chr17:29177709 29178201 +
(1)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(1)
OVARY 		(7)
PIWI.ip 		(1)
PIWI.mut 		(38)
TESTES

Sense strand
TCTGCTTCTAGATCCCCAAGAAGGAGAAGCTTTTCCCGAAGCCGGAGCAGGTAAATGTTTTGGTGCCCTGTTCTTAGAGATGGCAGCTTCTGACAACTTTAAGCTGTTTCCCGTGCTTGTTAATGAGATTTATAGATAACTCTCATTATAGTGACATGGGTAGCATACATAGTCACACAGTCAGCATTAAGTTAGCCTTTCTTCAAGGTGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTAAAGATTTATTTGTATGACTACACTTTAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAGATGGCATCTGATCTCACTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAGTTGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGCTGTCAGTGCTCTTTAACTGCTGAGCCATCTCTAGCCCTCAAGGTGATTTTCTAATAAAGGAATGTGCTGTTTGTTTTAGGTCACTTTCTAGAGATAGGAGAAGAGAAAGGTCTCTGTCTCGTGAGAGAA


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAGTTGAACTCAGGA.............................................................................................................................................. 52 3 28.00 28.00 28.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGCcaa.............................................................................................................................. 27 caa 8.00 0.00 - 1.00 - - - - 6.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGaaaa............................................................................................................................................................. 29 aaaa 5.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - 2.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - -
......................................................................................CTTCTGACAACTTTAAGCTG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 1 5.00 5.00 - - - - - - - 5.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAGcga................................................................................................................................. 24 cga 3.00 0.00 - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTTGCTGGGAGTTGAgttt.................................................................................................................................................. 21 gttt 3.00 0.00 - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGatta.............................................................................................................................. 27 atta 2.00 0.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGaaag.............................................................................................................................. 27 aaag 2.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAGcgaa................................................................................................................................ 25 cgaa 2.00 0.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTAAATGTTTTGGTGCCCTGTTCTTAGA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 2.00 2.00 - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGaaa.............................................................................................................................................................. 31 aaa 2.00 0.00 - - - - 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGTTGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGa................................................................................................................................. 31 a 2.00 0.00 - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGaaa.............................................................................................................................................................. 29 aaa 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTTGCTGGGAGTTGAACTCAGGAga............................................................................................................................................ 27 ga 2.00 0.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAATAAAGGAATGTGCTGTTTGTTTTA................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGtata........................................................................................................................................................ 29 tata 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAACTCAGGACCTTTGGAAGcga................................................................................................................................. 25 cga 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................ATTATAGTGACATGGtcta.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 tcta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - -
.....................AGGAGAAGCTTTTCCCGAAGCCGGAGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 3 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGTGGTTGCTGGGAGTTGAgcgc.................................................................................................................................................. 23 gcgc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGACCTTTGGAAGAGCTtgt............................................................................................................................. 22 tgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGTGGTTGCTGGGAGTTGAACTCAGGAaaa........................................................................................................................................... 31 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGTTGAACTCAGGACCTTTGGAgg.................................................................................................................................... 28 gg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAACTCAGGACCTTTGGAAGcgta................................................................................................................................ 26 cgta 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................ACTTTAGCTGTCTTCAGAaga........................................................................................................................................................................................................................ 21 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................TATAGTGACATGGGTAGCATACATAGT................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGatga.............................................................................................................................. 27 atga 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................TGTTAATGAGATTTATAGATA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATGTGGTTGCTGGGAGTTGAACTaga................................................................................................................................................ 26 aga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CACCATGTGGTTGCTGGGAGTTGAAtg................................................................................................................................................... 27 tg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATCTCACTACAGATGGTTGTGAGCCAaaa......................................................................................................................................................................... 30 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ACCTTTGGAAGAGCTGTCAGTGg........................................................................................................................ 23 g 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................TTTAGCTGTCTTCAGACACACCgga.................................................................................................................................................................................................................. 25 gga 1.00 0.00 - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGaaaa............................................................................................................................................................. 31 aaaa 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CATGTGGTTGCTGGGAGTTGAACTCtgc............................................................................................................................................... 28 tgc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGTTGCTGGGAGTTGAACTCAtt............................................................................................................................................... 24 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGattc.............................................................................................................................. 28 attc 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATAGGAGAAGAGAAAGGTCTCTGac........... 27 ac 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAACTCAGGACCTTTGGAAGAcaga............................................................................................................................... 27 caga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAAGGTCTCTGTCTCGTGAGAGgaat 28 gaat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................TGAGATTTATAGATAACTC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 19 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGCTtttt............................................................................................................................ 29 tttt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGaaaa.............................................................................................................................. 27 aaaa 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAGcta................................................................................................................................. 24 cta 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGattt.............................................................................................................................. 28 attt 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................TGTCTTCAGACACACCAGAAGATGGCATtt....................................................................................................................................................................................................... 30 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................TACACTTTAGCTGTCTTCAGACtctc...................................................................................................................................................................................................................... 26 tctc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGaca.............................................................................................................................................................. 29 aca 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTGCTGGGAGTTGAACTCtggt.............................................................................................................................................. 22 tggt 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................TTAGAGATGGCAGCTTCTGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAGGACCTTTGGAAtc................................................................................................................................... 18 tc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTGCTGGGAGTTGAACTtgga............................................................................................................................................... 22 tgga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAGctta................................................................................................................................ 25 ctta 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTAGAGATAGGAGAAGAGAAAGGTC................. 26 5 0.80 0.80 - 0.60 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGAGATAGGAGAAGAGAAAGGTCT................ 25 5 0.40 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ATAAAGGAATGTGCTGT........................................................... 17 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - -
...................GAAGGAGAAGCTTTTCCCGAAGCCGGAGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGACCTTTGGAAGAGCTGTCAGTGCTC...................................................................................................................... 29 19 0.32 0.32 - - - - - - - 0.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGAGATAGGAGAAGAGAAAGGTCTCT.............. 27 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGAGATAGGAGAAGAGAAAGGTCTC............... 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAGAAAGGTCTCTGTCTCGTGA..... 26 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGATAGGAGAAGAGAAAGGTCTCTGTC........... 28 5 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTTCTAGAGATAGGAGAAGAGAAAGGTC................. 28 5 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GATAGGAGAAGAGAAAGGTCTCTGTCT.......... 27 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATAGGAGAAGAGAAAGGTCTCTGTCT.......... 28 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAAGGTCTCTGTCTCGTGAGAGA. 25 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGAAGAGAAAGGTCTCTGTCTCGT....... 24 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TAGGAGAAGAGAAAGGTCTCTGTCTC......... 26 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGATAGGAGAAGAGAAAGGTCTCTGTC........... 27 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GAGAAAGGTCTCTGTCTCGTGAGA... 24 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTCACTTTCTAGAGATAGGAGAAGAGA....................... 27 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAGTGCTCTTTAACTGCTGAGCCATCTC.................................................................................................. 29 15 0.07 0.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.07

Antisense strand
TCTGCTTCTAGATCCCCAAGAAGGAGAAGCTTTTCCCGAAGCCGGAGCAGGTAAATGTTTTGGTGCCCTGTTCTTAGAGATGGCAGCTTCTGACAACTTTAAGCTGTTTCCCGTGCTTGTTAATGAGATTTATAGATAACTCTCATTATAGTGACATGGGTAGCATACATAGTCACACAGTCAGCATTAAGTTAGCCTTTCTTCAAGGTGAGCTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTAAAGATTTATTTGTATGACTACACTTTAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAGATGGCATCTGATCTCACTACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCTGGGAGTTGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGCTGTCAGTGCTCTTTAACTGCTGAGCCATCTCTAGCCCTCAAGGTGATTTTCTAATAAAGGAATGTGCTGTTTGTTTTAGGTCACTTTCTAGAGATAGGAGAAGAGAAAGGTCTCTGTCTCGTGAGAGAA


 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR363964(GSM822766)
AdultGlobal 5'-RACEread_length: 105. (testes) 		SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR029041(GSM433293)
6w_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR051941(GSM545785)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l-/-). (mov10L testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes)
................................................................................................................................................................................................................................................................TTTAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAag................................................................................................................................................................................................................. 28 ag 2.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................CTTTAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAcgt................................................................................................................................................................................................................. 30 cgt 2.00 0.00 - - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGAGTTGAACTCAGGACCTTTGGAAc..................................................................................................................................... 27 c 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTGTCTTCAGACACACCAGAAttt................................................................................................................................................................................................................. 26 ttt 2.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TTTAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAaaa................................................................................................................................................................................................................. 29 aaa 2.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTGAACTCAGGACCTTTGGAAaccc..................................................................................................................................... 26 accc 2.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAGAtcc................................................................................................................................... 25 tcc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................TTTAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAGAaa............................................................................................................................................................................................................... 30 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTGTCTTCAGACACACCAGAttaa.................................................................................................................................................................................................................. 26 ttaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAtccc...................................................................................................................................... 23 tccc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................TGTTCTTAGAGATGtggt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 tggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTGTCTTCAGACACACCAGAAtaat................................................................................................................................................................................................................. 27 taat 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................ATGAGATTTATAGgggt...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 17 gggt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAGAtca................................................................................................................................... 25 tca 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................TTTAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAaatt................................................................................................................................................................................................................. 30 aatt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAcacc..................................................................................................................................... 24 cacc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGGAGTTGAACTCAGGACCTTTGGAAt..................................................................................................................................... 27 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGACCTTTGGAAGAGCTGTCAggaa............................................................................................................................ 27 ggaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTGTCTTCAGACACACCAGAAGAccc............................................................................................................................................................................................................... 28 ccc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTGAACTCAGGACCTTTatcc......................................................................................................................................... 22 atcc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTGTCTTCAGACACACCAGAAGAtcgt............................................................................................................................................................................................................... 29 tcgt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTGAACTCAGGACCTTTGGAAGatc.................................................................................................................................... 26 atc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTGTCTTCAGACACACCAGAAtttt................................................................................................................................................................................................................. 27 tttt 1.00 0.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTGTCTTCAGACACACCAGAAtga................................................................................................................................................................................................................. 26 tga 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAGGACCTTTGGAAaaa..................................................................................................................................... 19 aaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTGAACTCAGGACCTTTGGAAGAatcc................................................................................................................................... 28 atcc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGTTGAACTCAGGACCTTTGGAaa...................................................................................................................................... 26 aa 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCACCATGTGGTTGCTGGGAGTTGAga...................................................................................................................................................... 27 ga 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................................................ATCTGATCTCACTagga.............................................................................................................................................................................................. 17 agga 1.00 0.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAtccc..................................................................................................................................... 24 tccc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................................................................................TTTAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAaaaa................................................................................................................................................................................................................. 30 aaaa 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAtcc..................................................................................................................................... 23 tcc 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGGGAGTTGAACTCAGGACCTTTGGAagca...................................................................................................................................... 30 agca 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTGTCTTCAGACACACCAGAAttat................................................................................................................................................................................................................. 27 ttat 1.00 0.00 - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................AGCTGTCTTCAGACACACCAGAAcccg................................................................................................................................................................................................................. 27 cccg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGAACTCAGGACCTTTGGAAGAcgt................................................................................................................................... 25 cgt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGGGAGTTGAACTCAGGACCTTTGGAAt..................................................................................................................................... 29 t 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGAGTTGAACTCAGGACCTTTGGAgagc...................................................................................................................................... 28 gagc 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................TTTAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAGAaat............................................................................................................................................................................................................... 31 aat 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................TTTAGCTGTCTTCAGACACACCAGAAaa................................................................................................................................................................................................................. 28 aa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -