM822759)
P20-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR363958(GSM822760)
Adult-WTSmall RNA Miwi IP. (testes)
SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes)
SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes)
mjTestesWT1()
Testes Data. (testes)
SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes)
SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes)
SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes)
SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes)
SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes)
SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes)
SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes)
SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes)
SRR037903(GSM510439)
testes_rep4. (testes)
SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes)
SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes)
SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes)
SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes)
SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes)
SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes)
SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes)
GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes)
GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes)
mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes)