chr17:28465943 28466368 +
(1)
OTHER.ip 		(11)
OTHER.mut 		(2)
OVARY 		(10)
PIWI.ip 		(4)
PIWI.mut 		(1)
TDRD1.ip 		(54)
TESTES

Sense strand
CTGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCAGGTTGGCACCGCTCTAACCCCACCCAGCCCTCAGTGTTCCCGTGTGGCCTGGCCGCGCCCTAGGCGGGCACGGGGACACTGACGTGCCAGGGTAGTTCAGGAGCCCTGCTGCAGGCAGGCAGGCTGGACGGACCCCCACCCTGGGTCTTAAAACAAGAGGGGAGGCGTGGGGAGGCCTCGGCCGAGCCCGCCGCCTAGCCTGAGAAGCCAGGCTAGTGTTGCCCAGAGCTCCGGGTAAGGCTTGCCGCTCCCTGCCATGCGTTCAGATCTAGCGGGATGGCCAGCGCCGACCATGACCTGTTCTGTTTTCTCCCCTCCCAAACGCAGGCTCAAGTCCACCCCACGCCCCAAGTTCTCGGTGTGCGTTCTGGGGGACC
..........................................................................................................................................................................................((((.(((((((.....))).(((..((((.((...(((....)))...))))))..((((((((......)))))))).....)))...)))).)))).............................................................................................................................................
.........................................................................................................................................................................................186..................................................................................................287.........................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 5 1885.20 1885.20 574.60 566.60 236.20 235.40 164.00 27.20 7.60 7.20 17.20 - 1.80 5.80 8.00 2.40 6.40 6.40 1.60 6.00 - 0.40 4.60 0.20 0.60 0.20 0.40 - 0.20 0.40 0.80 0.40 0.40 0.20 - 0.20 - - - - 0.20 0.60 - - 0.40 0.20 - - - - - - - 0.40 - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 5 775.40 775.40 215.20 217.00 115.60 101.20 100.80 6.60 2.00 1.00 2.20 - 1.00 1.20 2.40 0.80 - 2.40 - 1.20 - 0.20 1.60 0.40 0.60 0.20 - - 0.20 - - 0.40 - - - 0.20 - 0.20 0.40 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 5 386.40 386.40 110.80 105.00 40.40 47.40 19.60 3.00 13.60 17.80 3.40 - 2.60 2.20 2.80 1.40 2.40 1.40 2.00 1.80 1.40 0.20 1.40 - 0.80 0.20 0.60 1.00 0.20 - 0.40 0.40 0.40 - - 0.20 0.20 - - 0.40 0.20 - - - - 0.20 - - - - 0.20 0.20 0.20 - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAAC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 4 58.75 58.75 12.25 9.50 9.75 6.75 16.75 - 0.75 - - - 0.25 - - 0.50 - - - 0.25 - - - - 0.25 0.25 - - 0.25 - - - 0.25 0.50 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 t 50.20 1885.20 17.60 14.40 4.80 5.80 6.00 0.60 - - 0.40 - - - - - - 0.20 - - - 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 5 35.20 35.20 9.40 9.80 2.00 2.40 9.80 - 0.20 - - - 0.60 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - 0.20 - - 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 t 28.20 386.40 7.60 6.80 4.40 3.60 2.80 0.40 0.20 0.40 0.60 - - - 0.20 - - - - 0.20 - - 0.60 - 0.20 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 5 24.20 24.20 4.80 3.20 0.80 1.40 1.40 1.60 1.20 2.40 2.00 - 0.60 0.20 0.40 0.40 0.60 0.60 0.40 0.20 - - 0.60 - 0.40 0.20 - - 0.20 - - 0.20 - - - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 t 20.80 775.40 7.60 7.20 2.60 1.20 2.00 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 5 14.80 14.80 3.80 4.60 2.00 1.40 1.80 0.40 - - - - - - - - - - - - - - 0.40 - - - - - 0.20 - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 4 14.25 14.25 - - - - - - 2.50 - - - 8.50 - - - - - - - - - - - 2.25 0.25 - - - - - - - - 0.25 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAAC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 4 9.50 9.50 2.50 3.00 1.00 0.75 1.00 - 0.25 0.50 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 5 8.20 8.20 2.40 1.20 0.80 0.80 1.60 0.40 0.60 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 5 6.00 6.00 0.80 0.20 0.20 0.20 0.60 0.20 0.60 1.00 - - 0.20 - - 0.20 - - - - - - 0.20 0.20 - 0.20 - - 0.20 - 0.80 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 4 5.75 5.75 - - - - 0.50 - 0.50 0.25 - 1.75 0.25 - - 0.25 - - 1.00 - - 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - -
...AAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 5 4.20 4.20 1.40 1.00 0.20 - 0.20 0.40 - 0.20 - - - - 0.20 0.20 - - - - - - 0.20 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................AACGTTTCTCGGGCACCGTCAGGTTG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 4.00 4.00 2.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TGGGTCTTAAAACAAGAGGGGAGGCGT................................................................................................................................................................................................................. 27 1 4.00 4.00 2.00 1.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 3.75 3.75 - - - - 0.50 - - 0.75 - - - 1.00 - 0.25 - - 0.25 - - - - 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGAa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 a 3.60 24.20 0.80 1.20 0.20 1.00 - 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCAC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 4 3.50 3.50 0.50 0.50 0.25 - - - 0.25 - - - - 0.25 - 0.25 - - 0.25 - - 0.25 - - - - - - 0.25 - - 0.25 - - - 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GAAGGACAAACGTTTCTCGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 4 3.50 3.50 - - - - - - - - - 1.25 - - - - 2.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 tt 3.40 1885.20 0.60 1.20 0.20 0.20 1.00 - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGAta.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 ta 3.20 24.20 0.20 0.20 0.40 0.20 0.40 1.80 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................AACGTTTCTCGGGCACCGTCAGGTTt.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 3.00 3.00 - 2.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................GTTGCCCAGAGCTCCGG............................................................................................................................................... 17 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................AACGTTTCTCGGGCACCGTCAGGTT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAAC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 4 3.00 3.00 0.75 1.00 0.25 0.25 0.50 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 4 2.75 2.75 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - 1.25 0.50 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAAt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 t 2.60 35.20 0.40 0.40 0.60 0.20 0.60 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 tt 2.40 386.40 0.40 1.40 0.20 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 5 2.40 2.40 0.60 0.60 0.20 0.20 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGAaa.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 aa 2.40 24.20 0.40 1.40 0.20 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAGGACAAACGTTTCTCGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 4 2.25 2.25 - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................CCCTCAGTGTTCCCGTGTGGCCT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGAtc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 tc 2.00 24.20 0.20 - - - 0.20 1.60 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TTAAAACAAGAGGGGAGGCGTGGGG............................................................................................................................................................................................................. 25 1 2.00 2.00 - 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CAGGCAGGCAGGCTGGACGGACCCCCACC............................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 2.00 2.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GCAGGCAGGCTGGACGGACCCCaatt............................................................................................................................................................................................................................................. 26 aatt 2.00 0.00 - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................CCCTCAGTGTTCCCGTGTGGCCTtt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 tt 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................TAAAACAAGAGGGGAGGCGTGGGGA............................................................................................................................................................................................................ 25 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TTTCTCGGGCACCGTCAGGTTGGCACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 4 1.75 1.75 0.25 0.50 - 0.50 - - 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGAt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.60 24.20 0.20 0.40 - - - - - 0.20 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GACAAACGTTTCTCGGGCACCGTC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 4 1.50 1.50 - - - - - - - - - 1.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 1.50 1.50 0.50 - - - 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGgca.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 gca 1.40 6.00 0.80 0.40 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TTCTCGGTGTGCGTTCTGGGGGACC 25 3 1.33 1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - 0.67 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 1.25 1.25 0.50 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - -
....AGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 4 1.25 1.25 0.25 - - - - - - 0.50 - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 t 1.25 58.75 - - - - 0.75 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 4 1.25 1.25 - - - - - - - 0.25 - - 0.75 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 4 1.25 1.25 0.75 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 1.25 1.25 - 0.50 - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 5 1.20 1.20 - - - - - - 0.20 0.60 - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 5 1.20 1.20 0.40 0.20 0.20 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACg.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 g 1.20 386.40 0.20 0.60 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGcca.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 cca 1.20 6.00 0.20 0.40 - - 0.20 - - - - - - 0.20 - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................AACGTTTCTCGGGCACCGTCAGGTTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................CCAGGCTAGTGTTGCCCAGAGCTCCGGG.............................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TTTCTCGGGCACCGTCAGGcaaa................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 23 caaa 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................GCCAGGCTAGTGTTGCCCAGAGCTCCGGag............................................................................................................................................. 30 ag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 1.00 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................ACGTTTCTCGGGCACCGTCAGGTTGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 1.00 1.00 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................GCTGGACGGACCCCCACCCTGG......................................................................................................................................................................................................................................... 22 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................TGCTGCAGGCAGGCAGGCTGGACGGt..................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................AGGCTAGTGTTGCCCAGAGCTCCGGGct............................................................................................................................................ 28 ct 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................CCCTCAGTGTTCCCGTGTGGC......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCCCCAAGTTCTCGGTGTGCGTTCTtgg..... 29 tgg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................................................................................................................................................................GCAGGCAGGCTGGACGGA..................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TGGGTCTTAAAACAAGAGGGGAGGCG.................................................................................................................................................................................................................. 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TGGGTCTTAAAACAAGAGGGGAGGag.................................................................................................................................................................................................................. 26 ag 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................TCTAACCCCACCCAGCCCTCAGTGTTCCC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................CACTGACGTGCCAGGGTAGTTCAGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................................................................................................................................................................................................................................................CAGGCTAGTGTTGCCCAGAGCTCCGG............................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 4 1.00 1.00 0.25 0.50 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................GGCACCGTCAGGTTGGCACCGCTCTAt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 t 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCAGGTT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGAACTACGACCCTCAGAAGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................TGCCATGCGTTCAGATCTAGCGGGATGG................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................TGAGAAGCCAGGCTAGTGTTGCCCAGA...................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGACGTGCCAGGGTAGTTCAGGAG.................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACAAACGTTTCTCGGGCACCGacag........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 acag 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TGCAGGCAGGCAGGCTGGACGGACCCCCA............................................................................................................................................................................................................................................... 29 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 4 1.00 1.00 - 0.50 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................CAGGCAGGCAGGCTGGACGGACCCCCA............................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................TGGCACCGCTCTAACCCCACCCAGattt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 attt 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GTTTCTCGGGCACCGTCAGGTTGGCAC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................TTAAAACAAGAGGGGAGGCGTGGcg............................................................................................................................................................................................................. 25 cg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TGCAGGCAGGCAGGCTGGACGGACa................................................................................................................................................................................................................................................... 25 a 1.00 0.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TTCTCGGGCACCGTCAGGTTGGCACCGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TTCTCGGGCACCGTCAGGTTGGCACCGCTt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 t 1.00 0.00 - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................................TTCTCGGGCACCGTCAGGTTGGCACCGCTC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 1 1.00 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTTCTCGGTGTGCGTTCTGGGGGt.. 25 t 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TCAGTGTTCCCGTGTGGCCTGGCCGCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTTGGCACCGCTCTAACCCCACCCAa.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 a 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGACGTGCCAGGGTAGTTCAGGAGCCCTG............................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................GTTGGCACCGCTCTAACCCCACCCAGC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................................................................GCTGCAGGCAGGCAGGCTGGACGGACC................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................TGACGTGCCAGGGTAGTTCAGGAGCCC............................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................CCCTCAGTGTTCCCGTGTGGCCat...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 at 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAtt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 tt 1.00 775.40 - 0.20 0.20 0.20 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGTCCACCCCACGCCCCAAGTTCTa.................... 27 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................................................TGGGTCTTAAAACAAGAGGGGAGGCGTG................................................................................................................................................................................................................ 28 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACtt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 32 tt 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................GAGAAGCCAGGCTAGTGTTGCCCAGA...................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................................................................................................CTAGGCGGGCACGGGGACACTa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 a 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGct.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 ct 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................TCAGTGTTCCCGTGTGGCCTGGCCGCcc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 cc 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................GTTTCTCGGGCACCGTCAGGTTGGC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................................................................................................................................................TGCAGGCAGGCAGGCTGGACGGgt.................................................................................................................................................................................................................................................... 24 gt 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........ACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTatc.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 atc 1.00 0.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................CCGAGCCCGCCGCCaccg.................................................................................................................................................................................. 18 accg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGTTCTCGGTGTGCGTTCTGtggg... 26 tggg 1.00 0.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............ACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 t 1.00 0.00 - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GAACTACGACCCTCAGAAGGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 6 0.83 0.83 - - - - - - - - - 0.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGAACTACGACCCTCAGAAGGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 6 0.83 0.83 - - - - 0.17 - - 0.50 - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 25 t 0.80 6.00 0.20 0.40 - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 t 0.75 9.50 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.75 0.75 - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.75 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - 0.25 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAGGACAAACGTTTCTCGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 4 0.75 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 4 0.75 0.75 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - -
.........TACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.75 0.75 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 4 0.75 0.75 - - 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 29 4 0.75 0.75 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - -
....................GAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 0.75 0.75 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCT..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 4 0.75 0.75 0.50 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............CCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 27 4 0.75 0.75 0.25 - 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 30 4 0.75 0.75 - - 0.25 - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGAACTACGACCCTCAGAAGGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 6 0.67 0.67 0.33 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGTGCGTTCTGGGGGAC. 18 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGAACTACGACCCTCAGAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 6 0.67 0.67 - - - - - - - - - - 0.33 - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGTTCTCGGTGTGCGTTCTGGGG.... 25 3 0.67 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAAt........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 0.60 1.20 0.20 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGccaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ccaa 0.60 6.00 0.20 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGgcaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 gcaa 0.60 6.00 - 0.20 0.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGtc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 tc 0.60 6.00 0.40 - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 t 0.60 8.20 - 0.20 - 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 22 5 0.60 0.60 - - - - - - - 0.20 - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGA.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 5 0.60 0.60 - - - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAGGACAAACGTTTCTCGGGCACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGGACAAACGTTTCTCGGGCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 4 0.50 0.50 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 4 0.50 0.50 - 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGTCCACCCCACGCCCCAAGTTCTC.................... 27 2 0.50 0.50 - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCAC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 26 4 0.50 0.50 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 4 0.50 0.50 - 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 0.50 0.75 - - 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GAAGGACAAACGTTTCTCGGGCAC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 24 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - 0.25 -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGTT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 33 4 0.50 0.50 - - - - - - 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CAGAAGGACAAACGTTTCTCGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 0.50 0.50 - 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 4 0.50 0.50 - - - - - - 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....GAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGTT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 30 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................CTAGTGTTGCCCAGAGCTC.................................................................................................................................................. 19 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - -
....AGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAAC........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 0.50 0.50 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............................CGTTTCTCGGGCACCGTCAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......ACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 4 0.50 0.50 - 0.25 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 4 0.50 0.50 - 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 4 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCAAGTCCACCCCACGCCCCAAGTTC...................... 26 2 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................CTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 4 0.50 0.50 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGtac............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 tac 0.40 1.20 - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAtc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 tc 0.40 1885.20 0.20 - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACc.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 c 0.40 386.40 - - 0.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAc............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 29 c 0.40 775.40 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAAa........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 a 0.40 35.20 - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGAaaa............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 aaa 0.40 24.20 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACga............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 ga 0.40 386.40 0.20 - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAAat.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 at 0.40 35.20 - - - - 0.40 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAtgac............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 tgac 0.40 0.60 - 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGAACTACGACCCTCAGAAGGACA.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 5 0.40 0.40 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGAACTACGACCCTCAGAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 21 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CAAGTTCTCGGTGTGCGTTCTGGGGG... 26 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGAACTACGACCCTCAGAAGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 23 6 0.33 0.33 - - - - - 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCAAGTTCTCGGTGTGCGTTCTGGG..... 26 3 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTTCTCGGTGTGCGTTCTG....... 19 3 0.33 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGAACTACGACCCTCAGAAGGAt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 t 0.33 0.33 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCGGTGTGCGTTCTGGG..... 19 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGAACTACGACCCTCAGAAGGA................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 6 0.33 0.33 - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCGGTGTGCGTTCTGGGGGACCagct 28 agct 0.33 0.33 - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GGCTCAAGTCCACCCCACG................................ 19 3 0.33 0.33 - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCGGTGTGCGTTCTGGGGGACCagt 27 agt 0.33 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCCAAGTTCTCGGTGTGCGTTCT........ 24 3 0.33 0.33 - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................AGTTCTCGGTGTGCGTTCTGGGGGA.. 25 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCTCGGTGTGCGTTCTGGGGGACC 24 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................TCGGTGTGCGTTCTGGGGGAC. 21 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCCCAAGTTCTCGGTGTGCGTTCTG....... 25 3 0.33 0.33 - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCt......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 t 0.25 1.00 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................TTTCTCGGGCACCGTCAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 18 4 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTC...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - -
.....................AAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTt.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 t 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........CGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGt................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 t 0.25 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 4 0.25 0.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........TACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 4 0.25 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 a 0.25 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACAAACGTTTCTCGGGCACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - -
.............ACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............................AACGTTTCTCGGGCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 15 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGAAGGACAAACGTTTCTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 21 4 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................ACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.25 0.25 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..GAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACG.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 4 0.25 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...................AGAAGGACAAACGTTTCTCGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 23 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCAt.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 t 0.25 3.75 - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GACAAACGTTTCTCGGGCACCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 22 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 t 0.25 2.75 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 4 0.25 0.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 34 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCAGGgt..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 gt 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACaa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 aa 0.25 0.50 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - -
......................AGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 28 4 0.25 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 31 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGT......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 4 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACac............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 ac 0.25 0.50 - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
............GACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 27 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 32 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGTT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 31 4 0.25 0.25 - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................GGACAAACGTTTCTCGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 18 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
........................GACAAACGTTTCTCGGG................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..................CAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTC.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 30 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........ACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTC.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - -
......AACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.................TCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCAa.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 27 a 0.25 3.75 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACaa......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 32 aa 0.25 58.75 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CAAACGTTTCTCGGGCACCGTCAG........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 24 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - -
...................AGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCAC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 25 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGGACAAACGTTTCTCGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 20 4 0.25 0.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................GAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 26 4 0.25 0.25 - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..............CCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 29 4 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........ACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGC................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................ 32 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGGACAAACGTTTCTCGGGCAC.............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 22 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - -
............GACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGG.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 4 0.25 0.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................AGGACAAACGTTTCTCGGGCACtgtc.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 tgtc 0.25 0.25 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................AAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCA......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 28 4 0.25 0.25 - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....AGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTT....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................CAAACGTTTCTCGGGCACCGTCAGG....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 25 4 0.25 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................AAACGTTTCTCGGGCACCGT........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 20 4 0.25 0.25 - - - - - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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..........ACGACCCTCAGAAGGACAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 19 5 0.20 0.20 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................GTGTGCGTTCTGGGGG... 16 5 0.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - -
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.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGAtac............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 tac 0.20 24.20 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAgact.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 31 gact 0.20 1885.20 - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.TGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGAatt............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 28 att 0.20 24.20 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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.........TACGACCCTCAGAAGGACAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 20 5 0.20 0.20 - - - - - 0.20 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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............GACCCTCAGAAGGACAA............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. 17 7 0.14 0.14 - - - - - 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Antisense strand
CTGAAGAACTACGACCCTCAGAAGGACAAACGTTTCTCGGGCACCGTCAGGTTGGCACCGCTCTAACCCCACCCAGCCCTCAGTGTTCCCGTGTGGCCTGGCCGCGCCCTAGGCGGGCACGGGGACACTGACGTGCCAGGGTAGTTCAGGAGCCCTGCTGCAGGCAGGCAGGCTGGACGGACCCCCACCCTGGGTCTTAAAACAAGAGGGGAGGCGTGGGGAGGCCTCGGCCGAGCCCGCCGCCTAGCCTGAGAAGCCAGGCTAGTGTTGCCCAGAGCTCCGGGTAAGGCTTGCCGCTCCCTGCCATGCGTTCAGATCTAGCGGGATGGCCAGCGCCGACCATGACCTGTTCTGTTTTCTCCCCTCCCAAACGCAGGCTCAAGTCCACCCCACGCCCCAAGTTCTCGGTGTGCGTTCTGGGGGACC
..........................................................................................................................................................................................((((.(((((((.....))).(((..((((.((...(((....)))...))))))..((((((((......)))))))).....)))...)))).)))).............................................................................................................................................
.........................................................................................................................................................................................186..................................................................................................287.........................................................................................................................................
 Size Perfect hit Total Norm Perfect Norm SRR034119(GSM466729)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate2. (mili testes) 		SRR034118(GSM466728)
Mili IP_Tdrd9+/- replicate1. (mili testes) 		SRR034121(GSM466731)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate2. (mili testes) 		SRR034120(GSM466730)
Mili IP_Tdrd9-/- replicate1. (mili testes) 		SRR028732(GSM400969)
Mili-Tdrd1 KO associated. (mili testes) 		SRR069809(GSM610965)
small RNA sequencing; sample 1. (testes) 		SRR248523(GSM733811)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR248524(GSM733812)
cell type: Thy1+ spermatogonial stem cellstra. (testes) 		SRR069811(GSM610967)
small RNA sequencing; sample 3. (testes) 		mjTestesWT1()
Testes Data. (testes) 		SRR248527(GSM733815)
cell type: spermatogonial stem cell enriched . (testes) 		SRR029043(GSM433295)
18.5dpc_homo_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR028731(GSM400968)
Mili-wt-associated. (testes) 		SRR248526(GSM733814)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		mjTestesWT4()
Testes Data. (testes) 		SRR069810(GSM610966)
small RNA sequencing; sample 2. (testes) 		SRR029042(GSM433294)
18.5dpc_hetero_tdrd1-KO. (tdrd1 testes) 		SRR051939(GSM545783)
Mov10L1-associated piRNAs. (mov10L testes) 		mjTestesWT3()
Testes Data. (testes) 		SRR014231(GSM319955)
16.5 dpc total. (testes) 		SRR028730(GSM400967)
Tdrd1-associated. (tdrd1 testes) 		mjTestesKO7()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR248525(GSM733813)
cell type: Thy1- spermatogonial stem cellstra. (testes) 		GSM509277(GSM509277)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		mjTestesKO6()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		mjTestesWT2()
Testes Data. (testes) 		GSM509279(GSM509279)
MVH-/- E16.5 small RNA. (testes) 		SRR014235(GSM319959)
2 dpp total. (testes) 		mjTestesKO8()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		GSM475280(GSM475280)
Mili-IP. (mili testes) 		SRR029037(GSM433289)
18dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR363959(GSM822761)
AdultSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		SRR029036(GSM433288)
18dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		GSM509278(GSM509278)
small RNA cloning by length. (piwi testes) 		SRR014236(GSM319960)
10 dpp total. (testes) 		GSM179088(GSM179088)
Developmentally regulated piRNA clusters implicate MILI in transposon control. (piwi testes) 		SRR014232(GSM319956)
16.5 dpc MILI. (mili testes) 		SRR014234(GSM319958)
Ovary total. (ovary) 		GSM509275(GSM509275)
MitoPLD+/+ E16.5 small RNA. (testes) 		SRR029038(GSM433290)
25dpp_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR014233(GSM319957)
16.5 dpc MIWI2. (miwi2 testes) 		SRR029039(GSM433291)
25dpp_homo_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		mjTestesKO5()
Testes Data. (Zcchc11 testes) 		SRR014229(GSM319953)
10 dpp MILI. (mili testes) 		SRR363956(GSM822758)
P14-WTSmall RNA Miwi IPread_length: 36. (testes) 		GSM509280(GSM509280)
small RNA cloning by length. (testes) 		SRR037897(GSM510433)
ovary_rep2. (ovary) 		SRR029040(GSM433292)
6w_hetero_tdrd6-KO. (tdrd6 testes) 		SRR037901(GSM510437)
testes_rep2. (testes) 		GSM509276(GSM509276)
small RNA cloning by length. (testes) 		GSM475279(GSM475279)
Miwi-IP. (miwi testes) 		SRR042485(GSM539877)
mouse testicular tissue [09-002]. (testes) 		SRR014230(GSM319954)
10 dpp Dnmt3L-KO MILI. (mili testes) 		GSM475281(GSM475281)
total RNA. (testes) 		SRR037902(GSM510438)
testes_rep3. (testes) 		SRR051940(GSM545784)
18-32 nt total small RNAs (Mov10l+/-). (testes)
............................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTGCCATGCGTTCAGATCTAGCGGGA.................................................................................................... 26 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................CAGCCCTCAGTGTTCCCG............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 18 1 7.00 7.00 - - - - - - - - - 7.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTCCCTGCCATGCGTTCAGATCTA.......................................................................................................... 25 1 4.00 4.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.00 2.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGCTCCCTGCCATGCGTTCAGATCTA.......................................................................................................... 28 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.....................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCGCTCCCTGCCATGCGTTCAGATCTA.......................................................................................................... 27 1 3.00 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTGCCATGCGTTCAGATCTAGCGGGA.................................................................................................... 27 1 1.00 1.00 - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCCGCTCCCTGCCATGCGTTCAGA.............................................................................................................. 24 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
....................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCCTGCCATGCGTTCAGAgggc.............................................................................................................. 24 gggc 1.00 0.00 - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
................................................................................................................................................................................................................................................................................................GCTTGCCGCTCCCTGCCATGCGTTCAGA.............................................................................................................. 28 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................AGCCCGCCGCCTAGCCT................................................................................................................................................................................ 17 1 1.00 1.00 - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...........................................................................GCCCTCAGTGTTCCCGTGTGGCCTGG..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
......................................................................................................................................................................................................................................................................................................CGCTCCCTGCCATGCGTTCAGATCTA.......................................................................................................... 26 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
..........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CCTCCCAAACGCAGGCTCAAGTCCA....................................... 25 1 1.00 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.......................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCCCTGCCATGCGTTCAGATCTAt.......................................................................................................... 25 t 1.00 0.00 - - - - - - 1.00 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
.........................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................CTCAAGTCCACCCCACGCCC............................. 20 3 0.33 0.33 - - - - - - - - - - 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
...AAGAACTACGACCCTCAGAAGGAC............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... 24 6 0.17 0.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.17 - - - - - - - - - - - -